logo

Genes within 1Mb (chr12:89270076:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00529 0.0664 0.154 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 3.47e-02 0.189 0.0891 0.154 B L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0511 0.0926 0.154 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0965 0.154 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00967 0.104 0.154 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0352 0.117 0.154 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 4.26e-01 -0.07 0.0877 0.154 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0671 0.0646 0.154 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.48e-01 0.0445 0.0972 0.154 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.34e-01 0.0401 0.0842 0.154 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 4.00e-01 0.0786 0.0932 0.154 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0456 0.107 0.154 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0259 0.0988 0.154 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0206 0.0781 0.154 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0261 0.092 0.154 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0348 0.099 0.154 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 3.23e-04 0.362 0.0991 0.154 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 9.28e-02 -0.193 0.114 0.154 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.29e-01 0.0218 0.101 0.154 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.64e-01 0.0824 0.0905 0.146 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0777 0.0822 0.146 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0153 0.131 0.146 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 9.44e-01 0.00889 0.127 0.146 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 1.55e-01 0.166 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.23e-01 0.0429 0.0871 0.146 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 3.34e-01 0.103 0.106 0.146 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0206 0.0481 0.154 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.58e-01 0.0362 0.0816 0.154 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 4.74e-01 -0.078 0.109 0.154 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 2.82e-01 0.105 0.0974 0.154 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.55e-01 -0.118 0.0831 0.154 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 8.10e-01 -0.02 0.0831 0.154 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.96e-01 0.0733 0.0861 0.152 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 3.94e-01 0.0695 0.0814 0.152 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 3.87e-01 0.0893 0.103 0.152 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 4.21e-01 0.0865 0.107 0.152 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0381 0.121 0.152 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.117 0.152 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 8.18e-02 0.179 0.102 0.152 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 5.32e-01 0.0663 0.106 0.154 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 8.06e-02 0.205 0.117 0.154 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0212 0.106 0.154 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 6.86e-01 0.0532 0.131 0.154 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 5.19e-01 0.0787 0.122 0.154 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.52e-01 0.169 0.118 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.63e-01 0.114 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.86e-02 -0.222 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 4.07e-01 -0.118 0.142 0.161 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.14e-01 0.199 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00958 0.134 0.161 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0378 0.109 0.161 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 7.84e-02 -0.259 0.146 0.161 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0935 0.111 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.29e-01 0.0409 0.118 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.83e-01 0.00267 0.125 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.53e-01 -0.168 0.117 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0288 0.112 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 8.67e-01 0.0219 0.131 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.39e-01 -0.12 0.101 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 2.60e-01 -0.101 0.0898 0.155 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 4.19e-01 0.0939 0.116 0.155 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 3.28e-01 -0.118 0.121 0.155 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 6.54e-01 0.0572 0.127 0.155 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 7.59e-01 0.0393 0.128 0.155 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 4.60e-01 0.089 0.12 0.155 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0929 0.106 0.155 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 6.84e-01 0.0322 0.0792 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 1.26e-01 0.147 0.0955 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0403 0.102 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 4.33e-01 0.081 0.103 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0128 0.108 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0319 0.114 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 7.35e-01 0.0312 0.092 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.91e-01 0.0804 0.0936 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.26e-01 0.0411 0.117 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 3.27e-01 0.117 0.12 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.64e-01 -0.171 0.122 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.17e-01 0.0132 0.126 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 3.58e-01 -0.114 0.124 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0206 0.118 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0354 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 2.80e-01 0.134 0.123 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 7.96e-01 -0.035 0.135 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00057 0.12 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.26e-01 0.043 0.123 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0725 0.139 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0571 0.0709 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0388 0.109 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0199 0.0984 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 8.57e-01 0.0191 0.105 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0167 0.11 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0405 0.0941 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0299 0.0768 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.92e-01 0.0271 0.103 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0548 0.114 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 5.11e-01 0.0712 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0577 0.127 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0518 0.109 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0398 0.0955 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 1.05e-01 0.179 0.11 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.01e-01 0.016 0.129 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.02e-01 0.184 0.112 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.123 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.117 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0785 0.0949 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 2.11e-01 -0.144 0.114 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 8.06e-01 0.0285 0.116 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 1.85e-01 -0.154 0.116 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.11e-01 0.0276 0.115 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0861 0.098 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.04e-01 0.0545 0.105 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.73e-01 0.0489 0.116 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 8.03e-02 0.202 0.115 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.118 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 5.34e-01 0.0615 0.0986 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0764 0.111 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0951 0.128 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 2.93e-01 -0.142 0.135 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.33e-01 0.179 0.119 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 4.25e-01 -0.102 0.128 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0943 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0133 0.124 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 4.99e-01 0.0859 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 8.17e-02 0.201 0.115 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0447 0.11 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.40e-01 0.187 0.126 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.156 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 1.06e-01 0.194 0.12 0.156 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.65e-01 0.00558 0.125 0.156 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 5.56e-01 0.0726 0.123 0.156 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 5.67e-01 0.0705 0.123 0.156 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.156 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 1.03e-01 0.179 0.109 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 1.16e-03 0.373 0.113 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 4.97e-01 0.0862 0.127 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 5.16e-01 0.085 0.131 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0729 0.123 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.40e-01 0.0594 0.127 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0944 0.115 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.29e-01 0.0345 0.0995 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.99e-01 0.0356 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 3.69e-01 -0.103 0.115 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 3.39e-01 0.109 0.114 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0404 0.133 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.15e-02 -0.219 0.125 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 3.13e-01 0.113 0.112 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.64e-01 0.0873 0.119 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0868 0.123 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 1.10e-01 0.222 0.138 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 8.25e-01 0.0271 0.123 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 9.45e-01 0.00827 0.119 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.57e-01 -0.154 0.135 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 5.09e-01 0.0697 0.105 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0401 0.103 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0812 0.0992 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 1.79e-01 0.16 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.15e-01 0.19 0.12 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 5.41e-01 0.0727 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0665 0.124 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 6.59e-01 0.0506 0.115 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 9.53e-01 0.0068 0.114 0.167 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.04e-01 0.0729 0.14 0.167 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.92e-01 0.0623 0.157 0.167 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 4.93e-01 -0.108 0.157 0.167 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00441 0.142 0.167 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 3.64e-01 -0.124 0.136 0.167 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.33e-01 0.0298 0.141 0.167 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.85e-01 0.0333 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 2.49e-01 0.137 0.118 0.154 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 2.77e-01 -0.14 0.129 0.154 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 2.78e-01 0.133 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 1.56e-02 0.26 0.107 0.154 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.69e-01 0.178 0.129 0.154 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0084 0.104 0.154 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 9.83e-01 0.0024 0.115 0.154 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 1.23e-01 0.2 0.129 0.154 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 5.29e-01 0.0763 0.121 0.154 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0229 0.114 0.154 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 3.49e-01 -0.104 0.111 0.154 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.96e-01 0.0785 0.0922 0.146 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 3.77e-01 -0.08 0.0903 0.146 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0936 0.137 0.146 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 2.27e-01 0.153 0.126 0.146 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.146 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.85e-01 0.0148 0.102 0.146 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 5.04e-01 0.0746 0.111 0.146 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00244 0.0562 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 4.00e-01 0.0726 0.0861 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 1.33e-01 0.173 0.115 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 6.33e-02 0.195 0.104 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.50e-01 -0.117 0.101 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 9.09e-01 0.0103 0.0896 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0633 0.0645 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0329 0.0955 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 1.04e-01 -0.202 0.124 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 3.93e-01 0.0981 0.115 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0947 0.0822 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0959 0.0932 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.15e-01 0.12 0.147 0.152 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 7.71e-01 0.043 0.148 0.152 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.51e-01 0.00979 0.16 0.152 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 5.70e-01 0.0869 0.153 0.152 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0524 0.141 0.152 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0926 0.162 0.152 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 2.00e-01 0.098 0.0762 0.149 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0173 0.0876 0.149 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0633 0.131 0.149 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0867 0.119 0.149 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0469 0.109 0.149 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 9.42e-01 0.00794 0.109 0.149 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 4.15e-01 0.0562 0.0688 0.154 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0574 0.0977 0.154 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.08e-01 0.0297 0.122 0.154 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00449 0.129 0.154 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0135 0.102 0.154 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 1.85e-01 0.147 0.111 0.154 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0216 0.104 0.15 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 9.37e-01 0.00844 0.107 0.15 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 2.73e-01 0.164 0.149 0.15 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 9.96e-01 0.000634 0.133 0.15 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0109 0.12 0.15 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0624 0.0862 0.15 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 2.33e-01 0.127 0.106 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 2.00e-01 -0.107 0.0834 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.70e-01 0.0506 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0167 0.115 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 6.55e-01 0.0509 0.114 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 6.63e-01 0.0502 0.115 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 6.24e-01 0.0638 0.13 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0862 0.0894 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 9.40e-01 0.00549 0.0733 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 3.79e-02 0.189 0.0904 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0122 0.0955 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000123 0.101 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -441972 sc-eQTL 9.18e-01 0.0113 0.11 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 2.68e-01 -0.128 0.116 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0483 0.088 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0094 0.0523 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 5.79e-01 0.0473 0.0851 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 9.37e-01 0.00865 0.11 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.1 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.48e-01 -0.118 0.0811 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0271 0.0837 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0143 0.0627 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0385 0.0795 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 7.45e-01 0.0397 0.122 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 2.93e-01 -0.124 0.118 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0476 0.103 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 3.89e-01 0.087 0.101 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -439224 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0261 0.0861 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -82425 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00127 0.0837 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -255971 sc-eQTL 2.70e-01 0.12 0.108 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -254720 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -254518 sc-eQTL 8.20e-01 0.0282 0.124 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -438883 sc-eQTL 1.22e-01 -0.183 0.118 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -80939 sc-eQTL 2.19e-01 0.129 0.105 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000246363 LINC02458 -39490 eQTL 0.000109 0.138 0.0356 0.0123 0.0108 0.144

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 \N -255971 1.47e-06 1.29e-06 2.73e-07 1.26e-06 4.85e-07 6.42e-07 1.32e-06 5.78e-07 1.78e-06 7.41e-07 2e-06 1.26e-06 2.57e-06 4.19e-07 3.64e-07 1.1e-06 1.04e-06 1.21e-06 5.56e-07 7.62e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.47e-06 9.49e-07 2.43e-06 1.22e-06 1.05e-06 9.33e-07 1.66e-06 1.3e-06 8.35e-07 2.86e-07 3.97e-07 1.01e-06 5.93e-07 7.36e-07 7.82e-07 3.68e-07 6.22e-07 2.32e-07 3.05e-07 1.88e-06 3.48e-07 1.06e-07 3.48e-07 3.04e-07 4.27e-07 2.49e-07 2.13e-07
ENSG00000246363 LINC02458 -39490 1e-05 1.04e-05 2.45e-06 7.37e-06 2.95e-06 5.82e-06 1.38e-05 2.78e-06 1.09e-05 5.9e-06 1.41e-05 6.43e-06 2e-05 4.06e-06 3.8e-06 8.18e-06 6.78e-06 1.11e-05 4.21e-06 4.13e-06 7e-06 1.15e-05 1.12e-05 5.62e-06 1.95e-05 5.34e-06 7.21e-06 5.08e-06 1.43e-05 1.45e-05 7.11e-06 1.45e-06 1.87e-06 5.67e-06 5.63e-06 4.43e-06 2.85e-06 2.71e-06 3.61e-06 2.66e-06 1.82e-06 1.4e-05 2.21e-06 5.01e-07 2.04e-06 2.47e-06 2.71e-06 1.4e-06 1.39e-06