logo

Genes within 1Mb (chr12:106552264:GGAAAT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.87e-02 -0.241 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0549 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.127 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 2.61e-01 -0.198 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0994 0.0826 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 2.21e-01 0.152 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.30e-01 -0.048 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000621 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.22e-03 -0.324 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00423 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 1.29e-02 -0.247 0.0984 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.57e-01 0.0297 0.0959 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.72e-05 0.398 0.0979 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.43e-01 0.0115 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 7.23e-01 0.0332 0.0938 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 9.55e-01 0.00788 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00545 0.092 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 5.24e-01 0.0494 0.0774 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0813 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.13e-01 -0.036 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 6.24e-01 0.0795 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0592 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0443 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.15e-01 -0.144 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 4.49e-02 -0.28 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 2.85e-01 0.143 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.77e-02 -0.274 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0256 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.82e-01 0.15 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.13e-01 0.0984 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.63e-03 0.395 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 5.33e-02 0.349 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0867 0.171 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 6.42e-02 -0.222 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.46e-02 0.248 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.03e-01 0.215 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 6.03e-01 0.0845 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 6.82e-01 0.0785 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.11e-01 0.0458 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 1.56e-01 -0.254 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 7.75e-01 0.057 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.83e-01 -0.214 0.199 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 3.67e-01 -0.153 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0892 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 7.66e-01 0.0497 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.02e-01 -0.15 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 3.82e-01 0.156 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.20e-01 -0.198 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0374 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 4.96e-01 -0.124 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 1.74e-01 -0.232 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 6.78e-01 0.0725 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.85e-02 -0.353 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 9.34e-03 -0.469 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 3.42e-01 0.171 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.42e-01 -0.111 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.35e-01 0.144 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 9.56e-02 -0.262 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.90e-01 0.0986 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 8.06e-01 0.033 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0696 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 7.95e-01 0.0451 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 6.23e-02 0.324 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 6.53e-01 0.0644 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.63e-02 -0.352 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 9.89e-01 0.00208 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0245 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 5.40e-02 0.298 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 7.99e-01 0.0221 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.89e-02 -0.27 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0173 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 8.64e-03 -0.294 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0832 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.21e-05 0.483 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 1.43e-01 -0.218 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.62e-01 -0.132 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 1.57e-01 -0.155 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0605 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 6.86e-02 -0.22 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.98e-02 0.279 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.43e-01 0.0129 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.76e-01 0.162 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.67e-01 -0.107 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 7.98e-01 0.0438 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 7.04e-01 0.0695 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 4.60e-02 0.254 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0656 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 9.84e-01 0.00332 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0284 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.62e-01 0.168 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.42e-01 0.0882 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.28e-01 0.0162 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.42e-01 0.15 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0328 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 8.40e-01 -0.028 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 5.11e-01 0.0814 0.124 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 5.76e-02 0.289 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.14e-01 0.183 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.75e-02 -0.33 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0396 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0196 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.98e-01 0.0592 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 4.31e-01 0.13 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 6.45e-01 -0.075 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.183 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 6.77e-01 0.0734 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.93e-01 -0.145 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 9.75e-01 0.00583 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.87e-01 -0.147 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.177 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.14e-01 -0.216 0.136 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 2.39e-01 -0.203 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.12e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 7.52e-01 -0.049 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 3.24e-01 -0.179 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 3.38e-01 0.151 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 6.62e-01 0.0592 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.75e-01 -0.152 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.95e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 1.96e-01 -0.224 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 1.39e-01 0.256 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 3.94e-01 0.152 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.04e-01 0.0207 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 7.11e-01 0.057 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 1.78e-01 -0.211 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 7.20e-01 0.0566 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 3.08e-01 0.166 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 2.53e-01 0.149 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 3.75e-03 0.397 0.135 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 2.53e-02 0.405 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 5.46e-01 0.0894 0.148 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0253 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0598 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 5.51e-01 0.0961 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 1.75e-01 -0.25 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 1.26e-01 0.242 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.55e-01 0.257 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.49e-02 -0.303 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 6.92e-01 0.0646 0.163 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.73e-02 -0.285 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.38e-01 -0.105 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 5.64e-01 0.0929 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0716 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.30e-01 0.217 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 2.41e-01 0.209 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 5.40e-01 0.0744 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0661 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 7.44e-01 -0.03 0.0917 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 4.98e-02 -0.299 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0571 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 7.63e-02 0.259 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0183 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.97e-02 -0.321 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.29e-01 0.171 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 1.55e-01 0.233 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0359 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0526 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 7.86e-01 0.0494 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.09e-01 0.0353 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 1.12e-01 -0.261 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 2.00e-01 0.191 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0798 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 9.07e-02 -0.287 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.48e-01 0.0944 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 7.06e-01 -0.047 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0662 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.08e-01 0.287 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.24e-01 0.0419 0.188 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0434 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.04e-01 -0.184 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 2.99e-01 -0.194 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.21e-01 0.165 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 6.74e-01 0.0821 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 3.83e-01 0.162 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 3.78e-01 -0.142 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.96e-01 0.000862 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 9.72e-01 0.00536 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0218 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.78e-02 -0.28 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.97e-01 0.0809 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 6.04e-01 0.077 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0816 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0921 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.99e-01 -0.203 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.03e-01 -0.122 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 1.00e+00 -5.4e-05 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0851 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 2.36e-01 0.205 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 3.41e-02 -0.315 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 1.44e-01 -0.202 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 8.49e-01 -0.033 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00656 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.46e-02 -0.319 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.11e-01 0.115 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 5.51e-02 -0.3 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 8.64e-02 -0.208 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0686 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 5.88e-01 0.0763 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0803 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -541285 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000138 0.0884 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 194516 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 412231 sc-eQTL 9.07e-01 0.018 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -222357 sc-eQTL 6.18e-02 -0.275 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -434896 sc-eQTL 8.27e-01 0.0336 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247985 sc-eQTL 5.88e-01 0.0796 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -403455 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766157 sc-eQTL 3.72e-01 0.103 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 sc-eQTL 1.72e-03 0.389 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -403233 sc-eQTL 6.16e-02 0.338 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 194516 eQTL 4.86e-04 -0.21 0.0599 0.0 0.0 0.0486
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 eQTL 3.86e-06 0.15 0.0323 0.0 0.0 0.0486

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 250335 4.16e-06 4.83e-06 8.75e-07 4.51e-06 1.62e-06 1.66e-06 4.08e-06 8.67e-07 3.32e-06 1.99e-06 4.13e-06 1.29e-06 7.42e-06 1.73e-06 1.2e-06 3.05e-06 1.32e-06 2.9e-06 1.49e-06 9.5e-07 2.29e-06 3.51e-06 3.54e-06 1.71e-06 4.66e-06 1.22e-06 1.47e-06 1.78e-06 2.76e-06 2.37e-06 2.02e-06 9.42e-07 5.97e-07 4.03e-06 3.41e-06 1.17e-06 1.02e-06 4.6e-07 8.84e-07 1.03e-06 8.54e-07 5.31e-06 4.77e-07 1.67e-07 5.96e-07 9.77e-07 6.65e-07 2.41e-07 1.75e-07
ENSG00000258355 \N 305308 2.65e-06 3.09e-06 3.66e-07 3.21e-06 6.3e-07 8.19e-07 2.28e-06 4.27e-07 1.8e-06 9.51e-07 2.39e-06 9.81e-07 3.56e-06 1.45e-06 5.48e-07 1.66e-06 1.03e-06 2.31e-06 5.93e-07 1.32e-06 1.11e-06 2.19e-06 2.16e-06 1.9e-06 2.93e-06 6.58e-07 9.97e-07 1.47e-06 1.74e-06 1.64e-06 1.07e-06 4.2e-07 3.45e-07 3.33e-06 2.09e-06 8.93e-07 8.96e-07 3.45e-07 1.24e-06 4.56e-07 4.42e-07 3.38e-06 3.86e-07 1.99e-07 3.41e-07 5.88e-07 4.11e-07 2.44e-07 2.59e-07
ENSG00000260329 \N -403233 1.19e-06 9.79e-07 3.22e-07 1.57e-06 2.98e-07 5.91e-07 1.5e-06 2.47e-07 1.39e-06 4.36e-07 1.79e-06 5.77e-07 2.34e-06 4.3e-07 4.12e-07 9.13e-07 4.87e-07 6.21e-07 5.31e-07 6.86e-07 5.61e-07 1.17e-06 8.37e-07 6.1e-07 1.95e-06 2.74e-07 4.71e-07 9.25e-07 8.56e-07 1.27e-06 5.66e-07 1.91e-07 4.83e-08 1.64e-06 9.17e-07 4.54e-07 7.71e-07 1.36e-07 4.18e-07 2.44e-07 2.87e-07 1.57e-06 6.23e-08 1.29e-08 1.71e-07 3.05e-07 1.67e-07 3.05e-08 5.96e-08