logo

Genes within 1Mb (chr12:107416438:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 8.75e-02 0.137 0.08 0.132 B L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 8.01e-01 0.012 0.0475 0.132 B L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0663 0.0928 0.132 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0451 0.128 0.132 B L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.34e-01 -0.101 0.0669 0.132 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.39e-01 0.106 0.09 0.132 B L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0667 0.0521 0.132 CD4T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0288 0.0663 0.132 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 7.05e-01 0.0311 0.0821 0.132 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0956 0.101 0.132 CD4T L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 6.44e-01 0.0449 0.0972 0.132 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.10e-01 0.1 0.0794 0.132 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 9.85e-01 0.0013 0.0684 0.132 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.51e-01 0.165 0.115 0.132 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0273 0.0667 0.132 CD8T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00686 0.0783 0.132 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0892 0.0993 0.132 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 2.17e-01 0.127 0.103 0.132 CD8T L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.42e-01 -0.157 0.106 0.132 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 1.61e-01 0.119 0.0847 0.132 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 3.90e-02 0.113 0.0545 0.132 CD8T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0833 0.0691 0.132 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.76e-01 -0.168 0.124 0.132 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 8.87e-01 0.0158 0.111 0.126 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 2.11e-01 -0.16 0.128 0.126 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 7.72e-02 -0.216 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0342 0.114 0.126 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.19e-02 -0.199 0.114 0.126 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0129 0.114 0.126 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 9.63e-01 0.00495 0.108 0.126 DC L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0368 0.0678 0.126 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0101 0.0839 0.132 Mono L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 1.34e-01 -0.158 0.105 0.132 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0772 0.0966 0.132 Mono L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0243 0.1 0.132 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00981 0.0928 0.132 Mono L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0765 0.107 0.132 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0666 0.0612 0.133 NK L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0956 0.0905 0.133 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.47e-02 0.189 0.102 0.133 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 9.11e-01 0.0118 0.106 0.133 NK L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 4.97e-02 -0.211 0.107 0.133 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0839 0.106 0.133 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 1.01e-02 -0.215 0.0828 0.133 NK L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0431 0.052 0.133 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 3.25e-01 0.126 0.128 0.133 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.35e-01 0.0514 0.0657 0.132 Other_T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.80e-01 0.0939 0.107 0.132 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 2.58e-01 0.0976 0.0861 0.132 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0369 0.103 0.132 Other_T L1
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.07e-01 0.0215 0.0881 0.132 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0933 0.108 0.132 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 1.04e-01 0.126 0.0771 0.132 Other_T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 5.53e-01 -0.053 0.0892 0.132 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 6.78e-02 0.213 0.116 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.41e-02 0.278 0.122 0.14 B_Activated L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.95e-01 0.0486 0.124 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00244 0.0963 0.14 B_Activated L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 2.90e-01 -0.137 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.59e-01 0.146 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 5.72e-01 0.0662 0.117 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.61e-02 -0.118 0.0637 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.54e-01 -0.106 0.114 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 1.73e-01 0.168 0.123 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.26e-01 -0.13 0.0849 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0878 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 8.92e-01 0.0166 0.122 0.131 B_Memory L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0466 0.0698 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 2.89e-01 0.129 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 2.92e-01 -0.115 0.109 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 9.08e-01 0.0108 0.0932 0.131 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 8.22e-01 0.0278 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.68e-01 0.0789 0.109 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0038 0.0531 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0208 0.119 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.67e-01 0.0388 0.131 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0171 0.0671 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.73e-02 0.285 0.128 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 9.81e-01 -0.003 0.128 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0447 0.0637 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 7.59e-02 -0.202 0.113 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.26e-01 -0.128 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.03e-01 -0.142 0.0866 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0286 0.129 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 1.36e-01 -0.151 0.101 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 2.26e-01 0.157 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 1.40e-01 -0.191 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0217 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.10e-01 0.207 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0823 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 5.79e-01 0.0574 0.103 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 9.62e-01 0.00522 0.11 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0942 0.061 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0343 0.073 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.58e-01 0.081 0.088 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.89e-02 -0.205 0.116 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0153 0.113 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.86e-01 0.0598 0.0857 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 7.82e-01 0.0213 0.0768 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 7.43e-01 0.0396 0.121 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 7.02e-01 0.0298 0.0777 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0489 0.0935 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.73e-01 0.0995 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 1.87e-01 0.169 0.128 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.18e-01 0.0262 0.113 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.60e-01 0.079 0.107 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0634 0.0868 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 3.44e-02 0.273 0.128 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 9.48e-01 0.00685 0.106 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 5.61e-01 0.0678 0.117 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.09e-01 -0.123 0.121 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0347 0.129 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 6.88e-01 0.0485 0.12 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0506 0.119 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00698 0.0905 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.79e-01 0.168 0.125 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 1.79e-01 0.107 0.0794 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0851 0.095 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.85e-02 -0.205 0.112 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.22e-02 0.266 0.123 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.82e-02 -0.206 0.12 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 1.55e-02 0.248 0.102 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 6.88e-01 0.0445 0.111 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0982 0.0734 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 2.84e-01 -0.136 0.127 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.14e-03 -0.257 0.0888 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 4.45e-01 0.0749 0.0979 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0674 0.117 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0153 0.12 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.69e-01 0.102 0.114 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0725 0.104 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 1.44e-01 0.119 0.081 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 7.51e-02 -0.144 0.0803 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.38e-01 -0.183 0.123 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0868 0.11 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 1.75e-01 0.167 0.123 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 5.29e-01 0.0794 0.126 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 4.85e-01 0.0885 0.127 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 2.70e-01 -0.147 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 1.48e-01 0.159 0.11 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.92e-02 0.0734 0.0443 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0923 0.119 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.71e-01 0.127 0.115 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0676 0.132 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0219 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 6.93e-01 0.0517 0.131 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 5.07e-01 0.0847 0.127 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0959 0.131 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 8.69e-02 0.206 0.12 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0766 0.0913 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.12e-01 0.183 0.115 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 7.77e-01 0.0273 0.0965 0.132 MAIT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 4.94e-01 0.0814 0.119 0.132 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 7.56e-01 0.0336 0.108 0.132 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.97e-01 -0.1 0.118 0.132 MAIT L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0534 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.68e-01 0.141 0.127 0.132 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 2.53e-01 0.111 0.0969 0.132 MAIT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.74e-01 0.00201 0.0625 0.132 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.132 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0523 0.0972 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.74e-01 -0.113 0.127 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.86e-01 -0.116 0.133 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 9.11e-01 -0.014 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 4.51e-01 0.0965 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.12e-01 0.156 0.124 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 3.49e-01 0.103 0.11 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0844 0.0864 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 4.22e-01 0.099 0.123 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 9.44e-01 0.00534 0.0758 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.24e-01 0.0494 0.101 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 1.52e-01 0.163 0.113 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00255 0.113 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 2.44e-01 -0.143 0.123 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 3.86e-01 -0.102 0.118 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.96e-02 -0.185 0.0939 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 6.24e-02 -0.116 0.0617 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 6.59e-01 0.0583 0.132 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0511 0.104 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0499 0.124 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0206 0.129 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0515 0.13 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 5.91e-01 0.0674 0.125 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 6.77e-01 0.0541 0.13 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 8.52e-01 0.0207 0.111 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0507 0.0905 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 6.72e-01 0.0506 0.119 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.43e-01 -0.101 0.086 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0768 0.104 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.11e-01 0.0597 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.76e-01 0.106 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.30e-02 -0.25 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0625 0.123 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 2.09e-01 -0.113 0.0897 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0705 0.0768 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 9.84e-01 0.00255 0.126 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 3.60e-01 -0.135 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.12 0.148 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0365 0.142 0.148 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 5.47e-02 -0.255 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 2.17e-01 -0.177 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0582 0.114 0.148 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 7.60e-02 0.152 0.0852 0.13 Pro_T L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 7.49e-02 0.231 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 1.01e-01 0.191 0.116 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 6.75e-01 0.0492 0.117 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 9.94e-01 0.0008 0.101 0.13 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.03e-01 -0.138 0.108 0.13 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.34e-01 0.085 0.108 0.13 Pro_T L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.87e-01 0.0015 0.0933 0.13 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0497 0.103 0.13 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.90e-01 -0.114 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.07e-01 -0.119 0.116 0.132 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.76e-01 0.0507 0.121 0.132 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 6.18e-01 0.0658 0.132 0.132 Treg L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.123 0.132 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 8.73e-01 0.0195 0.122 0.132 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 8.71e-01 0.0144 0.0884 0.132 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 1.42e-01 0.176 0.119 0.132 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 1.72e-01 0.173 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 1.62e-01 -0.192 0.137 0.124 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0745 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0843 0.111 0.124 cDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 7.53e-03 -0.323 0.119 0.124 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 2.73e-01 0.13 0.119 0.124 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.95e-01 0.0766 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0811 0.105 0.124 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.89e-01 0.0427 0.107 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 2.80e-02 -0.263 0.118881 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0922 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0813 0.105 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0142 0.0987 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 2.84e-01 -0.123 0.114505 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 7.67e-01 0.037 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 2.54e-01 -0.143 0.125 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 9.06e-01 0.0135 0.115 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.118 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 2.73e-01 0.125 0.114 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 5.14e-01 0.0738 0.113 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 5.62e-01 0.0814 0.14 0.121 gdT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0668 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.47e-01 -0.14 0.149 0.121 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.38e-01 0.153 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.97e-01 0.21 0.162 0.121 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0422 0.146 0.121 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.129 0.121 gdT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0826 0.0993 0.121 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 2.27e-01 0.176 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0585 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 3.25e-01 0.129 0.131 0.129 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.46e-01 0.055 0.12 0.129 intMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 4.03e-01 -0.11 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 8.87e-01 0.0164 0.115 0.129 intMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.97e-01 0.000399 0.113 0.129 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 5.57e-01 -0.052 0.0886 0.129 ncMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 9.20e-01 0.011 0.11 0.129 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0145 0.111 0.129 ncMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 2.95e-01 -0.123 0.117 0.129 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 2.93e-02 -0.247 0.113 0.129 ncMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.90e-01 0.00142 0.111 0.129 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0888 0.125 0.116 pDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 4.70e-01 -0.11 0.151 0.116 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 3.47e-01 -0.124 0.132 0.116 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 3.04e-01 0.127 0.123 0.116 pDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0302 0.134 0.116 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0868 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 3.81e-02 0.224 0.107 0.116 pDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0924 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.112 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 9.53e-02 -0.103 0.0613 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0759 0.111 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 5.31e-01 0.0789 0.126 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 1.18e-01 -0.129 0.0822 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0805 0.123 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.38e-01 0.0463 0.0984 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0248 0.0463 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 1.16e-01 -0.19 0.12 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0552 0.132 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0545 0.0652 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 1.91e-01 0.163 0.124 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 6.33e-01 0.0491 0.103 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 1.23e-02 -0.275 0.109 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0882 0.105 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 5.70e-01 0.058 0.102 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 7.14e-01 0.0349 0.0952 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0719 0.109 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 2.54e-01 -0.103 0.0896 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 6.50e-01 0.0508 0.112 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.104 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.47e-02 -0.254 0.12 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 2.32e-01 -0.125 0.104 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00949 0.108 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 322889 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0529 0.0633 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00377 0.0884 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 641817 sc-eQTL 6.82e-02 0.193 0.105 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 429278 sc-eQTL 9.68e-01 0.00441 0.11 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -269361 sc-eQTL 3.31e-02 -0.245 0.114 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 460719 sc-eQTL 1.79e-01 -0.15 0.111 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 98017 sc-eQTL 4.85e-02 -0.162 0.0817 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -922879 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0707 0.0578 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 460941 sc-eQTL 9.75e-01 0.00414 0.13 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000110851 PRDM4 -344834 eQTL 0.263 0.0428 0.0382 0.00146 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 \N 322889 1.3e-06 9.36e-07 3.03e-07 3.43e-07 2.19e-07 4.23e-07 9.92e-07 3.27e-07 1.12e-06 3.89e-07 1.25e-06 5.71e-07 1.49e-06 2.4e-07 4.41e-07 6.22e-07 7.7e-07 5.65e-07 4.54e-07 4.71e-07 3.35e-07 9.64e-07 7.15e-07 5.1e-07 1.69e-06 2.99e-07 6.16e-07 4.96e-07 8.97e-07 1.08e-06 5.1e-07 3.9e-08 1.78e-07 3.91e-07 3.66e-07 3.92e-07 3.4e-07 1.5e-07 1.5e-07 4.09e-08 2.45e-07 1.19e-06 5.37e-08 5.96e-09 1.93e-07 7.5e-08 1.9e-07 8.51e-08 9.42e-08
ENSG00000174600 \N -922879 2.67e-07 1.3e-07 4.69e-08 1.8e-07 9.25e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.57e-07 9.19e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.68e-08 3.66e-08 8.34e-08 7.51e-08 3.49e-08 4.95e-08 9.23e-08 6.55e-08 3.87e-08 5.13e-08 1.35e-07 5.2e-08 2.1e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.22e-07 3.79e-09 5.04e-08