Genes within 1Mb (chr12:89258310:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0425 0.0599 0.201 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.96e-02 0.176 0.0803 0.201 B L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.48e-01 0.0161 0.0836 0.201 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.50e-01 0.0395 0.087 0.201 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0313 0.0935 0.201 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0916 0.106 0.201 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0683 0.0791 0.201 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0539 0.0594 0.201 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00372 0.0894 0.201 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.18e-01 0.0386 0.0774 0.201 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 4.84e-01 0.0601 0.0857 0.201 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.39e-01 -0.046 0.098 0.201 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0506 0.0908 0.201 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0131 0.0723 0.201 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0237 0.0851 0.201 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 9.39e-01 0.00701 0.0917 0.201 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.39e-03 0.299 0.0924 0.201 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 9.19e-02 -0.179 0.106 0.201 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0556 0.0935 0.201 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 2.28e-01 0.0998 0.0826 0.191 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0786 0.0751 0.191 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.81e-01 0.0494 0.12 0.191 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0156 0.116 0.191 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 4.02e-01 0.0893 0.106 0.191 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 8.85e-01 0.0115 0.0797 0.191 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 5.30e-01 0.061 0.0969 0.191 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0217 0.0434 0.201 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.93e-01 0.0629 0.0735 0.201 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 4.30e-01 0.0777 0.0983 0.201 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.27e-01 0.0428 0.0881 0.201 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 1.17e-01 -0.118 0.0749 0.201 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 8.75e-01 0.0118 0.075 0.201 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0048 0.0763 0.2 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 1.49e-01 0.104 0.0717 0.2 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 2.89e-01 0.0966 0.0909 0.2 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.79e-01 0.127 0.0946 0.2 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.106 0.2 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 7.49e-02 -0.184 0.103 0.2 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 4.06e-02 0.186 0.0903 0.2 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.84e-01 0.00196 0.0952 0.201 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.95e-01 0.09 0.106 0.201 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.25e-01 0.0335 0.0951 0.201 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.10e-01 0.044 0.118 0.201 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0563 0.11 0.201 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0119 0.112 0.209 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.57e-01 -0.124 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0642 0.127 0.209 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.56e-01 0.161 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 7.29e-01 0.0416 0.12 0.209 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 2.80e-01 -0.105 0.0972 0.209 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.27e-02 -0.28 0.13 0.209 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 1.57e-01 -0.141 0.099 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.49e-01 0.0993 0.106 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.54e-01 0.0207 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 2.11e-01 -0.132 0.105 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 3.20e-01 -0.1 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.52e-01 -0.022 0.117 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0898 0.091 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 1.96e-01 -0.105 0.081 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 9.66e-01 0.00445 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0436 0.109 0.203 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 8.75e-01 0.0181 0.115 0.203 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 7.70e-01 0.0338 0.116 0.203 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0225 0.109 0.203 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0812 0.096 0.203 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0363 0.0718 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 1.16e-01 0.137 0.0866 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0232 0.0929 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.60e-01 0.0412 0.0937 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0569 0.0983 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0923 0.103 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 9.56e-01 0.00466 0.0835 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.96e-01 0.0445 0.0838 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 9.80e-01 0.00266 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 1.48e-01 0.155 0.107 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0811 0.11 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 6.97e-01 0.0439 0.113 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0817 0.111 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0895 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.71e-01 0.0637 0.112 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.86e-01 0.117 0.11 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.37e-01 0.0248 0.12 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.21e-01 -0.038 0.106 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.83e-01 -0.016 0.109 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0165 0.124 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0656 0.0653 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0969 0.1 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0131 0.0907 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0422 0.0971 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0642 0.101 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0585 0.0867 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.19e-01 -0.045 0.0697 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0328 0.0933 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.103 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 2.11e-01 0.123 0.0979 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0612 0.115 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 2.19e-01 -0.122 0.0987 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.28e-01 0.00789 0.0871 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 5.79e-01 0.056 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.96e-01 0.0458 0.117 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 2.20e-01 0.126 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.79e-01 0.0464 0.112 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 7.61e-01 0.0326 0.107 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00158 0.0875 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0808 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 4.83e-01 0.0746 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.50e-01 0.034 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0541 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.63e-01 0.0522 0.0901 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 6.09e-01 0.0494 0.0966 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 5.65e-01 0.0613 0.106 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 9.94e-02 0.175 0.106 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0793 0.108 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 6.59e-01 0.04 0.0906 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0301 0.102 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0217 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0429 0.124 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 5.79e-02 0.207 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0601 0.117 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.14e-01 -0.077 0.118 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0493 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 4.01e-01 0.0989 0.118 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 3.05e-02 0.231 0.106 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 5.56e-01 -0.06 0.102 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 6.50e-01 0.0536 0.118 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 1.59e-01 -0.139 0.098 0.197 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 5.49e-01 0.0651 0.109 0.197 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.113 0.197 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.46e-01 0.161 0.111 0.197 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0238 0.111 0.197 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 8.84e-01 0.0158 0.109 0.197 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 4.40e-01 0.0757 0.0978 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 5.19e-04 0.354 0.1 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.73e-01 0.0491 0.116 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 2.52e-01 -0.126 0.109 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0681 0.113 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0916 0.102 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0316 0.0881 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.25e-01 0.0802 0.0813 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.61e-01 -0.031 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 9.51e-02 0.168 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 1.99e-01 -0.151 0.118 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.13e-02 -0.24 0.111 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 4.39e-01 0.0769 0.0991 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0558 0.105 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0394 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.25e-02 0.26 0.121 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0394 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0488 0.105 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0713 0.119 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 5.00e-01 0.0626 0.0927 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 2.53e-01 -0.105 0.0915 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0223 0.0882 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.42e-01 0.1 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 3.16e-01 0.108 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0181 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 2.92e-01 0.107 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0895 0.101 0.226 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 4.82e-01 0.0875 0.124 0.226 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.64e-01 0.0419 0.139 0.226 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.81e-01 -0.186 0.138 0.226 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 2.18e-01 -0.155 0.125 0.226 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.23e-01 0.0596 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0371 0.125 0.226 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0178 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.96e-01 0.109 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0432 0.114 0.2 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 5.81e-01 0.0596 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 3.72e-02 0.198 0.0944 0.2 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.81e-01 0.1 0.114 0.2 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0732 0.0936 0.201 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 5.85e-01 0.0568 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.41e-02 0.217 0.117 0.201 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 2.93e-01 0.115 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 7.33e-01 0.0353 0.103 0.201 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0959 0.1 0.201 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 7.02e-01 0.0321 0.0838 0.188 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0951 0.0819 0.188 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 5.96e-01 0.066 0.124 0.188 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 4.38e-01 0.0892 0.115 0.188 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0701 0.0949 0.188 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 6.36e-01 -0.044 0.0928 0.188 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 5.47e-01 0.0611 0.101 0.188 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00676 0.0504 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 2.48e-01 0.0894 0.0771 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.37e-02 0.219 0.102 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 1.28e-01 0.144 0.094 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 1.07e-01 -0.147 0.0906 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 4.76e-01 0.0573 0.0803 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0327 0.0582 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 8.72e-01 0.0139 0.0862 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.97e-01 -0.095 0.112 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0756 0.103 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 1.66e-01 -0.103 0.074 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 1.12e-01 -0.133 0.0837 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 4.76e-01 0.0944 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.38e-01 0.128 0.133 0.194 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.27e-01 0.0502 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.20e-01 0.0683 0.137 0.194 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 5.17e-01 -0.082 0.126 0.194 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0387 0.146 0.194 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 7.39e-01 0.0229 0.0686 0.198 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00225 0.0785 0.198 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00466 0.118 0.198 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.59e-01 0.0329 0.107 0.198 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0155 0.0975 0.198 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0386 0.0974 0.198 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.12e-01 0.00695 0.0631 0.201 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000364 0.0894 0.201 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 7.78e-01 0.0316 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 9.69e-01 0.00462 0.118 0.201 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 9.65e-01 0.00408 0.0933 0.201 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 4.39e-02 0.204 0.101 0.201 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 8.10e-01 0.0226 0.094 0.198 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0178 0.0967 0.198 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.33e-01 0.13 0.134 0.198 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0418 0.12 0.198 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 8.84e-01 0.0158 0.108 0.198 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 1.94e-01 -0.101 0.0774 0.198 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 3.34e-01 0.0927 0.0956 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 6.51e-02 -0.139 0.0749 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.69e-01 0.0963 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 6.62e-01 0.0454 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.63e-01 0.0448 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 7.10e-01 0.0387 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0506 0.117 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 1.58e-01 -0.114 0.0805 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0684 0.0662 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 4.04e-02 0.169 0.0819 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 8.02e-01 0.0217 0.0865 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 9.08e-01 0.0107 0.0917 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -453738 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00491 0.0997 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 1.25e-01 -0.161 0.105 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0586 0.0797 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 9.79e-01 0.00124 0.0471 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 3.03e-01 0.079 0.0764 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 2.93e-01 0.104 0.0988 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 4.10e-01 0.0749 0.0908 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 8.18e-02 -0.127 0.0728 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 9.84e-01 0.00148 0.0754 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0585 0.0566 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0113 0.0721 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 3.85e-01 0.0959 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0529 0.107 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 7.24e-01 0.0332 0.0937 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 3.33e-01 0.0884 0.0912 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -450990 sc-eQTL 1.54e-01 -0.109 0.0763 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 sc-eQTL 5.59e-01 0.0436 0.0745 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -267737 sc-eQTL 2.27e-01 0.117 0.0964 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -266486 sc-eQTL 6.66e-02 0.177 0.096 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -266284 sc-eQTL 2.63e-01 -0.124 0.11 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -450649 sc-eQTL 2.43e-02 -0.237 0.105 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -92705 sc-eQTL 8.47e-02 0.161 0.093 0.198 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139318 DUSP6 -94191 eQTL 0.0258 0.0659 0.0295 0.0011 0.0 0.187
ENSG00000246363 LINC02458 -51256 eQTL 1.86e-05 0.134 0.0311 0.0669 0.054 0.187


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 \N -267737 1.19e-06 1.01e-06 3.18e-07 1.14e-06 2.28e-07 5.63e-07 1.6e-06 3.49e-07 1.4e-06 4.44e-07 1.74e-06 6.63e-07 2.29e-06 3.03e-07 5.73e-07 8.79e-07 8.06e-07 7.19e-07 8.26e-07 6.72e-07 4.99e-07 1.42e-06 8.84e-07 6.4e-07 2.21e-06 3.63e-07 9.41e-07 6.51e-07 1.29e-06 1.23e-06 6.97e-07 7.37e-08 1.87e-07 5.64e-07 5.49e-07 4.5e-07 4.82e-07 1.69e-07 3.6e-07 2.51e-07 2.59e-07 1.65e-06 2.48e-07 1.38e-07 1.55e-07 9.85e-08 2.37e-07 5.39e-08 1.91e-07
ENSG00000246363 LINC02458 -51256 9.43e-06 1.01e-05 1.36e-06 6.13e-06 2.17e-06 4.42e-06 1.07e-05 1.92e-06 9.72e-06 5.11e-06 1.24e-05 5.26e-06 1.64e-05 3.63e-06 2.19e-06 6.52e-06 4.55e-06 7.74e-06 2.67e-06 2.93e-06 4.66e-06 9.34e-06 7.22e-06 3.08e-06 1.42e-05 3.1e-06 4.67e-06 3.44e-06 9.57e-06 9.42e-06 5.51e-06 9.97e-07 1.19e-06 2.92e-06 4.62e-06 2.66e-06 1.74e-06 1.87e-06 2.15e-06 1.04e-06 9.9e-07 1.3e-05 1.48e-06 1.9e-07 6.81e-07 1.32e-06 1.21e-06 7.2e-07 4.34e-07