logo

Genes within 1Mb (chr12:106854473:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 7.69e-01 0.0387 0.131 0.051 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0208 0.191 0.051 B L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 6.33e-01 0.0371 0.0775 0.051 B L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 2.83e-02 0.331 0.15 0.051 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 7.76e-01 0.0598 0.21 0.051 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0209 0.0985 0.051 B L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 3.65e-01 0.0994 0.109 0.051 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 5.51e-01 0.088 0.147 0.051 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 5.49e-01 0.0711 0.118 0.051 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.75e-01 0.117 0.0857 0.051 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 9.41e-02 0.229 0.136 0.051 CD4T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0992 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 4.34e-01 0.106 0.135 0.051 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0123 0.166 0.051 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 6.02e-01 -0.061 0.117 0.051 CD4T L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 8.22e-01 0.0361 0.16 0.051 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 1.40e-01 -0.193 0.13 0.051 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0179 0.112 0.051 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 8.50e-02 -0.205 0.118 0.051 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 3.87e-01 -0.164 0.189 0.051 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.051 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 5.61e-01 0.0947 0.162 0.051 CD8T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 6.33e-02 -0.239 0.128 0.051 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.46e-01 -0.154 0.163 0.051 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 3.48e-02 -0.357 0.168 0.051 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 2.16e-02 -0.246 0.106 0.051 CD8T L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 3.98e-01 0.148 0.175 0.051 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 4.35e-01 -0.109 0.14 0.051 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 9.16e-01 0.00954 0.0905 0.051 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 3.67e-01 -0.086 0.0951 0.051 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 5.82e-01 -0.113 0.205 0.051 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 7.00e-01 0.0684 0.177 0.054 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.12e-01 -0.07 0.189 0.054 DC L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00725 0.205 0.054 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 9.12e-01 0.0217 0.196 0.054 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 5.77e-01 0.102 0.182 0.054 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 3.51e-01 -0.121 0.13 0.054 DC L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 6.37e-01 0.0865 0.183 0.054 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 5.09e-01 0.12 0.181 0.054 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 5.09e-01 -0.114 0.172 0.054 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 9.27e-02 0.328 0.194 0.054 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 4.39e-02 -0.274 0.135 0.051 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.04e-01 0.0622 0.164 0.051 Mono L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 2.82e-01 -0.184 0.171 0.051 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00999 0.157 0.051 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 9.09e-01 0.0134 0.117 0.051 Mono L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 4.31e-01 0.128 0.162 0.051 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 7.91e-01 0.04 0.151 0.051 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 1.47e-01 0.197 0.136 0.051 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 2.52e-01 0.115 0.0997 0.052 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 8.53e-01 0.0333 0.179 0.052 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 714440 sc-eQTL 1.98e-01 -0.227 0.176 0.052 NK L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 7.38e-01 0.0495 0.148 0.052 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00413 0.167 0.052 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 1.39e-01 -0.254 0.171 0.052 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 7.77e-02 0.282 0.159 0.052 NK L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 2.47e-02 -0.392 0.174 0.052 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 3.51e-01 -0.162 0.173 0.052 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0317 0.137 0.052 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0894 0.146 0.052 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 2.47e-01 -0.242 0.208 0.052 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 9.27e-01 0.0101 0.11 0.051 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 1.00e-02 -0.529 0.203 0.051 Other_T L1
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 2.47e-01 -0.208 0.179 0.051 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0361 0.145 0.051 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0969 0.173 0.051 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 9.58e-03 -0.333 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 1.79e-01 -0.198 0.147 0.051 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 6.34e-01 0.0863 0.181 0.051 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 9.52e-01 0.00783 0.13 0.051 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 3.84e-01 0.138 0.159 0.051 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0141 0.196 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 7.45e-01 0.0623 0.192 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 2.29e-01 -0.254 0.211 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 7.34e-01 0.0357 0.105 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 1.39e-02 0.46 0.185 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 9.26e-03 0.521 0.198 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 3.90e-01 0.135 0.156 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 4.07e-01 0.116 0.14 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 9.10e-01 0.0228 0.2 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 4.75e-02 0.359 0.18 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 5.37e-02 -0.391 0.202 0.052 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00673 0.215 0.052 B_Memory L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 1.19e-01 0.181 0.116 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 9.62e-01 0.00972 0.202 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 2.28e-01 0.22 0.182 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0816 0.181 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 9.07e-02 0.262 0.154 0.052 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 3.08e-01 0.21 0.205 0.052 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.181 0.052 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 6.85e-01 0.0717 0.176 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 4.21e-01 0.159 0.198 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0907 0.086 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0106 0.193 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0413 0.212 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 4.87e-01 0.104 0.149 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 8.44e-01 0.0214 0.109 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 5.67e-01 -0.12 0.21 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0652 0.146 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.33e-01 0.319 0.212 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 8.67e-01 -0.036 0.214 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 4.61e-01 0.0785 0.106 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 4.57e-02 0.38 0.189 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 4.58e-02 -0.431 0.215 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 3.58e-01 0.171 0.186 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 2.66e-01 -0.162 0.145 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 3.17e-01 0.216 0.215 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 2.13e-01 -0.198 0.158 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 6.19e-02 0.313 0.167 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.65e-01 0.0612 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 1.66e-01 0.298 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0631 0.215 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0701 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 3.69e-01 -0.152 0.168 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0873 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 1.37e-01 0.325 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 3.79e-01 0.151 0.171 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 5.86e-01 -0.116 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 6.15e-01 0.0923 0.183 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 4.63e-01 0.074 0.101 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 8.31e-02 0.265 0.152 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0633 0.12 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.43e-01 0.138 0.145 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 1.17e-01 -0.302 0.192 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0548 0.132 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 7.29e-01 0.0648 0.187 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 1.05e-01 -0.229 0.14 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0366 0.126 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 5.26e-02 -0.255 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 5.86e-01 -0.109 0.199 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 3.50e-01 0.117 0.125 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 3.54e-01 0.16 0.172 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0255 0.151 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0642 0.18 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 8.46e-01 0.0405 0.208 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 7.71e-01 0.0369 0.127 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0577 0.183 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 3.89e-01 -0.149 0.172 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 2.67e-02 0.309 0.139 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 2.67e-01 -0.155 0.139 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 7.28e-02 -0.374 0.208 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.08e-01 0.284 0.176 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 5.34e-01 0.138 0.222 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0358 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.44e-01 0.192 0.203 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 6.44e-01 0.1 0.217 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 4.17e-01 0.141 0.174 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0421 0.202 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0392 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 4.79e-01 0.107 0.152 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 6.44e-01 0.0805 0.174 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 5.15e-01 -0.137 0.209 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 8.49e-02 0.229 0.132 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 5.96e-01 0.107 0.201 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 4.56e-01 -0.119 0.159 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0435 0.189 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 5.78e-01 -0.116 0.208 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00517 0.179 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 1.47e-01 0.294 0.202 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0227 0.172 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 2.78e-02 -0.406 0.183 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 5.32e-01 -0.12 0.192 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0258 0.213 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 9.53e-01 0.00896 0.152 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 3.36e-01 0.178 0.184 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 4.65e-02 -0.327 0.163 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 5.23e-01 -0.126 0.197 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0943 0.202 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 1.89e-03 -0.507 0.161 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 4.87e-01 -0.133 0.191 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 3.59e-01 -0.161 0.175 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 1.19e-01 0.213 0.136 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 1.30e-01 -0.222 0.146 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 3.07e-01 -0.212 0.207 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 5.93e-01 0.0969 0.181 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 3.88e-01 -0.186 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 5.53e-01 0.12 0.202 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 5.43e-01 -0.126 0.207 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 1.39e-01 -0.307 0.207 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 7.47e-01 0.0606 0.188 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 2.79e-01 0.237 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 5.88e-01 0.116 0.214 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 1.42e-01 -0.265 0.18 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 6.08e-02 0.338 0.179 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 3.59e-01 -0.18 0.196 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 4.86e-01 -0.114 0.163 0.052 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.68e-02 -0.363 0.204 0.052 MAIT L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 8.39e-02 -0.347 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 1.55e-01 0.26 0.182 0.052 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 1.43e-01 -0.292 0.199 0.052 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0939 0.185 0.052 MAIT L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 1.35e-02 -0.537 0.216 0.052 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 1.15e-01 0.34 0.215 0.052 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 5.43e-01 0.1 0.164 0.052 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 6.14e-01 -0.095 0.188 0.052 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 9.15e-01 0.0215 0.202 0.052 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 3.75e-01 -0.157 0.176 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 3.03e-01 0.22 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 714440 sc-eQTL 6.08e-01 -0.107 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 9.70e-02 -0.348 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 2.60e-01 -0.246 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 9.72e-03 -0.567 0.217 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0376 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 1.95e-01 -0.274 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 6.62e-01 0.0962 0.22 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 2.01e-01 -0.241 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 4.63e-01 -0.158 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 6.01e-01 -0.106 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.20e-01 0.365 0.233 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 6.21e-01 -0.125 0.253 0.059 PB L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 5.15e-01 -0.125 0.192 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 6.33e-01 0.108 0.226 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 5.21e-02 0.411 0.209 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 3.19e-01 0.142 0.141 0.059 PB L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0414 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 7.98e-01 0.0466 0.182 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 1.31e-01 -0.357 0.235 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 4.55e-01 0.107 0.143 0.052 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 1.83e-01 -0.275 0.206 0.052 Pro_T L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 5.76e-01 -0.121 0.217 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 4.32e-02 -0.391 0.192 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 4.08e-01 0.161 0.194 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 2.72e-01 -0.119 0.108 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0876 0.169 0.052 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 4.83e-01 0.126 0.18 0.052 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 7.08e-01 0.0677 0.181 0.052 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 2.10e-01 0.208 0.166 0.052 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 3.89e-01 0.148 0.172 0.052 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 3.23e-01 0.176 0.178 0.051 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0726 0.211 0.051 Treg L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 2.52e-02 -0.43 0.191 0.051 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 8.29e-01 0.0435 0.202 0.051 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 2.82e-01 0.235 0.218 0.051 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 4.33e-02 0.314 0.155 0.051 Treg L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 9.06e-01 0.0241 0.204 0.051 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 2.24e-01 -0.246 0.202 0.051 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 9.98e-01 0.000344 0.147 0.051 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 3.39e-01 -0.161 0.168 0.051 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 sc-eQTL 2.99e-01 0.206 0.198 0.051 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 6.13e-02 -0.323 0.172 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 9.91e-01 0.00219 0.195 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 2.84e-01 -0.209 0.194484 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0357 0.177 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0965 0.134 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 5.96e-01 0.0902 0.17 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 6.19e-01 0.0797 0.16 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 3.21e-01 0.159 0.159 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.17e-01 -0.314 0.2 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 2.89e-01 0.212 0.2 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 6.39e-01 0.0953 0.203 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0796 0.185 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 2.54e-01 0.167 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 2.28e-01 0.229 0.19 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0258 0.184 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 8.51e-01 0.0323 0.172 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 6.60e-01 -0.087 0.198 0.053 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0383 0.192 0.053 intMono L2
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 9.41e-01 0.0153 0.205 0.053 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.55e-01 0.174 0.187 0.053 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 5.94e-01 0.104 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 5.49e-01 0.124 0.207 0.053 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 6.83e-01 0.0739 0.18 0.053 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0588 0.219 0.053 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 5.42e-01 -0.112 0.183 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 1.85e-01 -0.28 0.211 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.71e-02 0.377 0.18 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 3.50e-03 0.595 0.201 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 8.22e-01 0.0321 0.143 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 1.01e-01 0.221 0.134 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 7.37e-01 0.0673 0.201 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 4.88e-02 0.34 0.171 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 4.77e-01 0.115 0.161 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 3.90e-01 0.174 0.202 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0394 0.076 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 3.09e-01 0.202 0.198 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -132687 sc-eQTL 2.83e-01 -0.232 0.216 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 5.90e-01 0.0813 0.151 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0178 0.107 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -101246 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0143 0.204 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 3.93e-01 -0.113 0.131 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 1.01e-02 -0.426 0.164 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 6.58e-01 0.0818 0.184 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 3.34e-01 -0.173 0.179 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 7.30e-01 -0.059 0.171 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 9.66e-01 0.00548 0.128 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 4.89e-01 0.114 0.165 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 7.45e-01 0.0504 0.155 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 2.49e-01 0.157 0.136 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -239076 sc-eQTL 3.49e-01 0.138 0.147 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 496725 sc-eQTL 7.31e-01 0.0616 0.179 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000110851 PRDM4 -906799 sc-eQTL 4.14e-01 -0.15 0.183 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B 79852 sc-eQTL 4.68e-01 0.124 0.17 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 550194 sc-eQTL 6.17e-01 0.0886 0.177 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136045 PWP1 -831326 sc-eQTL 4.54e-01 0.148 0.198 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -463948 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00384 0.171 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 sc-eQTL 9.51e-02 0.305 0.182 0.052 CD16_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 552544 eQTL 0.0152 -0.085 0.0349 0.0 0.0 0.0442
ENSG00000260329 AC007541.1 -101024 eQTL 0.00438 -0.217 0.0761 0.0 0.0 0.0442

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina