logo

Genes within 1Mb (chr12:108633232:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 1.60e-01 -0.25 0.178 0.052 DC L1
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 4.29e-01 -0.127 0.16 0.052 DC L1
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0554 0.171 0.052 DC L1
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0374 0.177 0.052 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0513 0.187 0.052 DC L1
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 2.68e-01 0.123 0.111 0.052 DC L1
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 4.85e-02 0.235 0.119 0.052 DC L1
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 8.85e-01 0.0286 0.198 0.052 DC L1
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 4.84e-01 -0.122 0.174 0.052 DC L1
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 1.75e-01 -0.248 0.182 0.052 DC L1
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 1.45e-01 0.225 0.154 0.052 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 9.90e-01 0.00218 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0585 0.186 0.052 DC L1
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 5.17e-01 -0.12 0.184 0.052 DC L1
ENSG00000174600 CMKLR1 293915 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0525 0.0986 0.052 DC L1
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 3.06e-01 0.178 0.173 0.052 DC L1
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 6.25e-01 0.0879 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 6.43e-01 0.0776 0.167 0.052 DC L1
ENSG00000257221 AC007569.1 4564 sc-eQTL 3.90e-01 -0.14 0.162 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 4.74e-01 -0.148 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 1.19e-01 0.288 0.184 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 3.90e-01 -0.151 0.175 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 2.08e-01 0.237 0.188 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 9.05e-01 0.0233 0.195 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 4.03e-01 -0.111 0.133 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00669 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 1.93e-01 0.244 0.187 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 1.72e-02 0.447 0.186 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 4.06e-03 -0.491 0.169 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0718 0.195 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 3.46e-01 0.188 0.199 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0531 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 5.41e-01 0.12 0.195 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 3.26e-01 -0.174 0.177 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000256139 AC007637.1 -477986 sc-eQTL 6.15e-02 0.278 0.148 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0156 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 5.87e-01 -0.111 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 5.28e-02 0.345 0.177 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 3.76e-01 -0.165 0.185 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 5.83e-01 0.107 0.194 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 3.84e-01 0.173 0.198 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0371 0.126 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 9.95e-02 -0.299 0.181 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 3.22e-01 -0.201 0.203 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0713 0.193 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 6.44e-01 0.0874 0.189 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 7.28e-01 0.062 0.178 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 4.93e-01 0.131 0.191 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 4.52e-01 0.151 0.2 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 3.32e-02 -0.412 0.192 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 293915 sc-eQTL 3.62e-01 -0.125 0.137 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 7.54e-01 0.0615 0.196 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0406 0.196 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 1.92e-01 0.257 0.196 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 8.15e-01 -0.056 0.238 0.063 PB L2
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 1.93e-01 0.28 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0289 0.2 0.063 PB L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 8.38e-01 0.0456 0.222 0.063 PB L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 6.42e-01 0.0777 0.167 0.063 PB L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 7.41e-01 0.0483 0.146 0.063 PB L2
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 1.82e-01 0.29 0.216 0.063 PB L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 4.68e-01 -0.169 0.232 0.063 PB L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 4.88e-01 -0.152 0.218 0.063 PB L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 3.37e-01 0.208 0.215 0.063 PB L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 2.11e-01 -0.205 0.163 0.063 PB L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 1.30e-01 -0.301 0.198 0.063 PB L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0842 0.21 0.063 PB L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 3.76e-02 0.458 0.217 0.063 PB L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 2.90e-01 -0.24 0.226 0.063 PB L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 8.64e-01 0.0279 0.163 0.063 PB L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 6.76e-03 0.564 0.204 0.063 PB L2
ENSG00000257221 AC007569.1 4564 sc-eQTL 5.46e-01 0.119 0.197 0.063 PB L2
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 1.09e-01 -0.3 0.186 0.051 cDC L2
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0524 0.162 0.051 cDC L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 8.95e-01 0.0226 0.171 0.051 cDC L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0671 0.193 0.051 cDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 3.89e-01 -0.168 0.195 0.051 cDC L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 2.22e-01 0.176 0.143 0.051 cDC L2
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 6.26e-02 0.319 0.17 0.051 cDC L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0612 0.202 0.051 cDC L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 2.38e-01 -0.221 0.186 0.051 cDC L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 4.88e-01 -0.127 0.183 0.051 cDC L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0332 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 1.32e-01 0.26 0.172 0.051 cDC L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0204 0.191 0.051 cDC L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0342 0.189 0.051 cDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 293915 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0101 0.15 0.051 cDC L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 4.93e-01 -0.132 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 2.48e-01 -0.186 0.161 0.051 cDC L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 4.68e-01 0.116 0.159 0.051 cDC L2
ENSG00000257221 AC007569.1 4564 sc-eQTL 1.60e-01 -0.187 0.133 0.051 cDC L2
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0533 0.189 0.051 intMono L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0203 0.169 0.051 intMono L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0918 0.173 0.051 intMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 3.26e-01 -0.182 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 3.79e-01 -0.117 0.133 0.051 intMono L2
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00317 0.149 0.051 intMono L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0796 0.188 0.051 intMono L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 7.40e-01 0.0594 0.179 0.051 intMono L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 7.79e-01 0.0498 0.177 0.051 intMono L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0544 0.188 0.051 intMono L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 5.49e-01 -0.112 0.187 0.051 intMono L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 4.69e-01 0.136 0.187 0.051 intMono L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0897 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 293915 sc-eQTL 4.10e-01 0.132 0.16 0.051 intMono L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 1.80e-01 -0.249 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 7.85e-01 0.0486 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 5.29e-01 0.101 0.16 0.051 intMono L2
ENSG00000075856 SART3 71832 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0729 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000076248 UNG -464342 sc-eQTL 2.13e-01 -0.228 0.182 0.051 pDC L2
ENSG00000076555 ACACB -483363 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0788 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000084112 SSH1 -224358 sc-eQTL 5.88e-01 0.108 0.198 0.051 pDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 871960 sc-eQTL 2.25e-01 0.267 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000110876 SELPLG -727 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.051 pDC L2
ENSG00000110880 CORO1C -98364 sc-eQTL 5.60e-03 0.395 0.14 0.051 pDC L2
ENSG00000110906 KCTD10 -844127 sc-eQTL 7.71e-01 0.0646 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000110921 MVK -940023 sc-eQTL 6.99e-01 0.0718 0.185 0.051 pDC L2
ENSG00000135093 USP30 -389857 sc-eQTL 1.09e-01 -0.31 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000136003 ISCU 70650 sc-eQTL 2.52e-01 0.188 0.164 0.051 pDC L2
ENSG00000136045 PWP1 947433 sc-eQTL 2.89e-01 -0.205 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000139428 MMAB -940348 sc-eQTL 1.45e-01 0.283 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000151148 UBE3B -844170 sc-eQTL 2.22e-01 -0.256 0.209 0.051 pDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 293915 sc-eQTL 9.74e-01 0.00445 0.134 0.051 pDC L2
ENSG00000189046 ALKBH2 -460399 sc-eQTL 5.68e-01 0.108 0.189 0.051 pDC L2
ENSG00000198855 FICD 117955 sc-eQTL 8.23e-01 0.0423 0.189 0.051 pDC L2
ENSG00000256262 USP30-AS1 -420720 sc-eQTL 4.69e-01 0.126 0.174 0.051 pDC L2
ENSG00000257221 AC007569.1 4564 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0377 0.184 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000076248 UNG -464342 eQTL 0.204 -0.0576 0.0453 0.00115 0.0 0.0368
ENSG00000110880 CORO1C -98364 eQTL 0.0246 0.11 0.0487 0.0 0.0 0.0368
ENSG00000136045 PWP1 947433 eQTL 0.0447 0.101 0.0501 0.0 0.0 0.0368
ENSG00000139428 MMAB -940348 eQTL 0.0109 0.143 0.056 0.00162 0.0 0.0368
ENSG00000257221 AC007569.1 4545 eQTL 7.38e-07 -0.425 0.0852 0.00307 0.0 0.0368

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000076248 UNG -464342 2.64e-07 1.11e-07 3.88e-08 1.81e-07 9.02e-08 9.61e-08 1.42e-07 5.37e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.56e-07 7.75e-08 1.26e-07 6.21e-08 6e-08 7.5e-08 4.63e-08 1.14e-07 5.82e-08 4.42e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.16e-08 1.32e-07 1.16e-07 1.08e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.26e-08 3.35e-08 8.65e-08 7.36e-08 3.97e-08 5.05e-08 9.26e-08 6.86e-08 3.99e-08 5.39e-08 1.33e-07 5.21e-08 1.08e-08 3.42e-08 1.69e-08 1.23e-07 3.86e-09 4.73e-08
ENSG00000110876 \N -727 9.03e-05 6.27e-05 8.75e-06 1.84e-05 7.81e-06 2.24e-05 6.81e-05 6.27e-06 4.81e-05 1.95e-05 6.77e-05 2.45e-05 8.55e-05 2.12e-05 8.96e-06 2.94e-05 2.74e-05 3.74e-05 1.07e-05 8.56e-06 2.5e-05 5.47e-05 5.12e-05 1.15e-05 6.61e-05 1.23e-05 1.99e-05 1.73e-05 5.59e-05 3.44e-05 3.05e-05 1.64e-06 2.59e-06 7.85e-06 1.59e-05 7.42e-06 3.43e-06 3.35e-06 5.37e-06 3.51e-06 1.77e-06 7.27e-05 5.77e-06 3.78e-07 3.52e-06 5.25e-06 5.18e-06 2.12e-06 1.47e-06
ENSG00000110880 CORO1C -98364 4.35e-06 3.76e-06 4.64e-07 2.59e-06 4.63e-07 1.01e-06 2.56e-06 1.01e-06 2.47e-06 1.44e-06 4.34e-06 2.24e-06 5.41e-06 1.43e-06 1.22e-06 1.77e-06 1.32e-06 2.15e-06 1.49e-06 1.28e-06 1.36e-06 3.15e-06 2.87e-06 1.6e-06 4.78e-06 1.23e-06 1.55e-06 1.78e-06 2.06e-06 2.37e-06 2.04e-06 4.14e-07 6.46e-07 1.32e-06 2.13e-06 9.33e-07 8.33e-07 4.49e-07 1.3e-06 3.99e-07 3.62e-07 5.18e-06 3.64e-07 1.99e-07 3.99e-07 3.33e-07 8.85e-07 2.72e-07 2.87e-07
ENSG00000257221 AC007569.1 4545 4.1e-05 3.46e-05 6.4e-06 1.56e-05 5.94e-06 1.51e-05 4.66e-05 4.55e-06 3.23e-05 1.56e-05 3.97e-05 1.78e-05 4.95e-05 1.45e-05 7.12e-06 1.98e-05 1.84e-05 2.66e-05 7.94e-06 6.66e-06 1.6e-05 3.46e-05 3.33e-05 9.09e-06 4.56e-05 8.26e-06 1.46e-05 1.3e-05 3.36e-05 2.61e-05 2.08e-05 1.64e-06 2.59e-06 7.05e-06 1.2e-05 5.84e-06 3.13e-06 3.16e-06 4.58e-06 3.3e-06 1.77e-06 4.03e-05 3.87e-06 3.59e-07 2.59e-06 3.93e-06 4.14e-06 1.58e-06 1.49e-06