logo

Genes within 1Mb (chr12:114277305:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 8.18e-01 0.0286 0.124 0.113 B L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0961 0.103 0.113 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.50e-02 -0.243 0.114 0.113 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 7.08e-01 0.0308 0.0822 0.113 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.54e-01 0.0766 0.0824 0.113 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 1.26e-01 -0.171 0.112 0.113 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00285 0.0792 0.113 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 7.92e-01 0.0254 0.0964 0.113 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00161 0.12 0.113 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 2.85e-01 -0.152 0.142 0.113 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.83e-01 0.13 0.149 0.113 DC L1
ENSG00000135094 SDS 851004 sc-eQTL 1.38e-01 0.194 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 7.77e-01 0.0383 0.135 0.113 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.91e-01 0.147 0.139 0.113 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.113 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 2.12e-01 0.133 0.107 0.113 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 3.17e-01 -0.121 0.12 0.113 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0308 0.104 0.113 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.13 0.114 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 5.72e-04 -0.355 0.101 0.114 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.63e-01 0.117 0.128 0.114 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 5.19e-01 0.0982 0.152 0.113 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 1.96e-01 -0.175 0.135 0.113 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0374 0.154 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.53e-01 -0.209 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 2.65e-01 0.184 0.165 0.107 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.22e-01 -0.156 0.157 0.107 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 7.71e-01 0.0434 0.149 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0226 0.129 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.14 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00574 0.146 0.11 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.52e-01 -0.102 0.135 0.11 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.11e-01 0.185 0.148 0.11 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 2.63e-01 0.149 0.133 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0977 0.117 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 1.40e-01 -0.215 0.146 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 9.39e-01 0.0106 0.139 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0461 0.13 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0136 0.139 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0921 0.15 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0433 0.155 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 6.60e-01 0.0686 0.156 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 8.75e-01 0.0154 0.0983 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 2.24e-01 0.11 0.0904 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.93e-02 -0.192 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.87e-01 0.0769 0.11 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.63e-01 -0.106 0.116 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.14 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 6.25e-01 0.0674 0.137 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0685 0.132 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0788 0.152 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.61e-01 -0.208 0.148 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0852 0.129 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.08e-01 0.0169 0.146 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.90e-01 -0.156 0.119 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0155 0.107 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.99e-01 0.000159 0.126 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 3.54e-02 0.312 0.147 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.05e-01 0.121 0.146 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 7.10e-01 0.0589 0.158 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 3.85e-01 0.131 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0221 0.159 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 7.75e-01 0.0444 0.155 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 2.49e-01 0.166 0.144 0.11 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0977 0.141 0.11 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 4.01e-01 0.126 0.15 0.11 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 8.01e-01 0.0368 0.146 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 6.79e-01 0.061 0.147 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 8.33e-02 0.259 0.149 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 9.22e-01 0.0143 0.145 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 9.25e-02 -0.201 0.119 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.52e-01 0.13 0.14 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 5.21e-01 0.0934 0.145 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0781 0.149 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.23e-01 -0.184 0.151 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 1.14e-03 -0.401 0.121 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.65e-01 0.152 0.136 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 6.83e-01 0.0748 0.183 0.104 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0932 0.186 0.104 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 1.25e-01 -0.267 0.173 0.104 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.70e-01 0.11 0.152 0.113 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.16e-01 -0.146 0.145 0.113 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.46e-02 -0.315 0.148 0.113 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 2.60e-01 -0.152 0.135 0.113 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0187 0.126 0.113 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 1.99e-01 0.188 0.145 0.113 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0846 0.158 0.112 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 3.39e-01 0.151 0.157 0.112 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 851004 sc-eQTL 1.30e-01 0.2 0.131 0.112 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 7.87e-01 0.038 0.141 0.112 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 4.87e-01 0.107 0.154 0.112 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.90e-01 0.0936 0.136 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 2.41e-02 0.269 0.118 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0579 0.124 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0688 0.116 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.47e-01 0.111 0.145 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 2.93e-01 0.144 0.136 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 8.65e-01 0.0221 0.13 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.35e-01 -0.122 0.126 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 5.63e-01 0.0993 0.171 0.106 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 7.51e-01 0.0582 0.183 0.106 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 2.66e-01 -0.192 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.148 0.118 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.33e-01 -0.107 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 2.78e-01 -0.155 0.142 0.118 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 6.08e-01 0.0675 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.90e-01 0.172 0.131 0.118 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 1.66e-01 -0.208 0.15 0.118 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 1.12e-01 -0.206 0.129 0.118 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0152 0.136 0.118 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.30e-01 -0.135 0.171 0.105 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0334 0.163 0.105 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 851004 sc-eQTL 3.83e-02 0.248 0.119 0.105 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0148 0.165 0.105 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 4.33e-01 0.135 0.172 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0613 0.149 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.50e-01 -0.089 0.118 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 3.71e-01 -0.12 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 4.59e-01 0.0929 0.125 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0703 0.111 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 1.93e-01 -0.177 0.136 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 3.06e-01 0.135 0.131 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 4.09e-02 0.234 0.114 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0333 0.119 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0719 0.107 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 1.44e-01 0.179 0.122 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 5.39e-03 -0.346 0.123 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 854925 sc-eQTL 8.24e-02 -0.216 0.124 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 6.08e-01 0.055 0.107 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 917812 sc-eQTL 6.26e-01 0.0655 0.134 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 310980 sc-eQTL 1.35e-04 -0.414 0.106 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 918739 sc-eQTL 4.26e-01 0.104 0.13 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000151176 PLBD2 918739 eQTL 0.0167 -0.0469 0.0196 0.00123 0.0 0.107

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina