Genes within 1Mb (chr12:113966532:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.103 0.16 B L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0496 0.0564 0.16 B L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 3.03e-01 -0.089 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 4.14e-01 0.0826 0.101 0.16 B L1
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0469 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 7.73e-01 0.0263 0.0908 0.16 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 1.94e-02 0.225 0.0955 0.16 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 7.73e-01 0.0254 0.0879 0.16 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0304 0.0685 0.16 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0399 0.054 0.16 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.58e-08 -0.375 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 9.75e-01 0.00286 0.0904 0.16 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0245 0.0869 0.16 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.68e-01 0.0985 0.0712 0.16 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 4.75e-01 0.0668 0.0933 0.16 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 2.06e-01 0.0811 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.99e-01 0.00825 0.0651 0.16 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0334 0.0645 0.16 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.90e-02 -0.172 0.0783 0.16 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 4.30e-02 0.218 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 8.39e-01 0.0183 0.0901 0.16 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0548 0.0987 0.16 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0113 0.0733 0.16 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.114 0.164 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.72e-01 0.0821 0.0916 0.164 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0841 0.119 0.164 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.71e-01 0.118 0.107 0.164 DC L1
ENSG00000135094 SDS 540231 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.79e-01 0.157 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0396 0.108 0.164 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0643 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 745438 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.099 0.164 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0903 0.164 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.03e-01 0.0258 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.49e-01 0.0584 0.0622 0.16 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0883 0.16 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00665 0.0814 0.16 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0993 0.16 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 4.15e-01 0.0699 0.0857 0.16 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 4.34e-01 0.049 0.0625 0.16 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 7.05e-01 -0.042 0.111 0.161 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.32e-01 0.0684 0.0703 0.161 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.79e-03 -0.273 0.0864 0.161 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 1.44e-01 -0.145 0.0985 0.161 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.38e-01 0.049 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 8.70e-01 0.0179 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0918 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0209 0.0657 0.16 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.37e-01 0.0684 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0146 0.0956 0.16 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 7.07e-01 0.037 0.0983 0.16 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0735 0.0989 0.16 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.71e-01 0.0366 0.126 0.16 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.119 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.91e-01 0.156 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.20e-01 0.0983 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.71e-01 -0.148 0.134 0.163 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.04e-01 0.0353 0.142 0.163 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0254 0.0886 0.163 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00492 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 2.32e-01 0.153 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.62e-01 0.176 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.125 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0945 0.0851 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.39e-02 -0.265 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0602 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0529 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0386 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.19e-02 0.211 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0386 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00472 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.29e-02 -0.202 0.0941 0.159 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0507 0.111 0.159 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.59e-02 -0.26 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 6.05e-01 0.0521 0.101 0.159 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0135 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 5.48e-01 0.0735 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.85e-01 0.161 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.91e-01 -0.144 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0599 0.0654 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00672 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00771 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.94e-01 0.0422 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0239 0.101 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0986 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 9.18e-02 -0.128 0.0757 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.92e-02 0.254 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 1.48e-01 -0.148 0.102 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 5.44e-01 0.0658 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 1.67e-01 0.158 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 5.34e-01 0.0681 0.109 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 2.90e-01 0.128 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 1.40e-01 -0.175 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 3.89e-02 -0.251 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 9.44e-01 0.00612 0.0874 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 2.38e-01 -0.147 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.41e-02 -0.278 0.112 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.74e-01 0.0131 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 9.72e-01 0.00232 0.0649 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.65e-05 -0.323 0.0732 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0433 0.0955 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00284 0.0902 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 9.57e-01 0.00447 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 6.77e-01 0.0409 0.0982 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 2.05e-01 0.0921 0.0724 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 3.43e-02 -0.197 0.0925 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0731 0.0653 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 8.79e-07 -0.47 0.0927 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 4.77e-01 0.0751 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 9.16e-01 0.00983 0.093 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 2.38e-01 0.114 0.0967 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 4.94e-01 0.0811 0.118 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0487 0.0983 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.50e-01 0.162 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.88e-01 0.0832 0.0781 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.18e-01 -0.169 0.107 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.72e-01 0.0194 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 8.64e-01 -0.019 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 4.43e-01 0.0957 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0891 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0725 0.0868 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 6.07e-02 -0.191 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 6.84e-01 0.0479 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 3.84e-01 0.0947 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.115 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 8.34e-01 0.0248 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.06e-01 0.024 0.0978 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.94e-01 -0.059 0.086 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0489 0.088 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.15e-01 0.074 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0492 0.0996 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0546 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00117 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.19e-01 0.0274 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.09e-01 0.0832 0.101 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0669 0.117 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.42e-01 0.154 0.131 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.36e-01 -0.185 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 8.50e-02 0.217 0.125 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 9.80e-01 0.00306 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0957 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 5.10e-01 -0.063 0.0954 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.133 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 1.47e-01 0.191 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 4.44e-01 -0.092 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.04e-01 0.0158 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0667 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 6.31e-01 -0.057 0.119 0.162 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0825 0.0942 0.162 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 4.59e-01 0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 4.58e-01 0.0902 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.18e-01 0.0447 0.124 0.162 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.85e-01 -0.103 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 9.14e-01 0.0136 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.42e-02 0.187 0.0922 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.13e-01 0.0822 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 6.67e-01 0.0548 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 2.90e-01 0.135 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.71e-01 0.00464 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 9.49e-01 0.00476 0.0748 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.17e-03 -0.277 0.0982 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0899 0.106 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 4.05e-01 0.0914 0.109 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0883 0.117 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0475 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 9.38e-01 0.00873 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.22e-02 -0.29 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 3.01e-01 -0.14 0.135 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.56e-02 -0.24 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 1.53e-02 -0.312 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 3.85e-01 0.0985 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.13e-01 0.0878 0.0868 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 4.38e-02 -0.214 0.105 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 3.55e-02 -0.248 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00249 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 8.69e-01 0.0193 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 7.79e-01 0.0289 0.103 0.2 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.07e-01 0.223 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.20e-01 0.0316 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0397 0.123 0.2 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0235 0.102 0.2 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.61e-01 0.0399 0.131 0.2 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.92e-01 0.175 0.134 0.2 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.24e-01 0.027 0.121 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.55e-01 -0.1 0.088 0.163 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0522 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.37e-01 0.0644 0.104 0.163 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0736 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.90e-01 0.0437 0.109 0.163 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.28e-01 0.0416 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0815 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0428 0.0802 0.16 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.58e-02 -0.195 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0198 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 1.55e-01 -0.139 0.0972 0.16 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.45e-02 0.282 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00361 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.16 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.88e-01 0.0181 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.166 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 9.61e-01 0.00634 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 540231 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0551 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.28e-01 0.0586 0.121 0.166 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0357 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 8.67e-01 -0.021 0.125 0.166 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 745438 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0299 0.093 0.166 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0531 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.63e-01 0.0631 0.0691 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.39e-01 -0.147 0.0989 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 3.73e-01 0.0803 0.09 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.68e-01 0.165 0.12 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 7.65e-02 0.181 0.102 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.14e-02 0.162 0.0955 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.82e-01 0.0612 0.0698 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.96e-01 0.0797 0.0761 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00713 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 7.17e-01 0.0448 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 7.16e-01 0.0392 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.12e-01 0.0748 0.0738 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0774 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0462 0.12 0.158 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 4.87e-02 -0.29 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.04e-02 -0.302 0.153 0.158 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0991 0.122 0.158 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 5.49e-01 0.0944 0.157 0.158 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0229 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0697 0.142 0.158 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 1.77e-01 0.117 0.0865 0.164 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 9.88e-01 0.00188 0.122 0.164 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 1.13e-01 0.19 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 2.40e-01 -0.129 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.097 0.164 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 4.53e-01 0.0662 0.088 0.158 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0822 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0533 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0843 0.129 0.158 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.158 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0909 0.0984 0.158 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 3.87e-01 0.121 0.139 0.155 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 8.14e-02 0.203 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.135 0.155 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 540231 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0992 0.0978 0.155 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0331 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.55e-01 0.00801 0.14 0.155 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 745438 sc-eQTL 9.91e-02 -0.177 0.107 0.155 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.127 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.123 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 1.44e-02 -0.238 0.0963 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 1.46e-01 -0.16 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00261 0.0815 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0333 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 1.73e-02 0.264 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 7.11e-01 0.0392 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 4.71e-02 -0.211 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0335 0.062 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0999 0.0944 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 909823 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0887 0.0955 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 6.02e-01 0.0509 0.0974 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 9.32e-01 0.00812 0.0948 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 9.95e-01 0.000643 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.17e-01 0.0681 0.068 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0959 0.0956 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.90e-01 0.0439 0.0815 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 1.81e-01 0.16 0.119 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 8.48e-02 0.17 0.0979 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 7.85e-02 0.157 0.0888 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 3.06e-01 0.0672 0.0654 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 1.31e-01 0.154 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 2.01e-01 0.0903 0.0704 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 5.85e-01 0.0571 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0692 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0279 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 544152 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.24e-02 -0.15 0.0885 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745482 sc-eQTL 9.50e-01 0.00543 0.0869 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 607039 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 988137 sc-eQTL 3.66e-01 0.0619 0.0683 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 207 sc-eQTL 3.27e-04 -0.33 0.0902 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 781053 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0975 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 781006 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607966 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00466 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 207 eQTL 2e-28 -0.163 0.0143 0.00231 0.00307 0.168


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000122965 RBM19 207 0.000374 0.000428 6.5e-05 0.000127 9.32e-05 0.000153 0.000409 8.49e-05 0.000365 0.000185 0.000442 0.00021 0.000507 0.000191 9.35e-05 0.000263 0.00018 0.000261 0.000103 8.24e-05 0.000221 0.000406 0.000332 0.000102 0.000433 0.000163 0.000218 0.000174 0.000333 0.000208 0.000236 3.2e-05 3.83e-05 7.43e-05 9.46e-05 6.02e-05 3.43e-05 3.54e-05 6.11e-05 3.78e-05 2.4e-05 0.000457 5.79e-05 5.27e-06 5.62e-05 6.34e-05 5.97e-05 3.2e-05 2.37e-05