logo

Genes within 1Mb (chr12:106559788:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 1.51e-01 0.164 0.114 0.066 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 2.58e-01 -0.188 0.165 0.066 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0929 0.132 0.066 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 2.73e-01 0.2 0.182 0.066 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0391 0.0857 0.066 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.44e-02 -0.312 0.126 0.066 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 3.50e-02 -0.216 0.102 0.066 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 1.60e-01 0.108 0.0766 0.066 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 1.17e-01 -0.192 0.122 0.066 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.38e-01 -0.116 0.12 0.066 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 6.85e-02 0.269 0.147 0.066 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 1.57e-02 -0.252 0.103 0.066 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00488 0.117 0.066 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 2.61e-02 -0.223 0.0994 0.066 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 6.72e-01 0.0452 0.106 0.066 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0619 0.17 0.066 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.25e-01 0.0469 0.0958 0.066 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 3.92e-01 -0.122 0.142 0.066 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 9.12e-01 0.0159 0.143 0.066 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.15e-01 0.0965 0.148 0.066 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0932 0.0937 0.066 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00276 0.122 0.066 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0614 0.079 0.066 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0987 0.0831 0.066 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0663 0.179 0.066 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00583 0.155 0.068 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0968 0.165 0.068 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.39e-01 -0.163 0.171 0.068 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.47e-01 0.0959 0.159 0.068 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 9.56e-01 0.00632 0.114 0.068 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.15e-01 -0.25 0.158 0.068 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 8.10e-01 0.0361 0.15 0.068 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0449 0.171 0.068 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.121 0.066 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 6.08e-02 0.271 0.144 0.066 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.90e-01 0.0371 0.139 0.066 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.35e-02 -0.235 0.103 0.066 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 2.67e-01 -0.148 0.133 0.066 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.62e-01 0.169 0.12 0.066 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.44e-01 0.00616 0.0874 0.067 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0648 0.156 0.067 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.067 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0298 0.146 0.067 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 1.58e-01 -0.212 0.149 0.067 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.82e-01 -0.151 0.14 0.067 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 4.19e-01 0.122 0.151 0.067 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.58e-01 0.089 0.12 0.067 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0427 0.128 0.067 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 5.66e-01 -0.105 0.182 0.067 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 3.83e-01 0.0814 0.093 0.066 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 4.03e-01 -0.146 0.174 0.066 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.95e-01 -0.104 0.122 0.066 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 9.84e-02 0.241 0.145 0.066 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0467 0.109 0.066 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.08e-01 0.156 0.152 0.066 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 1.10e-01 0.175 0.109 0.066 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 5.87e-01 0.073 0.134 0.066 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 6.87e-01 0.0666 0.165 0.066 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 7.35e-01 0.0695 0.205 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.80e-02 0.343 0.2 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 6.41e-01 0.0956 0.205 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 2.35e-02 0.358 0.157 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.25e-01 0.233 0.191 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.74e-01 0.19 0.214 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.87e-01 0.281 0.213 0.051 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.15e-01 0.206 0.166 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.99e-01 0.0468 0.184 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0643 0.163 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 3.06e-02 -0.377 0.173 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0714 0.136 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.63e-01 -0.159 0.174 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0473 0.158 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.21e-01 0.212 0.172 0.067 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 9.97e-01 0.000717 0.183 0.067 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.61e-01 -0.157 0.172 0.067 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 2.69e-01 0.171 0.155 0.067 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.84e-01 0.0629 0.154 0.067 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 6.77e-01 0.073 0.175 0.067 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 3.63e-03 -0.443 0.151 0.067 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 4.77e-02 0.303 0.152 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0653 0.173 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0187 0.169 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 3.54e-01 0.172 0.185 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0512 0.13 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.77e-01 -0.247 0.182 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 2.62e-02 -0.283 0.126 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0634 0.18 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 2.15e-01 -0.225 0.181 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.37e-01 0.0543 0.161 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.22e-01 0.117 0.183 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.94e-01 -0.134 0.157 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.78e-03 -0.565 0.178 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 5.55e-01 0.0793 0.134 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 1.49e-01 -0.202 0.14 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0289 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 2.98e-01 0.187 0.179 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 6.62e-01 -0.075 0.172 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.76e-02 -0.292 0.139 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 4.96e-01 0.124 0.182 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 3.19e-01 -0.143 0.143 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 4.84e-01 0.125 0.178 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 9.56e-01 0.00841 0.153 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 1.68e-01 0.124 0.0896 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0463 0.137 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 1.96e-01 -0.167 0.129 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 7.33e-01 0.0588 0.172 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0899 0.117 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 9.01e-02 -0.191 0.112 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.54e-01 0.167 0.117 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 7.87e-01 0.0479 0.178 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.13e-01 0.0121 0.111 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0515 0.152 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 9.70e-01 0.00605 0.159 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.22e-02 0.355 0.182 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 7.97e-02 -0.196 0.111 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0167 0.152 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 5.15e-02 -0.24 0.123 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.28e-01 0.0429 0.123 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 1.90e-01 -0.242 0.184 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.83e-01 0.00307 0.148 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 2.82e-02 -0.404 0.183 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.21e-01 -0.109 0.169 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0604 0.181 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.19e-01 -0.178 0.145 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 8.67e-01 0.028 0.167 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 2.42e-01 0.148 0.126 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0734 0.145 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00338 0.175 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0373 0.111 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.42e-01 0.0553 0.167 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0318 0.157 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00453 0.174 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 9.53e-01 0.00881 0.149 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.39e-01 0.212 0.143 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 5.01e-01 0.104 0.155 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 5.53e-01 0.095 0.16 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 5.89e-01 -0.096 0.177 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.92e-01 0.051 0.128 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0454 0.156 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 2.14e-01 0.207 0.166 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0982 0.17 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.43e-01 -0.162 0.139 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0373 0.148 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0731 0.115 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.99e-02 -0.21 0.123 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 5.69e-01 0.0999 0.175 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00319 0.149 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0173 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.75e-03 -0.45 0.167 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 9.17e-01 0.0179 0.171 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 7.30e-01 0.0536 0.155 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 6.19e-01 -0.088 0.177 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0387 0.149 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.96e-02 -0.261 0.148 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 5.12e-02 -0.314 0.16 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0994 0.163 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 3.24e-01 -0.182 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 4.92e-01 -0.122 0.176 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 4.13e-02 0.377 0.183 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 7.25e-01 -0.06 0.17 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 4.02e-01 0.156 0.186 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.87e-01 0.119 0.17 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0539 0.177 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 1.72e-01 -0.223 0.163 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 8.87e-01 0.0194 0.136 0.067 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0049 0.171 0.067 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.56e-01 -0.14 0.152 0.067 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.72e-02 0.315 0.165 0.067 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 1.26e-01 -0.235 0.153 0.067 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.98e-02 0.295 0.179 0.067 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 1.31e-01 0.207 0.136 0.067 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 4.39e-01 0.121 0.156 0.067 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 6.52e-01 0.0759 0.168 0.067 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0068 0.133 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.92e-01 0.0228 0.168 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0921 0.146 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.55e-01 -0.168 0.182 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0768 0.17 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 5.49e-02 -0.263 0.136 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 1.27e-01 0.259 0.169 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.74e-01 0.108 0.15 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 6.64e-01 0.0762 0.175 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 3.52e-01 -0.156 0.167 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.51e-01 -0.121 0.105 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00779 0.159 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 9.17e-01 0.0163 0.155 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 2.21e-01 0.194 0.158 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 2.92e-02 -0.342 0.156 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0066 0.159 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 6.11e-01 0.0837 0.164 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 2.06e-01 0.167 0.132 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0724 0.139 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 4.79e-01 0.13 0.183 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 5.40e-01 0.0939 0.153 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.85e-01 0.0267 0.185 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 9.33e-01 0.0152 0.181 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 4.46e-01 0.145 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 5.61e-01 0.112 0.192 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0844 0.167 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 4.62e-01 0.141 0.191 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.19e-01 0.132 0.163 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 9.03e-01 0.0228 0.188 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0246 0.176 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 8.77e-01 0.0192 0.124 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.71e-01 0.0288 0.177 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 4.20e-01 0.132 0.164 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.29e-01 -0.106 0.168 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0279 0.172 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 1.50e-01 -0.233 0.162 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 8.27e-01 0.0387 0.177 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 3.97e-01 0.11 0.129 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0256 0.145 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 2.96e-01 -0.188 0.18 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.55e-01 0.0906 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 5.33e-01 0.136 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 9.93e-01 0.00174 0.195 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 9.83e-01 0.00383 0.183 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.38e-01 -0.117 0.122 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.10e-01 -0.159 0.156 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0168 0.204 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.09e-01 -0.156 0.124 0.065 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.35e-01 0.0374 0.18 0.065 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0991 0.169 0.065 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 4.66e-01 -0.124 0.169 0.065 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 5.11e-02 0.183 0.0931 0.065 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.78e-01 -0.138 0.157 0.065 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 3.43e-01 0.149 0.157 0.065 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0339 0.145 0.065 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 7.92e-01 0.0396 0.15 0.065 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.65e-01 0.0656 0.152 0.066 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 5.62e-01 -0.105 0.18 0.066 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 1.03e-01 -0.279 0.17 0.066 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 4.01e-01 0.156 0.186 0.066 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 7.92e-02 -0.233 0.132 0.066 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0752 0.172 0.066 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 1.55e-01 -0.177 0.124 0.066 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 5.31e-01 0.0897 0.143 0.066 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 8.12e-02 -0.294 0.168 0.066 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.23e-01 0.213 0.175 0.071 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 2.64e-01 -0.188 0.168 0.071 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0742 0.178 0.071 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 1.02e-01 0.25 0.152 0.071 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0712 0.125 0.071 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 9.17e-02 -0.276 0.163 0.071 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0918 0.154 0.071 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 4.25e-01 -0.149 0.186 0.071 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.83e-01 0.0032 0.152 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 3.08e-01 0.175 0.171 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 3.38e-01 -0.149 0.155 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.79e-01 -0.103 0.117 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0128 0.141 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.74e-01 0.19 0.14 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.25e-01 0.0864 0.177 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.19e-02 0.316 0.175 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.42e-01 0.0995 0.163 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 5.20e-04 -0.441 0.125 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0808 0.162 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0339 0.151 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 5.30e-02 0.352 0.181 0.082 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00102 0.192 0.082 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0392 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 1.18e-01 0.325 0.207 0.082 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.31e-01 -0.178 0.182 0.082 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 2.79e-01 -0.207 0.19 0.082 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 4.34e-01 0.132 0.169 0.082 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 9.59e-01 0.0102 0.199 0.082 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 3.60e-01 0.174 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 2.73e-01 0.192 0.175 0.069 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 7.48e-01 0.0549 0.17 0.069 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0575 0.167 0.069 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 1.59e-01 -0.244 0.173 0.069 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 8.41e-01 0.0321 0.16 0.069 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 2.30e-01 0.234 0.194 0.069 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.00e-01 0.0156 0.124 0.068 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 4.35e-01 0.124 0.159 0.068 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 9.47e-02 0.258 0.153 0.068 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 4.92e-02 -0.323 0.163 0.068 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 7.28e-01 0.0553 0.159 0.068 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0695 0.162 0.068 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00802 0.175 0.076 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 1.48e-01 -0.275 0.189 0.076 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.59e-01 -0.107 0.184 0.076 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 7.19e-01 -0.062 0.172 0.076 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.31e-01 -0.119 0.122 0.076 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.44e-01 -0.185 0.194 0.076 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 9.59e-01 0.00778 0.151 0.076 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.62e-01 -0.032 0.183 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 4.27e-02 0.32 0.157 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0356 0.183 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 5.33e-01 -0.098 0.157 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 3.57e-01 -0.164 0.178 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0394 0.124 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 3.59e-01 0.16 0.173 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.73e-01 -0.204 0.149 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 3.28e-01 0.136 0.138 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 2.22e-01 -0.212 0.173 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.65e-01 0.0508 0.17 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 1.29e-01 0.282 0.185 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0884 0.129 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 5.30e-03 -0.485 0.172 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 5.56e-02 -0.215 0.112 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 5.68e-01 0.0848 0.148 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 1.71e-01 0.225 0.163 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0434 0.152 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 2.26e-02 -0.259 0.113 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 3.90e-01 -0.118 0.137 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 1.01e-01 0.199 0.121 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 6.93e-01 0.0498 0.126 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 6.71e-01 0.0652 0.153 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 1.89e-01 0.192 0.146 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 4.10e-02 -0.308 0.15 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0566 0.146 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0166 0.157 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -533761 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0214 0.0892 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 202040 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0334 0.162 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 419755 sc-eQTL 2.15e-01 0.193 0.155 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -214833 sc-eQTL 7.43e-01 0.0491 0.149 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -427372 sc-eQTL 2.19e-01 -0.19 0.154 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 255509 sc-eQTL 3.89e-01 -0.128 0.148 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -395931 sc-eQTL 6.10e-01 0.0801 0.157 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -758633 sc-eQTL 6.90e-01 0.0463 0.116 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0285 0.127 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -395709 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0157 0.183 0.067 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -533761 eQTL 0.0131 0.072 0.029 0.0 0.0 0.0667
ENSG00000136026 CKAP4 255509 pQTL 0.0137 0.0625 0.0253 0.0 0.0 0.0679
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 eQTL 1.28e-06 0.137 0.028 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 257859 1.29e-06 9.59e-07 3.28e-07 1.16e-06 3.46e-07 5.92e-07 1.58e-06 3.75e-07 1.39e-06 4.7e-07 1.74e-06 6.31e-07 2.13e-06 3e-07 5.73e-07 8.19e-07 8.95e-07 7.02e-07 8.21e-07 6.33e-07 6.61e-07 1.42e-06 8.53e-07 6.34e-07 2.28e-06 6.16e-07 8.34e-07 7.14e-07 1.37e-06 1.2e-06 6.82e-07 1.73e-07 2.19e-07 6.86e-07 6.22e-07 4.54e-07 7.25e-07 2.21e-07 4.67e-07 3.1e-07 2.71e-07 1.65e-06 6.21e-08 1.38e-07 2.62e-07 1.23e-07 2.3e-07 5.32e-08 1.56e-07