logo

Genes within 1Mb (chr12:114293370:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.72e-01 0.0675 0.159 0.06 B L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.44e-01 -0.125 0.132 0.06 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 6.26e-03 -0.402 0.145 0.06 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.53e-01 0.0474 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.44e-01 0.1 0.106 0.06 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 3.10e-02 -0.309 0.142 0.06 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 2.91e-01 0.107 0.101 0.06 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0639 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 2.50e-01 -0.176 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 5.87e-01 -0.103 0.188 0.059 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 4.41e-01 0.153 0.197 0.059 DC L1
ENSG00000135094 SDS 867069 sc-eQTL 1.55e-01 0.247 0.173 0.059 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 7.65e-01 0.0537 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 9.00e-01 0.0231 0.184 0.059 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 4.43e-01 0.122 0.159 0.06 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 1.85e-01 0.181 0.136 0.06 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 1.72e-01 -0.21 0.153 0.06 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 3.01e-01 -0.137 0.132 0.06 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.37e-01 0.0797 0.169 0.06 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.10e-02 -0.289 0.133 0.06 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 4.79e-01 -0.118 0.166 0.06 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 4.09e-01 -0.162 0.196 0.06 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0876 0.175 0.06 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.03e-01 -0.076 0.199 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 2.16e-01 -0.239 0.193 0.054 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 8.96e-01 0.0286 0.219 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0561 0.208 0.054 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.87e-01 0.0799 0.198 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0859 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 4.22e-01 -0.15 0.186 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.97e-01 0.0243 0.188 0.058 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.19e-01 0.0863 0.173 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 8.98e-01 0.0246 0.191 0.058 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.29e-01 0.0823 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0817 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.06e-04 -0.625 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00482 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0708 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 9.57e-01 0.00973 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 2.82e-01 -0.221 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.23e-01 -0.135 0.211 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 2.53e-01 -0.242 0.211 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.12e-01 0.0638 0.126 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 2.23e-02 -0.339 0.147 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 4.27e-01 0.113 0.142 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 4.57e-01 -0.111 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.49e-02 -0.32 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 4.70e-01 -0.129 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 2.63e-01 -0.191 0.17 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 8.01e-01 0.0498 0.197 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0378 0.197 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 1.47e-01 -0.248 0.171 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 4.90e-01 -0.134 0.193 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.74e-01 -0.122 0.137 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 1.89e-01 -0.212 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 5.67e-02 0.368 0.192 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0101 0.19 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 4.66e-01 -0.15 0.205 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 9.29e-02 0.331 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0626 0.208 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 8.15e-01 0.0477 0.204 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.27e-01 0.0408 0.187 0.056 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0517 0.183 0.056 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 8.74e-01 0.031 0.195 0.056 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.89e-01 0.0756 0.188 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.97e-01 0.1 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 4.28e-01 0.153 0.193 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 4.59e-01 0.139 0.187 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000112 0.155 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 5.40e-01 -0.111 0.181 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 9.85e-01 0.0037 0.195 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 4.34e-01 -0.156 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 6.36e-02 -0.374 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0297 0.173 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 4.42e-02 -0.325 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 9.15e-01 -0.019 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 7.91e-01 0.0577 0.217 0.063 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0192 0.221 0.063 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 1.37e-01 -0.307 0.205 0.063 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0991 0.197 0.059 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 9.75e-01 0.00604 0.189 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 2.22e-03 -0.59 0.19 0.059 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 1.02e-01 -0.283 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 4.80e-01 0.114 0.161 0.06 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 5.18e-01 0.121 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 3.60e-01 -0.192 0.209 0.054 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 7.60e-01 0.064 0.209 0.054 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 867069 sc-eQTL 3.20e-02 0.375 0.173 0.054 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 5.35e-01 0.116 0.187 0.054 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.54e-01 0.0641 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 9.31e-01 -0.015 0.173 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 2.11e-01 0.191 0.153 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 1.65e-01 -0.219 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 3.39e-01 -0.142 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.19e-01 0.0428 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.72e-02 0.332 0.174 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 8.63e-01 0.0288 0.166 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 2.85e-01 -0.173 0.161 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0192 0.234 0.052 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.68e-01 0.225 0.249 0.052 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0691 0.236 0.052 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 1.08e-01 0.304 0.188 0.062 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.52e-01 -0.104 0.174 0.062 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 3.08e-01 -0.186 0.182 0.062 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0124 0.168 0.062 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 3.36e-01 0.162 0.168 0.061 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 9.02e-01 0.0238 0.193 0.061 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 2.93e-01 -0.175 0.166 0.061 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0555 0.174 0.061 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0733 0.23 0.054 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 2.84e-01 0.236 0.219 0.054 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 867069 sc-eQTL 4.82e-01 0.114 0.162 0.054 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00401 0.222 0.054 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0888 0.232 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.80e-01 0.029 0.191 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0606 0.151 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 6.43e-01 -0.08 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 7.29e-01 0.0557 0.161 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0927 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 3.25e-03 -0.509 0.171 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.15e-01 0.0397 0.169 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 1.06e-01 0.239 0.147 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 2.86e-01 -0.162 0.152 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 1.46e-01 -0.2 0.137 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 1.05e-01 0.255 0.157 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 2.48e-01 -0.185 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 870990 sc-eQTL 1.27e-01 -0.243 0.159 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00618 0.137 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 933877 sc-eQTL 8.96e-01 0.0227 0.174 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 327045 sc-eQTL 3.71e-02 -0.295 0.141 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 934804 sc-eQTL 3.62e-01 -0.153 0.168 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000089060 \N 933877 2.67e-07 1.11e-07 3.59e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.61e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.75e-08 1.33e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.26e-08 3.9e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.16e-08 1.33e-07 1.16e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.05e-07 1.11e-07 9.73e-08 4.03e-08 3.26e-08 8.65e-08 8.98e-08 3.77e-08 5.01e-08 9.62e-08 7.52e-08 3.55e-08 4.46e-08 1.31e-07 4.1e-08 1.53e-08 5.59e-08 1.67e-08 1.23e-07 4.09e-09 4.73e-08