Genes within 1Mb (chr12:106553320:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.87e-02 -0.241 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0549 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.127 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 2.61e-01 -0.198 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0994 0.0826 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 2.21e-01 0.152 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.30e-01 -0.048 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000621 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.22e-03 -0.324 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00423 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 1.29e-02 -0.247 0.0984 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.57e-01 0.0297 0.0959 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.72e-05 0.398 0.0979 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.43e-01 0.0115 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 7.23e-01 0.0332 0.0938 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 9.55e-01 0.00788 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00545 0.092 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 5.24e-01 0.0494 0.0774 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0813 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.13e-01 -0.036 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 6.24e-01 0.0795 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0592 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0443 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.15e-01 -0.144 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 4.49e-02 -0.28 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 2.85e-01 0.143 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.77e-02 -0.274 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0256 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.82e-01 0.15 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.13e-01 0.0984 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.63e-03 0.395 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 5.33e-02 0.349 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0867 0.171 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 6.42e-02 -0.222 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.46e-02 0.248 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.03e-01 0.215 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 6.03e-01 0.0845 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 6.82e-01 0.0785 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.11e-01 0.0458 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 1.56e-01 -0.254 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 7.75e-01 0.057 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.83e-01 -0.214 0.199 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 3.67e-01 -0.153 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0892 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 7.66e-01 0.0497 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.02e-01 -0.15 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 3.82e-01 0.156 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.20e-01 -0.198 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0374 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 4.96e-01 -0.124 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 1.74e-01 -0.232 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 6.78e-01 0.0725 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.85e-02 -0.353 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 9.34e-03 -0.469 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 3.42e-01 0.171 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.42e-01 -0.111 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.35e-01 0.144 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 9.56e-02 -0.262 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.90e-01 0.0986 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 8.06e-01 0.033 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0696 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 7.95e-01 0.0451 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 6.23e-02 0.324 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 6.53e-01 0.0644 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.63e-02 -0.352 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 9.89e-01 0.00208 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0245 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 5.40e-02 0.298 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 7.99e-01 0.0221 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.89e-02 -0.27 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0173 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 8.64e-03 -0.294 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0832 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.21e-05 0.483 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 1.43e-01 -0.218 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.62e-01 -0.132 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 1.57e-01 -0.155 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0605 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 6.86e-02 -0.22 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.98e-02 0.279 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.43e-01 0.0129 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.76e-01 0.162 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.67e-01 -0.107 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 7.98e-01 0.0438 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 7.04e-01 0.0695 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 4.60e-02 0.254 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0656 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 9.84e-01 0.00332 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0284 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.62e-01 0.168 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.42e-01 0.0882 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.28e-01 0.0162 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.42e-01 0.15 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0328 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 8.40e-01 -0.028 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 5.11e-01 0.0814 0.124 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 5.76e-02 0.289 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.14e-01 0.183 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.75e-02 -0.33 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0396 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0196 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.98e-01 0.0592 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 4.31e-01 0.13 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 6.45e-01 -0.075 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.183 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 6.77e-01 0.0734 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.93e-01 -0.145 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 9.75e-01 0.00583 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.87e-01 -0.147 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.177 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.14e-01 -0.216 0.136 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 2.39e-01 -0.203 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.12e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 7.52e-01 -0.049 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 3.24e-01 -0.179 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 3.38e-01 0.151 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 6.62e-01 0.0592 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.75e-01 -0.152 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.95e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 1.96e-01 -0.224 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 1.39e-01 0.256 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 3.94e-01 0.152 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.04e-01 0.0207 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 7.11e-01 0.057 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 1.78e-01 -0.211 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 7.20e-01 0.0566 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 3.08e-01 0.166 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 2.53e-01 0.149 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 3.75e-03 0.397 0.135 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 2.53e-02 0.405 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 5.46e-01 0.0894 0.148 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0253 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0598 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 5.51e-01 0.0961 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 1.75e-01 -0.25 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 1.26e-01 0.242 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.55e-01 0.257 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.49e-02 -0.303 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 6.92e-01 0.0646 0.163 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.73e-02 -0.285 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.38e-01 -0.105 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 5.64e-01 0.0929 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0716 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.30e-01 0.217 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 2.41e-01 0.209 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 5.40e-01 0.0744 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0661 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 7.44e-01 -0.03 0.0917 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 4.98e-02 -0.299 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0571 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 7.63e-02 0.259 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0183 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.97e-02 -0.321 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.29e-01 0.171 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 1.55e-01 0.233 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0359 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0526 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 7.86e-01 0.0494 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.09e-01 0.0353 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 1.12e-01 -0.261 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 2.00e-01 0.191 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0798 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 9.07e-02 -0.287 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.48e-01 0.0944 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 7.06e-01 -0.047 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0662 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.08e-01 0.287 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.24e-01 0.0419 0.188 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0434 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.04e-01 -0.184 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 2.99e-01 -0.194 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.21e-01 0.165 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 6.74e-01 0.0821 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 3.83e-01 0.162 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 3.78e-01 -0.142 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.96e-01 0.000862 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 9.72e-01 0.00536 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0218 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.78e-02 -0.28 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.97e-01 0.0809 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 6.04e-01 0.077 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0816 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0921 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.99e-01 -0.203 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.03e-01 -0.122 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 1.00e+00 -5.4e-05 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0851 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 2.36e-01 0.205 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 3.41e-02 -0.315 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 1.44e-01 -0.202 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 8.49e-01 -0.033 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00656 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.46e-02 -0.319 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.11e-01 0.115 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 5.51e-02 -0.3 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 8.64e-02 -0.208 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0686 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 5.88e-01 0.0763 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0803 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -540229 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000138 0.0884 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 195572 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 413287 sc-eQTL 9.07e-01 0.018 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -221301 sc-eQTL 6.18e-02 -0.275 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -433840 sc-eQTL 8.27e-01 0.0336 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 249041 sc-eQTL 5.88e-01 0.0796 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -402399 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -765101 sc-eQTL 3.72e-01 0.103 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 sc-eQTL 1.72e-03 0.389 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -402177 sc-eQTL 6.16e-02 0.338 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 195572 eQTL 4.82e-04 -0.21 0.0599 0.0 0.0 0.0486
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 eQTL 3.65e-06 0.151 0.0323 0.0 0.0 0.0486


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 251391 1.6e-06 1.48e-06 2.77e-07 1.27e-06 4.59e-07 6.63e-07 1.27e-06 5.89e-07 1.76e-06 6.73e-07 1.95e-06 1.29e-06 2.64e-06 4.46e-07 3.66e-07 1.1e-06 1.06e-06 1.3e-06 5.56e-07 7.99e-07 6.57e-07 1.93e-06 1.64e-06 9.37e-07 2.4e-06 1.2e-06 1.06e-06 1.07e-06 1.74e-06 1.29e-06 7.52e-07 2.48e-07 3.7e-07 1.14e-06 7.4e-07 7.36e-07 7.47e-07 3.3e-07 7.23e-07 1.88e-07 1.67e-07 2.09e-06 3.37e-07 1.41e-07 3.62e-07 3.26e-07 4.23e-07 2.54e-07 2.14e-07
ENSG00000258355 \N 306364 1.26e-06 9e-07 3.06e-07 1e-06 3.83e-07 5.63e-07 1.64e-06 4.18e-07 1.59e-06 6.05e-07 1.84e-06 8.32e-07 2.31e-06 3.03e-07 5.32e-07 9.57e-07 9.2e-07 7.94e-07 7.81e-07 5.21e-07 7.96e-07 1.69e-06 8.94e-07 5.58e-07 2.26e-06 7.46e-07 9.45e-07 7.99e-07 1.45e-06 1.36e-06 7.05e-07 2.89e-07 2.54e-07 5.87e-07 5.6e-07 4.9e-07 6.97e-07 2.46e-07 4.53e-07 3.15e-07 3.04e-07 1.47e-06 1.08e-07 5.67e-08 2.83e-07 1.11e-07 2.39e-07 4.82e-08 1.85e-07
ENSG00000260329 \N -402177 1.25e-06 8.33e-07 3.06e-07 3.81e-07 1.79e-07 3.18e-07 7.44e-07 3.28e-07 1.12e-06 3.24e-07 1.13e-06 5.68e-07 1.34e-06 2.12e-07 4.3e-07 5.75e-07 7.79e-07 5.27e-07 3.71e-07 4.36e-07 2.83e-07 8.11e-07 5.82e-07 4.79e-07 1.52e-06 2.89e-07 5.83e-07 4.77e-07 8e-07 8.43e-07 4.61e-07 3.72e-08 1.21e-07 4.51e-07 3.16e-07 3.47e-07 3.26e-07 1.37e-07 1.44e-07 3.01e-08 2.45e-07 8.45e-07 7.23e-08 5.54e-09 1.84e-07 4.53e-08 1.97e-07 8.08e-08 5.77e-08