Genes within 1Mb (chr12:106551482:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.87e-02 -0.241 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0549 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.127 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 2.61e-01 -0.198 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0994 0.0826 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 2.21e-01 0.152 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.30e-01 -0.048 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000621 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.22e-03 -0.324 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00423 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 1.29e-02 -0.247 0.0984 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.57e-01 0.0297 0.0959 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.72e-05 0.398 0.0979 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.43e-01 0.0115 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 7.23e-01 0.0332 0.0938 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 9.55e-01 0.00788 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00545 0.092 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 5.24e-01 0.0494 0.0774 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0813 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.13e-01 -0.036 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 6.24e-01 0.0795 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0592 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0443 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.15e-01 -0.144 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 4.49e-02 -0.28 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 2.85e-01 0.143 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.77e-02 -0.274 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0256 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.82e-01 0.15 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.13e-01 0.0984 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.63e-03 0.395 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 5.33e-02 0.349 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0867 0.171 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 6.42e-02 -0.222 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.46e-02 0.248 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.03e-01 0.215 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 6.03e-01 0.0845 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 6.82e-01 0.0785 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.11e-01 0.0458 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 1.56e-01 -0.254 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 7.75e-01 0.057 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.83e-01 -0.214 0.199 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 3.67e-01 -0.153 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0892 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 7.66e-01 0.0497 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.02e-01 -0.15 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 3.82e-01 0.156 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.20e-01 -0.198 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0374 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 4.96e-01 -0.124 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 1.74e-01 -0.232 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 6.78e-01 0.0725 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.85e-02 -0.353 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 9.34e-03 -0.469 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 3.42e-01 0.171 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.42e-01 -0.111 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.35e-01 0.144 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 9.56e-02 -0.262 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.90e-01 0.0986 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 8.06e-01 0.033 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0696 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 7.95e-01 0.0451 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 6.23e-02 0.324 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 6.53e-01 0.0644 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.63e-02 -0.352 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 9.89e-01 0.00208 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0245 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 5.40e-02 0.298 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 7.99e-01 0.0221 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.89e-02 -0.27 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0173 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 8.64e-03 -0.294 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0832 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.21e-05 0.483 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 1.43e-01 -0.218 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.62e-01 -0.132 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 1.57e-01 -0.155 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0605 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 6.86e-02 -0.22 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.98e-02 0.279 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.43e-01 0.0129 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.76e-01 0.162 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.67e-01 -0.107 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 7.98e-01 0.0438 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 7.04e-01 0.0695 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 4.60e-02 0.254 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0656 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 9.84e-01 0.00332 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0284 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.62e-01 0.168 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.42e-01 0.0882 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.28e-01 0.0162 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.42e-01 0.15 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0328 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 8.40e-01 -0.028 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 5.11e-01 0.0814 0.124 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 5.76e-02 0.289 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.14e-01 0.183 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.75e-02 -0.33 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0396 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0196 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.98e-01 0.0592 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 4.31e-01 0.13 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 6.45e-01 -0.075 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.183 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 6.77e-01 0.0734 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.93e-01 -0.145 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 9.75e-01 0.00583 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.87e-01 -0.147 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.177 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.14e-01 -0.216 0.136 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 2.39e-01 -0.203 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.12e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 7.52e-01 -0.049 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 3.24e-01 -0.179 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 3.38e-01 0.151 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 6.62e-01 0.0592 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.75e-01 -0.152 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.95e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 1.96e-01 -0.224 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 1.39e-01 0.256 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 3.94e-01 0.152 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.04e-01 0.0207 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 7.11e-01 0.057 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 1.78e-01 -0.211 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 7.20e-01 0.0566 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 3.08e-01 0.166 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 2.53e-01 0.149 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 3.75e-03 0.397 0.135 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 2.53e-02 0.405 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 5.46e-01 0.0894 0.148 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0253 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0598 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 5.51e-01 0.0961 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 1.75e-01 -0.25 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 1.26e-01 0.242 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.55e-01 0.257 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.49e-02 -0.303 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 6.92e-01 0.0646 0.163 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.73e-02 -0.285 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.38e-01 -0.105 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 5.64e-01 0.0929 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0716 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.30e-01 0.217 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 2.41e-01 0.209 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 5.40e-01 0.0744 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0661 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 7.44e-01 -0.03 0.0917 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 4.98e-02 -0.299 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0571 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 7.63e-02 0.259 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0183 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.97e-02 -0.321 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.29e-01 0.171 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 1.55e-01 0.233 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0359 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0526 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 7.86e-01 0.0494 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.09e-01 0.0353 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 1.12e-01 -0.261 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 2.00e-01 0.191 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0798 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 9.07e-02 -0.287 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.48e-01 0.0944 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 7.06e-01 -0.047 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0662 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.08e-01 0.287 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.24e-01 0.0419 0.188 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0434 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.04e-01 -0.184 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 2.99e-01 -0.194 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.21e-01 0.165 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 6.74e-01 0.0821 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 3.83e-01 0.162 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 3.78e-01 -0.142 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.96e-01 0.000862 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 9.72e-01 0.00536 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0218 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.78e-02 -0.28 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.97e-01 0.0809 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 6.04e-01 0.077 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0816 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0921 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.99e-01 -0.203 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.03e-01 -0.122 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 1.00e+00 -5.4e-05 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0851 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 2.36e-01 0.205 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 3.41e-02 -0.315 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 1.44e-01 -0.202 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 8.49e-01 -0.033 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00656 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.46e-02 -0.319 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.11e-01 0.115 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 5.51e-02 -0.3 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 8.64e-02 -0.208 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0686 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 5.88e-01 0.0763 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0803 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -542067 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000138 0.0884 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 193734 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 411449 sc-eQTL 9.07e-01 0.018 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -223139 sc-eQTL 6.18e-02 -0.275 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -435678 sc-eQTL 8.27e-01 0.0336 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 247203 sc-eQTL 5.88e-01 0.0796 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -404237 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -766939 sc-eQTL 3.72e-01 0.103 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 sc-eQTL 1.72e-03 0.389 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -404015 sc-eQTL 6.16e-02 0.338 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 193734 eQTL 4.79e-04 -0.21 0.0598 0.0 0.0 0.0486
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 eQTL 3.63e-06 0.151 0.0323 0.0 0.0 0.0486


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 249553 1.29e-06 1.4e-06 2.14e-07 1.26e-06 3.43e-07 6.02e-07 1.53e-06 3.97e-07 1.42e-06 6.19e-07 1.84e-06 8.67e-07 2.19e-06 2.87e-07 5.65e-07 9.54e-07 9e-07 7.94e-07 8.3e-07 5.23e-07 8.07e-07 1.72e-06 9.73e-07 6.27e-07 2.23e-06 7.53e-07 9.45e-07 9.36e-07 1.48e-06 1.26e-06 7.8e-07 2.6e-07 2.57e-07 6.9e-07 5.28e-07 4.74e-07 6.79e-07 3.07e-07 4.75e-07 2.37e-07 2.83e-07 1.64e-06 1.68e-07 1.31e-07 2.84e-07 1.46e-07 2.3e-07 1.05e-07 2.57e-07
ENSG00000258355 \N 304526 1.28e-06 9.1e-07 2.95e-07 6.97e-07 1.87e-07 4.51e-07 1.08e-06 3.28e-07 1.13e-06 3.76e-07 1.35e-06 5.81e-07 1.47e-06 2.57e-07 4.43e-07 6.35e-07 7.72e-07 5.71e-07 4.82e-07 5.57e-07 3.8e-07 8.66e-07 7.79e-07 5.82e-07 1.92e-06 3.71e-07 6.13e-07 5.67e-07 9.32e-07 9.58e-07 5.48e-07 1.56e-07 1.81e-07 3.78e-07 3.93e-07 3.92e-07 4.49e-07 1.61e-07 1.94e-07 1.54e-07 2.84e-07 1.26e-06 5.37e-08 4.23e-08 1.72e-07 7.57e-08 1.87e-07 7.81e-08 1.13e-07
ENSG00000260329 \N -404015 8.25e-07 6.46e-07 1.04e-07 4.43e-07 9.82e-08 2.16e-07 5.54e-07 1.4e-07 4.18e-07 2.43e-07 6.88e-07 3.62e-07 6.47e-07 1.17e-07 1.68e-07 2.23e-07 2.77e-07 3.82e-07 2.13e-07 1.63e-07 2.05e-07 3.49e-07 3.69e-07 2.19e-07 7.94e-07 2.74e-07 2.56e-07 2.7e-07 3.83e-07 4.51e-07 3.1e-07 5.93e-08 4.49e-08 1.36e-07 3.01e-07 1.09e-07 8.6e-08 1.07e-07 6.72e-08 2.24e-08 1.03e-07 4.68e-07 3.55e-08 5.64e-09 1.6e-07 1.27e-08 1.17e-07 2.31e-08 6.32e-08