logo

Genes within 1Mb (chr12:89071721:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0983 0.0962 0.062 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0535 0.131 0.062 B L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0238 0.135 0.062 B L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.23e-02 0.309 0.177 0.062 B L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 1.57e-01 0.189 0.133 0.062 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0498 0.14 0.062 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 8.69e-01 0.0249 0.15 0.062 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0499 0.17 0.062 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0823 0.127 0.062 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0951 0.0954 0.062 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00164 0.144 0.062 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 3.32e-02 0.264 0.123 0.062 CD4T L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 7.81e-02 0.233 0.131 0.062 CD4T L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.52e-01 0.0393 0.124 0.062 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 5.33e-01 0.0861 0.138 0.062 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 2.54e-01 -0.18 0.157 0.062 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 2.22e-01 0.178 0.146 0.062 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 1.14e-01 -0.183 0.115 0.062 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.062 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.32e-01 0.0126 0.147 0.062 CD8T L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.062 CD8T L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.23e-01 0.044 0.124 0.062 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0445 0.152 0.062 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 8.60e-01 0.0303 0.171 0.062 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 9.22e-01 0.0147 0.15 0.062 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.68e-01 -0.112 0.125 0.065 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0369 0.113 0.065 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 1.77e-01 -0.243 0.18 0.065 DC L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0993 0.162 0.065 DC L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 2.26e-01 -0.209 0.172 0.065 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 6.78e-01 0.0728 0.175 0.065 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.36e-01 -0.125 0.16 0.065 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.065 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 8.36e-01 0.0302 0.146 0.065 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0983 0.0703 0.062 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 9.76e-01 0.00354 0.12 0.062 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 6.94e-01 0.0631 0.16 0.062 Mono L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 6.14e-01 0.0738 0.146 0.062 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 4.56e-01 -0.107 0.143 0.062 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 3.98e-01 0.104 0.122 0.062 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 2.97e-02 -0.264 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.34e-01 -0.12 0.124 0.062 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.73e-01 -0.034 0.118 0.062 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.87e-01 0.00245 0.149 0.062 NK L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 4.02e-01 0.144 0.172 0.062 NK L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0478 0.14 0.062 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 1.68e-03 -0.482 0.152 0.062 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 3.07e-01 -0.179 0.174 0.062 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 5.37e-01 -0.105 0.169 0.062 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 3.96e-01 -0.126 0.149 0.062 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 1.71e-01 -0.201 0.146 0.062 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 2.09e-01 -0.205 0.163 0.062 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.86e-01 -0.04 0.147 0.062 Other_T L1
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 1.25e-01 0.274 0.178 0.062 Other_T L1
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0107 0.156 0.062 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.33e-01 0.0622 0.182 0.062 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 7.06e-01 0.0641 0.169 0.062 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 1.79e-01 0.221 0.164 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.04e-01 -0.181 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 2.93e-01 -0.181 0.172 0.066 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.14e-01 -0.25 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 9.53e-01 0.00999 0.169 0.066 B_Activated L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.11e-01 -0.129 0.195 0.066 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 9.77e-01 0.00526 0.179 0.066 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 4.26e-01 -0.15 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.72e-01 0.111 0.154 0.066 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 1.60e-01 -0.292 0.207 0.066 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 4.31e-01 0.123 0.156 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0928 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 1.59e-01 -0.249 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 3.73e-01 0.16 0.179 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 4.29e-01 0.129 0.163 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 2.91e-01 0.175 0.166 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 5.54e-01 0.0939 0.159 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 8.71e-01 -0.03 0.185 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0171 0.143 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 9.95e-01 0.000789 0.129 0.062 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 3.08e-01 -0.169 0.166 0.062 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 8.67e-01 0.029 0.173 0.062 B_Memory L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0131 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 1.57e-01 0.257 0.181 0.062 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0959 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 5.72e-01 0.104 0.183 0.062 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0289 0.172 0.062 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 3.22e-01 0.151 0.152 0.062 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.90e-01 0.0314 0.118 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00253 0.143 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.89e-01 0.162 0.152 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 3.77e-01 0.159 0.179 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0574 0.16 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.58e-01 0.0475 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0106 0.162 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 1.41e-01 -0.249 0.169 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 3.74e-01 -0.122 0.137 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.80e-01 0.0372 0.133 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 2.79e-01 -0.18 0.165 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.28e-01 0.0591 0.17 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 5.27e-02 0.351 0.18 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 1.71e-01 0.236 0.172 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 9.58e-01 0.00915 0.174 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 5.78e-01 0.0993 0.178 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.49e-01 0.133 0.176 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0814 0.167 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 5.84e-01 0.094 0.172 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0724 0.168 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0122 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.02e-01 0.0435 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 8.07e-01 -0.045 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 3.16e-01 -0.163 0.162 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.00e-01 -0.14 0.166 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 6.42e-01 0.0881 0.189 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0886 0.104 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.60e-01 0.0487 0.159 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.83e-02 0.315 0.142 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 5.04e-01 0.0988 0.148 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0452 0.134 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 3.78e-01 0.136 0.154 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.82e-02 -0.316 0.159 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 2.76e-01 0.15 0.138 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0539 0.113 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 4.11e-01 -0.124 0.151 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00642 0.167 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 6.87e-02 0.316 0.172 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 3.00e-01 0.154 0.148 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0914 0.159 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 1.89e-02 0.434 0.184 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 2.52e-01 0.184 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 5.36e-02 -0.27 0.139 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 4.88e-01 -0.113 0.162 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.44e-01 0.0618 0.189 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 5.44e-01 0.114 0.187 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.59e-01 0.0543 0.177 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0229 0.165 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 1.54e-01 -0.257 0.18 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 5.01e-01 0.116 0.173 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0846 0.14 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 4.87e-01 0.118 0.169 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 5.41e-01 0.104 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 9.13e-01 0.0191 0.176 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 4.52e-01 -0.121 0.161 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.49e-01 0.0324 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 9.48e-01 0.0112 0.171 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 1.29e-01 0.257 0.169 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 8.04e-01 0.0368 0.148 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 5.52e-02 -0.303 0.157 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 6.32e-01 0.0838 0.175 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00833 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 9.15e-01 0.017 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 4.78e-01 -0.124 0.174 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 3.85e-01 0.155 0.178 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0414 0.149 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 8.37e-01 0.0332 0.162 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 5.05e-01 -0.125 0.187 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 8.38e-01 0.0403 0.197 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 4.42e-01 -0.146 0.19 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 1.62e-01 0.262 0.187 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.87e-01 0.047 0.174 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 1.10e-01 -0.275 0.171 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0566 0.186 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 1.44e-01 -0.268 0.183 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 9.31e-01 0.0155 0.18 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.56e-02 0.408 0.181 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 2.09e-01 -0.222 0.176 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 3.00e-01 0.194 0.186 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.85e-02 -0.293 0.166 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.53e-01 0.119 0.158 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 8.06e-01 0.0452 0.184 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 2.57e-01 -0.169 0.149 0.063 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 3.30e-02 -0.35 0.163 0.063 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 4.02e-01 0.144 0.171 0.063 MAIT L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 2.67e-02 0.383 0.172 0.063 MAIT L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0536 0.166 0.063 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 1.29e-01 0.255 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.33e-01 0.132 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 6.07e-01 0.0847 0.165 0.063 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 2.99e-01 -0.162 0.155 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 3.63e-01 -0.149 0.164 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 5.34e-01 0.111 0.179 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 4.37e-01 0.138 0.177 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 9.21e-01 0.0178 0.178 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 4.30e-02 -0.372 0.183 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 5.29e-01 -0.11 0.174 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 9.70e-01 0.00672 0.179 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0135 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00819 0.14 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0342 0.129 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0444 0.162 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.49e-01 -0.035 0.184 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0601 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.41e-02 -0.276 0.159 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 9.34e-01 0.0155 0.188 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 4.31e-01 -0.14 0.177 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0505 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.13e-02 -0.368 0.17 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0298 0.178 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 1.54e-01 0.286 0.199 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 4.31e-01 -0.139 0.177 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.45e-01 0.12 0.198 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 3.16e-03 -0.517 0.173 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0725 0.172 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 1.87e-01 -0.259 0.195 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 2.49e-01 -0.175 0.152 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 2.96e-01 -0.153 0.146 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 2.88e-01 -0.15 0.141 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0216 0.169 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 1.10e-01 0.28 0.175 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 4.93e-01 -0.11 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 1.73e-02 -0.407 0.169 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 3.02e-01 -0.174 0.168 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0467 0.176 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 3.90e-01 -0.14 0.162 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 9.54e-01 0.00975 0.167 0.063 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 3.04e-01 -0.211 0.204 0.063 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 3.43e-01 0.218 0.228 0.063 PB L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.04e-01 -0.057 0.229 0.063 PB L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 2.09e-01 0.246 0.195 0.063 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0991 0.23 0.063 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 8.14e-02 0.36 0.205 0.063 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0474 0.2 0.063 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.23e-01 0.0731 0.206 0.063 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0982 0.179 0.059 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 6.28e-01 0.0846 0.174 0.059 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 3.20e-01 0.188 0.189 0.059 Pro_T L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0439 0.178 0.059 Pro_T L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.59e-01 0.109 0.187 0.059 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 5.65e-01 -0.104 0.18 0.059 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 4.50e-01 -0.12 0.158 0.059 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0545 0.19 0.059 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0453 0.149 0.062 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0406 0.165 0.062 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.08e-01 0.236 0.187 0.062 Treg L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0147 0.184 0.062 Treg L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 6.46e-01 0.0813 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 1.98e-01 0.224 0.173 0.062 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 5.05e-01 -0.11 0.164 0.062 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 2.99e-01 0.166 0.159 0.062 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 6.29e-01 0.062 0.128 0.063 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0542 0.125 0.063 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 3.54e-01 -0.176 0.189 0.063 cDC L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 1.21e-01 -0.251 0.161 0.063 cDC L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 4.92e-01 -0.129 0.187 0.063 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 5.63e-02 0.334 0.174 0.063 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 2.48e-01 -0.168 0.145 0.063 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00268 0.142 0.063 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 8.14e-01 0.0365 0.155 0.063 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 4.59e-02 -0.163 0.0811 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0282 0.126 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.67e-01 0.0499 0.168 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.92e-01 0.0871 0.162 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 3.01e-01 -0.159 0.153 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 3.07e-01 0.151 0.148 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 1.53e-02 -0.315 0.129 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 2.60e-02 -0.21 0.0936 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 3.35e-01 -0.135 0.14 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 4.06e-01 -0.152 0.182 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.98e-01 0.093 0.176 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 3.73e-01 0.15 0.168 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.91e-01 0.0321 0.121 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00824 0.137 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 4.14e-02 -0.43 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 1.68e-02 -0.505 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.52e-01 0.014 0.23 0.064 gdT L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 3.94e-01 -0.182 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0356 0.233 0.064 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.68e-02 -0.388 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0785 0.202 0.064 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0743 0.234 0.064 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0354 0.113 0.062 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0241 0.129 0.062 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 5.12e-01 0.127 0.194 0.062 intMono L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0813 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.24e-01 0.0393 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0489 0.161 0.062 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0269 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0294 0.0998 0.061 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 2.02e-02 0.327 0.14 0.061 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 3.11e-01 0.18 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.23e-01 0.109 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 2.87e-01 -0.198 0.186 0.061 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 4.56e-01 0.11 0.147 0.061 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 4.94e-01 -0.11 0.161 0.061 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.50e-02 -0.259 0.145 0.068 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0987 0.15 0.068 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 2.64e-01 -0.234 0.208 0.068 pDC L2
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 2.92e-01 0.176 0.166 0.068 pDC L2
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 1.79e-01 -0.262 0.194 0.068 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0637 0.187 0.068 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0189 0.168 0.068 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0405 0.121 0.068 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0808 0.149 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 7.55e-01 0.038 0.122 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 1.25e-01 -0.264 0.171 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 1.92e-01 -0.218 0.166 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 8.82e-01 0.0276 0.186 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 2.14e-01 0.194 0.156 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 9.35e-01 0.0134 0.165 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 5.41e-01 0.102 0.167 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0257 0.189 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 8.76e-01 0.0204 0.13 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 5.11e-01 0.0697 0.106 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0461 0.132 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 5.10e-01 0.091 0.138 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 2.11e-02 0.406 0.175 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 2.05e-01 0.19 0.149 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.59e-01 0.0261 0.147 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -640327 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00847 0.159 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 7.80e-01 -0.047 0.168 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 2.98e-01 -0.133 0.127 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 2.06e-02 -0.176 0.0756 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 7.24e-01 -0.044 0.125 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0487 0.161 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 5.13e-01 0.104 0.159 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0347 0.148 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 5.01e-01 0.0804 0.119 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 8.93e-02 -0.208 0.122 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 1.96e-01 0.119 0.092 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 4.21e-02 0.237 0.116 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 4.96e-01 0.122 0.179 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 9.18e-01 0.0166 0.162 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0305 0.174 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 5.73e-01 0.0861 0.152 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 3.15e-01 -0.149 0.148 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -637579 sc-eQTL 3.65e-01 -0.11 0.121 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 -280780 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0194 0.118 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -454326 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00899 0.153 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139324 TMTC3 929425 sc-eQTL 7.37e-01 0.057 0.17 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198707 CEP290 929633 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0431 0.146 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -453075 sc-eQTL 1.60e-03 -0.478 0.15 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -452873 sc-eQTL 3.83e-01 -0.153 0.175 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -637238 sc-eQTL 4.79e-01 -0.119 0.167 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 -279294 sc-eQTL 3.80e-01 -0.13 0.148 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139318 \N -280780 1.28e-06 9e-07 2.45e-07 9.29e-07 3.5e-07 5.88e-07 1.64e-06 4.08e-07 1.47e-06 5.9e-07 1.84e-06 7.79e-07 2.25e-06 3e-07 5.62e-07 9.92e-07 8.94e-07 7.89e-07 8.15e-07 6.56e-07 8.02e-07 1.72e-06 8.89e-07 5.59e-07 2.27e-06 7.4e-07 9.29e-07 7.45e-07 1.48e-06 1.32e-06 6.68e-07 2.24e-07 2.5e-07 6.19e-07 5.93e-07 4.91e-07 6.91e-07 2.31e-07 5.03e-07 3.13e-07 2.88e-07 1.56e-06 9.55e-08 4.19e-08 2.47e-07 1.19e-07 2.29e-07 3.73e-08 1.82e-07
ENSG00000274021 \N -279294 1.28e-06 9.2e-07 2.59e-07 9.69e-07 3.36e-07 5.92e-07 1.6e-06 4.11e-07 1.5e-06 6.05e-07 1.84e-06 7.84e-07 2.31e-06 3.03e-07 5.65e-07 9.45e-07 9.01e-07 7.94e-07 8.3e-07 6.46e-07 8.07e-07 1.69e-06 8.95e-07 5.64e-07 2.24e-06 7.45e-07 9.35e-07 7.51e-07 1.44e-06 1.36e-06 6.73e-07 2.38e-07 2.51e-07 5.82e-07 5.85e-07 4.8e-07 6.79e-07 2.21e-07 4.8e-07 2.88e-07 3.03e-07 1.52e-06 9.6e-08 4.2e-08 2.49e-07 1.2e-07 2.3e-07 3.77e-08 1.83e-07