Genes within 1Mb (chr12:107345809:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.72e-01 0.0113 0.0702 0.239 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0962 0.102 0.239 B L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 7.16e-02 0.0744 0.0411 0.239 B L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0212 0.0809 0.239 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0878 0.112 0.239 B L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 9.25e-01 0.00552 0.0586 0.239 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 6.79e-03 -0.211 0.0773 0.239 B L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 3.91e-01 0.0395 0.0459 0.239 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.14e-01 0.0738 0.0731 0.239 CD4T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 2.96e-01 0.0609 0.0581 0.239 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.72e-01 0.0519 0.0721 0.239 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.07e-01 0.0589 0.0885 0.239 CD4T L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 1.01e-01 -0.14 0.085 0.239 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.74e-01 0.0952 0.0698 0.239 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0267 0.0601 0.239 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0424 0.101 0.239 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 5.34e-01 0.0363 0.0583 0.239 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 7.63e-01 0.0261 0.0865 0.239 CD8T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.29e-01 -0.104 0.0681 0.239 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.09e-01 0.139 0.0865 0.239 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.64e-01 -0.052 0.0901 0.239 CD8T L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0751 0.0931 0.239 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0103 0.0744 0.239 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 1.19e-01 -0.075 0.0479 0.239 CD8T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0605 0.0605 0.239 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0483 0.109 0.239 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.82e-01 -0.104 0.0964 0.241 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 5.41e-01 -0.063 0.103 0.241 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 5.64e-01 0.0646 0.112 0.241 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.88e-01 0.0428 0.107 0.241 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0403 0.0992 0.241 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0181 0.0999 0.241 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.099 0.241 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 3.94e-01 0.0799 0.0936 0.241 DC L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 9.28e-01 0.00535 0.0592 0.241 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 1.90e-01 0.0945 0.0718 0.239 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0803 0.0864 0.239 Mono L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 2.61e-01 0.102 0.0905 0.239 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 2.51e-01 0.0955 0.0829 0.239 Mono L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.10e-01 -0.108 0.0856 0.239 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 9.80e-01 -0.002 0.0798 0.239 Mono L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 4.45e-01 0.0703 0.0918 0.239 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 3.30e-01 0.0519 0.0532 0.24 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 2.41e-01 -0.112 0.0953 0.24 NK L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.10e-01 0.0402 0.0788 0.24 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 8.58e-01 0.0159 0.089 0.24 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 2.05e-01 0.116 0.0913 0.24 NK L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.50e-01 -0.108 0.0933 0.24 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 2.63e-01 0.103 0.092 0.24 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 6.11e-01 0.0372 0.0731 0.24 NK L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000575 0.0452 0.24 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0869 0.111 0.24 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0256 0.0573 0.239 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 5.74e-01 0.0604 0.107 0.239 Other_T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 7.94e-02 -0.163 0.0925 0.239 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0934 0.075 0.239 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 4.48e-01 0.0684 0.0899 0.239 Other_T L1
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00224 0.0768 0.239 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 5.16e-01 0.0611 0.0939 0.239 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0104 0.0676 0.239 Other_T L1
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 1.80e-01 0.104 0.0775 0.239 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 5.28e-01 0.0642 0.102 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0817 0.11 0.255 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0837 0.108 0.255 B_Activated L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.0997 0.255 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 3.96e-02 0.226 0.109 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.98e-01 -0.011 0.0856 0.255 B_Activated L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 6.33e-02 0.213 0.114 0.255 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 4.20e-01 0.0928 0.115 0.255 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.30e-01 0.0496 0.103 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.41e-01 0.108 0.113 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 4.15e-01 0.046 0.0563 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 3.87e-02 -0.207 0.0997 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 1.45e-01 -0.157 0.108 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 8.16e-02 -0.13 0.0744 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0321 0.106 0.239 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 6.12e-01 0.0568 0.112 0.239 B_Memory L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.80e-01 0.00155 0.0606 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 2.66e-01 0.117 0.105 0.239 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0253 0.0949 0.239 B_Memory L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.47e-01 0.0936 0.0806 0.239 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0815 0.107 0.239 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00231 0.0922 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 6.31e-01 0.0498 0.103 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.50e-01 0.0648 0.0448 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 9.48e-01 0.00655 0.101 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0715 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 5.21e-01 0.0365 0.0568 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.68e-01 -0.151 0.109 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0273 0.11 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 5.77e-03 -0.303 0.109 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 3.19e-01 0.0548 0.0548 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 5.96e-01 0.0522 0.0983 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0203 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0964 0.0747 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 5.91e-03 -0.304 0.109 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 9.40e-01 0.00659 0.0875 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 9.82e-02 -0.175 0.106 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.88e-01 -0.148 0.112 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00502 0.112 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.98e-01 0.0138 0.107 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 8.26e-02 -0.195 0.112 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 7.30e-01 0.0393 0.114 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 5.63e-01 0.0517 0.0891 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0997 0.095 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 5.01e-01 0.0364 0.054 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0817 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.59e-01 0.0906 0.0641 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.96e-01 0.1 0.0775 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0837 0.0999 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 3.84e-02 0.156 0.0749 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0493 0.0677 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 6.92e-01 0.0423 0.107 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.82e-01 0.0276 0.0672 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 6.14e-01 0.0467 0.0924 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0398 0.0808 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.12e-01 0.0792 0.0965 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 7.74e-01 -0.032 0.111 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 1.61e-02 -0.235 0.0967 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.67e-01 0.128 0.092 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0472 0.075 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0463 0.112 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.99e-01 0.0972 0.0934 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0276 0.117 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 8.62e-01 0.018 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.65e-01 -0.149 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 2.39e-01 0.135 0.114 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.14e-01 0.132 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.26e-01 -0.161 0.105 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0797 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0288 0.0679 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 6.53e-01 -0.046 0.102 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0149 0.0811 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 8.83e-01 0.0142 0.096 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.99e-03 -0.29 0.104 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0398 0.103 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0894 0.0875 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0426 0.0944 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0303 0.0628 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 2.98e-01 0.113 0.108 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 9.33e-01 0.00669 0.0797 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 4.29e-01 0.0765 0.0965 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00663 0.0863 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.62e-01 0.0759 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 2.11e-01 0.132 0.105 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0721 0.0999 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 2.83e-01 0.0985 0.0916 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 1.42e-01 -0.105 0.0712 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 6.97e-01 0.0278 0.0711 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0177 0.109 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0823 0.0959 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0766 0.114 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 7.21e-01 0.0385 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.72e-01 0.0465 0.11 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0232 0.11 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0966 0.116 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.22e-01 0.175 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0269 0.0958 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 4.96e-01 0.0265 0.0388 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0121 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 5.24e-01 0.065 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.59e-01 0.106 0.115 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 7.21e-02 -0.21 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0782 0.11 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 4.46e-01 0.0883 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 7.96e-01 0.0293 0.113 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 8.77e-01 0.0179 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 6.66e-01 0.0461 0.107 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 7.75e-04 0.269 0.0787 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 8.53e-01 0.019 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.02e-01 -0.109 0.0853 0.242 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 9.71e-01 0.00396 0.108 0.242 MAIT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 2.99e-01 -0.11 0.105 0.242 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0703 0.0956 0.242 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 6.54e-02 0.192 0.104 0.242 MAIT L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 5.00e-01 0.0773 0.115 0.242 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 8.98e-01 0.0146 0.113 0.242 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 7.80e-01 0.0241 0.0862 0.242 MAIT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 1.00e-01 0.091 0.0551 0.242 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.106 0.242 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.05e-02 -0.147 0.0835 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 5.11e-01 0.0701 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.81e-01 0.0452 0.11 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 7.30e-01 0.0399 0.115 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 1.35e-02 0.265 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0871 0.11 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 2.68e-01 0.119 0.108 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 7.25e-01 0.0335 0.0952 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 9.07e-01 0.00875 0.0749 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 4.28e-01 0.0843 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00153 0.0643 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.20e-02 -0.206 0.0955 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.02e-01 0.0105 0.0854 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.81e-01 0.0398 0.0966 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.77e-02 0.164 0.0953 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0684 0.104 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.0998 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 8.23e-01 -0.018 0.0804 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 5.17e-01 0.0342 0.0527 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0444 0.112 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0385 0.0921 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.98e-01 0.0942 0.111 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 2.04e-01 0.139 0.109 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.56e-01 -0.162 0.114 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 3.23e-01 -0.114 0.115 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 8.48e-02 -0.191 0.11 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 7.74e-01 0.033 0.115 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 5.21e-01 0.0633 0.0984 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0132 0.0801 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0396 0.106 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 7.08e-01 0.0285 0.0762 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 8.60e-01 0.0193 0.109 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00937 0.0923 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 8.76e-01 0.0162 0.104 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 1.53e-01 -0.151 0.105 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0234 0.104 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0464 0.109 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 4.03e-01 0.0665 0.0794 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 8.43e-01 0.0134 0.0679 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.111 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.72e-01 0.14 0.127 0.248 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 9.32e-01 0.0118 0.137 0.248 PB L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0223 0.104 0.248 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.04e-01 0.198 0.121 0.248 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.20e-02 0.222 0.113 0.248 PB L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 7.12e-01 0.0459 0.124 0.248 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0115 0.0982 0.248 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 6.69e-01 0.0322 0.0753 0.239 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 7.30e-01 0.0376 0.109 0.239 Pro_T L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.14e-02 -0.213 0.113 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 3.49e-01 0.0961 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0242 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.98e-01 0.0603 0.0888 0.239 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 3.98e-02 -0.195 0.094 0.239 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 8.30e-01 0.0204 0.0953 0.239 Pro_T L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 3.14e-01 0.0825 0.0817 0.239 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 3.62e-01 0.0827 0.0906 0.239 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0696 0.0925 0.239 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0522 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 8.22e-01 0.0226 0.1 0.239 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0572 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 7.20e-01 0.0408 0.114 0.239 Treg L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 6.57e-02 -0.195 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 9.42e-01 0.00771 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0059 0.0763 0.239 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 9.70e-01 0.00384 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.81e-01 0.0161 0.108 0.249 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 8.69e-01 0.0171 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00515 0.117 0.249 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0769 0.109 0.249 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0607 0.0941 0.249 cDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 7.92e-01 0.0272 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0307 0.101 0.249 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 7.38e-01 0.0318 0.095 0.249 cDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 4.65e-01 0.0655 0.0894 0.249 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 7.90e-01 0.0244 0.0918 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 7.37e-02 -0.185 0.103 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 4.08e-02 0.211 0.102499 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.83e-01 0.0385 0.094 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 1.09e-02 -0.228 0.0889 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0588 0.0849 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 1.92e-01 0.129 0.0984449 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0234 0.106 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 9.63e-01 0.00486 0.106 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.35e-01 0.051 0.107 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0975 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000755 0.0973 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 1.26e-01 -0.147 0.0958 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0423 0.12 0.242 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 4.93e-01 0.0864 0.126 0.242 gdT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0726 0.135 0.242 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 1.83e-01 -0.17 0.127 0.242 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 4.07e-01 0.114 0.137 0.242 gdT L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0732 0.14 0.242 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 9.25e-01 0.0119 0.125 0.242 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 2.33e-01 -0.133 0.111 0.242 gdT L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0318 0.0853 0.242 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 2.28e-01 -0.15 0.124 0.242 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 1.58e-01 0.15 0.106 0.24 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0204 0.104 0.24 intMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0687 0.111 0.24 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.68e-01 0.0736 0.101 0.24 intMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 3.82e-01 0.0977 0.112 0.24 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 8.80e-01 0.0147 0.0974 0.24 intMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0871 0.0953 0.24 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 1.47e-01 0.108 0.0744 0.247 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 8.59e-01 0.0171 0.0963 0.247 ncMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 9.48e-01 0.00608 0.0925 0.247 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 4.62e-01 0.0689 0.0934 0.247 ncMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 4.00e-01 0.0837 0.0992 0.247 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 1.65e-02 0.229 0.0947 0.247 ncMono L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 4.49e-02 0.188 0.0931 0.247 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.08e-01 -0.144 0.114 0.237 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0953 0.124 0.237 pDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.70e-01 0.189 0.137 0.237 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.237 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 3.72e-01 -0.101 0.112 0.237 pDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 3.59e-01 -0.112 0.122 0.237 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 5.61e-01 0.0742 0.127 0.237 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0316 0.0991 0.237 pDC L2
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 9.17e-01 0.00879 0.0846 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.38e-01 0.0198 0.0969 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 4.00e-01 0.0941 0.112 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 5.46e-01 0.0323 0.0533 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0424 0.096 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 2.99e-01 -0.113 0.108 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0073 0.0715 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00668 0.0844 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0986 0.106 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 1.75e-01 0.0538 0.0396 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.103 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0704 0.113 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 9.31e-01 0.00484 0.056 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 1.75e-02 -0.252 0.105 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 8.39e-01 0.0179 0.0882 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 1.74e-01 -0.133 0.0972 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 7.76e-02 0.167 0.0943 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0901 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 9.96e-03 -0.224 0.0861 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0613 0.0816 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 8.41e-01 0.0189 0.094 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 2.85e-01 0.0818 0.0764 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00853 0.0932 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 2.91e-01 -0.1 0.095 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.96e-01 0.0348 0.0887 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 2.17e-01 0.127 0.103 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 2.74e-01 0.0972 0.0886 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 1.56e-01 0.13 0.0914 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 252260 sc-eQTL 1.77e-01 0.0727 0.0536 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 988061 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0824 0.0976 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -415463 sc-eQTL 6.39e-01 0.0352 0.075 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 571188 sc-eQTL 6.33e-01 0.0431 0.0901 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 358649 sc-eQTL 6.13e-01 0.0473 0.0934 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -339990 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0993 0.0978 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 390090 sc-eQTL 4.40e-01 0.0732 0.0945 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 27388 sc-eQTL 4.64e-01 0.0513 0.07 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000174600 CMKLR1 -993508 sc-eQTL 8.98e-01 0.00632 0.0493 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 390312 sc-eQTL 3.09e-01 -0.112 0.11 0.241 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111785 \N 571188 3.27e-07 1.67e-07 7.72e-08 2.26e-07 1.1e-07 8.75e-08 2.4e-07 5.78e-08 1.85e-07 1.15e-07 2.04e-07 1.59e-07 2.74e-07 8.54e-08 6.53e-08 9.11e-08 5.27e-08 2.43e-07 8.68e-08 5.61e-08 1.33e-07 1.81e-07 1.69e-07 4.15e-08 2.28e-07 1.31e-07 1.25e-07 1.42e-07 1.32e-07 1.85e-07 1.52e-07 8.02e-08 4.76e-08 9.52e-08 3.57e-08 4.77e-08 5.54e-08 7.92e-08 6.33e-08 6.31e-08 5.28e-08 1.6e-07 1.96e-08 2.06e-08 8.43e-08 6.98e-09 7.13e-08 0.0 5.43e-08