logo

Genes within 1Mb (chr12:113939507:T:TGGGAGGCTGAGGCGGGC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 3.54e-01 0.108 0.116 0.122 B L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.89e-01 0.00884 0.0633 0.122 B L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.66e-02 -0.16 0.0962 0.122 B L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 9.34e-01 0.00938 0.114 0.122 B L1
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 2.81e-01 0.0994 0.0919 0.122 B L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0896 0.102 0.122 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.47e-01 0.021 0.108 0.122 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.71e-01 -0.016 0.0986 0.122 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 7.98e-01 0.0198 0.0772 0.122 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0185 0.061 0.122 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.33e-02 0.13 0.0771 0.122 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 2.56e-01 -0.116 0.102 0.122 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0649 0.0979 0.122 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 1.61e-01 -0.113 0.0803 0.122 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00032 0.105 0.122 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0117 0.0723 0.122 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.68e-02 0.125 0.0725 0.122 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0996 0.072 0.122 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 6.52e-01 -0.04 0.0887 0.122 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 7.73e-01 0.035 0.121 0.122 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 2.15e-01 0.125 0.101 0.122 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0303 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 1.90e-01 -0.108 0.0818 0.122 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0305 0.132 0.119 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0163 0.106 0.119 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0511 0.138 0.119 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.28e-01 0.121 0.123 0.119 DC L1
ENSG00000135094 SDS 513206 sc-eQTL 5.45e-01 0.0737 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.36e-01 0.0842 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 7.01e-01 0.0482 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.20e-01 -0.013 0.129 0.119 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 718413 sc-eQTL 2.78e-01 0.126 0.116 0.119 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 2.21e-01 0.128 0.104 0.119 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 1.51e-01 0.168 0.117 0.122 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 9.84e-02 0.117 0.0704 0.122 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 7.51e-01 0.032 0.101 0.122 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 9.16e-02 -0.156 0.092 0.122 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 8.55e-01 0.0234 0.128 0.122 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 2.82e-01 0.122 0.113 0.122 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.42e-01 0.00711 0.0977 0.122 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 9.60e-01 0.00356 0.0712 0.122 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.61e-01 0.0918 0.124 0.12 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0667 0.079 0.12 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.79e-01 -0.133 0.0989 0.12 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.00e-01 -0.182 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0381 0.117 0.12 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.77e-01 0.0511 0.123 0.12 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0603 0.137 0.122 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.31e-02 0.126 0.0723 0.122 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 4.25e-01 0.0978 0.122 0.122 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0385 0.106 0.122 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 1.85e-01 -0.144 0.108 0.122 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000514 0.11 0.122 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 7.60e-01 0.0425 0.139 0.122 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 6.32e-01 0.0632 0.132 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.59e-02 -0.251 0.145 0.117 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.38e-01 -0.24 0.161 0.117 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 6.15e-01 0.086 0.171 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 9.22e-02 0.179 0.106 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 1.66e-01 0.207 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.154 0.117 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 9.62e-01 0.00728 0.152 0.117 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0893 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.47e-01 0.138 0.0948 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 3.54e-01 0.112 0.121 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 8.85e-01 -0.018 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 1.54e-01 0.169 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 7.26e-01 0.0461 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0662 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0754 0.123 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.41e-01 0.0273 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0139 0.107 0.123 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 2.59e-01 -0.141 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.17e-01 0.207 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 2.21e-01 -0.139 0.113 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 3.30e-02 -0.292 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.137 0.123 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00888 0.137 0.123 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 1.93e-01 0.164 0.126 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00217 0.0751 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0686 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.27e-01 -0.127 0.129 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 8.84e-01 -0.018 0.123 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.86e-01 0.00242 0.138 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.83e-01 0.101 0.116 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 9.94e-01 0.000952 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00607 0.086 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 3.78e-01 -0.107 0.121 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.74e-01 -0.117 0.132 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 5.69e-01 0.0657 0.115 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0663 0.122 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0123 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0712 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0404 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.90e-01 -0.019 0.137 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 3.31e-02 0.304 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0503 0.141 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 3.35e-01 0.0972 0.101 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 1.63e-01 0.195 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.98e-01 0.0185 0.144 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00943 0.131 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0193 0.0932 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0394 0.073 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 4.05e-02 0.176 0.0852 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.57e-01 -0.152 0.107 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0511 0.101 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 1.38e-01 -0.138 0.0926 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0478 0.11 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 5.08e-01 0.0541 0.0816 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.51e-02 0.207 0.103 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 4.09e-01 0.0601 0.0726 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0691 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 5.53e-01 0.0697 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 5.23e-01 -0.066 0.103 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0516 0.108 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.21e-01 0.0299 0.132 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0641 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.11e-02 -0.259 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 3.23e-01 0.0873 0.0882 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 8.00e-01 -0.031 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 2.80e-01 -0.147 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 5.83e-01 0.0687 0.125 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 3.69e-01 -0.118 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 2.08e-01 -0.177 0.14 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 2.72e-01 0.144 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 2.44e-01 0.158 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 3.19e-01 -0.1 0.1 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 3.33e-01 0.114 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 5.81e-01 0.075 0.136 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0415 0.125 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.31e-01 0.0641 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.11e-02 -0.294 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 5.58e-01 0.0654 0.111 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.15e-01 -0.155 0.0976 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.70e-01 -0.057 0.1 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0574 0.129 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0773 0.113 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.28e-01 0.0256 0.118 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.46e-02 -0.244 0.115 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 2.41e-01 0.161 0.137 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0657 0.116 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0507 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 8.68e-01 0.0253 0.152 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 1.31e-02 0.352 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 4.56e-01 -0.109 0.146 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 5.02e-01 0.0957 0.142 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 3.96e-01 -0.091 0.107 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.15e-01 0.016 0.15 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 4.63e-02 0.293 0.146 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0884 0.135 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.54e-01 0.0271 0.147 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 2.36e-01 -0.167 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.29e-01 -0.105 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0408 0.105 0.123 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.38e-01 0.0797 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.37e-02 -0.286 0.134 0.123 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 3.04e-01 -0.119 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00413 0.124 0.123 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0674 0.138 0.123 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0198 0.14 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.59e-02 -0.25 0.103 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.42e-01 -0.206 0.14 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.75e-01 0.126 0.142 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 7.42e-01 0.0473 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0772 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 9.70e-01 0.00524 0.137 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 7.41e-01 0.0281 0.0847 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 7.64e-02 -0.2 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.74e-01 -0.163 0.12 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 3.86e-01 -0.108 0.124 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 2.04e-01 0.168 0.132 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0312 0.138 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0861 0.124 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 3.13e-01 -0.143 0.141 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 6.36e-01 0.0713 0.15 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 8.21e-01 0.0329 0.145 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.98e-02 -0.243 0.142 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 8.86e-01 0.0183 0.127 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.20e-01 -0.152 0.0973 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 2.08e-01 0.151 0.119 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.41e-01 -0.127 0.133 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.44e-01 0.0093 0.132 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 2.42e-01 -0.153 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.42e-02 0.329 0.161 0.141 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.02e-01 0.202 0.122 0.141 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.64e-01 -0.232 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 2.33e-01 0.198 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 3.97e-02 0.302 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.23e-01 0.0787 0.123 0.141 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0381 0.157 0.141 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.73e-01 0.0258 0.162 0.141 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0821 0.139 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.53e-01 0.144 0.101 0.122 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.35e-01 0.198 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 4.94e-01 0.0818 0.119 0.122 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00741 0.106 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0158 0.125 0.122 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 6.70e-01 0.0585 0.137 0.122 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.124 0.122 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.48e-01 -0.094 0.124 0.122 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0349 0.0902 0.122 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 4.77e-01 0.0819 0.115 0.122 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.26e-01 -0.206 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0133 0.11 0.122 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0706 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 4.48e-01 0.101 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 1.50e-02 -0.276 0.113 0.122 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.12 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0608 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.46e-02 -0.245 0.146 0.12 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 5.46e-01 0.0853 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 513206 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0619 0.123 0.12 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 7.62e-01 0.0421 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 3.22e-01 0.13 0.131 0.12 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 3.18e-01 0.144 0.143 0.12 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 718413 sc-eQTL 6.16e-02 0.227 0.121 0.12 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.21e-01 0.0242 0.107 0.12 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 1.73e-01 0.173 0.127 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 8.00e-02 0.137 0.0779 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 6.16e-01 0.0564 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.64e-02 -0.213 0.101 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.74e-02 0.225 0.135 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0876 0.109 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.38e-01 0.0759 0.079 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 1.45e-01 0.199 0.136 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 2.74e-01 0.0945 0.0861 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0753 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0666 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 2.12e-01 -0.174 0.139 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 7.83e-02 0.214 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 3.89e-01 0.102 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 7.66e-01 -0.025 0.0837 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.68e-01 0.112 0.154 0.103 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 7.82e-01 0.0369 0.134 0.103 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 6.68e-01 0.0741 0.173 0.103 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0573 0.137 0.103 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 9.74e-01 0.00572 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 1.61e-01 -0.218 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.73e-01 0.0255 0.158 0.103 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 5.30e-01 0.0904 0.144 0.122 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.94e-01 -0.13 0.1 0.122 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.99e-01 -0.0002 0.132 0.122 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 9.22e-01 0.0125 0.127 0.122 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 3.57e-01 -0.13 0.141 0.122 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0144 0.139 0.122 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 2.67e-01 0.142 0.127 0.122 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0974 0.113 0.122 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 2.70e-01 -0.131 0.119 0.12 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 1.45e-02 -0.237 0.0961 0.12 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.12 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.76e-01 0.111 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0904 0.142 0.12 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 7.04e-01 0.0448 0.118 0.12 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 2.83e-01 -0.132 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0573 0.109 0.12 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.55e-01 -0.117 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 4.54e-01 0.0983 0.131 0.11 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 4.09e-02 0.304 0.147 0.11 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0297 0.152 0.11 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 513206 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.11 0.11 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 2.01e-01 0.196 0.152 0.11 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 4.50e-01 -0.114 0.15 0.11 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0345 0.157 0.11 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 718413 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0792 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 2.97e-01 0.149 0.142 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0412 0.141 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 9.46e-01 0.00575 0.085 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 8.19e-01 0.0254 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 3.20e-01 0.125 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 2.70e-01 0.102 0.0926 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 1.61e-01 -0.178 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0631 0.121 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 1.75e-01 0.159 0.117 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0334 0.0685 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 1.47e-01 -0.151 0.104 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 2.48e-01 -0.139 0.12 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 882798 sc-eQTL 7.39e-01 0.0352 0.106 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0661 0.108 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0172 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 9.41e-02 0.207 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 2.75e-02 0.169 0.0762 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 9.77e-01 0.0031 0.108 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 6.77e-02 -0.168 0.0915 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.76e-01 0.0756 0.135 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00852 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 4.91e-01 0.0511 0.0742 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 9.62e-01 0.00551 0.117 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0731 0.0805 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 6.82e-01 0.0489 0.119 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.121 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0171 0.135 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 517127 sc-eQTL 7.52e-01 0.0375 0.118 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 5.19e-01 0.0658 0.102 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718457 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.099 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 580014 sc-eQTL 4.97e-01 0.0872 0.128 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961112 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0792 0.0771 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26818 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 754028 sc-eQTL 1.30e-01 -0.167 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753981 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0762 0.118 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580941 sc-eQTL 7.25e-01 0.0438 0.124 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 -26818 eQTL 0.00121 0.0543 0.0167 0.0 0.0 0.13

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina