Genes within 1Mb (chr12:113963803:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.103 0.16 B L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0496 0.0564 0.16 B L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 3.03e-01 -0.089 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 4.14e-01 0.0826 0.101 0.16 B L1
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0469 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 7.73e-01 0.0263 0.0908 0.16 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 1.94e-02 0.225 0.0955 0.16 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 7.73e-01 0.0254 0.0879 0.16 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0304 0.0685 0.16 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0399 0.054 0.16 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.58e-08 -0.375 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 9.75e-01 0.00286 0.0904 0.16 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0245 0.0869 0.16 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.68e-01 0.0985 0.0712 0.16 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 4.75e-01 0.0668 0.0933 0.16 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 2.06e-01 0.0811 0.0638 0.16 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.99e-01 0.00825 0.0651 0.16 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0334 0.0645 0.16 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.90e-02 -0.172 0.0783 0.16 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 4.30e-02 0.218 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 8.39e-01 0.0183 0.0901 0.16 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0548 0.0987 0.16 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0113 0.0733 0.16 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.114 0.164 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.72e-01 0.0821 0.0916 0.164 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0841 0.119 0.164 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.71e-01 0.118 0.107 0.164 DC L1
ENSG00000135094 SDS 537502 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.79e-01 0.157 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0396 0.108 0.164 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0643 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 742709 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.099 0.164 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0903 0.164 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.03e-01 0.0258 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.49e-01 0.0584 0.0622 0.16 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0883 0.16 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00665 0.0814 0.16 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0993 0.16 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 4.15e-01 0.0699 0.0857 0.16 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 4.34e-01 0.049 0.0625 0.16 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 7.05e-01 -0.042 0.111 0.161 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.32e-01 0.0684 0.0703 0.161 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.79e-03 -0.273 0.0864 0.161 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 1.44e-01 -0.145 0.0985 0.161 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.38e-01 0.049 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 8.70e-01 0.0179 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0918 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0209 0.0657 0.16 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.37e-01 0.0684 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0146 0.0956 0.16 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 7.07e-01 0.037 0.0983 0.16 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0735 0.0989 0.16 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.71e-01 0.0366 0.126 0.16 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.119 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.91e-01 0.156 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.20e-01 0.0983 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.71e-01 -0.148 0.134 0.163 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.04e-01 0.0353 0.142 0.163 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0254 0.0886 0.163 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00492 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 2.32e-01 0.153 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.62e-01 0.176 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.125 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0945 0.0851 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.39e-02 -0.265 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0602 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0529 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0386 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.19e-02 0.211 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0386 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00472 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.29e-02 -0.202 0.0941 0.159 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0507 0.111 0.159 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.59e-02 -0.26 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 6.05e-01 0.0521 0.101 0.159 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0135 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 5.48e-01 0.0735 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.85e-01 0.161 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.91e-01 -0.144 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0599 0.0654 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00672 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00771 0.0969 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.94e-01 0.0422 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0239 0.101 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0986 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 9.18e-02 -0.128 0.0757 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.92e-02 0.254 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 1.48e-01 -0.148 0.102 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 5.44e-01 0.0658 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 1.67e-01 0.158 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 5.34e-01 0.0681 0.109 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 2.90e-01 0.128 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 1.40e-01 -0.175 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 3.89e-02 -0.251 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 9.44e-01 0.00612 0.0874 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 2.38e-01 -0.147 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.41e-02 -0.278 0.112 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.74e-01 0.0131 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 9.72e-01 0.00232 0.0649 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.65e-05 -0.323 0.0732 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0433 0.0955 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00284 0.0902 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 9.57e-01 0.00447 0.0828 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 6.77e-01 0.0409 0.0982 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 2.05e-01 0.0921 0.0724 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 3.43e-02 -0.197 0.0925 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0731 0.0653 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 8.79e-07 -0.47 0.0927 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 4.77e-01 0.0751 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 9.16e-01 0.00983 0.093 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 2.38e-01 0.114 0.0967 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 4.94e-01 0.0811 0.118 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0487 0.0983 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.50e-01 0.162 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.88e-01 0.0832 0.0781 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.18e-01 -0.169 0.107 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.72e-01 0.0194 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 8.64e-01 -0.019 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 4.43e-01 0.0957 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0891 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0725 0.0868 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 6.07e-02 -0.191 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 6.84e-01 0.0479 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 3.84e-01 0.0947 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.115 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 8.34e-01 0.0248 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.06e-01 0.024 0.0978 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.94e-01 -0.059 0.086 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0489 0.088 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.15e-01 0.074 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0492 0.0996 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0546 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00117 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.19e-01 0.0274 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.09e-01 0.0832 0.101 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0669 0.117 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.42e-01 0.154 0.131 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.36e-01 -0.185 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 8.50e-02 0.217 0.125 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 9.80e-01 0.00306 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0957 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 5.10e-01 -0.063 0.0954 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.133 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 1.47e-01 0.191 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 4.44e-01 -0.092 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.04e-01 0.0158 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0667 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 6.31e-01 -0.057 0.119 0.162 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0825 0.0942 0.162 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 4.59e-01 0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 4.58e-01 0.0902 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.18e-01 0.0447 0.124 0.162 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.85e-01 -0.103 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 9.14e-01 0.0136 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.42e-02 0.187 0.0922 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.13e-01 0.0822 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 6.67e-01 0.0548 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 2.90e-01 0.135 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.71e-01 0.00464 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 9.49e-01 0.00476 0.0748 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.17e-03 -0.277 0.0982 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0899 0.106 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 4.05e-01 0.0914 0.109 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0883 0.117 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0475 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 9.38e-01 0.00873 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.22e-02 -0.29 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 3.01e-01 -0.14 0.135 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.56e-02 -0.24 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 1.53e-02 -0.312 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 3.85e-01 0.0985 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.13e-01 0.0878 0.0868 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 4.38e-02 -0.214 0.105 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 3.55e-02 -0.248 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00249 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 8.69e-01 0.0193 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 7.79e-01 0.0289 0.103 0.2 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.07e-01 0.223 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.20e-01 0.0316 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0397 0.123 0.2 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0235 0.102 0.2 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.61e-01 0.0399 0.131 0.2 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.92e-01 0.175 0.134 0.2 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.24e-01 0.027 0.121 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.55e-01 -0.1 0.088 0.163 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0522 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.37e-01 0.0644 0.104 0.163 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0736 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.90e-01 0.0437 0.109 0.163 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.28e-01 0.0416 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0815 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0428 0.0802 0.16 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.58e-02 -0.195 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0198 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 1.55e-01 -0.139 0.0972 0.16 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.45e-02 0.282 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00361 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.16 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.88e-01 0.0181 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.166 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 9.61e-01 0.00634 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 537502 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0551 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.28e-01 0.0586 0.121 0.166 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0357 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 8.67e-01 -0.021 0.125 0.166 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 742709 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0299 0.093 0.166 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0531 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.63e-01 0.0631 0.0691 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.39e-01 -0.147 0.0989 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 3.73e-01 0.0803 0.09 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.68e-01 0.165 0.12 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 7.65e-02 0.181 0.102 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.14e-02 0.162 0.0955 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.82e-01 0.0612 0.0698 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.96e-01 0.0797 0.0761 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00713 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 7.17e-01 0.0448 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 7.16e-01 0.0392 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.12e-01 0.0748 0.0738 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0774 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0462 0.12 0.158 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 4.87e-02 -0.29 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.04e-02 -0.302 0.153 0.158 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0991 0.122 0.158 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 5.49e-01 0.0944 0.157 0.158 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0229 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0697 0.142 0.158 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 1.77e-01 0.117 0.0865 0.164 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 9.88e-01 0.00188 0.122 0.164 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 1.13e-01 0.19 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 2.40e-01 -0.129 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.097 0.164 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 4.53e-01 0.0662 0.088 0.158 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0822 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0533 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0843 0.129 0.158 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.158 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0909 0.0984 0.158 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 3.87e-01 0.121 0.139 0.155 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 8.14e-02 0.203 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.135 0.155 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 537502 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0992 0.0978 0.155 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0331 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.55e-01 0.00801 0.14 0.155 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 742709 sc-eQTL 9.91e-02 -0.177 0.107 0.155 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.127 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.123 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 1.44e-02 -0.238 0.0963 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 1.46e-01 -0.16 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00261 0.0815 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0333 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 1.73e-02 0.264 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 7.11e-01 0.0392 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 4.71e-02 -0.211 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0335 0.062 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0999 0.0944 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 907094 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0887 0.0955 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 6.02e-01 0.0509 0.0974 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 9.32e-01 0.00812 0.0948 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 9.95e-01 0.000643 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.17e-01 0.0681 0.068 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0959 0.0956 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.90e-01 0.0439 0.0815 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 1.81e-01 0.16 0.119 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 8.48e-02 0.17 0.0979 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 7.85e-02 0.157 0.0888 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 3.06e-01 0.0672 0.0654 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 1.31e-01 0.154 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 2.01e-01 0.0903 0.0704 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 5.85e-01 0.0571 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0692 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0279 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 541423 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.24e-02 -0.15 0.0885 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 742753 sc-eQTL 9.50e-01 0.00543 0.0869 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 604310 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 985408 sc-eQTL 3.66e-01 0.0619 0.0683 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -2522 sc-eQTL 3.27e-04 -0.33 0.0902 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 778324 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0975 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 778277 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 605237 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00466 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 -2522 eQTL 3.79e-29 -0.165 0.0142 0.0146 0.0144 0.17


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000122965 RBM19 -2522 6.76e-05 5.57e-05 1.15e-05 2.53e-05 1.09e-05 2.74e-05 7.73e-05 1.04e-05 6.38e-05 3.14e-05 8.1e-05 3.51e-05 9.24e-05 2.7e-05 1.32e-05 4.23e-05 3.64e-05 4.93e-05 1.52e-05 1.59e-05 3.15e-05 6.62e-05 5.88e-05 1.99e-05 8.54e-05 1.9e-05 2.93e-05 2.72e-05 5.97e-05 5.68e-05 4.44e-05 4.79e-06 7.48e-06 1.37e-05 2.18e-05 1.19e-05 6.62e-06 6.91e-06 1.01e-05 5.16e-06 2.7e-06 6.42e-05 6.77e-06 1.12e-06 6.57e-06 9.58e-06 9.01e-06 4.21e-06 3.35e-06
ENSG00000166578 \N 742709 4.89e-07 2.56e-07 8.02e-08 2.44e-07 1.05e-07 1.44e-07 3.44e-07 7.98e-08 2.56e-07 1.5e-07 2.98e-07 2.33e-07 4.27e-07 8.85e-08 1.01e-07 1.63e-07 1.01e-07 2.9e-07 9.69e-08 7.4e-08 1.6e-07 2.48e-07 2.26e-07 6.52e-08 3.7e-07 2.2e-07 1.74e-07 1.69e-07 1.87e-07 2.02e-07 1.71e-07 8.25e-08 4.93e-08 1.21e-07 1.39e-07 5.41e-08 8.07e-08 6.89e-08 4.99e-08 8.16e-08 3.5e-08 2.71e-07 2.62e-08 1.99e-08 4.91e-08 9.12e-09 9.52e-08 2.89e-09 4.74e-08