logo

Genes within 1Mb (chr12:89410406:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 8.66e-01 0.0124 0.0736 0.126 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.60e-01 0.112 0.0995 0.126 B L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 9.40e-01 0.00775 0.103 0.126 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.15e-01 0.107 0.107 0.126 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 2.79e-01 0.124 0.115 0.126 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 1.89e-02 0.303 0.128 0.126 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 2.13e-01 0.121 0.097 0.126 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 5.56e-01 0.0432 0.0731 0.126 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 6.29e-01 0.0532 0.11 0.126 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0546 0.0952 0.126 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0916 0.105 0.126 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.92e-01 -0.127 0.12 0.126 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0342 0.112 0.126 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0621 0.0874 0.126 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0623 0.103 0.126 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0302 0.111 0.126 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0695 0.115 0.126 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 5.43e-01 0.0787 0.129 0.126 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 4.68e-01 0.0823 0.113 0.126 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 2.94e-01 0.103 0.0976 0.128 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.72e-02 -0.168 0.0881 0.128 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.41e-01 0.0468 0.141 0.128 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 2.94e-01 0.144 0.137 0.128 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.44e-01 0.119 0.126 0.128 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.13e-01 0.149 0.0935 0.128 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 7.80e-01 -0.032 0.115 0.128 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 4.60e-01 0.0402 0.0543 0.126 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 4.75e-01 0.066 0.0922 0.126 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0299 0.123 0.126 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.22e-02 -0.236 0.109 0.126 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 7.70e-02 0.167 0.0938 0.126 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 2.89e-01 0.0996 0.0938 0.126 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0896 0.0967 0.124 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 1.83e-01 -0.122 0.0912 0.124 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 2.48e-01 0.134 0.116 0.124 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.60e-01 -0.11 0.12 0.124 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 6.19e-01 0.0676 0.136 0.124 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0924 0.132 0.124 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 3.29e-01 -0.113 0.116 0.124 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0511 0.119 0.126 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.29e-01 0.0834 0.132 0.126 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.23e-01 0.0422 0.119 0.126 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.35e-02 0.313 0.146 0.126 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 4.98e-01 0.0932 0.137 0.126 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 3.12e-01 0.135 0.133 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.92e-01 0.054 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 1.87e-01 0.176 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 8.95e-01 0.0205 0.155 0.133 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.46e-01 -0.13 0.138 0.133 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 7.14e-01 0.0535 0.146 0.133 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0134 0.119 0.133 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 8.68e-02 0.275 0.159 0.133 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 1.94e-01 0.161 0.123 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.58e-01 0.149 0.132 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.46e-01 0.106 0.14 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.17e-01 0.0658 0.131 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 3.98e-01 0.106 0.125 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 5.54e-01 0.0866 0.146 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.82e-01 0.00253 0.114 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0858 0.1 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0432 0.129 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.21e-01 0.0866 0.135 0.125 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0107 0.142 0.125 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 2.39e-01 0.168 0.142 0.125 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.40e-01 -0.158 0.134 0.125 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0876 0.119 0.125 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 8.55e-01 0.0166 0.0903 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 4.64e-01 0.0803 0.109 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.117 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 4.32e-01 0.0927 0.118 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0706 0.124 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.23e-02 0.295 0.128 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.21e-01 0.0104 0.105 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.07e-01 0.0543 0.105 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.84e-01 0.141 0.131 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 2.24e-01 -0.164 0.134 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0213 0.138 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 2.46e-01 0.165 0.141 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0632 0.14 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.24e-01 0.203 0.132 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.40e-01 0.0633 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.85e-01 0.036 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.11e-01 0.0949 0.144 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 4.14e-01 0.104 0.128 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0112 0.149 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 4.17e-01 0.0646 0.0795 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0509 0.122 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0319 0.11 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0992 0.118 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 9.89e-01 0.00163 0.123 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.106 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0872 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.15e-01 0.0427 0.117 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.47e-01 0.0417 0.129 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0629 0.123 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 4.09e-01 -0.102 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.45e-01 0.107 0.113 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.48e-01 0.0423 0.132 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.49e-01 -0.049 0.153 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0214 0.134 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 5.07e-01 0.0971 0.146 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.68e-01 -0.193 0.139 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.54e-01 0.101 0.109 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0418 0.132 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.32e-01 0.104 0.133 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0343 0.133 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 7.70e-02 0.236 0.133 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.19e-01 0.206 0.132 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.58e-02 -0.233 0.111 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0116 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0402 0.132 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.11e-01 -0.133 0.131 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.44e-01 0.127 0.134 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 8.01e-01 0.0284 0.112 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.14e-01 -0.128 0.126 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 1.00e-01 -0.241 0.146 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 3.22e-01 0.153 0.154 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.23e-01 0.067 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0696 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0365 0.146 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0447 0.145 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.06e-01 0.0944 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 3.51e-01 -0.135 0.145 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.06e-01 -0.135 0.132 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0284 0.125 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.26e-02 0.243 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 4.05e-01 0.1 0.12 0.128 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0357 0.133 0.128 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 8.99e-01 0.0175 0.138 0.128 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 9.46e-02 0.226 0.135 0.128 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.15e-01 0.168 0.135 0.128 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.07e-01 0.214 0.132 0.128 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0451 0.124 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.04e-01 -0.167 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0761 0.143 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 3.29e-01 0.144 0.147 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.72e-01 0.153 0.139 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0532 0.143 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0733 0.13 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0295 0.109 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0547 0.101 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 8.63e-02 0.216 0.125 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.75e-02 -0.228 0.124 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 8.80e-01 0.022 0.146 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 6.02e-01 0.0722 0.138 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 8.32e-01 0.0261 0.123 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.47e-01 -0.123 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0736 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.05e-01 0.102 0.153 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0348 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 5.29e-01 0.0827 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 2.65e-01 -0.167 0.149 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 7.37e-01 -0.039 0.116 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 2.86e-01 -0.121 0.113 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0794 0.109 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.78e-01 0.0728 0.131 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 9.64e-01 -0.006 0.133 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.80e-01 -0.182 0.135 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 1.59e-01 -0.177 0.125 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.62e-01 0.121 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 4.63e-01 0.119 0.162 0.137 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 1.56e-01 -0.257 0.18 0.137 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 4.33e-01 0.143 0.181 0.137 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 4.08e-03 0.464 0.158 0.137 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0358 0.158 0.137 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 6.01e-01 0.0852 0.163 0.137 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 2.64e-01 -0.15 0.134 0.124 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0521 0.131 0.124 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0697 0.143 0.124 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 2.50e-01 0.156 0.135 0.124 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 4.27e-01 0.0949 0.119 0.124 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0833 0.143 0.124 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.60e-01 0.0527 0.12 0.126 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 1.54e-02 0.319 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.126 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 9.36e-01 0.0112 0.14 0.126 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 1.67e-02 -0.313 0.13 0.126 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00321 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 8.52e-01 0.0191 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 1.77e-01 -0.135 0.0996 0.124 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.73e-01 -0.109 0.151 0.124 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 9.35e-01 0.0114 0.14 0.124 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0532 0.116 0.124 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 5.48e-02 0.216 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 4.61e-01 0.0909 0.123 0.124 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 7.78e-01 0.018 0.0636 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 6.52e-01 -0.044 0.0977 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0517 0.13 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 2.58e-02 -0.265 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.12e-01 0.0127 0.115 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0195 0.102 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 8.41e-01 0.0147 0.0733 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.56e-01 0.0639 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.11e-01 -0.116 0.141 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0369 0.13 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.87e-01 0.123 0.0931 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 6.97e-01 0.0413 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 1.77e-01 -0.238 0.175 0.106 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 4.53e-01 0.133 0.177 0.106 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0898 0.191 0.106 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 2.70e-01 -0.202 0.182 0.106 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 4.30e-01 -0.133 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 8.07e-01 0.0478 0.195 0.106 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 5.33e-01 0.0538 0.0862 0.127 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 9.92e-01 0.000999 0.0987 0.127 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.148 0.127 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0726 0.134 0.127 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.88e-01 0.161 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 6.44e-02 0.226 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 3.69e-01 0.07 0.0778 0.115 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.11 0.115 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 3.44e-01 0.131 0.138 0.115 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0646 0.145 0.115 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.23e-01 0.178 0.115 0.115 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 3.83e-01 0.11 0.126 0.115 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 4.28e-01 0.0989 0.124 0.119 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0302 0.128 0.119 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 3.28e-01 0.174 0.178 0.119 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 2.65e-01 0.177 0.159 0.119 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 2.60e-01 0.161 0.142 0.119 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 8.50e-01 0.0196 0.103 0.119 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0676 0.127 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 7.82e-01 0.0256 0.0923 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.35e-01 0.155 0.13 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.12e-01 0.0833 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 7.01e-01 0.0482 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 2.91e-01 0.134 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 8.44e-01 0.0282 0.143 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00668 0.0989 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 5.64e-01 0.048 0.0831 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.09e-01 0.0684 0.103 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 5.06e-01 -0.072 0.108 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.52e-01 0.0518 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -301642 sc-eQTL 8.74e-01 0.0198 0.125 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.64e-02 0.274 0.13 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 5.71e-01 0.0567 0.0998 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 6.84e-01 0.0241 0.0591 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 6.58e-01 0.0427 0.0962 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0918 0.124 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 6.15e-02 -0.213 0.113 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 1.32e-01 0.138 0.0917 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 6.34e-01 0.0451 0.0947 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 1.78e-01 0.096 0.071 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 5.04e-01 0.0606 0.0905 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.139 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 1.68e-01 -0.185 0.134 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 2.39e-01 0.139 0.117 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 4.65e-02 0.228 0.114 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -298894 sc-eQTL 2.78e-01 -0.104 0.0952 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 57905 sc-eQTL 2.21e-01 -0.113 0.0924 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -115641 sc-eQTL 1.69e-01 0.165 0.12 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -114390 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0932 0.12 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -114188 sc-eQTL 3.39e-01 0.131 0.137 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -298553 sc-eQTL 4.04e-01 -0.11 0.131 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 sc-eQTL 1.77e-01 -0.157 0.116 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139318 DUSP6 57905 eQTL 0.0216 -0.0795 0.0346 0.00186 0.0 0.13
ENSG00000139323 POC1B -115641 eQTL 4.68e-05 0.0954 0.0233 0.0 0.0 0.13
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -115248 eQTL 0.0429 0.084 0.0415 0.0 0.0 0.13
ENSG00000274021 AC024909.1 59391 eQTL 0.026 -0.0742 0.0333 0.0 0.0 0.13

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B -115641 4.81e-06 4.99e-06 6.9e-07 3.17e-06 1.59e-06 1.66e-06 5.37e-06 1.07e-06 5.16e-06 2.5e-06 5.57e-06 3.34e-06 7.12e-06 2.33e-06 1.11e-06 3.89e-06 1.74e-06 3.75e-06 1.57e-06 1.28e-06 3.09e-06 4.93e-06 4.56e-06 1.84e-06 6.75e-06 1.96e-06 2.45e-06 1.87e-06 4.46e-06 4.36e-06 2.83e-06 4.2e-07 4.82e-07 1.83e-06 2.07e-06 1.14e-06 1.08e-06 4.57e-07 8.54e-07 5.33e-07 7.24e-07 5.76e-06 4.38e-07 1.59e-07 7.57e-07 1.03e-06 1.03e-06 7.21e-07 4.38e-07