logo

Genes within 1Mb (chr12:114248057:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 7.66e-01 0.0363 0.122 0.1 B L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.101 0.1 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0812 0.113 0.1 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.00e-01 -0.133 0.0808 0.1 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.29e-01 0.0395 0.0816 0.1 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 7.39e-01 0.0369 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.19e-01 0.0934 0.0757 0.1 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0243 0.0925 0.1 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0503 0.115 0.1 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.135 0.101 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0743 0.142 0.101 DC L1
ENSG00000135094 SDS 821756 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0485 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 9.83e-01 0.00272 0.129 0.101 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.53e-01 0.0595 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 8.60e-01 0.0215 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0355 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0759 0.101 0.1 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.31e-01 0.102 0.129 0.101 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 4.34e-01 0.0809 0.103 0.101 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 1.03e-01 0.207 0.127 0.101 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0964 0.145 0.1 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00536 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 3.53e-01 0.136 0.147 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.21e-01 -0.118 0.146 0.092 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 9.37e-01 -0.013 0.165 0.092 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 1.76e-01 -0.212 0.156 0.092 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 3.16e-01 -0.151 0.15 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.37e-01 0.125 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 8.18e-01 0.0326 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.41e-01 0.17 0.145 0.099 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 1.53e-01 0.191 0.134 0.099 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.13e-01 0.0965 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.41e-01 0.154 0.131 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.29e-02 -0.214 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0951 0.144 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.87e-01 -0.188 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.70e-01 -0.119 0.133 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.87e-01 0.0573 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0615 0.144 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.70e-01 0.133 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.26e-02 0.276 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0875 0.097 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.39e-01 0.0299 0.0897 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.51e-01 0.0688 0.115 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.26e-01 -0.133 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 5.87e-01 0.0626 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 9.39e-01 0.0107 0.139 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.39e-02 -0.331 0.134 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.84e-02 0.268 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.54e-01 0.0673 0.15 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 8.93e-01 0.0187 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00452 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 3.33e-01 -0.132 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.30e-01 0.091 0.115 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 8.00e-01 0.0264 0.104 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 2.18e-01 -0.15 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0857 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 1.78e-01 0.19 0.141 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 2.18e-01 0.188 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.13e-01 -0.242 0.152 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 4.55e-01 0.12 0.161 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 4.14e-01 0.129 0.158 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.73e-01 -0.192 0.14 0.102 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00987 0.138 0.102 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.16e-01 0.0955 0.147 0.102 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0934 0.144 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 1.73e-01 0.198 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 8.35e-01 0.0308 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.83e-01 0.0785 0.143 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 1.69e-01 0.162 0.117 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 3.40e-01 0.132 0.138 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0491 0.145 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.49e-01 0.0475 0.148 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 2.87e-01 0.16 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.28e-01 0.0609 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.75e-01 0.0769 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 6.46e-01 -0.077 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.54e-01 0.0762 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00113 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 3.27e-01 -0.141 0.143 0.102 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.90e-01 0.0367 0.137 0.102 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.23e-01 0.0696 0.142 0.102 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.38e-01 0.154 0.13 0.1 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 2.32e-01 0.145 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 8.26e-02 -0.244 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0269 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0298 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 821756 sc-eQTL 3.47e-01 -0.12 0.127 0.102 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 1.74e-01 0.184 0.135 0.102 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 1.00e-01 0.244 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.20e-01 -0.108 0.133 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 2.59e-01 0.133 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 7.46e-01 0.0394 0.121 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0983 0.114 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 8.91e-01 0.0198 0.144 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0977 0.135 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 2.20e-01 -0.157 0.127 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0125 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0756 0.162 0.088 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0768 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.99e-02 0.305 0.161 0.088 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0959 0.147 0.1 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 3.82e-01 0.118 0.135 0.1 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0492 0.141 0.1 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0761 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.97e-02 0.27 0.123 0.102 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0827 0.142 0.102 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 2.68e-01 -0.136 0.123 0.102 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0193 0.129 0.102 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 4.09e-01 -0.14 0.169 0.099 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 1.43e-01 -0.237 0.161 0.099 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 821756 sc-eQTL 2.12e-01 0.149 0.119 0.099 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 6.81e-01 0.0671 0.163 0.099 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 3.82e-01 -0.149 0.17 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 5.99e-01 0.0777 0.148 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.40e-02 0.208 0.116 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0851 0.133 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 8.06e-01 0.0307 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 6.41e-02 -0.205 0.11 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 9.08e-01 0.0157 0.135 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0346 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 4.83e-01 0.0796 0.113 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00883 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0486 0.106 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 1.67e-01 0.167 0.12 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00699 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 825677 sc-eQTL 2.47e-01 -0.142 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 8.94e-01 -0.014 0.105 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 888564 sc-eQTL 2.84e-01 0.143 0.134 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 281732 sc-eQTL 7.20e-01 0.0394 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 889491 sc-eQTL 9.73e-02 0.215 0.129 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 281732 pQTL 0.0125 -0.0684 0.0273 0.00146 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina