logo

Genes within 1Mb (chr12:112640517:CTCTTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0608 0.128 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 6.01e-01 0.111 0.212 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 5.19e-01 0.135 0.209 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 1.36e-01 -0.272 0.182 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 3.72e-01 -0.195 0.218 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 3.92e-01 0.17 0.198 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 2.68e-01 -0.25 0.225 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 6.32e-01 -0.1 0.209 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 5.56e-01 -0.127 0.216 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 1.63e-01 -0.246 0.176 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 3.15e-01 -0.232 0.23 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0534 0.218 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 6.94e-01 0.0857 0.217 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 7.67e-01 0.0659 0.222 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 7.48e-01 0.0578 0.18 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0106 0.205 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 4.63e-01 -0.16 0.218 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 3.02e-01 -0.233 0.225 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 1.47e-02 -0.496 0.201 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00961 0.0945 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0559 0.217 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0834 0.213 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 1.40e-01 -0.191 0.129 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 4.02e-01 -0.177 0.21 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 6.67e-01 0.056 0.13 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 4.25e-01 -0.162 0.203 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0319 0.209 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0761 0.182 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 7.39e-01 0.0518 0.155 0.05 Pro_T L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 3.77e-01 -0.162 0.183 0.05 Pro_T L2
ENSG00000135144 DTX1 -416192 sc-eQTL 7.97e-01 0.0419 0.162 0.05 Pro_T L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0468 0.215 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 9.09e-01 0.0219 0.192 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00416 0.21 0.05 Pro_T L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 1.12e-01 0.302 0.189 0.05 Pro_T L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 5.82e-01 0.0958 0.174 0.05 Pro_T L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 4.68e-01 -0.138 0.19 0.05 Pro_T L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00114 0.216 0.05 Pro_T L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 6.06e-01 -0.101 0.195 0.05 Pro_T L2
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0498 0.105 0.051 cDC L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 4.48e-01 0.173 0.227 0.051 cDC L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 1.50e-01 0.326 0.225 0.051 cDC L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 8.44e-01 0.0311 0.158 0.051 cDC L2
ENSG00000089169 RPH3A 70137 sc-eQTL 7.58e-01 0.0593 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 6.66e-01 0.1 0.232 0.051 cDC L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0373 0.16 0.051 cDC L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 6.35e-01 0.108 0.227 0.051 cDC L2
ENSG00000111275 ALDH2 873630 sc-eQTL 8.88e-01 0.0235 0.167 0.051 cDC L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 8.58e-02 -0.367 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 2.84e-01 -0.168 0.157 0.051 cDC L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 7.63e-01 0.0538 0.179 0.051 cDC L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 4.96e-01 0.148 0.217 0.051 cDC L2
ENSG00000135094 SDS -785784 sc-eQTL 2.40e-01 0.223 0.189 0.051 cDC L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 7.08e-01 0.0812 0.216 0.051 cDC L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0253 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000139410 SDSL -781863 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0653 0.202 0.051 cDC L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 8.99e-01 0.0279 0.221 0.051 cDC L2
ENSG00000166578 IQCD -580577 sc-eQTL 3.97e-01 -0.159 0.187 0.051 cDC L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 3.92e-01 -0.174 0.202 0.051 cDC L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 1.85e-01 -0.276 0.207 0.051 cDC L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0269 0.164 0.051 cDC L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 5.21e-01 0.132 0.205 0.051 cDC L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 7.01e-01 0.0879 0.229 0.051 cDC L2
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0752 0.119 0.052 gdT L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 7.78e-01 0.0721 0.256 0.052 gdT L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 8.54e-01 0.0421 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 4.12e-02 0.439 0.213 0.052 gdT L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 6.86e-01 0.104 0.257 0.052 gdT L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 8.75e-01 0.035 0.222 0.052 gdT L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 5.41e-01 0.138 0.225 0.052 gdT L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 1.98e-01 -0.335 0.259 0.052 gdT L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 6.68e-01 0.104 0.243 0.052 gdT L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0867 0.198 0.052 gdT L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 1.07e-02 0.646 0.25 0.052 gdT L2
ENSG00000135144 DTX1 -416192 sc-eQTL 8.77e-01 0.0312 0.202 0.052 gdT L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 7.21e-03 -0.637 0.234 0.052 gdT L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 1.79e-01 0.349 0.258 0.052 gdT L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 8.54e-02 -0.395 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 1.15e-01 -0.362 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0159 0.238 0.052 gdT L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 5.54e-01 -0.139 0.234 0.052 gdT L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 1.73e-01 -0.315 0.23 0.052 gdT L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 6.67e-01 0.105 0.242 0.052 gdT L2
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 4.66e-02 0.182 0.091 0.051 intMono L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 2.51e-01 0.247 0.215 0.051 intMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00568 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 6.39e-01 0.0574 0.122 0.051 intMono L2
ENSG00000089169 RPH3A 70137 sc-eQTL 4.09e-03 0.584 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 6.94e-01 0.0819 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 5.12e-01 0.128 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 1.41e-01 -0.323 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000111275 ALDH2 873630 sc-eQTL 1.56e-01 -0.256 0.18 0.051 intMono L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 6.98e-01 0.0828 0.213 0.051 intMono L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0118 0.158 0.051 intMono L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0393 0.156 0.051 intMono L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 6.11e-01 -0.101 0.198 0.051 intMono L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 6.21e-01 -0.091 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0721 0.22 0.051 intMono L2
ENSG00000139410 SDSL -781863 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0695 0.215 0.051 intMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 2.68e-01 0.22 0.198 0.051 intMono L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 1.97e-01 -0.248 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 1.23e-01 0.301 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 7.41e-01 0.058 0.175 0.051 intMono L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 6.19e-01 -0.104 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 2.80e-01 -0.247 0.228 0.051 intMono L2
ENSG00000089009 RPL6 221679 sc-eQTL 2.63e-01 0.108 0.0957 0.052 ncMono L2
ENSG00000089022 MAPKAPK5 798289 sc-eQTL 3.63e-01 0.175 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000089060 SLC8B1 -718976 sc-eQTL 5.17e-01 -0.117 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000089127 OAS1 -266266 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0497 0.101 0.052 ncMono L2
ENSG00000089169 RPH3A 70137 sc-eQTL 6.25e-01 0.0845 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000089234 BRAP 954561 sc-eQTL 2.95e-01 0.213 0.203 0.052 ncMono L2
ENSG00000089248 ERP29 627169 sc-eQTL 5.44e-01 -0.105 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000111271 ACAD10 954461 sc-eQTL 4.60e-02 0.416 0.207 0.052 ncMono L2
ENSG00000111275 ALDH2 873630 sc-eQTL 2.07e-01 0.163 0.128 0.052 ncMono L2
ENSG00000111300 NAA25 531721 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0833 0.214 0.052 ncMono L2
ENSG00000111331 OAS3 -297927 sc-eQTL 2.48e-01 -0.175 0.151 0.052 ncMono L2
ENSG00000111335 OAS2 -337878 sc-eQTL 6.45e-01 0.068 0.147 0.052 ncMono L2
ENSG00000123064 DDX54 -544962 sc-eQTL 6.34e-01 0.0906 0.19 0.052 ncMono L2
ENSG00000135148 TRAFD1 514979 sc-eQTL 2.47e-01 0.177 0.153 0.052 ncMono L2
ENSG00000139405 RITA1 -545009 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0221 0.216 0.052 ncMono L2
ENSG00000139410 SDSL -781863 sc-eQTL 8.71e-01 0.0289 0.178 0.052 ncMono L2
ENSG00000151176 PLBD2 -718049 sc-eQTL 1.29e-02 -0.461 0.183 0.052 ncMono L2
ENSG00000173064 HECTD4 258078 sc-eQTL 9.25e-01 0.0155 0.165 0.052 ncMono L2
ENSG00000179295 PTPN11 222166 sc-eQTL 3.64e-01 -0.191 0.21 0.052 ncMono L2
ENSG00000186815 TPCN1 -580533 sc-eQTL 1.73e-02 0.391 0.163 0.052 ncMono L2
ENSG00000198270 TMEM116 627332 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00425 0.204 0.052 ncMono L2
ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 797615 sc-eQTL 8.76e-01 0.0285 0.182 0.052 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111275 ALDH2 873630 pQTL 0.015 0.155 0.0637 0.0 0.0 0.0444
ENSG00000135148 TRAFD1 514972 eQTL 0.0746 0.0463 0.026 0.00112 0.0 0.0427

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina