Genes within 1Mb (chr12:106567949:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 2.61e-01 0.0794 0.0704 0.197 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 9.70e-02 -0.169 0.102 0.197 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 8.57e-01 0.0147 0.0814 0.197 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0036 0.113 0.197 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0451 0.0528 0.197 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 5.10e-01 0.0522 0.0791 0.197 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0373 0.0635 0.197 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 1.61e-01 0.0659 0.0469 0.197 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0483 0.075 0.197 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 9.25e-01 0.00696 0.0739 0.197 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 2.29e-01 0.109 0.0905 0.197 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.11e-01 0.0527 0.064 0.197 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0171 0.0718 0.197 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0503 0.0615 0.197 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0469 0.0651 0.197 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 2.71e-01 -0.114 0.104 0.197 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 1.37e-01 0.0888 0.0596 0.197 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0306 0.0887 0.197 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0437 0.0893 0.197 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 1.18e-01 0.145 0.092 0.197 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.96e-01 0.0498 0.0586 0.197 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0618 0.0763 0.197 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0404 0.0493 0.197 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0656 0.0518 0.197 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 9.11e-01 0.0126 0.112 0.197 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.35e-02 0.2 0.0934 0.2 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 1.60e-01 -0.141 0.1 0.2 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 4.38e-01 0.0809 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 3.24e-01 0.0956 0.0967 0.2 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 2.06e-01 0.0876 0.0691 0.2 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 7.69e-01 0.0285 0.0967 0.2 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 4.63e-02 -0.182 0.0907 0.2 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0191 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.46e-01 0.0683 0.0724 0.197 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0534 0.087 0.197 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 1.30e-01 -0.126 0.0832 0.197 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 5.20e-02 -0.121 0.0619 0.197 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 1.17e-01 -0.125 0.0797 0.197 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0982 0.0721 0.197 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0141 0.0544 0.195 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0366 0.0974 0.195 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 5.06e-01 0.0639 0.0958 0.195 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 2.61e-01 0.102 0.0905 0.195 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.73e-01 -0.067 0.0933 0.195 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 9.64e-01 0.00389 0.0872 0.195 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 1.71e-01 0.129 0.0937 0.195 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00623 0.0745 0.195 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.69e-01 -0.109 0.079 0.195 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0493 0.113 0.195 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 1.79e-01 0.0797 0.059 0.197 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.54e-01 0.0205 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.38e-01 0.0261 0.0779 0.197 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 5.07e-01 0.0618 0.093 0.197 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0735 0.0695 0.197 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 3.81e-01 0.0853 0.0971 0.197 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.14e-01 0.0705 0.0698 0.197 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0615 0.0853 0.197 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.12e-01 0.0702 0.107 0.202 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.105 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 3.08e-01 -0.109 0.107 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.82e-01 0.0584 0.083 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 5.76e-01 0.056 0.1 0.202 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.111 0.202 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.84e-01 -0.148 0.111 0.202 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.11e-02 0.223 0.103 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 6.69e-01 0.0489 0.114 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 5.31e-01 0.0637 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.56e-01 0.0813 0.109 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0319 0.0848 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0656 0.108 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0843 0.0983 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0914 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.33e-01 -0.109 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0327 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.85e-01 0.00184 0.0952 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.20e-01 0.0215 0.0947 0.198 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0247 0.108 0.198 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0332 0.0944 0.198 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.99e-01 0.0498 0.0946 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 2.90e-01 -0.113 0.106 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.12e-01 0.0528 0.104 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.88e-01 0.00178 0.114 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0323 0.0801 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 2.47e-01 0.131 0.112 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 9.62e-01 0.0037 0.0786 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.11e-01 0.113 0.111 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0674 0.112 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 9.98e-01 0.000295 0.0996 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 5.38e-01 0.0698 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 6.44e-01 -0.045 0.0971 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 5.02e-01 0.0757 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.23e-02 0.144 0.0823 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0485 0.0866 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.00e-02 -0.227 0.104 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.11e-01 0.0412 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.95e-02 -0.207 0.105 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.79e-01 0.0616 0.0868 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.32e-01 0.0884 0.112 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0847 0.0881 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.76e-01 0.0171 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 1.38e-01 -0.14 0.0938 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 1.29e-01 0.084 0.0551 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 9.43e-01 0.006 0.0843 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 1.40e-01 -0.117 0.0793 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 3.87e-01 0.0917 0.106 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.81e-01 0.0634 0.0722 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0254 0.0776 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0623 0.0693 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0355 0.0724 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0918 0.109 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 2.34e-01 0.0807 0.0677 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.99e-01 0.0118 0.0934 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 8.37e-01 0.0201 0.0976 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 6.55e-01 0.0502 0.112 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000136 0.0687 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 7.64e-01 0.0281 0.0934 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0272 0.0759 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0563 0.0755 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0924 0.113 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 9.87e-02 0.152 0.0918 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0173 0.116 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 1.40e-01 0.156 0.105 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 3.34e-02 0.24 0.112 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.55e-01 0.0166 0.0908 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.71e-01 0.0752 0.104 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0697 0.079 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0505 0.0908 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.00e-01 0.0921 0.109 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.52e-03 0.196 0.07 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0954 0.107 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.44e-01 -0.033 0.101 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 1.25e-01 0.171 0.111 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0764 0.0953 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 9.55e-02 -0.153 0.0914 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.93e-01 0.0847 0.0989 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 7.52e-01 0.0325 0.102 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 7.17e-01 0.0413 0.114 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0124 0.0811 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 6.62e-01 0.0431 0.0984 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0346 0.105 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.74e-01 0.0771 0.107 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 9.57e-01 0.00476 0.0878 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0695 0.0934 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.44e-01 -0.069 0.0728 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0728 0.0783 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00653 0.111 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0964 0.0947 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.25e-01 -0.111 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0721 0.108 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 2.77e-01 -0.118 0.109 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.29e-01 0.078 0.0984 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 6.98e-01 0.0437 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0785 0.0946 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.30e-01 -0.114 0.0947 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 3.10e-01 -0.104 0.103 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0651 0.105 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 8.38e-01 0.0233 0.114 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.00e-01 -0.015 0.119 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.00e-01 0.0921 0.109 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 6.31e-01 0.0576 0.12 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0767 0.114 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 2.41e-01 -0.123 0.105 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0413 0.0859 0.199 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0464 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0469 0.096 0.199 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 7.15e-01 0.0355 0.0971 0.199 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.76e-01 0.081 0.114 0.199 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 9.54e-01 0.00496 0.0865 0.199 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.69e-01 0.136 0.0985 0.199 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 6.04e-02 0.199 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 8.71e-01 0.0136 0.0836 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0216 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 2.21e-01 -0.113 0.092 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 4.75e-01 0.082 0.115 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 7.96e-01 0.0224 0.0866 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 4.91e-01 -0.074 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 2.03e-02 -0.219 0.0934 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 9.46e-01 0.00745 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 7.09e-01 0.0395 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.81e-01 0.0573 0.0652 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 1.70e-01 0.134 0.0977 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 3.01e-01 0.0991 0.0956 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.35e-01 0.0467 0.0981 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0884 0.0973 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.64e-01 0.0169 0.0984 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 1.70e-01 0.139 0.101 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 7.90e-01 0.0218 0.0816 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0192 0.0863 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0153 0.114 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0914 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 5.38e-01 0.0683 0.111 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 3.73e-01 -0.101 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0343 0.115 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.52e-01 0.0187 0.0998 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 1.39e-01 0.169 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0919 0.0978 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.26e-01 -0.136 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 3.24e-01 0.104 0.105 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 7.12e-01 0.0277 0.0752 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0887 0.108 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 6.42e-01 0.0464 0.0996 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 2.18e-01 0.126 0.102 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 2.97e-01 0.109 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.27e-01 0.0216 0.0986 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 6.50e-01 0.0487 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0453 0.0785 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.43e-01 -0.103 0.0879 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0261 0.109 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0678 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 7.34e-02 -0.251 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0513 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 8.31e-01 0.0252 0.118 0.196 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.23e-02 -0.168 0.0774 0.196 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0396 0.101 0.196 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0279 0.132 0.196 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00756 0.0766 0.198 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 7.42e-01 0.0364 0.111 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.34e-01 0.0496 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 7.16e-01 0.0381 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0181 0.0578 0.198 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0523 0.0965 0.198 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 1.43e-01 -0.142 0.0964 0.198 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 3.98e-03 -0.255 0.0874 0.198 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0689 0.0921 0.198 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 7.51e-01 0.0298 0.0939 0.197 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0268 0.111 0.197 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 4.51e-01 0.08 0.106 0.197 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.46e-01 0.0877 0.115 0.197 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.12e-01 0.0675 0.0821 0.197 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.107 0.197 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 7.26e-02 -0.138 0.0767 0.197 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0333 0.0887 0.197 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.28e-01 0.083 0.104 0.197 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 1.69e-01 0.146 0.106 0.202 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 1.50e-02 -0.248 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00553 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.95e-01 0.000609 0.0933 0.202 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 6.63e-02 0.14 0.0755 0.202 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 2.20e-03 -0.303 0.0974 0.202 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 4.38e-02 -0.189 0.093 0.202 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.91e-01 -0.12 0.113 0.202 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 7.09e-01 0.0346 0.0926 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0166 0.105 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0518 0.0948 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 1.13e-01 -0.113 0.0713 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0826 0.0855 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.15e-01 -0.106 0.0852 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.107 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 2.45e-02 -0.239 0.105 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 1.03e-02 -0.251 0.0971 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 1.68e-01 -0.107 0.0776 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0838 0.098 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 9.84e-01 0.00189 0.0914 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 8.56e-01 0.0217 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 6.39e-01 0.0587 0.125 0.2 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 5.68e-01 0.0726 0.127 0.2 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 1.09e-01 0.218 0.135 0.2 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0445 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 1.47e-01 0.18 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 7.32e-01 0.0379 0.11 0.2 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.97e-01 -0.167 0.129 0.2 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 4.53e-01 0.093 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 6.05e-01 0.0548 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.193 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0508 0.1 0.193 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.55e-02 -0.209 0.104 0.193 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 2.33e-01 -0.115 0.0962 0.193 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.193 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0485 0.077 0.188 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 9.80e-01 0.00251 0.0992 0.188 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0494 0.0963 0.188 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.29e-01 -0.1 0.102 0.188 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 1.66e-01 -0.137 0.0985 0.188 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.101 0.188 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 6.79e-02 0.199 0.108 0.206 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 3.85e-01 0.104 0.119 0.206 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 6.54e-01 0.0517 0.115 0.206 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 3.31e-01 0.105 0.107 0.206 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.82e-01 0.0538 0.0764 0.206 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 9.45e-02 0.203 0.121 0.206 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0446 0.0948 0.206 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0176 0.115 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 6.37e-01 0.046 0.0972 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 4.60e-01 0.0829 0.112 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0964 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.109 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0545 0.0757 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0599 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.62e-01 -0.103 0.0915 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 3.51e-01 0.08 0.0855 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 1.70e-01 -0.147 0.107 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 7.24e-01 0.0372 0.105 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00316 0.115 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0824 0.0797 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 2.35e-01 0.129 0.108 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 7.94e-01 0.0182 0.0698 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 5.53e-01 0.0529 0.089 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0982 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 1.98e-01 -0.117 0.0909 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0967 0.0682 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 1.18e-01 -0.129 0.0821 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0881 0.0727 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0164 0.0764 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 7.33e-01 0.0318 0.093 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 2.22e-01 -0.108 0.0883 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0816 0.0916 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 1.68e-01 -0.122 0.0883 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 4.70e-02 -0.188 0.0942 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -525600 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0158 0.0551 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 210201 sc-eQTL 6.03e-01 -0.052 0.0999 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 427916 sc-eQTL 3.66e-01 0.0869 0.096 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -206672 sc-eQTL 5.27e-01 0.0583 0.092 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -419211 sc-eQTL 4.71e-01 -0.069 0.0955 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 263670 sc-eQTL 8.35e-01 0.0191 0.0914 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -387770 sc-eQTL 1.25e-01 0.148 0.0962 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -750472 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0102 0.0716 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 266020 sc-eQTL 1.86e-01 -0.103 0.0778 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -387548 sc-eQTL 9.98e-01 0.000288 0.113 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 263670 pQTL 0.0328 0.0346 0.0162 0.0 0.0 0.203
ENSG00000136026 CKAP4 263670 eQTL 0.0247 -0.0281 0.0125 0.0 0.0 0.215
ENSG00000277715 AC079174.2 317190 eQTL 0.0259 -0.0434 0.0195 0.0 0.0 0.215


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000277715 AC079174.2 317190 1.29e-06 9.48e-07 3.05e-07 4.4e-07 2.66e-07 4.12e-07 1.08e-06 3.25e-07 1.11e-06 3.85e-07 1.35e-06 5.6e-07 1.57e-06 2.54e-07 4.36e-07 6.94e-07 7.7e-07 5.63e-07 5.29e-07 6.7e-07 3.87e-07 1.01e-06 7.95e-07 5.98e-07 1.86e-06 3.66e-07 6.81e-07 6e-07 1.04e-06 1.06e-06 5.42e-07 9.54e-08 2.27e-07 5.24e-07 4.25e-07 4.47e-07 3.67e-07 1.47e-07 1.96e-07 2.44e-07 2.67e-07 1.34e-06 7.66e-08 3.36e-08 1.55e-07 7.77e-08 2.01e-07 8.51e-08 9.42e-08