logo

Genes within 1Mb (chr12:106989369:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 1.24e-01 -0.213 0.138 0.051 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0711 0.201 0.051 B L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0547 0.0818 0.051 B L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 1.30e-01 0.242 0.159 0.051 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 6.01e-01 -0.116 0.221 0.051 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 1.85e-01 0.138 0.104 0.051 B L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 6.30e-01 0.0558 0.116 0.051 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 1.65e-01 0.216 0.155 0.051 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 4.84e-02 0.246 0.124 0.051 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 7.45e-02 -0.159 0.089 0.051 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 6.90e-02 -0.259 0.142 0.051 CD4T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 2.53e-01 0.13 0.113 0.051 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0197 0.141 0.051 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 8.35e-01 0.0361 0.173 0.051 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 2.68e-02 -0.269 0.121 0.051 CD4T L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 9.53e-01 0.00993 0.167 0.051 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 4.35e-01 0.107 0.136 0.051 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 4.55e-02 0.234 0.116 0.051 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 5.31e-01 0.0777 0.124 0.051 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0921 0.197 0.051 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 7.68e-01 -0.033 0.112 0.051 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 2.12e-01 -0.207 0.165 0.051 CD8T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 3.45e-01 0.124 0.131 0.051 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0324 0.167 0.051 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 6.33e-01 0.0827 0.173 0.051 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 2.36e-01 -0.13 0.109 0.051 CD8T L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 4.76e-01 -0.128 0.179 0.051 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 2.79e-01 -0.155 0.142 0.051 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 2.55e-01 -0.105 0.0921 0.051 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 8.50e-01 0.0184 0.0973 0.051 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0233 0.209 0.051 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 3.66e-01 -0.166 0.183 0.052 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 1.33e-01 0.293 0.195 0.052 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 7.21e-01 0.076 0.212 0.052 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 1.13e-01 0.32 0.201 0.052 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 7.99e-01 0.0479 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 7.18e-01 0.0486 0.135 0.052 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0633 0.189 0.052 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0505 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 5.13e-01 0.116 0.178 0.052 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 1.63e-01 0.282 0.201 0.052 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0867 0.141 0.051 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 3.03e-01 0.174 0.169 0.051 Mono L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 4.11e-01 -0.146 0.177 0.051 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 4.68e-01 0.118 0.162 0.051 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 9.81e-01 0.00297 0.121 0.051 Mono L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 4.72e-01 -0.121 0.168 0.051 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 1.13e-01 0.246 0.155 0.051 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0204 0.141 0.051 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 1.99e-01 -0.142 0.111 0.051 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 2.69e-01 0.23 0.207 0.051 Other_T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 3.69e-01 -0.162 0.18 0.051 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0253 0.146 0.051 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 5.57e-02 -0.332 0.173 0.051 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 1.01e-02 -0.333 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 2.18e-01 -0.183 0.148 0.051 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 5.00e-01 -0.123 0.182 0.051 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.051 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.16 0.051 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 1.08e-01 -0.316 0.196 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 6.17e-01 -0.106 0.212 0.056 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 2.95e-01 -0.218 0.208 0.056 B_Activated L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00288 0.193 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 8.06e-01 0.0521 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 3.18e-01 0.164 0.164 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 2.38e-01 0.233 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 6.08e-02 0.413 0.219 0.056 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0256 0.221 0.056 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 1.90e-01 0.289 0.22 0.056 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 1.88e-01 -0.259 0.196 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0412 0.217 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00201 0.108 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 3.74e-01 0.172 0.193 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 4.68e-01 0.151 0.207 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 9.07e-01 0.0188 0.161 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 6.42e-01 0.0668 0.144 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 4.95e-01 0.141 0.206 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 3.84e-01 -0.163 0.187 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 4.62e-02 -0.357 0.178 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 5.13e-02 -0.392 0.2 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 9.79e-02 0.145 0.0873 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 2.78e-01 0.214 0.197 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 4.55e-01 0.162 0.216 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00988 0.152 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 9.16e-01 0.0117 0.111 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 8.71e-01 0.0349 0.214 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 2.03e-02 0.345 0.147 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 4.98e-01 -0.115 0.169 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 5.84e-01 -0.113 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 2.97e-01 -0.226 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0387 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0412 0.207 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 3.81e-01 -0.149 0.169 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 3.66e-01 0.197 0.217 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 9.03e-01 -0.027 0.22 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 7.82e-02 -0.303 0.171 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 3.63e-01 -0.195 0.214 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 7.06e-02 -0.332 0.183 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 3.88e-01 -0.091 0.105 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 4.34e-01 -0.125 0.16 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 4.07e-01 0.104 0.125 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 7.59e-01 0.0466 0.151 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 5.91e-01 0.108 0.201 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 1.22e-01 -0.212 0.137 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0899 0.195 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 8.16e-01 0.0344 0.147 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 9.66e-02 0.219 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 5.70e-01 0.0783 0.138 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 4.04e-01 -0.174 0.208 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0875 0.131 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 4.20e-01 -0.145 0.18 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 1.47e-01 0.228 0.157 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 3.09e-01 -0.191 0.188 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 4.49e-01 0.164 0.216 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 4.07e-01 -0.11 0.132 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 6.59e-01 0.0842 0.191 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 4.61e-01 0.133 0.18 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 3.28e-02 0.311 0.145 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 8.80e-01 0.022 0.146 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 3.62e-01 0.199 0.218 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 4.45e-01 -0.135 0.177 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 9.01e-01 0.0277 0.222 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 1.26e-01 -0.299 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 7.90e-01 0.0542 0.203 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 2.43e-02 -0.487 0.214 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 1.63e-01 -0.243 0.173 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 2.31e-01 0.241 0.201 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0918 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 5.58e-01 0.089 0.152 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 1.04e-01 0.283 0.173 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 4.57e-01 0.156 0.21 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 2.29e-01 -0.159 0.132 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 9.11e-01 0.0223 0.199 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 9.19e-01 0.0162 0.158 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 4.70e-01 -0.135 0.187 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00215 0.207 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 2.94e-01 -0.186 0.177 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 5.43e-01 -0.122 0.201 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 6.21e-02 -0.318 0.169 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 5.17e-01 0.119 0.184 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 3.98e-01 0.161 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 2.33e-01 -0.251 0.21 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 5.77e-01 0.0862 0.154 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 4.74e-01 -0.134 0.187 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 5.65e-01 0.0962 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00658 0.2 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 6.60e-01 0.0902 0.205 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 2.98e-01 -0.174 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 7.45e-01 0.0631 0.194 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 3.89e-01 -0.153 0.178 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 3.61e-01 0.127 0.138 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00553 0.149 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 2.88e-01 0.224 0.21 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 9.36e-01 0.0157 0.195 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 9.35e-01 -0.018 0.221 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 2.68e-01 0.249 0.224 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0685 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0169 0.222 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 8.29e-01 0.044 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 3.42e-01 -0.205 0.215 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 8.47e-02 -0.383 0.221 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 6.27e-02 -0.379 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 1.99e-01 0.272 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 8.63e-01 0.0337 0.196 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 9.88e-01 0.0025 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 8.10e-01 0.0492 0.205 0.052 MAIT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 4.07e-01 -0.166 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 5.63e-01 0.105 0.181 0.052 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 2.43e-01 -0.231 0.198 0.052 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 6.61e-02 -0.336 0.182 0.052 MAIT L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 3.63e-01 -0.198 0.217 0.052 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 2.13e-01 -0.267 0.214 0.052 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 2.12e-01 -0.204 0.163 0.052 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 9.43e-01 0.0134 0.187 0.052 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 2.41e-01 -0.236 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 4.21e-01 0.121 0.15 0.05 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 6.86e-01 0.0877 0.217 0.05 Pro_T L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 6.20e-01 -0.113 0.227 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 2.70e-01 -0.225 0.203 0.05 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0526 0.205 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 3.63e-01 -0.103 0.113 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 4.12e-01 -0.146 0.177 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 6.88e-01 0.0761 0.189 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 8.28e-01 0.0413 0.19 0.05 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0225 0.175 0.05 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 5.05e-01 -0.121 0.181 0.05 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 1.14e-01 -0.284 0.179 0.051 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 3.12e-01 -0.215 0.213 0.051 Treg L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 1.03e-01 -0.316 0.193 0.051 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0928 0.203 0.051 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 3.26e-01 -0.216 0.22 0.051 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 3.33e-01 -0.152 0.157 0.051 Treg L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 4.70e-01 0.149 0.206 0.051 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0608 0.204 0.051 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0154 0.148 0.051 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 2.75e-01 -0.185 0.169 0.051 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 33872 sc-eQTL 1.14e-01 0.316 0.199 0.051 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 7.88e-02 -0.366 0.207 0.051 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 4.76e-02 0.396 0.199 0.051 cDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 9.45e-01 0.0156 0.226 0.051 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 5.65e-01 0.122 0.212 0.051 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 8.79e-02 -0.311 0.181 0.051 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 8.70e-01 0.0245 0.149 0.051 cDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 8.91e-01 0.0274 0.2 0.051 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 1.79e-01 -0.263 0.195 0.051 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 5.54e-01 0.109 0.184 0.051 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0468 0.222 0.051 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0228 0.176 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 5.95e-01 0.106 0.199 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 5.83e-01 0.109 0.1984 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0721 0.18 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 9.00e-01 0.0172 0.136 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 5.32e-01 -0.108 0.173 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 2.98e-01 0.17 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 6.67e-01 0.0701 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 2.42e-01 -0.238 0.203 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 7.62e-01 0.0617 0.203 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 3.91e-01 0.177 0.205 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 4.04e-01 -0.157 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 6.08e-01 0.0762 0.148 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 7.88e-01 0.052 0.193 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 3.39e-01 0.179 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0571 0.174 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 9.49e-01 0.0133 0.207 0.054 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 5.08e-01 0.15 0.226 0.054 pDC L2
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 8.36e-01 0.0519 0.251 0.054 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 4.56e-01 0.163 0.218 0.054 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 8.68e-01 0.034 0.204 0.054 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0396 0.145 0.054 pDC L2
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 2.83e-01 -0.237 0.22 0.054 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0772 0.231 0.054 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 3.21e-01 0.178 0.179 0.054 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 3.39e-01 0.208 0.217 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 1.01e-01 -0.304 0.185 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 8.59e-01 0.038 0.215 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0151 0.102 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 2.01e-01 0.235 0.184 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 3.61e-01 0.19 0.208 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 5.22e-01 0.0928 0.145 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 1.32e-01 0.207 0.137 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 7.21e-01 0.0728 0.204 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 6.50e-01 0.0798 0.176 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 3.42e-01 -0.157 0.165 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 3.45e-01 -0.195 0.207 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 5.52e-01 0.0463 0.0777 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 2.39e-01 0.238 0.202 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 2209 sc-eQTL 3.69e-01 -0.199 0.221 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 3.52e-01 -0.144 0.154 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 9.68e-01 0.00446 0.11 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 33650 sc-eQTL 3.15e-01 0.21 0.208 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 3.15e-02 0.288 0.133 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -104180 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0591 0.171 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 631621 sc-eQTL 4.94e-01 0.129 0.189 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -771903 sc-eQTL 6.37e-01 0.0868 0.183 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 214748 sc-eQTL 3.20e-01 -0.174 0.174 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 685090 sc-eQTL 6.81e-01 0.0541 0.131 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -696430 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0891 0.169 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -329052 sc-eQTL 8.76e-02 0.269 0.157 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 687440 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0133 0.14 0.051 CD14_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -104180 eQTL 5.54e-09 -0.22 0.0374 0.0 0.0 0.0402
ENSG00000074590 NUAK1 849336 eQTL 0.00123 -0.244 0.0753 0.0 0.0 0.0402
ENSG00000120832 MTERF2 2209 eQTL 0.0262 0.133 0.0599 0.0 0.0 0.0402
ENSG00000258136 AC007622.2 -747186 eQTL 0.0145 0.228 0.0932 0.00114 0.0 0.0402

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 CRY1 -104180 4.39e-06 2.26e-05 7.64e-07 3.84e-06 1.62e-06 1.09e-06 9.71e-06 1.45e-06 2.15e-05 5.52e-06 7.04e-05 1.94e-05 2.49e-05 1.05e-05 3.87e-06 6.33e-06 2.06e-06 5.33e-06 1.36e-06 9.52e-07 2.71e-06 1.37e-05 4.55e-06 1.4e-06 1.58e-05 1.32e-06 3.57e-06 6.14e-06 6.71e-06 4.13e-06 2.88e-05 1.72e-07 3.99e-07 1.75e-06 1.95e-06 9.86e-07 6.93e-07 3.93e-07 1.18e-06 3.46e-07 3.01e-07 6.58e-05 4.77e-07 1.3e-07 3.5e-07 8.98e-07 2.71e-07 8.58e-08 9.13e-08
ENSG00000074590 NUAK1 849336 2.66e-07 1.78e-07 4.69e-08 2.05e-07 8.83e-08 9.61e-08 1.53e-07 5.19e-08 1.71e-07 5.42e-08 4.39e-07 1.86e-07 1.79e-07 8.66e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.63e-08 1.26e-07 5.21e-08 3.59e-08 1.04e-07 1.42e-07 1.26e-07 4.82e-08 1.65e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.92e-08 1.05e-07 1.1e-07 1.26e-07 3.41e-08 2.74e-08 8.65e-08 7.02e-08 3.97e-08 4.72e-08 9.25e-08 8.22e-08 3.05e-08 3.58e-08 2.19e-07 3.98e-08 1.08e-08 1.01e-07 1.69e-08 1.34e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000120832 MTERF2 2209 3.63e-05 6.65e-05 8.49e-06 1.96e-05 6.77e-06 1.79e-05 6.32e-05 7.6e-06 6.6e-05 2.94e-05 0.000119 3.75e-05 0.000112 2.2e-05 1.03e-05 3.38e-05 3.08e-05 3.77e-05 7.56e-06 8.44e-06 2.06e-05 6.97e-05 3.52e-05 8.48e-06 7.33e-05 7.7e-06 1.99e-05 2.14e-05 5.14e-05 3.25e-05 6.4e-05 1.58e-06 2.6e-06 8.12e-06 1.12e-05 7.7e-06 3.17e-06 3.2e-06 5.61e-06 3.95e-06 1.82e-06 0.000162 4.92e-06 3.59e-07 3.27e-06 6.92e-06 3.97e-06 1.41e-06 1.33e-06
ENSG00000166046 \N 687440 2.74e-07 6.04e-07 6.45e-08 2.62e-07 9.8e-08 8.21e-08 2.4e-07 5.62e-08 4.19e-07 1.15e-07 1.25e-06 5.22e-07 4.74e-07 1.59e-07 9.2e-08 1.1e-07 4.01e-08 1.8e-07 6.32e-08 4.2e-08 1.25e-07 2.86e-07 1.44e-07 3.79e-08 3.55e-07 1.26e-07 1.2e-07 1.54e-07 1.34e-07 1.07e-07 3.1e-07 3.52e-08 2.74e-08 9.3e-08 5.41e-08 3.77e-08 5.29e-08 9.22e-08 7.63e-08 3.87e-08 3.44e-08 7.53e-07 5.21e-08 1.93e-08 8.16e-08 1.86e-08 1.26e-07 4.6e-09 4.61e-08
ENSG00000258136 AC007622.2 -747186 2.67e-07 3.77e-07 6.04e-08 2.36e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.81e-07 5.53e-08 2.56e-07 8.53e-08 1.02e-06 3.68e-07 3.04e-07 1.1e-07 5.62e-08 8.71e-08 3.98e-08 1.51e-07 5.75e-08 3.88e-08 1.19e-07 2.07e-07 1.39e-07 4.26e-08 2.37e-07 1.25e-07 1.18e-07 1.28e-07 1.2e-07 1.1e-07 1.93e-07 3.59e-08 2.74e-08 8e-08 3.12e-08 4.02e-08 5.05e-08 9.55e-08 8.19e-08 3.55e-08 3.77e-08 4.55e-07 4.52e-08 1.7e-08 9.21e-08 1.83e-08 1.25e-07 4.7e-09 4.61e-08