logo

Genes within 1Mb (chr12:109537366:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075856 SART3 975966 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00173 0.252 0.054 B_Activated L2
ENSG00000076248 UNG 439792 sc-eQTL 7.32e-01 0.0759 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000076513 ANKRD13A -461820 sc-eQTL 2.58e-01 -0.243 0.214 0.054 B_Activated L2
ENSG00000076555 ACACB 420771 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0727 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000084112 SSH1 679776 sc-eQTL 6.39e-01 -0.107 0.227 0.054 B_Activated L2
ENSG00000110876 SELPLG 903407 sc-eQTL 5.65e-01 0.121 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000110880 CORO1C 805770 sc-eQTL 3.61e-01 -0.227 0.247 0.054 B_Activated L2
ENSG00000110906 KCTD10 60007 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0596 0.234 0.054 B_Activated L2
ENSG00000110921 MVK -35889 sc-eQTL 4.45e-01 0.168 0.22 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111229 ARPC3 -913056 sc-eQTL 3.55e-01 -0.163 0.176 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111231 GPN3 -931902 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0512 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111237 VPS29 -964745 sc-eQTL 7.59e-02 -0.426 0.238 0.054 B_Activated L2
ENSG00000122970 IFT81 -586969 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0709 0.179 0.054 B_Activated L2
ENSG00000135093 USP30 514277 sc-eQTL 2.07e-01 -0.275 0.217 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136003 ISCU 974784 sc-eQTL 3.56e-01 -0.213 0.23 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139428 MMAB -36214 sc-eQTL 3.10e-01 -0.233 0.229 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139433 GLTP -343175 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0198 0.26 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139436 GIT2 -459023 sc-eQTL 4.40e-01 -0.186 0.241 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139437 TCHP -362898 sc-eQTL 9.96e-01 0.00116 0.23 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151148 UBE3B 59964 sc-eQTL 5.34e-01 0.153 0.246 0.054 B_Activated L2
ENSG00000174437 ATP2A2 -743390 sc-eQTL 2.80e-01 0.249 0.23 0.054 B_Activated L2
ENSG00000174456 C12orf76 -536268 sc-eQTL 5.30e-01 -0.159 0.252 0.054 B_Activated L2
ENSG00000189046 ALKBH2 443735 sc-eQTL 5.30e-01 -0.147 0.234 0.054 B_Activated L2
ENSG00000196510 ANAPC7 -866364 sc-eQTL 9.83e-04 -0.762 0.227 0.054 B_Activated L2
ENSG00000204856 FAM216A -931049 sc-eQTL 9.13e-01 0.0247 0.225 0.054 B_Activated L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 483414 sc-eQTL 5.11e-01 0.145 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000257221 AC007569.1 908698 sc-eQTL 9.80e-02 -0.417 0.251 0.054 B_Activated L2
ENSG00000075856 SART3 975966 sc-eQTL 4.59e-01 -0.184 0.248 0.067 PB L2
ENSG00000076248 UNG 439792 sc-eQTL 1.10e-01 -0.357 0.222 0.067 PB L2
ENSG00000076513 ANKRD13A -461820 sc-eQTL 1.52e-01 -0.27 0.187 0.067 PB L2
ENSG00000076555 ACACB 420771 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0127 0.208 0.067 PB L2
ENSG00000084112 SSH1 679776 sc-eQTL 6.21e-01 -0.114 0.231 0.067 PB L2
ENSG00000110876 SELPLG 903407 sc-eQTL 3.39e-01 -0.145 0.151 0.067 PB L2
ENSG00000110880 CORO1C 805770 sc-eQTL 9.65e-01 0.00995 0.227 0.067 PB L2
ENSG00000110906 KCTD10 60007 sc-eQTL 6.31e-01 -0.117 0.242 0.067 PB L2
ENSG00000110921 MVK -35889 sc-eQTL 4.66e-01 -0.166 0.227 0.067 PB L2
ENSG00000111229 ARPC3 -913056 sc-eQTL 3.00e-01 -0.139 0.133 0.067 PB L2
ENSG00000111231 GPN3 -931902 sc-eQTL 4.82e-01 -0.138 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000111237 VPS29 -964745 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0203 0.167 0.067 PB L2
ENSG00000122970 IFT81 -586969 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0118 0.181 0.067 PB L2
ENSG00000135093 USP30 514277 sc-eQTL 5.60e-01 0.131 0.225 0.067 PB L2
ENSG00000136003 ISCU 974784 sc-eQTL 3.51e-01 0.16 0.171 0.067 PB L2
ENSG00000139428 MMAB -36214 sc-eQTL 5.16e-01 -0.143 0.219 0.067 PB L2
ENSG00000139433 GLTP -343175 sc-eQTL 6.51e-01 -0.108 0.239 0.067 PB L2
ENSG00000139436 GIT2 -459023 sc-eQTL 5.90e-01 0.132 0.244 0.067 PB L2
ENSG00000139437 TCHP -362898 sc-eQTL 7.09e-01 -0.084 0.224 0.067 PB L2
ENSG00000151148 UBE3B 59964 sc-eQTL 3.75e-01 -0.205 0.23 0.067 PB L2
ENSG00000174437 ATP2A2 -743390 sc-eQTL 5.42e-01 0.0912 0.149 0.067 PB L2
ENSG00000174456 C12orf76 -536268 sc-eQTL 3.83e-01 0.194 0.222 0.067 PB L2
ENSG00000189046 ALKBH2 443735 sc-eQTL 3.38e-01 -0.227 0.235 0.067 PB L2
ENSG00000196510 ANAPC7 -866364 sc-eQTL 6.37e-01 -0.102 0.216 0.067 PB L2
ENSG00000204856 FAM216A -931049 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0117 0.232 0.067 PB L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 483414 sc-eQTL 4.00e-01 0.185 0.219 0.067 PB L2
ENSG00000257221 AC007569.1 908698 sc-eQTL 1.35e-01 -0.307 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000075856 SART3 975966 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0817 0.216 0.05 Pro_T L2
ENSG00000076248 UNG 439792 sc-eQTL 5.29e-01 0.101 0.161 0.05 Pro_T L2
ENSG00000076513 ANKRD13A -461820 sc-eQTL 4.51e-01 -0.153 0.203 0.05 Pro_T L2
ENSG00000076555 ACACB 420771 sc-eQTL 6.39e-01 -0.092 0.196 0.05 Pro_T L2
ENSG00000084112 SSH1 679776 sc-eQTL 8.46e-01 0.0389 0.2 0.05 Pro_T L2
ENSG00000110876 SELPLG 903407 sc-eQTL 5.69e-01 0.0849 0.149 0.05 Pro_T L2
ENSG00000110880 CORO1C 805770 sc-eQTL 9.41e-02 0.254 0.151 0.05 Pro_T L2
ENSG00000110906 KCTD10 60007 sc-eQTL 2.09e-01 -0.265 0.21 0.05 Pro_T L2
ENSG00000110921 MVK -35889 sc-eQTL 8.67e-01 0.035 0.208 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111229 ARPC3 -913056 sc-eQTL 9.13e-01 0.0147 0.134 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111231 GPN3 -931902 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0152 0.158 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111237 VPS29 -964745 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0881 0.155 0.05 Pro_T L2
ENSG00000135093 USP30 514277 sc-eQTL 6.17e-01 0.107 0.214 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136003 ISCU 974784 sc-eQTL 4.50e-01 -0.121 0.16 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139428 MMAB -36214 sc-eQTL 3.02e-01 -0.211 0.204 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139433 GLTP -343175 sc-eQTL 1.36e-01 -0.307 0.205 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139436 GIT2 -459023 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0222 0.215 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139437 TCHP -362898 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0624 0.219 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151148 UBE3B 59964 sc-eQTL 8.99e-01 0.0282 0.223 0.05 Pro_T L2
ENSG00000174437 ATP2A2 -743390 sc-eQTL 4.22e-01 -0.12 0.15 0.05 Pro_T L2
ENSG00000174456 C12orf76 -536268 sc-eQTL 1.73e-01 0.284 0.208 0.05 Pro_T L2
ENSG00000189046 ALKBH2 443735 sc-eQTL 3.62e-01 -0.184 0.201 0.05 Pro_T L2
ENSG00000196510 ANAPC7 -866364 sc-eQTL 2.19e-01 -0.244 0.198 0.05 Pro_T L2
ENSG00000204856 FAM216A -931049 sc-eQTL 4.70e-01 0.15 0.207 0.05 Pro_T L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 483414 sc-eQTL 4.18e-01 -0.159 0.196 0.05 Pro_T L2
ENSG00000257221 AC007569.1 908698 sc-eQTL 8.40e-02 -0.168 0.097 0.05 Pro_T L2
ENSG00000075856 SART3 975966 sc-eQTL 3.40e-02 -0.463 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000076513 ANKRD13A -461820 sc-eQTL 9.88e-01 0.00277 0.183 0.051 intMono L2
ENSG00000076555 ACACB 420771 sc-eQTL 2.39e-01 0.231 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000084112 SSH1 679776 sc-eQTL 8.11e-01 -0.048 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000110876 SELPLG 903407 sc-eQTL 1.29e-02 -0.382 0.152 0.051 intMono L2
ENSG00000110880 CORO1C 805770 sc-eQTL 7.13e-01 0.0634 0.172 0.051 intMono L2
ENSG00000110906 KCTD10 60007 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0283 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000110921 MVK -35889 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0717 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000111199 TRPV4 -296035 sc-eQTL 8.10e-01 0.0467 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000111229 ARPC3 -913056 sc-eQTL 6.87e-01 0.0479 0.119 0.051 intMono L2
ENSG00000111231 GPN3 -931902 sc-eQTL 7.02e-01 0.0803 0.21 0.051 intMono L2
ENSG00000111237 VPS29 -964745 sc-eQTL 2.01e-01 0.207 0.161 0.051 intMono L2
ENSG00000135093 USP30 514277 sc-eQTL 2.68e-01 0.227 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000136003 ISCU 974784 sc-eQTL 1.68e-01 0.3 0.216 0.051 intMono L2
ENSG00000139428 MMAB -36214 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0991 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000139433 GLTP -343175 sc-eQTL 8.52e-01 0.0358 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000139436 GIT2 -459023 sc-eQTL 1.91e-01 -0.241 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000139437 TCHP -362898 sc-eQTL 4.32e-01 -0.157 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000151148 UBE3B 59964 sc-eQTL 7.17e-01 -0.075 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000174437 ATP2A2 -743390 sc-eQTL 8.90e-01 0.026 0.187 0.051 intMono L2
ENSG00000174456 C12orf76 -536268 sc-eQTL 5.19e-01 0.14 0.216 0.051 intMono L2
ENSG00000189046 ALKBH2 443735 sc-eQTL 4.12e-01 0.176 0.215 0.051 intMono L2
ENSG00000196510 ANAPC7 -866364 sc-eQTL 3.67e-01 0.187 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000204856 FAM216A -931049 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0859 0.209 0.051 intMono L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 483414 sc-eQTL 3.70e-02 -0.384 0.183 0.051 intMono L2
ENSG00000075856 SART3 975966 sc-eQTL 2.19e-01 0.29 0.235 0.051 pDC L2
ENSG00000076248 UNG 439792 sc-eQTL 4.63e-01 -0.161 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000076513 ANKRD13A -461820 sc-eQTL 7.19e-01 0.0902 0.251 0.051 pDC L2
ENSG00000076555 ACACB 420771 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0586 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000084112 SSH1 679776 sc-eQTL 3.68e-01 -0.214 0.237 0.051 pDC L2
ENSG00000110876 SELPLG 903407 sc-eQTL 4.04e-01 -0.131 0.157 0.051 pDC L2
ENSG00000110880 CORO1C 805770 sc-eQTL 7.41e-01 0.0571 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000110906 KCTD10 60007 sc-eQTL 5.01e-01 -0.179 0.265 0.051 pDC L2
ENSG00000110921 MVK -35889 sc-eQTL 9.71e-01 0.00799 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000111229 ARPC3 -913056 sc-eQTL 1.43e-01 0.207 0.14 0.051 pDC L2
ENSG00000111231 GPN3 -931902 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0235 0.239 0.051 pDC L2
ENSG00000111237 VPS29 -964745 sc-eQTL 6.49e-01 0.0966 0.212 0.051 pDC L2
ENSG00000122970 IFT81 -586969 sc-eQTL 4.85e-01 -0.152 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000135093 USP30 514277 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0421 0.233 0.051 pDC L2
ENSG00000136003 ISCU 974784 sc-eQTL 5.54e-01 0.117 0.197 0.051 pDC L2
ENSG00000139428 MMAB -36214 sc-eQTL 6.72e-01 -0.099 0.233 0.051 pDC L2
ENSG00000139433 GLTP -343175 sc-eQTL 4.20e-01 0.177 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000139436 GIT2 -459023 sc-eQTL 3.99e-01 -0.174 0.206 0.051 pDC L2
ENSG00000139437 TCHP -362898 sc-eQTL 3.82e-02 0.451 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000151148 UBE3B 59964 sc-eQTL 5.21e-01 -0.162 0.251 0.051 pDC L2
ENSG00000174437 ATP2A2 -743390 sc-eQTL 7.14e-01 -0.087 0.237 0.051 pDC L2
ENSG00000174456 C12orf76 -536268 sc-eQTL 4.18e-01 -0.212 0.261 0.051 pDC L2
ENSG00000189046 ALKBH2 443735 sc-eQTL 6.41e-01 -0.106 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000196510 ANAPC7 -866364 sc-eQTL 4.75e-01 0.167 0.233 0.051 pDC L2
ENSG00000204856 FAM216A -931049 sc-eQTL 2.88e-02 0.457 0.207 0.051 pDC L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 483414 sc-eQTL 4.63e-01 -0.154 0.209 0.051 pDC L2
ENSG00000257221 AC007569.1 908698 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0311 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000110906 KCTD10 60007 eQTL 0.00515 -0.124 0.0441 0.0 0.0 0.0393
ENSG00000110921 MVK -35889 eQTL 0.0155 -0.137 0.0563 0.0 0.0 0.0393
ENSG00000122970 IFT81 -586969 eQTL 0.0124 -0.14 0.0558 0.0 0.0 0.0393
ENSG00000139428 MMAB -36214 eQTL 0.00317 -0.148 0.0501 0.0 0.0 0.0393

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000110906 KCTD10 60007 1.24e-05 1.84e-05 2.44e-06 9.8e-06 2.39e-06 6.19e-06 1.85e-05 2.2e-06 1.51e-05 7.65e-06 1.96e-05 7.45e-06 2.57e-05 5.53e-06 4.41e-06 9.06e-06 7.77e-06 1.13e-05 3.64e-06 3.36e-06 6.83e-06 1.4e-05 1.37e-05 4.52e-06 2.55e-05 4.65e-06 7.68e-06 5.78e-06 1.44e-05 1.25e-05 1.03e-05 1.09e-06 1.2e-06 3.63e-06 6.89e-06 3.35e-06 1.76e-06 2.15e-06 2.24e-06 1.6e-06 1.05e-06 1.93e-05 1.66e-06 2.71e-07 9.22e-07 2.33e-06 2.11e-06 7.25e-07 7.82e-07
ENSG00000274598 \N 702982 2.77e-07 1.67e-07 5.64e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.59e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.4e-07 7.18e-08 5.07e-08 1.25e-07 1.47e-07 1.58e-07 2.91e-08 1.85e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.2e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.55e-08 3.29e-08 8e-08 4.92e-08 2.69e-08 4.62e-08 9.3e-08 6.71e-08 5.24e-08 5.59e-08 1.59e-07 5.2e-08 1.43e-08 3.4e-08 1.92e-08 1.22e-07 1.96e-09 4.72e-08