Genes within 1Mb (chr12:113964644:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.103 0.16 B L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0496 0.0564 0.16 B L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 3.03e-01 -0.089 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 4.14e-01 0.0826 0.101 0.16 B L1
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0469 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 7.73e-01 0.0263 0.0908 0.16 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 1.94e-02 0.225 0.0955 0.16 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 7.73e-01 0.0254 0.0879 0.16 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0304 0.0685 0.16 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0399 0.054 0.16 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.58e-08 -0.375 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 9.75e-01 0.00286 0.0904 0.16 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0245 0.0869 0.16 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.68e-01 0.0985 0.0712 0.16 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 4.75e-01 0.0668 0.0933 0.16 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 2.06e-01 0.0811 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.99e-01 0.00825 0.0651 0.16 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0334 0.0645 0.16 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.90e-02 -0.172 0.0783 0.16 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 4.30e-02 0.218 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 8.39e-01 0.0183 0.0901 0.16 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0548 0.0987 0.16 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0113 0.0733 0.16 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.114 0.164 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.72e-01 0.0821 0.0916 0.164 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0841 0.119 0.164 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.71e-01 0.118 0.107 0.164 DC L1
ENSG00000135094 SDS 538343 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.79e-01 0.157 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0396 0.108 0.164 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0643 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 743550 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.099 0.164 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0903 0.164 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.03e-01 0.0258 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.49e-01 0.0584 0.0622 0.16 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0883 0.16 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00665 0.0814 0.16 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0993 0.16 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 4.15e-01 0.0699 0.0857 0.16 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 4.34e-01 0.049 0.0625 0.16 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 7.05e-01 -0.042 0.111 0.161 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.32e-01 0.0684 0.0703 0.161 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.79e-03 -0.273 0.0864 0.161 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 1.44e-01 -0.145 0.0985 0.161 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.38e-01 0.049 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 8.70e-01 0.0179 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0918 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0209 0.0657 0.16 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.37e-01 0.0684 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0146 0.0956 0.16 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 7.07e-01 0.037 0.0983 0.16 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0735 0.0989 0.16 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.71e-01 0.0366 0.126 0.16 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.119 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.91e-01 0.156 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.20e-01 0.0983 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.71e-01 -0.148 0.134 0.163 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.04e-01 0.0353 0.142 0.163 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0254 0.0886 0.163 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00492 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 2.32e-01 0.153 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.62e-01 0.176 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.125 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0945 0.0851 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.39e-02 -0.265 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0602 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0529 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0386 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.19e-02 0.211 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0386 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00472 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.29e-02 -0.202 0.0941 0.159 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0507 0.111 0.159 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.59e-02 -0.26 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 6.05e-01 0.0521 0.101 0.159 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0135 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 5.48e-01 0.0735 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.85e-01 0.161 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.91e-01 -0.144 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0599 0.0654 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00672 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00771 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.94e-01 0.0422 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0239 0.101 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0986 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 9.18e-02 -0.128 0.0757 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.92e-02 0.254 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 1.48e-01 -0.148 0.102 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 5.44e-01 0.0658 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 1.67e-01 0.158 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 5.34e-01 0.0681 0.109 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 2.90e-01 0.128 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 1.40e-01 -0.175 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 3.89e-02 -0.251 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 9.44e-01 0.00612 0.0874 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 2.38e-01 -0.147 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.41e-02 -0.278 0.112 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.74e-01 0.0131 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 9.72e-01 0.00232 0.0649 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.65e-05 -0.323 0.0732 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0433 0.0955 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00284 0.0902 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 9.57e-01 0.00447 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 6.77e-01 0.0409 0.0982 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 2.05e-01 0.0921 0.0724 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 3.43e-02 -0.197 0.0925 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0731 0.0653 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 8.79e-07 -0.47 0.0927 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 4.77e-01 0.0751 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 9.16e-01 0.00983 0.093 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 2.38e-01 0.114 0.0967 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 4.94e-01 0.0811 0.118 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0487 0.0983 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.50e-01 0.162 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.88e-01 0.0832 0.0781 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.18e-01 -0.169 0.107 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.72e-01 0.0194 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 8.64e-01 -0.019 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 4.43e-01 0.0957 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0891 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0725 0.0868 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 6.07e-02 -0.191 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 6.84e-01 0.0479 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 3.84e-01 0.0947 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.115 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 8.34e-01 0.0248 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.06e-01 0.024 0.0978 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.94e-01 -0.059 0.086 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0489 0.088 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.15e-01 0.074 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0492 0.0996 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0546 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00117 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.19e-01 0.0274 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.09e-01 0.0832 0.101 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0669 0.117 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.42e-01 0.154 0.131 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.36e-01 -0.185 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 8.50e-02 0.217 0.125 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 9.80e-01 0.00306 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0957 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 5.10e-01 -0.063 0.0954 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.133 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 1.47e-01 0.191 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 4.44e-01 -0.092 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.04e-01 0.0158 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0667 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 6.31e-01 -0.057 0.119 0.162 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0825 0.0942 0.162 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 4.59e-01 0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 4.58e-01 0.0902 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.18e-01 0.0447 0.124 0.162 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.85e-01 -0.103 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 9.14e-01 0.0136 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.42e-02 0.187 0.0922 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.13e-01 0.0822 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 6.67e-01 0.0548 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 2.90e-01 0.135 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.71e-01 0.00464 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 9.49e-01 0.00476 0.0748 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.17e-03 -0.277 0.0982 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0899 0.106 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 4.05e-01 0.0914 0.109 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0883 0.117 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0475 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 9.38e-01 0.00873 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.22e-02 -0.29 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 3.01e-01 -0.14 0.135 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.56e-02 -0.24 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 1.53e-02 -0.312 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 3.85e-01 0.0985 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.13e-01 0.0878 0.0868 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 4.38e-02 -0.214 0.105 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 3.55e-02 -0.248 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00249 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 8.69e-01 0.0193 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 7.79e-01 0.0289 0.103 0.2 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.07e-01 0.223 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.20e-01 0.0316 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0397 0.123 0.2 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0235 0.102 0.2 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.61e-01 0.0399 0.131 0.2 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.92e-01 0.175 0.134 0.2 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.24e-01 0.027 0.121 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.55e-01 -0.1 0.088 0.163 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0522 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.37e-01 0.0644 0.104 0.163 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0736 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.90e-01 0.0437 0.109 0.163 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.28e-01 0.0416 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0815 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0428 0.0802 0.16 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.58e-02 -0.195 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0198 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 1.55e-01 -0.139 0.0972 0.16 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.45e-02 0.282 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00361 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.16 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.88e-01 0.0181 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.166 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 9.61e-01 0.00634 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 538343 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0551 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.28e-01 0.0586 0.121 0.166 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0357 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 8.67e-01 -0.021 0.125 0.166 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 743550 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0299 0.093 0.166 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0531 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.63e-01 0.0631 0.0691 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.39e-01 -0.147 0.0989 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 3.73e-01 0.0803 0.09 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.68e-01 0.165 0.12 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 7.65e-02 0.181 0.102 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.14e-02 0.162 0.0955 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.82e-01 0.0612 0.0698 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.96e-01 0.0797 0.0761 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00713 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 7.17e-01 0.0448 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 7.16e-01 0.0392 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.12e-01 0.0748 0.0738 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0774 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0462 0.12 0.158 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 4.87e-02 -0.29 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.04e-02 -0.302 0.153 0.158 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0991 0.122 0.158 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 5.49e-01 0.0944 0.157 0.158 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0229 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0697 0.142 0.158 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 1.77e-01 0.117 0.0865 0.164 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 9.88e-01 0.00188 0.122 0.164 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 1.13e-01 0.19 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 2.40e-01 -0.129 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.097 0.164 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 4.53e-01 0.0662 0.088 0.158 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0822 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0533 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0843 0.129 0.158 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.158 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0909 0.0984 0.158 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 3.87e-01 0.121 0.139 0.155 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 8.14e-02 0.203 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.135 0.155 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 538343 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0992 0.0978 0.155 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0331 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.55e-01 0.00801 0.14 0.155 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 743550 sc-eQTL 9.91e-02 -0.177 0.107 0.155 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.127 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.123 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 1.44e-02 -0.238 0.0963 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 1.46e-01 -0.16 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00261 0.0815 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0333 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 1.73e-02 0.264 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 7.11e-01 0.0392 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 4.71e-02 -0.211 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0335 0.062 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0999 0.0944 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 907935 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0887 0.0955 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 6.02e-01 0.0509 0.0974 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 9.32e-01 0.00812 0.0948 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 9.95e-01 0.000643 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.17e-01 0.0681 0.068 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0959 0.0956 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.90e-01 0.0439 0.0815 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 1.81e-01 0.16 0.119 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 8.48e-02 0.17 0.0979 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 7.85e-02 0.157 0.0888 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 3.06e-01 0.0672 0.0654 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 1.31e-01 0.154 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 2.01e-01 0.0903 0.0704 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 5.85e-01 0.0571 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0692 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0279 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 542264 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.24e-02 -0.15 0.0885 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 743594 sc-eQTL 9.50e-01 0.00543 0.0869 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 605151 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 986249 sc-eQTL 3.66e-01 0.0619 0.0683 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -1681 sc-eQTL 3.27e-04 -0.33 0.0902 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 779165 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0975 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 779118 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 606078 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00466 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 -1681 eQTL 3.79e-29 -0.165 0.0142 0.0146 0.0144 0.17


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000122965 RBM19 -1681 0.000182 0.000265 5.79e-05 0.000132 0.000117 0.000116 0.000311 9.92e-05 0.000323 0.000208 0.000388 0.000178 0.000433 0.000135 8.76e-05 0.000236 0.000154 0.000253 0.000114 9.84e-05 0.000233 0.000333 0.000266 0.000113 0.000383 0.000146 0.0002 0.000185 0.000281 0.000166 0.000207 4.88e-05 5.05e-05 8.93e-05 0.000103 7.18e-05 6.33e-05 5.68e-05 7.3e-05 5.11e-05 3.49e-05 0.000286 3.49e-05 1.41e-05 5.47e-05 7.49e-05 7.17e-05 8.58e-05 4.23e-05