logo

Genes within 1Mb (chr12:113966338:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 1.23e-01 -0.16 0.103 0.162 B L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0632 0.0563 0.162 B L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0951 0.0861 0.162 B L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.54e-01 0.0757 0.101 0.162 B L1
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0388 0.0821 0.162 B L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 7.39e-01 0.0303 0.0908 0.162 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.36e-02 0.237 0.0953 0.162 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 6.72e-01 0.0373 0.0878 0.162 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0337 0.0683 0.162 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0504 0.0539 0.162 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.47e-08 -0.375 0.0636 0.162 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00283 0.0902 0.162 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0203 0.0867 0.162 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.34e-01 0.107 0.071 0.162 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 3.03e-01 0.096 0.093 0.162 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.90e-01 0.0837 0.0637 0.162 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.55e-01 0.0118 0.0649 0.162 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0486 0.0643 0.162 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.97e-02 -0.183 0.078 0.162 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 5.29e-02 0.208 0.107 0.162 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 9.12e-01 0.00997 0.0898 0.162 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0428 0.0985 0.162 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0187 0.0731 0.162 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.114 0.164 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.72e-01 0.0821 0.0916 0.164 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0841 0.119 0.164 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 2.71e-01 0.118 0.107 0.164 DC L1
ENSG00000135094 SDS 540037 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.79e-01 0.157 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0396 0.108 0.164 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0643 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 745244 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.099 0.164 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0903 0.164 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.11e-01 0.0246 0.103 0.162 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.22e-01 0.0616 0.0621 0.162 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.65e-01 -0.123 0.088 0.162 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00576 0.0813 0.162 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.82e-01 0.15 0.112 0.162 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 1.55e-01 0.142 0.0992 0.162 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 3.68e-01 0.0771 0.0855 0.162 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 3.64e-01 0.0567 0.0624 0.162 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0281 0.111 0.163 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.24e-01 0.0564 0.0705 0.163 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.14e-03 -0.285 0.0864 0.163 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 1.06e-01 -0.16 0.0986 0.163 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.05e-01 0.054 0.104 0.163 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 7.47e-01 0.0353 0.109 0.163 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0724 0.124 0.162 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0322 0.0659 0.162 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.64e-01 0.0812 0.111 0.162 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00919 0.0959 0.162 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 5.97e-01 0.0522 0.0986 0.162 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.75e-01 -0.071 0.0991 0.162 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 6.94e-01 0.0497 0.126 0.162 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0965 0.119 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.51e-01 0.0917 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.02e-01 -0.171 0.134 0.166 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 6.90e-01 0.0565 0.142 0.166 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0391 0.0884 0.166 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.15e-01 0.201 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.15e-01 0.198 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.38e-01 0.12 0.125 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0838 0.0853 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 9.78e-03 -0.278 0.107 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0969 0.111 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0716 0.106 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0459 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 7.40e-02 0.21 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0512 0.11 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00129 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.162 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0579 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 1.36e-02 -0.288 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 7.16e-01 0.0366 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 9.50e-01 0.00761 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 5.22e-01 0.0783 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.62e-01 0.17 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 2.51e-01 -0.126 0.11 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0697 0.0652 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0967 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 8.44e-01 0.0223 0.113 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 9.11e-01 0.0108 0.0967 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.96e-01 0.0419 0.107 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.71e-01 0.133 0.12 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0178 0.101 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 9.68e-02 -0.126 0.0758 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.07e-01 -0.136 0.107 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 2.10e-02 0.269 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 1.34e-01 -0.153 0.102 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.01e-01 0.0567 0.108 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.21e-01 0.141 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 4.75e-01 0.0784 0.109 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 2.90e-01 0.128 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 1.40e-01 -0.175 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.89e-02 -0.251 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 9.44e-01 0.00612 0.0874 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.38e-01 -0.147 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.41e-02 -0.278 0.112 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.82e-01 0.0123 0.0826 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00551 0.0648 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.79e-05 -0.321 0.073 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0488 0.0952 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 9.58e-01 0.00476 0.09 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.74e-01 0.0131 0.0826 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 5.10e-01 0.0645 0.0979 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.82e-01 0.0967 0.0722 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.71e-02 -0.194 0.0923 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0821 0.0651 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 8.93e-07 -0.469 0.0926 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 5.73e-01 0.0594 0.105 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 8.21e-01 0.0211 0.0928 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0964 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 3.66e-01 0.107 0.118 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0392 0.0981 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 1.31e-01 0.17 0.112 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.35e-01 0.0612 0.0783 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 9.95e-02 -0.178 0.107 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 7.92e-01 0.0317 0.12 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0476 0.111 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 2.72e-01 0.128 0.116 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.92e-01 0.131 0.124 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0769 0.117 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0833 0.0868 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.51e-02 -0.204 0.101 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 6.87e-01 0.0475 0.118 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.38e-01 0.0843 0.109 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 3.84e-01 -0.101 0.115 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 8.47e-01 0.0229 0.119 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000141 0.0977 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0552 0.086 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0679 0.0879 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.90e-01 0.0783 0.113 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.95e-01 -0.039 0.0995 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0924 0.103 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 9.67e-01 0.00418 0.102 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.95e-01 0.0159 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 5.13e-01 0.0661 0.101 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0673 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.55e-01 0.122 0.132 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.57e-02 -0.213 0.123 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 4.99e-02 0.248 0.126 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 9.92e-01 0.00129 0.125 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0823 0.127 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0636 0.0955 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.46e-01 -0.155 0.133 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 1.16e-01 0.207 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0911 0.12 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 7.21e-01 0.047 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 5.61e-01 -0.073 0.125 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.50e-01 -0.071 0.119 0.165 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0917 0.0942 0.165 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.16e-01 0.0945 0.116 0.165 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.29e-01 0.0961 0.121 0.165 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 3.39e-01 0.0995 0.104 0.165 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0935 0.112 0.165 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 7.09e-01 0.0462 0.124 0.165 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 3.30e-01 -0.116 0.118 0.165 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.79e-01 0.019 0.125 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 6.41e-02 0.173 0.0927 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.22e-01 0.101 0.126 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 6.58e-01 0.0567 0.128 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 3.95e-01 0.109 0.128 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 8.39e-01 0.026 0.128 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.85e-01 0.00225 0.122 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00659 0.0749 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 3.98e-03 -0.286 0.0982 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0956 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 4.12e-01 0.0902 0.11 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0708 0.117 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0277 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00378 0.111 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.70e-02 -0.302 0.125 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.05e-01 -0.139 0.135 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 7.85e-02 -0.229 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.48e-02 -0.288 0.127 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.40e-01 0.0674 0.087 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 3.64e-02 -0.222 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.00e-02 -0.256 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 9.10e-01 0.0133 0.118 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 8.12e-01 0.0278 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.97e-01 -0.116 0.136 0.204 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 7.88e-01 0.0277 0.103 0.204 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 1.22e-01 0.214 0.137 0.204 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 8.00e-01 0.0351 0.138 0.204 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0334 0.123 0.204 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0148 0.102 0.204 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 6.93e-01 0.0515 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.87e-01 0.176 0.133 0.204 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 7.47e-01 0.0392 0.121 0.165 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 2.42e-01 -0.103 0.0879 0.165 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0505 0.116 0.165 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.91e-01 0.0718 0.104 0.165 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 4.75e-01 -0.066 0.0922 0.165 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.26e-01 0.0533 0.109 0.165 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 6.56e-01 0.0532 0.119 0.165 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.81e-01 -0.145 0.108 0.165 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.41e-01 -0.105 0.11 0.162 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0424 0.0803 0.162 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 3.33e-02 -0.217 0.101 0.162 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0143 0.12 0.162 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 1.08e-01 -0.157 0.0971 0.162 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.99e-02 0.269 0.115 0.162 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 9.59e-01 0.00614 0.119 0.162 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 5.47e-01 0.0612 0.102 0.162 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 8.88e-01 0.0181 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.166 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 9.61e-01 0.00634 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 540037 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0551 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.28e-01 0.0586 0.121 0.166 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0357 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 8.67e-01 -0.021 0.125 0.166 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 745244 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0299 0.093 0.166 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0405 0.112 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.62e-01 0.0631 0.0691 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 7.86e-02 -0.174 0.0986 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 3.65e-01 0.0817 0.09 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.74e-01 0.163 0.12 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 7.89e-02 0.18 0.102 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 9.05e-02 0.162 0.0955 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 3.14e-01 0.0704 0.0698 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.33e-01 0.117 0.121 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.34e-01 0.0737 0.0761 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0077 0.114 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 9.39e-01 -0.008 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.38e-01 0.0581 0.123 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 8.48e-01 0.0206 0.108 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.11e-01 0.131 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 2.73e-01 0.0812 0.0738 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0774 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0462 0.12 0.158 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 4.87e-02 -0.29 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 5.04e-02 -0.302 0.153 0.158 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0991 0.122 0.158 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 5.49e-01 0.0944 0.157 0.158 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0229 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0697 0.142 0.158 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.40e-02 0.208 0.124 0.167 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 1.94e-01 0.113 0.0867 0.167 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 3.49e-01 0.107 0.114 0.167 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0401 0.11 0.167 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00428 0.123 0.167 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 8.77e-02 0.204 0.119 0.167 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.72e-01 -0.151 0.11 0.167 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0971 0.167 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.53e-01 0.0662 0.088 0.158 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0822 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0533 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0843 0.129 0.158 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.158 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0909 0.0984 0.158 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.87e-01 0.121 0.139 0.155 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 8.14e-02 0.203 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.135 0.155 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 540037 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0992 0.0978 0.155 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0331 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 9.55e-01 0.00801 0.14 0.155 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 745244 sc-eQTL 9.91e-02 -0.177 0.107 0.155 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.127 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 3.31e-01 0.121 0.124 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 1.24e-01 -0.115 0.0744 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 8.06e-03 -0.257 0.0963 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 8.17e-02 -0.191 0.109 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0209 0.0817 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0204 0.116 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.08e-02 0.283 0.11 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 6.88e-01 0.0426 0.106 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 5.71e-02 -0.202 0.106 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0404 0.062 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0986 0.0944 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 2.13e-01 0.136 0.109 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 909629 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0769 0.0955 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 6.53e-01 0.0438 0.0974 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.31e-01 0.174 0.115 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 8.88e-01 0.0133 0.0948 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.64e-01 0.00501 0.11 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 3.19e-01 0.0679 0.0679 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.44e-01 -0.112 0.0954 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 5.86e-01 0.0445 0.0814 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 1.44e-01 0.174 0.119 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 1.05e-01 0.159 0.0979 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 5.55e-02 0.171 0.0887 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 2.72e-01 0.0719 0.0654 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 1.23e-01 0.158 0.102 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 1.45e-01 0.103 0.0705 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 6.75e-01 0.044 0.105 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0751 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0286 0.118 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 543958 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.104 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 1.05e-01 -0.145 0.0889 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 745288 sc-eQTL 8.50e-01 0.0165 0.0872 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 606845 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00327 0.114 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 987943 sc-eQTL 4.63e-01 0.0503 0.0685 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 13 sc-eQTL 2.07e-04 -0.341 0.0902 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 780859 sc-eQTL 8.88e-02 -0.167 0.0976 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 780812 sc-eQTL 7.28e-01 0.0364 0.104 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 607772 sc-eQTL 9.02e-01 0.0136 0.11 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 13 eQTL 6.64e-29 -0.164 0.0142 0.00706 0.00889 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000122965 RBM19 13 0.000528 0.000697 0.000127 0.000243 0.000247 0.000261 0.00059 0.000218 0.000824 0.000344 0.000813 0.000498 0.000858 0.00051 0.00017 0.000635 0.000292 0.000438 0.000292 0.0002 0.000453 0.000724 0.000483 0.000293 0.000732 0.000405 0.000531 0.000347 0.000555 0.000273 0.000463 9.43e-05 8.01e-05 0.000179 0.000155 0.000112 7.22e-05 6.92e-05 0.000127 0.000123 4.15e-05 0.000592 7.79e-05 8.13e-06 0.000101 0.000179 0.000148 8.16e-05 6.03e-05