Genes within 1Mb (chr12:113943417:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.88e-01 0.0914 0.106 0.15 B L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.11e-01 0.0293 0.0575 0.15 B L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 2.11e-02 0.202 0.0868 0.15 B L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.52e-01 -0.096 0.103 0.15 B L1
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 7.28e-01 0.0291 0.0837 0.15 B L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 1.61e-01 -0.13 0.0921 0.15 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.34e-01 0.0207 0.0986 0.15 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.35e-03 -0.231 0.0881 0.15 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 4.35e-01 0.0544 0.0694 0.15 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0574 0.0548 0.15 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 2.85e-02 0.152 0.0691 0.15 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 9.63e-02 -0.152 0.0912 0.15 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0398 0.0882 0.15 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 5.56e-02 -0.139 0.072 0.15 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 2.93e-01 0.0999 0.0946 0.15 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0334 0.065 0.15 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0112 0.0655 0.15 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00593 0.0649 0.15 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.02e-03 0.259 0.0777 0.15 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.10e-01 -0.11 0.108 0.15 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0178 0.0906 0.15 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0282 0.0994 0.15 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 8.17e-02 0.128 0.0733 0.15 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 8.56e-01 -0.023 0.127 0.14 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0425 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 7.41e-01 0.0439 0.133 0.14 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0929 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000135094 SDS 517116 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0352 0.117 0.14 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 3.76e-01 -0.115 0.13 0.14 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 2.04e-01 -0.153 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 7.47e-01 0.04 0.124 0.14 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 722323 sc-eQTL 3.67e-01 -0.101 0.111 0.14 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0929 0.1 0.14 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.00e-02 0.234 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 5.63e-01 0.0379 0.0653 0.15 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.56e-01 0.132 0.0925 0.15 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.23e-01 0.0846 0.0853 0.15 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.00e-02 -0.207 0.118 0.15 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0673 0.105 0.15 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.52e-02 0.155 0.0895 0.15 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0259 0.0657 0.15 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.38e-01 0.134 0.113 0.148 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.82e-02 -0.127 0.0716 0.148 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0555 0.0904 0.148 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.32e-01 0.0633 0.101 0.148 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.62e-02 -0.183 0.106 0.148 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.111 0.148 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.91e-01 0.136 0.128 0.15 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0217 0.0681 0.15 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0157 0.115 0.15 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0516 0.0991 0.15 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 3.72e-01 0.0911 0.102 0.15 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 2.54e-01 -0.117 0.102 0.15 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.02e-01 0.0327 0.13 0.15 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0358 0.123 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.22e-01 0.121 0.122 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.39e-02 -0.231 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.75e-01 0.187 0.137 0.166 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.73e-01 0.0822 0.145 0.166 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 8.06e-01 0.0224 0.0909 0.166 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 6.04e-01 0.0663 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 2.22e-01 -0.16 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.96e-02 -0.234 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00361 0.129 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0362 0.0879 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 3.52e-03 0.323 0.109 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.06e-01 0.0764 0.115 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 6.02e-01 0.0571 0.109 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 9.10e-02 -0.204 0.12 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0496 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0642 0.113 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 9.99e-01 0.000133 0.129 0.151 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0754 0.102 0.151 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.119 0.151 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 4.02e-01 0.106 0.126 0.151 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 1.14e-01 0.171 0.107 0.151 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 5.57e-01 0.0772 0.131 0.151 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.28e-01 0.199 0.131 0.151 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0165 0.131 0.151 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 4.43e-01 0.0869 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.48e-01 0.0217 0.0673 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 6.08e-01 0.0512 0.0995 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 6.52e-01 0.0524 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0996 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0771 0.11 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 7.60e-01 0.0379 0.124 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0597 0.104 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.07e-01 0.153 0.121 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 3.74e-01 0.0714 0.0802 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 6.87e-02 0.206 0.113 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 7.11e-02 -0.222 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 9.08e-02 0.182 0.107 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 2.65e-01 -0.127 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.25e-01 0.0966 0.121 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 2.88e-03 -0.341 0.113 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.69e-01 0.112 0.124 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 2.32e-02 0.276 0.12 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 4.91e-01 0.0881 0.128 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.30e-01 0.027 0.125 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0188 0.0899 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 3.72e-01 0.112 0.125 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.86e-01 0.0895 0.128 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.51e-01 0.00723 0.117 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0272 0.083 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.12e-02 -0.117 0.0645 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 6.05e-02 0.143 0.076 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 2.03e-01 -0.122 0.0953 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00435 0.0903 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 1.88e-01 -0.109 0.0826 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 2.82e-01 0.106 0.0981 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0838 0.0726 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.28e-02 0.214 0.0931 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0679 0.0658 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 2.98e-01 0.103 0.0988 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 2.61e-01 -0.12 0.106 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0111 0.0938 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 6.45e-02 -0.18 0.097 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 2.39e-01 0.141 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.32e-01 0.00848 0.0992 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 5.68e-01 0.0658 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 2.11e-01 -0.1 0.0797 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.84e-02 0.208 0.109 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 1.10e-01 -0.196 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0769 0.113 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 9.52e-01 0.00716 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 5.41e-01 0.0779 0.127 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 7.56e-01 0.0369 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.41e-01 0.141 0.12 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 3.64e-01 0.0805 0.0886 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.31e-02 0.201 0.103 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.77e-01 -0.106 0.12 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 4.06e-01 0.0922 0.111 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0221 0.118 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.28e-02 0.203 0.12 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0104 0.0987 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 4.49e-02 -0.174 0.0861 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.66e-03 0.244 0.0873 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0713 0.114 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 5.24e-01 0.0666 0.104 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 2.55e-01 0.117 0.103 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.34e-01 0.151 0.127 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 2.69e-01 -0.119 0.107 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.78e-01 0.0693 0.124 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.06e-01 -0.143 0.14 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 9.20e-01 0.0133 0.132 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 9.57e-01 0.00723 0.135 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 3.10e-01 0.134 0.132 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 6.00e-01 0.0655 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 4.47e-02 0.188 0.093 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.64e-01 0.183 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.58e-01 0.0231 0.129 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0873 0.118 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.15e-01 -0.203 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.37e-01 0.0762 0.123 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.80e-01 0.11 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0225 0.1 0.149 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 6.03e-01 -0.064 0.123 0.149 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 7.28e-01 0.0449 0.129 0.149 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 3.52e-01 0.103 0.11 0.149 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.50e-02 -0.204 0.118 0.149 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 9.09e-01 0.015 0.131 0.149 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0151 0.126 0.149 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 7.79e-01 0.0362 0.129 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 8.53e-04 -0.317 0.0935 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 3.19e-01 -0.129 0.129 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 7.26e-02 -0.235 0.13 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 3.02e-01 -0.136 0.132 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 7.67e-01 0.0391 0.132 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 8.35e-01 0.0263 0.126 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 1.60e-01 -0.109 0.0775 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.88e-01 0.0565 0.104 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.31e-01 0.0695 0.111 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 1.79e-01 -0.154 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.90e-02 0.285 0.12 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0942 0.123 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 5.09e-02 -0.214 0.109 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.88e-01 0.0178 0.126 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 2.76e-02 0.293 0.132 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 5.68e-01 0.0738 0.129 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.18e-01 0.104 0.128 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.30e-02 0.249 0.116 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0781 0.0901 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 2.23e-01 -0.134 0.11 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 1.89e-01 -0.161 0.122 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0248 0.122 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 5.74e-01 0.068 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0167 0.155 0.141 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0463 0.117 0.141 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0498 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.42e-02 -0.3 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 3.35e-01 -0.135 0.139 0.141 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 7.46e-01 0.0377 0.116 0.141 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0285 0.148 0.141 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 2.00e-01 -0.195 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.18e-01 0.13 0.13 0.146 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 5.49e-01 0.0569 0.0949 0.146 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 3.30e-01 0.122 0.125 0.146 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.78e-01 0.0625 0.112 0.146 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0498 0.0993 0.146 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0618 0.118 0.146 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0503 0.129 0.146 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.10e-01 0.114 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0526 0.0821 0.15 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.14e-02 0.182 0.104 0.15 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 2.04e-01 -0.156 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0271 0.1 0.15 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 9.05e-01 0.0145 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0603 0.104 0.15 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 1.33e-01 0.214 0.142 0.141 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00294 0.113 0.141 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 7.93e-01 0.0375 0.142 0.141 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 1.64e-01 -0.19 0.136 0.141 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 517116 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0287 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 1.64e-01 -0.187 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 6.31e-02 -0.235 0.126 0.141 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.51e-01 -0.105 0.139 0.141 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 722323 sc-eQTL 2.99e-01 -0.123 0.118 0.141 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 9.26e-01 0.00961 0.103 0.141 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 1.66e-02 0.288 0.119 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0615 0.0742 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0219 0.107 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0327 0.0968 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 3.32e-01 -0.125 0.129 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 1.67e-01 -0.152 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 3.87e-01 0.0894 0.103 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.03e-01 0.0391 0.0751 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 9.61e-01 0.00642 0.13 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 5.94e-01 0.0438 0.0821 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.20e-03 0.339 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.32e-02 0.194 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 7.58e-02 -0.235 0.132 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0185 0.116 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 2.80e-02 0.247 0.112 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.03e-02 -0.155 0.0789 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.74e-01 0.147 0.134 0.155 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 8.77e-01 0.0181 0.117 0.155 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.144 0.155 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0242 0.151 0.155 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 3.13e-01 0.12 0.119 0.155 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 4.15e-01 -0.125 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.54e-02 0.27 0.134 0.155 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 5.32e-01 0.0864 0.138 0.155 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 7.34e-01 0.0466 0.137 0.147 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 1.28e-01 0.145 0.095 0.147 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 7.00e-01 0.0486 0.126 0.147 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0251 0.121 0.147 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0801 0.134 0.147 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 3.92e-01 -0.113 0.132 0.147 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.79e-01 0.163 0.121 0.147 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0214 0.107 0.147 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.88e-02 0.245 0.111 0.152 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0428 0.0921 0.152 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 5.62e-01 0.0747 0.129 0.152 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0381 0.119 0.152 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0345 0.135 0.152 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0109 0.111 0.152 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 5.10e-01 0.0768 0.116 0.152 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.103 0.152 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.23e-01 -0.147 0.148 0.147 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 6.26e-01 0.0607 0.124 0.147 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0331 0.142 0.147 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.85e-01 0.125 0.144 0.147 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 517116 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.104 0.147 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0298 0.145 0.147 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0931 0.142 0.147 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.69e-01 0.108 0.149 0.147 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 722323 sc-eQTL 4.06e-01 0.095 0.114 0.147 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.31e-01 0.065 0.135 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 7.81e-01 0.0361 0.13 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 9.99e-01 -7e-05 0.0781 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.77e-03 0.316 0.0998 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 9.49e-01 0.00742 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0134 0.0853 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0269 0.121 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0234 0.117 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 1.82e-01 -0.148 0.11 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.107 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.51e-01 0.0198 0.0622 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.37e-01 0.141 0.0944 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.109 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 886708 sc-eQTL 4.47e-01 0.073 0.0958 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 1.46e-01 -0.142 0.0973 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 4.76e-01 0.0826 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 3.51e-02 -0.2 0.0941 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 8.28e-02 0.201 0.115 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 7.98e-01 0.0185 0.0723 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.101 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.0861 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 6.25e-02 -0.235 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0909 0.104 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 1.07e-01 0.153 0.0944 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0321 0.0696 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 3.83e-01 0.0644 0.0737 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0214 0.109 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 8.55e-01 0.0202 0.11 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 2.58e-01 -0.139 0.123 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 521037 sc-eQTL 6.58e-01 -0.048 0.108 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 3.10e-01 0.0946 0.0928 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 722367 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0306 0.0907 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 583924 sc-eQTL 3.09e-01 0.122 0.12 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 965022 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0539 0.0721 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -22908 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0276 0.0982 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 757938 sc-eQTL 5.27e-01 0.0656 0.103 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 757891 sc-eQTL 2.10e-01 -0.138 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 584851 sc-eQTL 7.85e-02 0.204 0.115 0.149 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 -22908 eQTL 6.3e-14 0.11 0.0145 0.0 0.0 0.175


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000122965 RBM19 -22908 1.41e-05 1.48e-05 3.46e-06 9.8e-06 3.38e-06 7.88e-06 2.21e-05 3.39e-06 1.64e-05 8.14e-06 2e-05 7.87e-06 2.89e-05 6.34e-06 5.11e-06 9.83e-06 8.88e-06 1.52e-05 5.97e-06 5.22e-06 8.81e-06 1.6e-05 1.67e-05 7.31e-06 2.69e-05 5.34e-06 8e-06 7.58e-06 1.81e-05 2.21e-05 1.08e-05 1.65e-06 2.38e-06 6.48e-06 7.46e-06 4.59e-06 2.83e-06 2.98e-06 4.13e-06 3.2e-06 1.78e-06 1.9e-05 2.71e-06 4.23e-07 2.04e-06 2.69e-06 3.43e-06 1.48e-06 1.52e-06
ENSG00000139405 \N 757891 3.14e-07 1.5e-07 6.42e-08 2.05e-07 1.05e-07 8.37e-08 1.99e-07 5.82e-08 1.59e-07 9.35e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.62e-08 8.08e-08 4.45e-08 1.77e-07 7.39e-08 5.87e-08 1.18e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.42e-08 1.85e-07 1.31e-07 1.22e-07 1.1e-07 1.31e-07 1.24e-07 1.14e-07 4.23e-08 3.74e-08 9.78e-08 3.57e-08 2.79e-08 5.42e-08 7.61e-08 6.5e-08 5.96e-08 5.96e-08 1.48e-07 3.35e-08 7.51e-09 3.34e-08 6.39e-09 7.92e-08 2.07e-09 4.67e-08