logo

Genes within 1Mb (chr12:113939458:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 3.54e-01 0.108 0.116 0.122 B L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.89e-01 0.00884 0.0633 0.122 B L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.66e-02 -0.16 0.0962 0.122 B L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 9.34e-01 0.00938 0.114 0.122 B L1
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 2.81e-01 0.0994 0.0919 0.122 B L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0896 0.102 0.122 B L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.47e-01 0.021 0.108 0.122 B L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.71e-01 -0.016 0.0986 0.122 B L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 7.98e-01 0.0198 0.0772 0.122 CD4T L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0185 0.061 0.122 CD4T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.33e-02 0.13 0.0771 0.122 CD4T L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 2.56e-01 -0.116 0.102 0.122 CD4T L1
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0649 0.0979 0.122 CD4T L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 1.61e-01 -0.113 0.0803 0.122 CD4T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00032 0.105 0.122 CD4T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0117 0.0723 0.122 CD4T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.68e-02 0.125 0.0725 0.122 CD8T L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0996 0.072 0.122 CD8T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 6.52e-01 -0.04 0.0887 0.122 CD8T L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 7.73e-01 0.035 0.121 0.122 CD8T L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 2.15e-01 0.125 0.101 0.122 CD8T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0303 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 1.90e-01 -0.108 0.0818 0.122 CD8T L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0305 0.132 0.119 DC L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0163 0.106 0.119 DC L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0511 0.138 0.119 DC L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.28e-01 0.121 0.123 0.119 DC L1
ENSG00000135094 SDS 513157 sc-eQTL 5.45e-01 0.0737 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.36e-01 0.0842 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 7.01e-01 0.0482 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.20e-01 -0.013 0.129 0.119 DC L1
ENSG00000166578 IQCD 718364 sc-eQTL 2.78e-01 0.126 0.116 0.119 DC L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 2.21e-01 0.128 0.104 0.119 DC L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 1.51e-01 0.168 0.117 0.122 Mono L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 9.84e-02 0.117 0.0704 0.122 Mono L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 7.51e-01 0.032 0.101 0.122 Mono L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 9.16e-02 -0.156 0.092 0.122 Mono L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 8.55e-01 0.0234 0.128 0.122 Mono L1
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 2.82e-01 0.122 0.113 0.122 Mono L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.42e-01 0.00711 0.0977 0.122 Mono L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 9.60e-01 0.00356 0.0712 0.122 Mono L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.61e-01 0.0918 0.124 0.12 NK L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0667 0.079 0.12 NK L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.79e-01 -0.133 0.0989 0.12 NK L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.00e-01 -0.182 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0381 0.117 0.12 NK L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.77e-01 0.0511 0.123 0.12 NK L1
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0603 0.137 0.122 Other_T L1
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.31e-02 0.126 0.0723 0.122 Other_T L1
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 4.25e-01 0.0978 0.122 0.122 Other_T L1
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0385 0.106 0.122 Other_T L1
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 1.85e-01 -0.144 0.108 0.122 Other_T L1
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000514 0.11 0.122 Other_T L1
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 7.60e-01 0.0425 0.139 0.122 Other_T L1
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 6.32e-01 0.0632 0.132 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.59e-02 -0.251 0.145 0.117 B_Activated L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.38e-01 -0.24 0.161 0.117 B_Activated L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 6.15e-01 0.086 0.171 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 9.22e-02 0.179 0.106 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 1.66e-01 0.207 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.154 0.117 B_Activated L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 9.62e-01 0.00728 0.152 0.117 B_Activated L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0893 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.47e-01 0.138 0.0948 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 3.54e-01 0.112 0.121 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 8.85e-01 -0.018 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 1.54e-01 0.169 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 7.26e-01 0.0461 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0662 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0754 0.123 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.41e-01 0.0273 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0139 0.107 0.123 B_Memory L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 2.59e-01 -0.141 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.17e-01 0.207 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 2.21e-01 -0.139 0.113 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 3.30e-02 -0.292 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.137 0.123 B_Memory L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00888 0.137 0.123 B_Memory L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 1.93e-01 0.164 0.126 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00217 0.0751 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0686 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.27e-01 -0.127 0.129 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 8.84e-01 -0.018 0.123 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.86e-01 0.00242 0.138 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.83e-01 0.101 0.116 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 9.94e-01 0.000952 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00607 0.086 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 3.78e-01 -0.107 0.121 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.74e-01 -0.117 0.132 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 5.69e-01 0.0657 0.115 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0663 0.122 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0123 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0712 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0404 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.90e-01 -0.019 0.137 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 3.31e-02 0.304 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0503 0.141 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 3.35e-01 0.0972 0.101 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 1.63e-01 0.195 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.98e-01 0.0185 0.144 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00943 0.131 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0193 0.0932 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0394 0.073 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 4.05e-02 0.176 0.0852 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.57e-01 -0.152 0.107 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0511 0.101 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 1.38e-01 -0.138 0.0926 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0478 0.11 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 5.08e-01 0.0541 0.0816 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.51e-02 0.207 0.103 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 4.09e-01 0.0601 0.0726 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0691 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 5.53e-01 0.0697 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 5.23e-01 -0.066 0.103 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0516 0.108 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.21e-01 0.0299 0.132 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0641 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.11e-02 -0.259 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 3.23e-01 0.0873 0.0882 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 8.00e-01 -0.031 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 2.80e-01 -0.147 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 5.83e-01 0.0687 0.125 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 3.69e-01 -0.118 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 2.08e-01 -0.177 0.14 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 2.72e-01 0.144 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 2.44e-01 0.158 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 3.19e-01 -0.1 0.1 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 3.33e-01 0.114 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 5.81e-01 0.075 0.136 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0415 0.125 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.31e-01 0.0641 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.11e-02 -0.294 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 5.58e-01 0.0654 0.111 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.15e-01 -0.155 0.0976 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.70e-01 -0.057 0.1 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0574 0.129 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0773 0.113 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.28e-01 0.0256 0.118 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.46e-02 -0.244 0.115 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 2.41e-01 0.161 0.137 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0657 0.116 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0507 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 8.68e-01 0.0253 0.152 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 1.31e-02 0.352 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 4.56e-01 -0.109 0.146 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 5.02e-01 0.0957 0.142 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 3.96e-01 -0.091 0.107 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.15e-01 0.016 0.15 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 4.63e-02 0.293 0.146 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0884 0.135 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.54e-01 0.0271 0.147 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 2.36e-01 -0.167 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.29e-01 -0.105 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0408 0.105 0.123 MAIT L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.38e-01 0.0797 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.37e-02 -0.286 0.134 0.123 MAIT L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 3.04e-01 -0.119 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00413 0.124 0.123 MAIT L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0674 0.138 0.123 MAIT L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0198 0.14 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.59e-02 -0.25 0.103 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.42e-01 -0.206 0.14 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.75e-01 0.126 0.142 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 7.42e-01 0.0473 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0772 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 9.70e-01 0.00524 0.137 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 7.41e-01 0.0281 0.0847 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 7.64e-02 -0.2 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.74e-01 -0.163 0.12 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 3.86e-01 -0.108 0.124 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 2.04e-01 0.168 0.132 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0312 0.138 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0861 0.124 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 3.13e-01 -0.143 0.141 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 6.36e-01 0.0713 0.15 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 8.21e-01 0.0329 0.145 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.98e-02 -0.243 0.142 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 8.86e-01 0.0183 0.127 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.20e-01 -0.152 0.0973 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 2.08e-01 0.151 0.119 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.41e-01 -0.127 0.133 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.44e-01 0.0093 0.132 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 2.42e-01 -0.153 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.42e-02 0.329 0.161 0.141 PB L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.02e-01 0.202 0.122 0.141 PB L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.64e-01 -0.232 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 2.33e-01 0.198 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 3.97e-02 0.302 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.23e-01 0.0787 0.123 0.141 PB L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0381 0.157 0.141 PB L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.73e-01 0.0258 0.162 0.141 PB L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0821 0.139 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.53e-01 0.144 0.101 0.122 Pro_T L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.35e-01 0.198 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 4.94e-01 0.0818 0.119 0.122 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00741 0.106 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0158 0.125 0.122 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 6.70e-01 0.0585 0.137 0.122 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.124 0.122 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.48e-01 -0.094 0.124 0.122 Treg L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0349 0.0902 0.122 Treg L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 4.77e-01 0.0819 0.115 0.122 Treg L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.26e-01 -0.206 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0133 0.11 0.122 Treg L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0706 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 4.48e-01 0.101 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 1.50e-02 -0.276 0.113 0.122 Treg L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.12 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0608 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.46e-02 -0.245 0.146 0.12 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 5.46e-01 0.0853 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000135094 SDS 513157 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0619 0.123 0.12 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 7.62e-01 0.0421 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 3.22e-01 0.13 0.131 0.12 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 3.18e-01 0.144 0.143 0.12 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD 718364 sc-eQTL 6.16e-02 0.227 0.121 0.12 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.21e-01 0.0242 0.107 0.12 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 1.73e-01 0.173 0.127 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 8.00e-02 0.137 0.0779 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 6.16e-01 0.0564 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.64e-02 -0.213 0.101 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.74e-02 0.225 0.135 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0876 0.109 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.38e-01 0.0759 0.079 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 1.45e-01 0.199 0.136 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 2.74e-01 0.0945 0.0861 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0753 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0666 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 2.12e-01 -0.174 0.139 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 7.83e-02 0.214 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 3.89e-01 0.102 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 7.66e-01 -0.025 0.0837 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.68e-01 0.112 0.154 0.103 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 7.82e-01 0.0369 0.134 0.103 gdT L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 6.68e-01 0.0741 0.173 0.103 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0573 0.137 0.103 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 9.74e-01 0.00572 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 1.61e-01 -0.218 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.73e-01 0.0255 0.158 0.103 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 5.30e-01 0.0904 0.144 0.122 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.94e-01 -0.13 0.1 0.122 intMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.99e-01 -0.0002 0.132 0.122 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 9.22e-01 0.0125 0.127 0.122 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 3.57e-01 -0.13 0.141 0.122 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0144 0.139 0.122 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 2.67e-01 0.142 0.127 0.122 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0974 0.113 0.122 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 2.70e-01 -0.131 0.119 0.12 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 1.45e-02 -0.237 0.0961 0.12 ncMono L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.12 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.76e-01 0.111 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0904 0.142 0.12 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 7.04e-01 0.0448 0.118 0.12 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 2.83e-01 -0.132 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0573 0.109 0.12 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.55e-01 -0.117 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 4.54e-01 0.0983 0.131 0.11 pDC L2
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 4.09e-02 0.304 0.147 0.11 pDC L2
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0297 0.152 0.11 pDC L2
ENSG00000135094 SDS 513157 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.11 0.11 pDC L2
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 2.01e-01 0.196 0.152 0.11 pDC L2
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 4.50e-01 -0.114 0.15 0.11 pDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0345 0.157 0.11 pDC L2
ENSG00000166578 IQCD 718364 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0792 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 2.97e-01 0.149 0.142 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0412 0.141 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 9.46e-01 0.00575 0.085 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 8.19e-01 0.0254 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 3.20e-01 0.125 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 2.70e-01 0.102 0.0926 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 1.61e-01 -0.178 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0631 0.121 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 1.75e-01 0.159 0.117 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0334 0.0685 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 1.47e-01 -0.151 0.104 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 2.48e-01 -0.139 0.12 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135144 DTX1 882749 sc-eQTL 7.39e-01 0.0352 0.106 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0661 0.108 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0172 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 9.41e-02 0.207 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 2.75e-02 0.169 0.0762 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 9.77e-01 0.0031 0.108 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 6.77e-02 -0.168 0.0915 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.76e-01 0.0756 0.135 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00852 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 4.91e-01 0.0511 0.0742 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 9.62e-01 0.00551 0.117 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0731 0.0805 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 6.82e-01 0.0489 0.119 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.121 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0171 0.135 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139410 SDSL 517078 sc-eQTL 7.52e-01 0.0375 0.118 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 5.19e-01 0.0658 0.102 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000186815 TPCN1 718408 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.099 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000089060 SLC8B1 579965 sc-eQTL 4.97e-01 0.0872 0.128 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111335 OAS2 961063 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0792 0.0771 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000122965 RBM19 -26867 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123064 DDX54 753979 sc-eQTL 1.30e-01 -0.167 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139405 RITA1 753932 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0762 0.118 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151176 PLBD2 580892 sc-eQTL 7.25e-01 0.0438 0.124 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000122965 RBM19 -26867 eQTL 0.00119 0.0542 0.0167 0.0 0.0 0.131

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina