Genes within 1Mb (chr12:107429216:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 2.52e-02 0.182 0.0808 0.139 B L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.10e-01 0.0179 0.0482 0.139 B L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0544 0.0942 0.139 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000964 0.13 0.139 B L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0786 0.068 0.139 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.62e-01 0.128 0.0913 0.139 B L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0478 0.0527 0.139 CD4T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0267 0.0669 0.139 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00644 0.0829 0.139 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0293 0.102 0.139 CD4T L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 7.50e-01 0.0313 0.0982 0.139 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.11e-01 0.128 0.08 0.139 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 9.80e-01 0.00178 0.069 0.139 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.139 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0204 0.0675 0.139 CD8T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0653 0.0792 0.139 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.46e-01 -0.117 0.1 0.139 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.139 CD8T L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.30e-01 -0.13 0.108 0.139 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 3.64e-01 0.0783 0.086 0.139 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 3.59e-02 0.116 0.0552 0.139 CD8T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0892 0.0699 0.139 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 3.51e-01 -0.117 0.126 0.139 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00949 0.111 0.133 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0687 0.129 0.133 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 1.00e-01 -0.201 0.122 0.133 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00955 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.28e-02 -0.244 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0247 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0265 0.068 0.133 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0118 0.0854 0.139 Mono L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.28e-01 -0.163 0.107 0.139 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0716 0.0983 0.139 Mono L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0434 0.102 0.139 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 9.15e-01 0.01 0.0944 0.139 Mono L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0831 0.109 0.139 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0497 0.0624 0.139 NK L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 2.94e-01 -0.097 0.0921 0.139 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 5.74e-02 0.198 0.103 0.139 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.22e-01 0.0383 0.107 0.139 NK L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.63e-02 -0.229 0.109 0.139 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.108 0.139 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 1.43e-02 -0.209 0.0844 0.139 NK L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0365 0.0529 0.139 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 2.06e-01 0.165 0.13 0.139 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 4.15e-01 0.0543 0.0665 0.139 Other_T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.77e-01 0.0958 0.108 0.139 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0873 0.139 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0303 0.105 0.139 Other_T L1
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 7.36e-01 0.0301 0.0892 0.139 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 2.54e-01 -0.125 0.109 0.139 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 1.64e-01 0.109 0.0783 0.139 Other_T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0419 0.0904 0.139 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.05e-01 0.191 0.118 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 7.39e-02 0.223 0.124 0.148 B_Activated L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.50e-01 -0.106 0.114 0.148 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.34e-01 0.0104 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00395 0.0971 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 6.19e-02 -0.243 0.129 0.148 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 6.89e-02 0.237 0.129 0.148 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 5.10e-01 0.0778 0.118 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0953 0.0644 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.20e-01 -0.142 0.115 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.124 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 1.34e-01 -0.129 0.0857 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0412 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.42e-01 0.0246 0.124 0.138 B_Memory L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 5.91e-01 -0.038 0.0707 0.138 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.37e-01 -0.106 0.111 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0079 0.0943 0.138 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 9.57e-01 0.00671 0.125 0.138 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 1.91e-01 0.143 0.109 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00377 0.0536 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00286 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 4.80e-01 0.0933 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.44e-01 0.00478 0.0677 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 3.53e-02 0.274 0.129 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 7.64e-01 0.0387 0.129 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0284 0.0643 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.115 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0723 0.131 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.50e-01 -0.101 0.0876 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 8.03e-01 0.0326 0.13 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 1.63e-01 -0.143 0.102 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 8.61e-02 0.225 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 1.20e-01 -0.203 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0411 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 1.60e-01 0.185 0.131 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 8.16e-01 -0.031 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 5.61e-01 0.0607 0.104 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0248 0.111 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0913 0.0616 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0181 0.0737 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 5.00e-01 0.06 0.0889 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.16e-01 -0.119 0.118 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.38e-01 0.00897 0.115 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 4.90e-01 0.0598 0.0865 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 6.90e-01 0.0309 0.0775 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 9.57e-01 0.00655 0.122 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 6.34e-01 0.0374 0.0786 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0398 0.0946 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 5.94e-01 0.0603 0.113 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 1.72e-01 0.178 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0087 0.115 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.108 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0677 0.0877 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 6.77e-02 0.239 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 9.91e-01 0.00116 0.107 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 9.54e-01 0.00676 0.118 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.30e-01 -0.147 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 8.20e-01 0.0297 0.131 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0239 0.121 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0797 0.12 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0121 0.0913 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.90e-01 0.165 0.126 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 3.68e-01 0.0723 0.0802 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0951 0.0956 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 3.12e-02 -0.244 0.112 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.56e-02 0.263 0.124 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 1.53e-01 -0.174 0.122 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 2.51e-02 0.231 0.102 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 7.83e-01 0.0307 0.112 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0922 0.0739 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0837 0.128 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.93e-03 -0.237 0.0898 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.14e-01 0.0363 0.0988 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0409 0.118 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0223 0.121 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 5.04e-01 0.0766 0.115 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 2.06e-01 -0.133 0.105 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 2.34e-01 0.0975 0.0818 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 7.53e-02 -0.145 0.0809 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.01e-01 -0.204 0.124 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0796 0.111 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.99e-01 0.159 0.124 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 6.65e-01 0.0549 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.57e-01 0.0394 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 4.46e-01 -0.102 0.134 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 6.85e-01 0.0535 0.132 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 2.43e-01 0.129 0.11 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 1.03e-01 0.0731 0.0446 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0958 0.12 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 2.15e-01 0.144 0.116 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.18e-01 -0.133 0.133 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0265 0.126 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 8.14e-01 0.031 0.132 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.79e-01 0.113 0.128 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 6.09e-02 0.227 0.12 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0686 0.0921 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.37e-01 0.173 0.116 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.50e-01 0.0185 0.0977 0.139 MAIT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 5.15e-01 0.0784 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.19e-01 0.0111 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0808 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0693 0.131 0.139 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 4.71e-01 0.0933 0.129 0.139 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 2.69e-01 0.109 0.0982 0.139 MAIT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 9.53e-01 0.00372 0.0633 0.139 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.121 0.139 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0233 0.0982 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.128 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 4.45e-01 -0.103 0.135 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00575 0.126 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 7.42e-01 0.0425 0.129 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 3.38e-01 0.121 0.126 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 4.43e-01 0.0853 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0993 0.0872 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.22e-01 0.192 0.123 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 7.79e-01 0.0217 0.077 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.19e-01 0.0368 0.102 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.54e-02 0.193 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.18e-01 0.0416 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 1.76e-01 -0.169 0.124 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.24e-01 -0.184 0.119 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 8.58e-02 -0.165 0.0956 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0824 0.0629 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 6.79e-01 0.0554 0.134 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0973 0.105 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0732 0.125 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0127 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0185 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.53e-01 0.117 0.126 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 6.24e-01 0.0642 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00829 0.112 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0741 0.091 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 5.69e-01 0.0685 0.12 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 1.76e-01 -0.118 0.0868 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0274 0.105 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 8.05e-01 0.0293 0.118 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.121 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 5.34e-02 -0.229 0.118 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0685 0.124 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 2.02e-01 -0.116 0.0906 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 1.09e-01 -0.124 0.0772 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 9.18e-01 0.0131 0.127 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 3.64e-01 -0.132 0.145 0.159 PB L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.05e-01 0.122 0.118 0.159 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0484 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 5.10e-02 -0.255 0.129 0.159 PB L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.64e-01 -0.129 0.141 0.159 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0926 0.112 0.159 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 8.95e-03 0.225 0.0851 0.137 Pro_T L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.20e-02 0.236 0.13 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 2.22e-01 0.144 0.117 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 5.38e-01 0.0727 0.118 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 2.54e-01 -0.125 0.109 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 6.52e-01 0.0494 0.109 0.137 Pro_T L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 9.46e-01 0.00641 0.0941 0.137 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 6.59e-01 -0.046 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0483 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 2.10e-01 -0.148 0.118 0.139 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 6.36e-01 0.0586 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 2.09e-01 0.169 0.134 0.139 Treg L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 5.12e-01 0.0823 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 7.75e-01 0.0356 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 7.41e-01 0.0298 0.0901 0.139 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 2.52e-01 0.14 0.122 0.139 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 2.36e-01 0.152 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.39e-01 -0.205 0.138 0.132 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0524 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0853 0.112 0.132 cDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 4.12e-03 -0.35 0.12 0.132 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.46e-01 0.175 0.12 0.132 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 6.68e-01 0.0486 0.113 0.132 cDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0949 0.106 0.132 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 6.98e-01 0.0422 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.03e-02 -0.264 0.120826 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 3.24e-01 -0.109 0.111 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0821 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00366 0.1 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 3.51e-01 -0.109 0.116418 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 7.03e-01 0.048 0.126 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.38e-01 -0.122 0.127 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 8.29e-01 0.0252 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.78e-01 0.105 0.119 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 6.35e-01 0.0544 0.114 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 4.92e-01 0.0982 0.143 0.124 gdT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0546 0.16 0.124 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 5.09e-01 -0.1 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 4.57e-01 0.121 0.163 0.124 gdT L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.43e-01 0.194 0.166 0.124 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0575 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 5.77e-01 0.0738 0.132 0.124 gdT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0427 0.101 0.124 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 1.85e-01 0.196 0.147 0.124 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0779 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 3.62e-01 0.121 0.132 0.136 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 6.47e-01 0.0554 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.23e-01 -0.132 0.133 0.136 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 8.30e-01 0.0249 0.116 0.136 intMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0195 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0467 0.0892 0.136 ncMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 8.69e-01 0.0182 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.112 0.136 ncMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.79e-01 -0.128 0.118 0.136 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 4.02e-02 -0.234 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00462 0.112 0.136 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 2.14e-01 -0.159 0.128 0.121 pDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 8.27e-01 0.0339 0.155 0.121 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 4.16e-01 -0.11 0.135 0.121 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 3.18e-01 0.126 0.126 0.121 pDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.79e-01 0.00364 0.137 0.121 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 4.51e-01 -0.108 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 1.86e-02 0.26 0.109 0.121 pDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0569 0.0948 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 1.26e-01 0.174 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0925 0.0624 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.71e-01 0.0372 0.128 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 9.67e-02 -0.139 0.0834 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0462 0.125 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 3.18e-01 0.0995 0.0993 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0217 0.0468 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 1.74e-01 -0.166 0.122 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0209 0.066 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 1.06e-01 0.203 0.125 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 6.44e-01 0.0483 0.104 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 1.45e-02 -0.273 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0835 0.107 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 6.25e-01 0.0506 0.103 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 5.56e-01 0.057 0.0967 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0689 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0904 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 6.42e-01 0.0526 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 8.48e-01 0.0202 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 2.01e-02 -0.282 0.12 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 2.94e-01 -0.11 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0412 0.109 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 335667 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0418 0.0643 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00701 0.0898 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 654595 sc-eQTL 4.96e-02 0.211 0.107 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 442056 sc-eQTL 8.70e-01 0.0184 0.112 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -256583 sc-eQTL 3.18e-02 -0.251 0.116 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 473497 sc-eQTL 5.97e-02 -0.213 0.112 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 110795 sc-eQTL 7.60e-02 -0.148 0.0831 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -910101 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0638 0.0587 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 473719 sc-eQTL 9.35e-01 0.0107 0.132 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 335667 eQTL 0.0266 0.0529 0.0238 0.0 0.0 0.111
ENSG00000110851 PRDM4 -332056 eQTL 0.255 0.0434 0.038 0.00245 0.0 0.111


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 CRY1 335667 1.31e-06 2.15e-06 2.56e-07 1.02e-06 3.5e-07 5.26e-07 1.36e-06 3.34e-07 1.49e-06 5.15e-07 1.99e-06 7.5e-07 2.7e-06 2.98e-07 4.48e-07 7.95e-07 9.18e-07 7.21e-07 6.62e-07 6.76e-07 6.36e-07 1.72e-06 2.16e-06 6.68e-07 2.44e-06 4.11e-07 7.97e-07 5.78e-07 1.78e-06 1.38e-06 8.51e-07 5.35e-08 5.95e-08 4.57e-07 5.39e-07 4.42e-07 2.14e-07 1.24e-07 1.01e-07 9.5e-09 4.36e-08 2.2e-06 3.49e-07 1.06e-08 1.73e-07 1.25e-07 1.37e-07 8.74e-08 1.47e-07
ENSG00000174600 \N -910101 2.74e-07 1.53e-07 5.35e-08 1.97e-07 9.8e-08 9.91e-08 2.24e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.67e-07 1.05e-07 2.05e-07 7.95e-08 5.69e-08 7.49e-08 4.01e-08 1.51e-07 6.32e-08 4.23e-08 1.22e-07 1.25e-07 1.68e-07 2.87e-08 2.09e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.61e-08 1.31e-07 1.24e-07 1.06e-07 3.7e-08 3.16e-08 8.11e-08 5.99e-08 3.18e-08 5.11e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.87e-08 4.19e-08 1.5e-07 3.35e-08 1.91e-08 3.83e-08 1.55e-08 1.24e-07 3.78e-09 4.91e-08