logo

Genes within 1Mb (chr12:106557639:T:TAGTGATTATATGCATTA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.18e-01 0.139 0.113 0.068 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 2.58e-01 -0.185 0.163 0.068 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0249 0.13 0.068 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.01e-01 0.23 0.179 0.068 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 5.55e-01 -0.05 0.0846 0.068 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 2.67e-02 -0.279 0.125 0.068 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 3.04e-02 -0.219 0.1 0.068 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.57e-01 0.0865 0.076 0.068 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.51e-02 -0.209 0.121 0.068 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0753 0.119 0.068 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 4.97e-02 0.287 0.146 0.068 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.24e-03 -0.277 0.102 0.068 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 9.74e-01 0.00384 0.116 0.068 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.92e-02 -0.216 0.0985 0.068 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 5.64e-01 0.0609 0.105 0.068 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0542 0.168 0.068 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 5.51e-01 0.0564 0.0944 0.068 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 3.83e-01 -0.122 0.14 0.068 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 7.62e-01 0.0426 0.141 0.068 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 4.92e-01 0.101 0.146 0.068 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0926 0.0923 0.068 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 7.29e-01 0.0419 0.121 0.068 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0619 0.0779 0.068 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 2.00e-01 -0.105 0.0818 0.068 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0697 0.176 0.068 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00361 0.153 0.07 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0508 0.163 0.07 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.06e-01 -0.173 0.168 0.07 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 4.78e-01 0.111 0.156 0.07 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.37e-01 0.0377 0.112 0.07 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.28e-01 -0.238 0.155 0.07 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 8.77e-01 0.023 0.148 0.07 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0431 0.168 0.07 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 5.90e-01 0.0642 0.119 0.068 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 4.88e-02 0.281 0.142 0.068 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 7.33e-01 0.0468 0.137 0.068 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.34e-02 -0.252 0.101 0.068 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.48e-01 -0.152 0.131 0.068 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.77e-01 0.16 0.118 0.068 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.44e-01 0.017 0.0862 0.069 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0442 0.154 0.069 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 4.39e-01 0.118 0.152 0.069 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.51e-01 -0.027 0.144 0.069 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 1.81e-01 -0.198 0.148 0.069 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.31e-01 -0.165 0.138 0.069 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 3.64e-01 0.136 0.149 0.069 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 4.87e-01 0.0822 0.118 0.069 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0315 0.126 0.069 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 3.96e-01 -0.153 0.179 0.069 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 4.00e-01 0.0772 0.0916 0.068 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 3.35e-01 -0.166 0.171 0.068 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.92e-01 -0.103 0.12 0.068 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 9.13e-02 0.243 0.143 0.068 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0403 0.108 0.068 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 3.12e-01 0.152 0.15 0.068 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 9.39e-02 0.181 0.108 0.068 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 5.64e-01 0.0762 0.132 0.068 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 7.77e-01 0.0462 0.163 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.59e-01 0.0362 0.203 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 1.03e-01 0.324 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 6.58e-01 0.0895 0.202 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.74e-02 0.345 0.155 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.24e-01 0.23 0.189 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 4.63e-01 0.155 0.211 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.15e-01 0.332 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 3.26e-01 0.162 0.164 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.13e-01 0.0429 0.181 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.70e-01 0.0264 0.161 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 6.71e-02 -0.316 0.172 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0887 0.134 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0992 0.172 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0447 0.156 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.04e-01 0.217 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0184 0.18 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 4.66e-01 -0.124 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.31e-01 0.183 0.153 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.92e-01 0.0401 0.152 0.069 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 7.38e-01 0.0579 0.173 0.069 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 3.19e-03 -0.444 0.149 0.069 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 6.90e-02 0.275 0.15 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0704 0.17 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.79e-01 0.0254 0.166 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 3.04e-01 0.188 0.182 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0424 0.128 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 2.18e-01 -0.222 0.18 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 2.47e-02 -0.281 0.124 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0947 0.177 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 2.85e-01 -0.191 0.178 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 6.02e-01 0.0829 0.159 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 5.01e-01 0.122 0.181 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 3.98e-01 -0.131 0.155 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.09e-03 -0.581 0.175 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 5.56e-01 0.0779 0.132 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.39e-01 -0.163 0.138 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0486 0.169 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 2.93e-01 0.187 0.177 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0681 0.17 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 4.07e-02 -0.284 0.138 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 4.37e-01 0.14 0.18 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 3.22e-01 -0.14 0.141 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 4.72e-01 0.127 0.176 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0142 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.36e-01 0.105 0.0887 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0597 0.135 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 2.89e-01 -0.136 0.128 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 7.39e-01 0.0567 0.17 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0921 0.116 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 9.01e-01 0.0156 0.125 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 1.23e-01 -0.172 0.111 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.06e-01 0.188 0.116 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 7.43e-01 0.0577 0.176 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.49e-01 0.0209 0.109 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0619 0.15 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.13e-01 0.0373 0.157 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 4.35e-02 0.364 0.179 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 5.56e-02 -0.211 0.11 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00874 0.151 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 6.77e-02 -0.223 0.121 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 6.75e-01 0.0511 0.122 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 1.99e-01 -0.234 0.182 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0186 0.146 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 2.15e-02 -0.417 0.18 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 5.14e-01 -0.109 0.167 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0574 0.178 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.58e-01 -0.202 0.142 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 8.46e-01 0.032 0.164 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.20e-01 0.153 0.124 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0394 0.143 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 9.50e-01 0.0107 0.172 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0433 0.11 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.58e-01 0.0295 0.165 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0344 0.155 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0451 0.172 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0498 0.147 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 7.71e-02 0.25 0.141 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.42e-01 0.178 0.152 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.42e-01 0.052 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 4.08e-01 -0.145 0.175 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 7.13e-01 0.0467 0.127 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0455 0.154 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 1.62e-01 0.229 0.163 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0865 0.168 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.95e-01 -0.144 0.137 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0188 0.146 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0487 0.114 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.18e-01 -0.191 0.122 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 5.85e-01 0.0945 0.173 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0024 0.147 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0315 0.175 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 7.87e-03 -0.443 0.165 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 9.94e-01 0.0012 0.169 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 8.15e-01 0.0357 0.153 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0521 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0374 0.147 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 8.67e-02 -0.252 0.146 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 6.61e-02 -0.292 0.158 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0994 0.163 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 3.24e-01 -0.182 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 4.92e-01 -0.122 0.176 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 4.13e-02 0.377 0.183 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.25e-01 -0.06 0.17 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 4.02e-01 0.156 0.186 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 4.87e-01 0.119 0.17 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0539 0.177 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 1.72e-01 -0.223 0.163 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 9.33e-01 0.0112 0.134 0.069 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0332 0.169 0.069 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.54e-01 -0.139 0.149 0.069 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 5.03e-02 0.319 0.162 0.069 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.42e-01 -0.222 0.151 0.069 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.38e-01 0.262 0.176 0.069 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 1.15e-01 0.212 0.134 0.069 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 4.13e-01 0.126 0.154 0.069 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 7.76e-01 0.0471 0.166 0.069 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00325 0.131 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.90e-01 0.0021 0.166 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 5.52e-01 -0.086 0.144 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.73e-01 -0.16 0.179 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 6.22e-01 -0.083 0.168 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 4.32e-02 -0.273 0.134 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.92e-01 0.219 0.167 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 4.82e-01 0.104 0.148 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.62e-01 0.0525 0.173 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 3.93e-01 -0.141 0.165 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.66e-01 -0.116 0.104 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 8.79e-01 0.0238 0.157 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00209 0.153 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 1.79e-01 0.21 0.156 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.28e-02 -0.352 0.154 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0145 0.157 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 6.60e-01 0.0714 0.162 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.30e-01 0.156 0.13 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.39e-01 -0.046 0.138 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 6.47e-01 0.0831 0.181 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 3.80e-01 0.132 0.15 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00696 0.182 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 7.64e-01 0.0534 0.177 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.50e-01 0.174 0.186 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.82e-01 0.203 0.188 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 5.34e-01 -0.102 0.164 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 5.20e-01 0.121 0.188 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 5.14e-01 0.105 0.161 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.67e-01 0.0547 0.184 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 7.86e-01 -0.047 0.173 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.38e-01 0.025 0.122 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.76e-01 0.05 0.175 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 3.39e-01 0.155 0.161 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.96e-01 -0.141 0.166 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 8.54e-01 0.0313 0.169 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.17e-01 -0.251 0.159 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 4.25e-01 0.139 0.174 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 2.82e-01 0.137 0.127 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0292 0.143 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 2.01e-01 -0.227 0.177 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 6.12e-01 0.101 0.199 0.063 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 6.06e-01 0.111 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 9.62e-01 0.0092 0.191 0.063 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0468 0.18 0.063 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 3.60e-01 -0.11 0.12 0.063 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0715 0.154 0.063 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.84e-01 0.0552 0.201 0.063 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 1.15e-01 -0.194 0.123 0.067 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.66e-01 0.0076 0.178 0.067 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0625 0.168 0.067 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0939 0.168 0.067 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 9.21e-02 0.156 0.0924 0.067 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 5.02e-01 -0.104 0.155 0.067 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 4.36e-01 0.122 0.156 0.067 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0311 0.143 0.067 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 8.25e-01 0.0329 0.148 0.067 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 7.02e-01 0.0572 0.149 0.068 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 4.13e-01 -0.145 0.177 0.068 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 2.39e-01 -0.199 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 3.91e-01 0.157 0.183 0.068 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 5.81e-02 -0.247 0.13 0.068 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0576 0.169 0.068 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 1.15e-01 -0.194 0.122 0.068 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 4.83e-01 0.0991 0.141 0.068 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 5.78e-02 -0.315 0.165 0.068 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 2.52e-01 0.198 0.172 0.073 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 5.10e-01 -0.11 0.166 0.073 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0889 0.175 0.073 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 8.27e-02 0.261 0.15 0.073 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 7.10e-01 -0.046 0.123 0.073 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.48e-01 -0.234 0.161 0.073 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0841 0.152 0.073 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 3.73e-01 -0.164 0.184 0.073 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0212 0.15 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 3.08e-01 0.173 0.169 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 3.44e-01 -0.145 0.153 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.65e-01 -0.129 0.116 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 9.14e-01 -0.015 0.139 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.29e-01 0.209 0.138 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 6.92e-01 0.0693 0.175 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 5.27e-02 0.336 0.173 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 4.80e-01 0.114 0.161 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 3.20e-04 -0.451 0.123 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0973 0.16 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0834 0.149 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 7.28e-02 0.317 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.72e-01 0.00652 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0386 0.189 0.085 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 1.56e-01 0.288 0.201 0.085 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.86e-01 -0.189 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 3.12e-01 -0.187 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 3.75e-01 0.146 0.164 0.085 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00284 0.193 0.085 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 3.53e-01 0.171 0.184 0.085 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 4.12e-01 0.142 0.172 0.071 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 6.29e-01 0.0812 0.168 0.071 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0715 0.164 0.071 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.34e-01 -0.255 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 8.99e-01 0.02 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.91e-01 0.25 0.191 0.071 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 9.92e-01 0.00119 0.122 0.07 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 4.14e-01 0.128 0.157 0.07 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 6.00e-02 0.285 0.151 0.07 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 6.66e-02 -0.297 0.161 0.07 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 6.26e-01 0.0762 0.156 0.07 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0592 0.159 0.07 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 7.24e-01 0.0606 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 1.23e-01 -0.288 0.186 0.079 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 4.49e-01 -0.137 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0208 0.169 0.079 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 2.98e-01 -0.125 0.12 0.079 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 1.70e-01 -0.263 0.19 0.079 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.149 0.079 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 9.26e-01 0.0167 0.18 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 7.50e-02 0.278 0.155 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0569 0.181 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.52e-01 -0.029 0.155 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 5.01e-01 -0.118 0.175 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0507 0.122 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 3.02e-01 0.177 0.171 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.76e-01 -0.2 0.147 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 4.22e-01 0.11 0.136 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 2.49e-01 -0.197 0.171 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 5.65e-01 0.0965 0.167 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 1.08e-01 0.294 0.182 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0873 0.127 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 5.57e-03 -0.475 0.17 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 5.87e-02 -0.21 0.11 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 6.65e-01 0.0634 0.146 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 1.41e-01 0.238 0.161 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0371 0.15 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 1.17e-02 -0.282 0.111 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 3.78e-01 -0.12 0.135 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 1.12e-01 0.19 0.119 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.37e-01 0.0256 0.124 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 5.95e-01 0.0804 0.151 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 1.48e-01 0.208 0.143 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 4.16e-02 -0.302 0.147 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0421 0.144 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00735 0.154 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -535910 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0122 0.0881 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 199891 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00109 0.16 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 417606 sc-eQTL 1.98e-01 0.198 0.153 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -216982 sc-eQTL 7.16e-01 0.0537 0.147 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -429521 sc-eQTL 2.49e-01 -0.176 0.152 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 253360 sc-eQTL 3.34e-01 -0.141 0.146 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -398080 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.155 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -760782 sc-eQTL 7.14e-01 0.042 0.115 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00404 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -397858 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0892 0.181 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -535910 eQTL 0.0133 0.072 0.029 0.0 0.0 0.0667
ENSG00000136026 CKAP4 253360 pQTL 0.0136 0.0626 0.0253 0.0 0.0 0.0679
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 eQTL 1.26e-06 0.137 0.0281 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 255710 1.28e-06 9.74e-07 1.27e-07 1.25e-06 1.54e-07 4.39e-07 1.37e-06 9.07e-08 1.11e-06 2.67e-07 1.35e-06 4.75e-07 2.45e-06 2.1e-07 1.32e-07 4.11e-07 7.57e-07 6.85e-07 3.74e-07 8.87e-08 2.86e-07 5.49e-07 8.03e-07 1.23e-07 1.96e-06 2.44e-07 2.94e-07 3.24e-07 1.3e-06 1.39e-06 5.67e-07 3.94e-08 3.74e-08 6.74e-07 4.22e-07 2.76e-07 6.67e-08 5.8e-08 5.25e-08 2.76e-07 5.44e-08 2.62e-06 1.7e-08 5.64e-09 3.3e-08 1.72e-07 9.52e-08 3.99e-09 4.81e-08