logo

Genes within 1Mb (chr12:106565086:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0322 0.0622 0.241 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 5.05e-01 0.0603 0.0902 0.241 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0538 0.0717 0.241 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0527 0.0992 0.241 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0204 0.0466 0.241 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0371 0.0697 0.241 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 9.81e-01 0.00133 0.056 0.241 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0269 0.0413 0.241 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0261 0.0658 0.241 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 6.45e-01 0.0299 0.0648 0.241 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0734 0.0795 0.241 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.19e-03 -0.17 0.055 0.241 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 7.99e-01 0.016 0.063 0.241 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0189 0.054 0.241 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.31e-01 0.0451 0.0571 0.241 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 7.80e-01 0.0255 0.091 0.241 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.82e-01 -0.046 0.0526 0.241 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.96e-01 0.0305 0.0781 0.241 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0936 0.0783 0.241 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0611 0.0813 0.241 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.04e-02 -0.119 0.0509 0.241 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 5.91e-01 0.0362 0.0672 0.241 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0111 0.0435 0.241 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 5.57e-01 0.0269 0.0457 0.241 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 5.76e-01 0.055 0.0982 0.241 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0481 0.0884 0.236 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.0943 0.236 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.71e-02 -0.193 0.0966 0.236 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 1.29e-01 -0.138 0.0902 0.236 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0287 0.0649 0.236 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0674 0.0904 0.236 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 5.88e-01 0.0465 0.0857 0.236 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 6.33e-01 0.0466 0.0975 0.236 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.62e-01 0.0199 0.0656 0.241 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 4.29e-01 0.0623 0.0787 0.241 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 1.62e-01 0.106 0.0753 0.241 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0826 0.0562 0.241 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 2.60e-01 0.0817 0.0723 0.241 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0007 0.0655 0.241 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0608 0.0476 0.24 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 7.18e-01 0.031 0.0855 0.24 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0372 0.0842 0.24 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0366 0.0797 0.24 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0626 0.082 0.24 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0904 0.0763 0.24 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0946 0.0824 0.24 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 1.60e-02 -0.157 0.0646 0.24 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.48e-02 0.12 0.0692 0.24 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0291 0.0996 0.24 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0714 0.0513 0.241 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0929 0.0963 0.241 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0778 0.0675 0.241 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0568 0.0809 0.241 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0696 0.0603 0.241 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 7.94e-01 0.022 0.0845 0.241 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 7.43e-01 0.0199 0.0608 0.241 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 1.96e-01 0.096 0.0739 0.241 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 2.86e-01 0.0975 0.0912 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.38e-01 0.0602 0.0977 0.24 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 3.93e-01 0.0823 0.096 0.24 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 6.99e-01 0.0378 0.0976 0.24 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0324 0.0758 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0491 0.0914 0.24 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0868 0.102 0.24 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 3.75e-01 0.0904 0.102 0.24 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.79e-01 0.0511 0.092 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 7.16e-01 -0.037 0.102 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00365 0.0903 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0528 0.0968 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0732 0.0751 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0817 0.0962 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 9.41e-01 0.00645 0.0874 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 9.24e-02 0.165 0.0974 0.241 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 1.27e-01 -0.158 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 7.89e-02 -0.171 0.0967 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0316 0.0878 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0424 0.0874 0.241 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0493 0.0993 0.241 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 3.00e-01 0.0903 0.0869 0.241 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0748 0.0824 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 7.61e-01 0.0282 0.0927 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00371 0.0906 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0177 0.0994 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0511 0.0698 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0613 0.0982 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00612 0.0686 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00605 0.1 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 4.70e-01 0.0728 0.101 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0196 0.0896 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0864 0.102 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 7.93e-01 -0.023 0.0874 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 4.77e-01 0.0722 0.101 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.19e-01 0.0171 0.0745 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00497 0.0834 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.41e-01 0.0473 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 1.75e-01 0.145 0.106 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.69e-01 0.03 0.102 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0833 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.62e-01 0.0988 0.108 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0189 0.085 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.70e-02 0.209 0.105 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0725 0.0907 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0104 0.0486 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 9.66e-01 0.00314 0.0739 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.70e-01 0.0506 0.0699 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000301 0.093 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 7.66e-04 -0.211 0.0618 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.64e-01 0.0296 0.0681 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0163 0.0609 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.32e-01 0.0135 0.0636 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.0958 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.72e-01 0.0174 0.0599 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0652 0.0823 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0251 0.0861 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0677 0.099 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0551 0.0605 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0358 0.0824 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00331 0.067 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 1.36e-01 0.0992 0.0663 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 9.03e-01 0.0122 0.0999 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.15e-02 -0.143 0.0818 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0294 0.103 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0318 0.0943 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.59e-03 -0.228 0.0794 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.06e-01 -0.095 0.0927 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0737 0.0703 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 2.83e-01 0.087 0.0808 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 3.77e-01 -0.086 0.0973 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.75e-02 -0.11 0.0622 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 2.21e-01 0.115 0.0939 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.58e-02 -0.185 0.0877 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 5.48e-02 -0.188 0.0972 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.05e-01 -0.106 0.0836 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 1.59e-02 0.194 0.0798 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 6.45e-01 0.0401 0.0871 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.02e-02 0.157 0.0895 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0458 0.0999 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000474 0.0727 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.51e-01 0.0166 0.0882 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 5.15e-01 0.0612 0.0939 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 6.27e-01 0.0469 0.0963 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0743 0.0785 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 2.90e-02 -0.182 0.0828 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 8.82e-01 0.00973 0.0653 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0452 0.0702 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 6.80e-01 0.041 0.099 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0551 0.0869 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0879 0.103 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0889 0.0992 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0107 0.0998 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0972 0.09 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.59e-01 0.0455 0.103 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0575 0.0867 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 9.73e-01 0.00293 0.087 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 4.41e-01 0.0727 0.0941 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0276 0.0939 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.106 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 1.98e-01 -0.137 0.106 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.40e-01 0.0459 0.0979 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0437 0.107 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00295 0.0982 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 3.01e-01 0.105 0.102 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 4.10e-02 -0.192 0.0932 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.53e-01 0.0719 0.0771 0.242 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.33e-02 -0.18 0.0966 0.242 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 1.10e-01 -0.138 0.0859 0.242 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.44e-01 0.0309 0.0945 0.242 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 1.52e-01 -0.125 0.087 0.242 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0971 0.102 0.242 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 1.99e-01 0.1 0.0776 0.242 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 5.97e-01 0.0471 0.089 0.242 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 8.27e-01 0.021 0.0958 0.242 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 6.83e-01 0.0319 0.0779 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.01e-01 0.0249 0.0986 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0107 0.0861 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 1.15e-01 -0.168 0.106 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00235 0.1 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0226 0.0807 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0372 0.1 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0857 0.088 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 2.71e-01 0.113 0.103 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 2.97e-02 -0.213 0.0975 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0954 0.058 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 5.57e-01 0.0515 0.0875 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0669 0.0855 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.25e-01 -0.07 0.0875 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0282 0.087 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 1.03e-01 -0.143 0.0873 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0597 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 5.66e-02 -0.139 0.0723 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 1.32e-01 0.116 0.0766 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0364 0.101 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0124 0.0847 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 3.96e-01 -0.087 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 5.39e-01 0.0615 0.0998 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 6.62e-02 0.192 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 6.64e-01 0.0462 0.106 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 3.70e-02 -0.192 0.0912 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 1.24e-01 -0.162 0.105 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 5.45e-01 0.0549 0.0905 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 7.20e-02 0.186 0.103 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0275 0.0973 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0379 0.0689 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 5.86e-01 0.0538 0.0988 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0352 0.0913 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 5.87e-01 -0.051 0.0937 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 9.47e-01 0.00641 0.0957 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0331 0.0904 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00137 0.0983 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0802 0.0718 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 6.07e-01 0.0417 0.0808 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0278 0.1 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0849 0.118 0.219 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0614 0.127 0.219 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 9.27e-02 0.191 0.112 0.219 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0383 0.107 0.219 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.02e-01 0.0601 0.0714 0.219 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0908 0.219 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 5.07e-01 0.0795 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0213 0.0679 0.241 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 5.22e-01 0.0628 0.098 0.241 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 8.96e-01 0.0121 0.0923 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 8.97e-01 0.012 0.0926 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 9.62e-01 0.00243 0.0513 0.241 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 1.52e-01 0.123 0.0852 0.241 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 1.74e-02 0.203 0.0847 0.241 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.26e-02 0.16 0.0783 0.241 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 6.61e-01 0.0359 0.0817 0.241 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.34e-01 0.0175 0.0833 0.241 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.37e-01 0.0467 0.0988 0.241 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 9.61e-01 0.00461 0.0942 0.241 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0298 0.102 0.241 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.93e-02 -0.132 0.0724 0.241 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.29e-01 0.0457 0.0945 0.241 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 9.08e-01 0.00797 0.0686 0.241 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.80e-01 0.0556 0.0786 0.241 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0137 0.0929 0.241 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 1.09e-01 -0.156 0.097 0.249 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.58e-01 0.0168 0.094 0.249 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0968 0.099 0.249 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0887 0.0852 0.249 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0331 0.0698 0.249 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 1.53e-01 -0.131 0.091 0.249 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 6.80e-01 0.0356 0.0861 0.249 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 7.42e-01 0.0343 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.48e-01 0.0775 0.0824 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.80e-01 0.0141 0.0933 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.16e-01 0.0688 0.0845 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0495 0.0638 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 4.04e-01 0.0638 0.0763 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 6.94e-01 -0.03 0.0763 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 9.92e-01 0.001 0.0957 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 4.65e-01 0.0697 0.0953 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.56e-01 0.0659 0.0881 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 2.00e-02 -0.161 0.0688 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 7.21e-01 0.0315 0.0878 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.77e-01 0.0126 0.0817 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 4.56e-01 0.0788 0.105 0.264 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0137 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.70e-01 0.0812 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 1.29e-01 -0.183 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.19e-01 0.0525 0.105 0.264 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 8.71e-01 0.0179 0.11 0.264 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0126 0.0977 0.264 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0321 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 4.05e-01 0.0913 0.109 0.264 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 7.60e-02 -0.168 0.0944 0.247 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00883 0.0924 0.247 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.95e-01 0.0769 0.0902 0.247 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0403 0.0942 0.247 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 8.67e-01 0.0146 0.0869 0.247 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 1.30e-01 0.16 0.105 0.247 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 1.72e-01 0.0957 0.0698 0.24 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0117 0.0904 0.24 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 1.88e-02 0.205 0.0865 0.24 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00527 0.0936 0.24 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 2.60e-01 0.102 0.0899 0.24 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 5.90e-03 0.251 0.0902 0.24 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0244 0.103 0.249 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 2.46e-01 -0.13 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0716 0.108 0.249 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0942 0.101 0.249 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 6.76e-01 0.0301 0.0718 0.249 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0534 0.115 0.249 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 6.54e-01 0.04 0.0891 0.249 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.41e-01 0.0217 0.108 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.19e-01 0.0871 0.0872 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0307 0.101 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0861 0.0864 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 6.10e-01 -0.05 0.098 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0392 0.0681 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 2.52e-01 -0.11 0.0954 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0825 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0414 0.0753 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 3.98e-01 0.0798 0.0942 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 4.82e-01 -0.065 0.0923 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 2.82e-01 -0.109 0.101 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0489 0.0702 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0343 0.0952 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0173 0.0614 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 3.65e-01 0.0726 0.08 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 2.73e-01 0.0971 0.0884 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.98e-01 0.0694 0.082 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0928 0.0614 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 3.72e-01 0.0663 0.0741 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0538 0.0655 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 8.48e-01 0.0132 0.0688 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 8.99e-01 0.0106 0.0837 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 3.53e-02 0.167 0.0789 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0674 0.0825 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 1.74e-01 0.108 0.0795 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 4.03e-02 0.175 0.0847 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -528463 sc-eQTL 1.23e-01 -0.076 0.0491 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 207338 sc-eQTL 6.37e-01 0.0423 0.0895 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 425053 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0946 0.0859 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -209535 sc-eQTL 6.81e-01 -0.034 0.0825 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -422074 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0748 0.0855 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 260807 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0777 0.0817 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -390633 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0888 0.0865 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -753335 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0867 0.0639 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 sc-eQTL 8.08e-02 0.122 0.0695 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -390411 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 eQTL 1.46e-06 0.0838 0.0173 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 \N -528463 4.37e-07 3.12e-07 6.99e-08 3.66e-07 1.07e-07 1.57e-07 4.05e-07 8.37e-08 2.26e-07 1.37e-07 3.32e-07 1.72e-07 4.11e-07 8.85e-08 8.45e-08 1.17e-07 9.3e-08 2.75e-07 1.36e-07 8.86e-08 1.57e-07 2.3e-07 2.33e-07 1.06e-07 3.55e-07 1.82e-07 1.78e-07 1.67e-07 1.87e-07 2.39e-07 1.59e-07 6.87e-08 5.64e-08 1.23e-07 2.35e-07 4.95e-08 9.77e-08 7.62e-08 5.7e-08 7.5e-08 4.51e-08 2.91e-07 3.14e-08 1.23e-08 8.43e-08 1.37e-08 9.19e-08 0.0 4.52e-08
ENSG00000111785 \N -209535 2.17e-06 2.44e-06 3.29e-07 1.99e-06 4.41e-07 8.34e-07 1.88e-06 6.87e-07 1.81e-06 8.89e-07 2.48e-06 1.35e-06 3.58e-06 1.23e-06 5.48e-07 1.48e-06 1.12e-06 1.7e-06 7.85e-07 1.26e-06 9.29e-07 2.71e-06 2.16e-06 1.1e-06 3.25e-06 1.26e-06 1.31e-06 1.49e-06 1.91e-06 1.88e-06 1.31e-06 3.22e-07 4.32e-07 1.1e-06 1.27e-06 6.66e-07 7.59e-07 4.38e-07 7.04e-07 3.34e-07 3.55e-07 3.26e-06 4.93e-07 1.86e-07 3.3e-07 3.28e-07 6.75e-07 2.3e-07 2.41e-07
ENSG00000166046 TCP11L2 263157 1.27e-06 1.39e-06 3.06e-07 1.44e-06 3.71e-07 6.46e-07 1.35e-06 4.13e-07 1.67e-06 6.44e-07 2.09e-06 8.48e-07 2.49e-06 3.29e-07 5.04e-07 9.36e-07 9.57e-07 9.58e-07 6.75e-07 5.06e-07 7.86e-07 1.89e-06 1.12e-06 6.43e-07 2.41e-06 6.73e-07 9.97e-07 8.48e-07 1.6e-06 1.32e-06 8.22e-07 2.62e-07 2.76e-07 5.71e-07 6.82e-07 4.6e-07 7.3e-07 3.5e-07 4.67e-07 2.09e-07 2.77e-07 1.93e-06 3.01e-07 1.99e-07 3.12e-07 2.88e-07 2.28e-07 5.98e-08 1.83e-07