logo

Genes within 1Mb (chr12:106650660:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.47e-01 0.116 0.123 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0768 0.179 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.02e-02 0.363 0.14 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 7.57e-01 0.061 0.197 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 7.59e-01 0.0284 0.0924 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.07e-01 0.174 0.138 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 8.21e-01 0.0251 0.111 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0798 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 1.55e-01 0.181 0.127 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0295 0.126 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.17e-01 -0.1 0.155 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.75e-01 0.00348 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0988 0.122 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 2.26e-01 0.127 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 8.90e-03 -0.289 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 4.26e-01 -0.141 0.177 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.22e-02 0.199 0.102 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 3.70e-01 0.136 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.44e-01 -0.223 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.22e-02 -0.395 0.156 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.01e-02 -0.17 0.0998 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 3.09e-01 -0.133 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 2.27e-01 0.102 0.0844 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0979 0.0889 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 4.27e-01 0.152 0.191 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 6.21e-01 0.0829 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 3.77e-01 -0.158 0.179 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.76e-01 0.202 0.184 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 6.61e-01 0.0755 0.172 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.67e-01 -0.111 0.123 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.01e-01 0.219 0.171 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 5.05e-01 -0.109 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.09e-01 0.296 0.184 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.70e-01 -0.174 0.126 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0587 0.152 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.51e-01 -0.21 0.146 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0479 0.109 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.75e-01 -0.1 0.14 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.96e-01 0.108 0.127 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.96e-01 0.0802 0.0943 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0649 0.169 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0755 0.167 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0103 0.158 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 3.21e-02 -0.346 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.31e-01 0.147 0.151 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0888 0.163 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0862 0.129 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 2.48e-01 -0.159 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 2.95e-01 -0.206 0.196 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0869 0.106 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 1.73e-02 -0.469 0.196 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0546 0.139 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0955 0.166 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 1.78e-02 -0.293 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 1.03e-01 0.282 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 9.22e-01 0.0122 0.125 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000508 0.152 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0652 0.188 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.22e-01 -0.13 0.203 0.056 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 2.46e-01 0.232 0.199 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.78e-01 0.22 0.202 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.88e-01 0.0855 0.158 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.38e-01 -0.182 0.19 0.056 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 9.89e-01 0.00299 0.212 0.056 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.77e-01 0.187 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 8.89e-01 0.0252 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 1.20e-01 -0.308 0.198 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.19e-02 0.328 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 4.87e-02 0.372 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 1.51e-01 0.211 0.146 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 6.87e-01 0.0759 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 8.70e-02 0.292 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.31e-01 -0.187 0.192 0.06 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 8.15e-01 0.0475 0.203 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.54e-01 0.0857 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 6.52e-01 0.0778 0.172 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 4.14e-01 -0.14 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.64e-01 0.218 0.194 0.06 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 7.12e-01 0.0631 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 6.93e-01 0.065 0.164 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.66e-01 0.008 0.185 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0152 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00683 0.198 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.44e-01 0.132 0.139 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 8.94e-01 -0.026 0.196 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0421 0.137 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 2.51e-02 0.443 0.196 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.80e-01 0.00512 0.2 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 3.36e-03 0.518 0.175 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.23e-01 -0.312 0.201 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 5.40e-01 0.107 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.57e-01 0.229 0.201 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.57e-01 -0.209 0.148 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.17e-02 0.309 0.158 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 4.44e-01 0.148 0.193 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0935 0.204 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.84e-01 -0.259 0.194 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.01e-01 -0.165 0.159 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 4.36e-02 0.416 0.205 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 1.11e-01 0.258 0.161 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.71e-01 -0.276 0.201 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00188 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.61e-01 0.0861 0.0941 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.14e-02 0.241 0.142 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 8.09e-01 0.0327 0.136 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.81e-02 -0.34 0.179 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00129 0.123 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.81e-01 -0.142 0.132 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.12e-01 0.0599 0.118 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 4.73e-03 -0.345 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0454 0.186 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 2.92e-01 0.124 0.117 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.58e-01 0.00845 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0986 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0991 0.194 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 7.59e-01 0.0365 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0684 0.161 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 1.17e-04 0.497 0.127 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.94e-01 -0.17 0.13 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 1.71e-01 -0.268 0.195 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.72e-01 0.147 0.165 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0635 0.207 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00941 0.189 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 4.66e-01 0.147 0.202 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.02e-01 0.167 0.162 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.186 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 1.58e-01 0.199 0.141 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00779 0.162 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0971 0.195 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 9.75e-02 0.206 0.124 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 6.70e-01 0.0799 0.187 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.18e-01 -0.114 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 8.09e-01 0.0472 0.195 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0392 0.167 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 8.30e-01 0.0346 0.161 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.76e-01 -0.124 0.173 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 5.46e-01 -0.108 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 2.02e-01 0.253 0.198 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.87e-01 0.0772 0.142 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 8.53e-02 0.296 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.89e-02 -0.346 0.182 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 3.19e-01 -0.188 0.188 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 6.00e-02 -0.288 0.153 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 1.02e-01 -0.267 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.74e-02 0.252 0.127 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.08e-02 -0.295 0.136 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 3.44e-01 -0.183 0.193 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 4.72e-01 0.125 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 2.81e-01 -0.223 0.206 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.10e-01 -0.131 0.199 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 2.62e-01 -0.224 0.199 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 4.96e-01 0.123 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 7.18e-01 0.0745 0.206 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 3.75e-01 -0.154 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 4.67e-02 0.345 0.172 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00251 0.189 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.85e-01 0.0984 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 1.61e-01 0.286 0.203 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0787 0.195 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.13e-01 -0.323 0.203 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00477 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 6.02e-01 -0.107 0.205 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 2.24e-01 0.229 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 7.99e-02 0.342 0.194 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 1.53e-01 0.258 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.67e-01 -0.216 0.156 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.25e-02 -0.331 0.196 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 4.52e-02 0.349 0.173 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.00e-01 -0.314 0.19 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0942 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 2.54e-02 0.461 0.205 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 3.83e-01 0.138 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.24e-01 -0.178 0.18 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 9.38e-01 0.0151 0.194 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 7.44e-02 0.277 0.155 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 6.36e-01 0.0935 0.197 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 2.55e-01 -0.196 0.171 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.06e-01 0.142 0.214 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 9.78e-01 0.00549 0.2 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0538 0.161 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 7.70e-01 0.0585 0.2 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 5.79e-01 0.0979 0.176 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0287 0.206 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 5.20e-01 -0.127 0.197 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 5.03e-01 -0.117 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 3.06e-01 -0.174 0.17 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.56e-01 -0.198 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.89e-01 -0.227 0.172 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 1.13e-01 0.277 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 5.54e-01 -0.107 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.35e-01 -0.113 0.145 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.27e-02 -0.326 0.152 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 2.93e-01 -0.212 0.201 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.54e-01 -0.1 0.169 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.00e-01 0.079 0.204 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 4.59e-01 -0.148 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.61e-01 -0.236 0.209 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 2.79e-02 -0.464 0.21 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00438 0.184 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 9.71e-01 0.00769 0.211 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0763 0.181 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 2.17e-01 -0.256 0.207 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 4.08e-01 -0.161 0.194 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 4.45e-01 0.104 0.135 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 4.99e-01 0.131 0.194 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 7.32e-01 0.0615 0.179 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.32e-01 0.22 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 2.13e-01 -0.234 0.187 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 1.44e-01 0.259 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 1.35e-01 -0.288 0.192 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0335 0.141 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 4.21e-01 0.128 0.159 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 9.52e-01 0.0119 0.197 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 2.31e-01 0.271 0.225 0.067 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 5.94e-01 -0.13 0.243 0.067 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 8.42e-01 0.0434 0.217 0.067 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.17e-02 0.395 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 1.26e-01 0.208 0.135 0.067 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00882 0.175 0.067 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 2.90e-01 -0.241 0.227 0.067 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 2.77e-01 0.144 0.132 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.32e-02 -0.321 0.19 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 8.25e-03 -0.473 0.177 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 3.24e-01 0.178 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0754 0.0999 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 5.76e-01 0.0934 0.167 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0741 0.168 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 4.76e-01 0.11 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 8.18e-01 0.0367 0.16 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.58e-01 0.237 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0556 0.2 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0658 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 4.19e-01 0.167 0.206 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 2.05e-02 0.34 0.146 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 9.63e-01 0.00893 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 2.94e-01 0.145 0.138 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.14e-01 -0.16 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 7.31e-01 0.0645 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 4.00e-02 0.411 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 1.35e-01 -0.289 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 3.82e-01 0.178 0.204 0.056 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 1.86e-01 0.232 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 2.90e-01 -0.152 0.143 0.056 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 8.04e-02 0.328 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 2.90e-01 -0.187 0.177 0.056 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 2.60e-01 0.241 0.213 0.056 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.05e-01 -0.164 0.16 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0576 0.181 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 2.04e-01 -0.208 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.79e-01 -0.109 0.124 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0664 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 4.62e-01 0.109 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 2.40e-01 -0.219 0.186 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 4.10e-01 0.153 0.186 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.68e-01 -0.237 0.171 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 8.50e-01 0.0257 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.96e-01 -0.117 0.171 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0721 0.159 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 7.93e-01 0.0493 0.187 0.06 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 8.37e-01 0.0375 0.182 0.06 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.89e-01 0.0962 0.178 0.06 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0509 0.186 0.06 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.12e-01 -0.14 0.171 0.06 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 9.42e-01 0.0151 0.208 0.06 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.34e-01 0.21 0.14 0.057 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 8.25e-01 0.04 0.181 0.057 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.73e-01 0.0991 0.175 0.057 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 6.33e-01 0.0894 0.187 0.057 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 3.68e-01 -0.162 0.18 0.057 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.81e-01 0.246 0.183 0.057 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 5.82e-01 -0.118 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.10e-01 0.087 0.234 0.051 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 3.65e-01 0.205 0.225 0.051 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 9.98e-01 0.000616 0.212 0.051 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 8.15e-01 0.0351 0.15 0.051 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 4.97e-01 0.163 0.239 0.051 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0796 0.186 0.051 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 9.21e-01 0.0224 0.225 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0182 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 4.16e-01 -0.16 0.197 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.29e-01 0.257 0.168 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 5.20e-02 0.371 0.19 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 3.44e-01 0.126 0.133 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 4.31e-01 0.147 0.187 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.99e-02 0.33 0.16 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 1.54e-01 0.214 0.15 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.52e-01 0.0597 0.188 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 1.09e-01 0.295 0.183 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 3.03e-01 -0.208 0.201 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 4.44e-01 0.107 0.14 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 8.10e-01 0.0459 0.19 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 3.88e-01 -0.106 0.122 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 7.20e-02 -0.278 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 9.96e-01 0.000918 0.171 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 7.20e-02 -0.284 0.157 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0584 0.119 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 6.31e-01 -0.069 0.143 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 6.19e-01 0.063 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 3.89e-01 0.119 0.138 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 8.46e-01 0.0328 0.168 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 6.60e-01 0.0706 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 9.07e-01 0.0194 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 4.64e-01 -0.118 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 9.65e-02 0.285 0.171 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -442889 sc-eQTL 4.43e-01 0.074 0.0963 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 292912 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0605 0.175 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 510627 sc-eQTL 4.71e-01 -0.121 0.168 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -123961 sc-eQTL 5.18e-01 -0.105 0.161 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -336500 sc-eQTL 4.61e-02 -0.333 0.166 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 346381 sc-eQTL 2.01e-01 0.205 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -305059 sc-eQTL 1.83e-01 -0.226 0.169 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -667761 sc-eQTL 7.99e-01 -0.032 0.125 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 348731 sc-eQTL 1.16e-01 -0.215 0.136 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 sc-eQTL 1.82e-01 -0.264 0.197 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000260329 AC007541.1 -304837 eQTL 0.00984 -0.18 0.0698 0.0 0.0 0.0535

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 \N -442889 1.26e-06 8.33e-07 1.5e-07 3.22e-07 9.77e-08 3.22e-07 7.25e-07 1.91e-07 6.52e-07 3.1e-07 1.08e-06 5.15e-07 1.16e-06 1.84e-07 3.58e-07 3.68e-07 5.63e-07 4.31e-07 2.88e-07 2.63e-07 2.61e-07 5.76e-07 5.63e-07 2.19e-07 1.54e-06 2.54e-07 4.71e-07 3.95e-07 6.19e-07 8.5e-07 3.77e-07 5.62e-08 5.3e-08 1.73e-07 3.23e-07 1.19e-07 8.28e-08 1.06e-07 6.49e-08 2.65e-08 1.23e-07 1.15e-06 5.03e-08 1.95e-08 1.47e-07 2.07e-08 1.47e-07 1.77e-08 6.46e-08