logo

Genes within 1Mb (chr12:106566923:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 5.51e-01 0.0552 0.0923 0.107 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 3.30e-01 -0.131 0.134 0.107 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 5.93e-01 -0.057 0.106 0.107 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 7.67e-01 0.0437 0.147 0.107 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 1.91e-02 -0.161 0.0683 0.107 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0787 0.103 0.107 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0847 0.0829 0.107 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 6.56e-01 0.0277 0.0621 0.107 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0866 0.0987 0.107 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0759 0.0973 0.107 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 2.97e-01 0.125 0.119 0.107 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.76e-01 0.0602 0.0844 0.107 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0943 0.107 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 8.15e-01 -0.019 0.0811 0.107 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 8.07e-01 0.0211 0.086 0.107 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.51e-01 -0.157 0.136 0.107 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.40e-01 0.0751 0.0785 0.107 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 9.36e-01 0.00944 0.117 0.107 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 3.32e-01 -0.114 0.117 0.107 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 7.06e-01 0.046 0.122 0.107 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 3.15e-01 0.0774 0.0769 0.107 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0554 0.1 0.107 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 7.16e-01 0.0237 0.0649 0.107 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0387 0.0683 0.107 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 5.19e-01 0.0946 0.147 0.107 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 1.08e-01 0.198 0.123 0.11 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 2.04e-01 -0.168 0.131 0.11 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.68e-01 0.0403 0.136 0.11 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.55e-01 0.118 0.127 0.11 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 5.80e-01 0.0502 0.0907 0.11 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 5.12e-01 0.0831 0.127 0.11 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 5.31e-02 -0.231 0.119 0.11 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 6.13e-01 -0.069 0.136 0.11 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.74e-01 0.0686 0.0958 0.107 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 4.17e-01 0.0935 0.115 0.107 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 6.41e-02 -0.204 0.11 0.107 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 3.44e-02 -0.174 0.0817 0.107 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 6.23e-02 -0.197 0.105 0.107 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0791 0.0957 0.107 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0678 0.0702 0.107 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0229 0.126 0.107 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 1.37e-01 0.184 0.124 0.107 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 8.09e-01 0.0284 0.117 0.107 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000634 0.121 0.107 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0413 0.113 0.107 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.76e-01 -0.051 0.122 0.107 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 6.48e-01 0.044 0.0965 0.107 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 6.20e-01 -0.051 0.103 0.107 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 3.47e-01 -0.138 0.147 0.107 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.92e-01 0.0675 0.0786 0.107 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 3.29e-01 0.144 0.147 0.107 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.82e-01 0.0287 0.103 0.107 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0407 0.124 0.107 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00698 0.0925 0.107 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.36e-01 0.0611 0.129 0.107 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0809 0.0928 0.107 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.113 0.107 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 7.00e-03 0.374 0.137 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0526 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.25e-01 0.221 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0915 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 5.01e-01 0.0766 0.114 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.137 0.107 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0971 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 1.05e-01 -0.247 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 2.76e-01 0.146 0.134 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 1.80e-01 0.176 0.131 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.71e-01 0.102 0.141 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 3.51e-02 -0.23 0.108 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 3.10e-01 -0.142 0.14 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 1.31e-01 -0.192 0.126 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0737 0.139 0.108 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0494 0.146 0.108 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 3.88e-01 -0.119 0.137 0.108 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0148 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0157 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 1.43e-01 -0.205 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 2.30e-01 -0.148 0.123 0.108 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.16e-01 0.0998 0.122 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 4.36e-01 -0.107 0.138 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 6.23e-01 0.0662 0.134 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.33e-01 0.143 0.147 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0392 0.104 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 5.65e-01 0.0841 0.146 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0198 0.102 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 9.09e-01 0.0166 0.145 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.16e-01 0.0533 0.146 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 2.99e-01 -0.135 0.13 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.24e-01 0.146 0.147 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 9.15e-01 0.0135 0.127 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 3.51e-01 -0.137 0.147 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 1.81e-01 0.145 0.108 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0802 0.112 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.44e-01 -0.199 0.136 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 8.92e-01 0.0195 0.144 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 1.48e-02 -0.333 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.95e-01 0.077 0.113 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00038 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0381 0.114 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 7.00e-01 0.055 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0448 0.122 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 7.53e-01 0.023 0.073 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0394 0.111 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.31e-02 -0.188 0.104 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 2.76e-01 0.152 0.139 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 1.52e-01 0.136 0.0948 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 1.83e-01 -0.136 0.102 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0304 0.0914 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.73e-01 0.00324 0.0954 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.78e-01 -0.156 0.144 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.07e-01 0.0751 0.0903 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0789 0.124 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 1.74e-01 0.177 0.129 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.15 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 6.04e-01 0.0475 0.0914 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 7.79e-01 -0.035 0.124 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 3.19e-01 -0.101 0.101 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00474 0.101 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 1.29e-01 -0.229 0.15 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.82e-01 0.109 0.125 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.73e-01 0.0452 0.156 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 9.26e-01 0.0132 0.143 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 2.51e-01 0.175 0.152 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0954 0.123 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 8.64e-01 0.0242 0.141 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 7.82e-01 0.0296 0.107 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.123 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.89e-01 0.156 0.147 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 1.08e-01 0.148 0.092 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 3.78e-01 -0.123 0.139 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 9.61e-01 0.00636 0.131 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.68e-01 0.105 0.145 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0327 0.124 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0613 0.119 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.71e-01 0.176 0.128 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 8.70e-01 0.0218 0.133 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.51e-01 0.169 0.147 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 8.55e-01 0.0194 0.106 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 2.75e-01 0.14 0.128 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0996 0.137 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0703 0.14 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 8.23e-01 0.0256 0.115 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0582 0.122 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 9.92e-01 -0.001 0.0951 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 9.28e-01 -0.013 0.144 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 5.35e-01 0.078 0.126 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 6.41e-02 -0.276 0.148 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 4.82e-01 -0.101 0.143 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.54e-01 -0.108 0.144 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 3.16e-01 0.131 0.13 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0681 0.149 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 9.11e-01 -0.014 0.125 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0926 0.126 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 6.23e-01 -0.067 0.136 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0521 0.134 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 3.81e-01 0.133 0.151 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0512 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0584 0.152 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 2.26e-01 0.169 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 8.89e-01 0.0214 0.152 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.33e-01 -0.209 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0251 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 8.23e-02 -0.232 0.133 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0735 0.113 0.108 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0207 0.143 0.108 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0263 0.127 0.108 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 1.36e-01 -0.206 0.138 0.108 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 1.47e-01 0.185 0.127 0.108 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 3.53e-01 0.139 0.149 0.108 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 2.54e-01 -0.13 0.114 0.108 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.53e-02 0.217 0.13 0.108 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 1.31e-02 0.346 0.138 0.108 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0198 0.11 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 4.47e-01 -0.106 0.139 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 2.58e-01 -0.138 0.122 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0782 0.151 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.33e-01 0.137 0.142 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 7.03e-01 0.0437 0.114 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 1.57e-01 -0.2 0.141 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 2.09e-01 -0.157 0.124 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 3.94e-01 0.124 0.146 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 7.07e-01 0.0525 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.70e-01 0.0612 0.0845 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.45e-02 0.226 0.126 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 4.88e-02 0.244 0.123 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 5.64e-01 0.0734 0.127 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 9.52e-01 0.00766 0.126 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0162 0.127 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0929 0.132 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 5.67e-01 0.0606 0.106 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.112 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 4.85e-01 -0.103 0.147 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 6.71e-02 0.218 0.118 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.02e-01 0.236 0.143 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 9.31e-01 0.0122 0.141 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 1.37e-01 -0.219 0.147 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0636 0.15 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 6.23e-01 -0.064 0.13 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 7.75e-01 0.0426 0.149 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 8.09e-01 0.0309 0.128 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0938 0.146 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 8.11e-01 0.0328 0.137 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0702 0.098 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.75e-01 -0.191 0.14 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 3.18e-01 0.13 0.13 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 9.92e-01 0.0014 0.133 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.65e-01 0.124 0.136 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 7.65e-01 0.0384 0.129 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 8.27e-01 0.0306 0.14 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0439 0.102 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 1.41e-01 -0.169 0.114 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0212 0.143 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0427 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.99e-01 -0.231 0.178 0.104 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0933 0.16 0.104 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0913 0.151 0.104 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 5.62e-02 -0.192 0.0993 0.104 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 5.54e-01 0.0764 0.129 0.104 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0556 0.168 0.104 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 7.64e-01 0.0308 0.103 0.107 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.148 0.107 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 9.91e-01 0.00156 0.139 0.107 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.91e-01 -0.12 0.14 0.107 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 2.43e-01 0.0903 0.0772 0.107 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 6.30e-02 -0.24 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.17e-01 -0.203 0.129 0.107 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 1.28e-02 -0.295 0.118 0.107 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.80e-01 0.133 0.123 0.107 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0887 0.123 0.107 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0335 0.146 0.107 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.139 0.107 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 3.55e-01 0.14 0.151 0.107 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00535 0.108 0.107 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0115 0.14 0.107 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.14e-02 -0.255 0.0999 0.107 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 3.69e-01 0.105 0.116 0.107 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.44e-01 0.16 0.137 0.107 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 2.14e-02 0.323 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.55e-01 -0.193 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 2.51e-01 0.165 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.85e-01 0.0864 0.123 0.11 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.58e-01 0.075 0.101 0.11 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 1.09e-03 -0.427 0.129 0.11 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 9.65e-02 -0.207 0.124 0.11 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 4.37e-01 -0.117 0.15 0.11 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 5.14e-01 0.0801 0.123 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 5.61e-01 0.0807 0.138 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0798 0.125 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 1.12e-01 -0.15 0.0943 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0397 0.113 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0402 0.113 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00984 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 2.28e-01 -0.169 0.14 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 1.40e-01 -0.191 0.129 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 6.87e-02 -0.186 0.102 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 3.01e-02 -0.279 0.128 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0814 0.12 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 6.57e-02 0.302 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 6.89e-01 0.0671 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 4.91e-02 0.351 0.177 0.109 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0202 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 7.17e-01 0.0596 0.164 0.109 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.145 0.109 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.54e-02 -0.284 0.169 0.109 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 2.20e-01 0.2 0.162 0.109 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 1.29e-01 0.215 0.141 0.107 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 2.57e-01 0.156 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 8.35e-02 -0.233 0.134 0.107 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 2.79e-02 -0.307 0.139 0.107 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.46e-01 -0.188 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0994 0.157 0.107 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0916 0.104 0.097 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 1.31e-01 0.203 0.134 0.097 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 2.34e-01 -0.155 0.13 0.097 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.70e-01 -0.101 0.139 0.097 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 9.25e-02 -0.225 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 2.05e-01 -0.174 0.136 0.097 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 2.49e-01 0.163 0.141 0.11 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0412 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 3.32e-01 -0.145 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 9.20e-01 0.0141 0.14 0.11 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 4.60e-01 0.0734 0.0991 0.11 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 2.35e-03 0.475 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.38e-01 -0.182 0.122 0.11 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 2.62e-01 -0.167 0.149 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 9.98e-01 0.000331 0.127 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 9.22e-01 0.0144 0.146 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.30e-01 0.0435 0.126 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 7.27e-01 0.0497 0.142 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 3.62e-02 -0.207 0.0979 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 1.04e-01 -0.226 0.138 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 6.82e-02 -0.218 0.119 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 3.38e-01 0.107 0.111 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0739 0.14 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0607 0.137 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 2.87e-01 0.16 0.149 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 2.97e-01 -0.109 0.104 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0447 0.141 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 9.49e-01 0.00583 0.091 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 7.14e-01 0.043 0.117 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 8.60e-01 0.0228 0.129 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0991 0.12 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 9.58e-02 -0.15 0.0895 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 6.97e-02 -0.196 0.108 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0553 0.0957 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0242 0.102 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 2.75e-01 0.135 0.124 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 2.52e-02 -0.263 0.117 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 1.53e-01 -0.174 0.122 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 1.51e-02 -0.286 0.116 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 5.11e-02 -0.246 0.125 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -526626 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0747 0.0711 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 209175 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0309 0.129 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 426890 sc-eQTL 6.42e-02 0.23 0.123 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -207698 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0336 0.119 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -420237 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00102 0.124 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 262644 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0545 0.118 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00622 0.125 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 sc-eQTL 8.42e-01 0.0185 0.0926 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 264994 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0824 0.101 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0825 0.146 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 209175 eQTL 4.54e-02 0.0843 0.0421 0.0 0.0 0.109
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 eQTL 0.0444 -0.0375 0.0186 0.0 0.0 0.109
ENSG00000151136 BTBD11 -751498 eQTL 0.173 -0.0508 0.0372 0.00114 0.0 0.109
ENSG00000260329 AC007541.1 -388574 eQTL 0.035 -0.105 0.0498 0.0 0.0 0.109
ENSG00000277715 AC079174.2 316164 eQTL 0.012 -0.0632 0.0251 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151135 TMEM263 -388796 8.25e-07 4.93e-07 8.99e-08 4.36e-07 9.82e-08 1.25e-07 6.51e-07 5.75e-08 5.3e-07 1.15e-07 5.93e-07 2.11e-07 1.05e-06 1.58e-07 1.18e-07 1.06e-07 4.63e-08 2.9e-07 1.55e-07 8e-08 1.39e-07 2.51e-07 2.48e-07 3.68e-08 3.98e-07 1.65e-07 1.33e-07 1.61e-07 1.98e-07 9.49e-07 3.32e-07 3.87e-08 3.56e-08 9.98e-08 3.97e-08 5.14e-08 1.06e-07 9.23e-08 5.8e-08 5.24e-08 4.39e-08 4.55e-07 1.65e-08 1.98e-08 4.7e-08 6.39e-09 1.15e-07 4.09e-09 4.91e-08