Genes within 1Mb (chr12:106549338:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 7.64e-01 0.0259 0.0862 0.137 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.37e-01 -0.148 0.125 0.137 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0379 0.0993 0.137 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 5.44e-01 0.0835 0.137 0.137 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 4.40e-01 0.0499 0.0645 0.137 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 1.64e-01 -0.134 0.0962 0.137 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.70e-01 0.0441 0.0775 0.137 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.44e-01 0.0359 0.0591 0.137 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.30e-01 -0.113 0.0939 0.137 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.80e-01 0.014 0.0928 0.137 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 4.34e-03 0.322 0.112 0.137 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.66e-03 -0.251 0.0786 0.137 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 2.81e-01 0.0972 0.0899 0.137 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 6.14e-02 -0.144 0.0766 0.137 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.13e-01 0.0671 0.0817 0.137 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 8.24e-01 -0.029 0.13 0.137 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 6.54e-01 0.0331 0.0738 0.137 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.137 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0277 0.11 0.137 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 9.63e-01 0.00528 0.114 0.137 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0944 0.072 0.137 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 2.82e-01 0.101 0.094 0.137 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 2.37e-01 -0.072 0.0607 0.137 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 9.37e-01 0.00505 0.0642 0.137 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 4.25e-01 0.11 0.138 0.137 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 8.48e-01 0.0228 0.119 0.137 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0793 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.84e-01 -0.14 0.131 0.137 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0281 0.122 0.137 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0937 0.0869 0.137 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 3.10e-01 -0.123 0.121 0.137 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 9.51e-01 0.00708 0.115 0.137 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.22e-01 0.0838 0.131 0.137 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.27e-01 0.0589 0.0929 0.137 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 6.10e-03 0.304 0.11 0.137 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.95e-01 0.112 0.107 0.137 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.52e-01 -0.114 0.0797 0.137 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 7.32e-01 0.0353 0.103 0.137 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 2.27e-01 0.112 0.0926 0.137 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0387 0.0667 0.137 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 7.29e-01 0.0415 0.12 0.137 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00187 0.118 0.137 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 7.25e-01 0.0392 0.111 0.137 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 8.22e-02 -0.199 0.114 0.137 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.88e-01 -0.141 0.107 0.137 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 2.58e-01 0.13 0.115 0.137 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 4.46e-01 0.0697 0.0913 0.137 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 2.31e-01 0.117 0.0971 0.137 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 8.00e-01 0.0352 0.139 0.137 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00687 0.0725 0.137 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.18e-01 -0.167 0.135 0.137 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0952 0.137 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 6.46e-02 0.21 0.113 0.137 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0848 0.137 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 4.07e-02 0.242 0.118 0.137 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 4.97e-01 0.0581 0.0854 0.137 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.14e-01 0.0682 0.104 0.137 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0194 0.129 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.79e-01 0.153 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 9.27e-02 0.234 0.138 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.10e-01 0.177 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.36e-01 0.164 0.109 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 9.69e-01 0.00512 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 9.73e-01 0.00509 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 3.49e-01 0.138 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.53e-01 0.00749 0.128 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.63e-01 0.0815 0.141 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 6.95e-01 -0.049 0.125 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0693 0.134 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 8.36e-01 0.0216 0.104 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 8.75e-01 0.0211 0.133 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 6.05e-01 0.0627 0.121 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 1.85e-01 0.177 0.133 0.138 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.41e-01 -0.166 0.141 0.138 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 1.69e-01 -0.183 0.132 0.138 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 5.47e-01 0.0722 0.12 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 3.75e-01 -0.106 0.119 0.138 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 5.70e-01 -0.077 0.135 0.138 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 3.61e-01 -0.109 0.119 0.138 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.16e-01 0.144 0.116 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 1.19e-01 -0.204 0.13 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 1.99e-01 0.164 0.128 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0385 0.141 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 5.31e-01 0.062 0.0988 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0871 0.139 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 6.19e-01 0.0483 0.097 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 1.04e-01 -0.226 0.138 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0938 0.14 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 5.71e-01 0.0707 0.125 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0411 0.142 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 9.02e-01 0.015 0.122 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 6.04e-03 -0.385 0.139 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 1.14e-01 0.164 0.103 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0537 0.108 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 3.16e-01 0.131 0.131 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 3.01e-01 0.143 0.138 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 7.91e-01 0.0349 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 3.90e-02 -0.222 0.107 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 2.50e-01 0.161 0.14 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0687 0.11 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 9.19e-02 0.23 0.136 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 1.39e-01 -0.174 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 1.87e-01 0.0913 0.069 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0249 0.105 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00659 0.0996 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.78e-01 0.178 0.132 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.68e-01 -0.124 0.09 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 3.55e-01 0.0898 0.0968 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 8.74e-02 -0.148 0.0862 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.09e-02 0.176 0.0897 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 5.78e-01 0.076 0.137 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0327 0.0855 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 3.29e-01 -0.115 0.117 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0378 0.123 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 3.57e-02 0.296 0.14 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 2.54e-02 -0.192 0.0855 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 8.33e-01 0.0248 0.118 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.0953 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 6.60e-01 0.0418 0.0951 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0664 0.143 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.73e-01 -0.124 0.113 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.59e-02 -0.27 0.14 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0893 0.129 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 2.50e-01 0.159 0.138 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.78e-01 -0.149 0.111 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 9.77e-01 0.00374 0.127 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 2.47e-01 0.112 0.0965 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.40e-01 0.0682 0.111 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 2.12e-01 -0.167 0.133 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.07e-01 -0.107 0.0847 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0122 0.128 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.57e-02 -0.206 0.119 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 3.12e-01 -0.134 0.133 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.87e-01 -0.15 0.113 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 4.54e-02 0.219 0.109 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 5.62e-01 0.0686 0.118 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 1.58e-01 0.172 0.122 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 2.50e-01 -0.156 0.135 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.12e-01 0.011 0.0996 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0524 0.121 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 3.75e-01 0.114 0.129 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0575 0.132 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0168 0.108 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0307 0.115 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0187 0.0895 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0688 0.0962 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 3.28e-01 0.133 0.136 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00497 0.117 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0331 0.139 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 4.87e-02 -0.262 0.132 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 8.12e-01 0.0319 0.134 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0922 0.121 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 8.79e-01 0.0211 0.138 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 1.99e-01 0.149 0.116 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0923 0.116 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0534 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.39e-01 0.0808 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.84e-01 -0.104 0.149 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0244 0.143 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.91e-01 0.195 0.149 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 3.82e-01 -0.12 0.137 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 1.01e-01 0.245 0.149 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 6.58e-01 0.061 0.138 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 3.95e-01 -0.122 0.143 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 7.71e-01 0.0385 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.21e-01 0.0687 0.107 0.139 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.55e-01 -0.101 0.135 0.139 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0996 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 3.89e-02 0.269 0.129 0.139 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 5.67e-02 -0.23 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 1.66e-01 0.196 0.141 0.139 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 5.66e-01 0.062 0.108 0.139 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 2.60e-01 0.139 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0371 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 4.54e-01 0.0774 0.103 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0226 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 9.72e-02 -0.189 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0609 0.142 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 2.98e-01 -0.138 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 2.91e-01 -0.113 0.107 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 4.74e-01 0.095 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 8.19e-01 0.0268 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 3.65e-01 0.124 0.136 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0531 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0622 0.0804 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.00e-01 0.0816 0.121 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 8.82e-01 0.0176 0.118 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 1.29e-01 0.183 0.12 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.02e-01 -0.196 0.119 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0777 0.121 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 6.94e-01 0.0493 0.125 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 1.49e-01 0.145 0.1 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 3.20e-01 0.106 0.106 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 5.74e-01 0.0787 0.14 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 4.60e-01 0.0852 0.115 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.74e-01 0.0998 0.139 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 3.39e-01 0.13 0.136 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 1.13e-01 0.226 0.142 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 4.30e-01 0.114 0.144 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0612 0.125 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 6.74e-01 0.0606 0.144 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 7.79e-01 0.0346 0.123 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 1.04e-02 0.36 0.139 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0434 0.132 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0323 0.0944 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 3.00e-01 0.14 0.135 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 3.73e-01 -0.112 0.125 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.48e-01 -0.148 0.128 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.131 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0909 0.124 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 7.95e-02 0.236 0.134 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 4.94e-02 0.193 0.0977 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.53e-01 0.0832 0.111 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0855 0.137 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0692 0.152 0.122 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 3.42e-01 0.156 0.163 0.122 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0107 0.146 0.122 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 4.68e-01 -0.1 0.137 0.122 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0702 0.0916 0.122 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0638 0.117 0.122 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 6.58e-01 0.068 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.29e-01 0.00844 0.0945 0.137 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 7.83e-01 0.0376 0.136 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0679 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.51e-01 -0.185 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 6.55e-01 0.0319 0.0713 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00853 0.119 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 8.86e-01 0.0171 0.12 0.137 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0675 0.11 0.137 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0629 0.114 0.137 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 4.09e-01 0.0961 0.116 0.137 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 8.64e-01 0.0237 0.138 0.137 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.132 0.137 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.43e-01 0.209 0.142 0.137 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 2.67e-01 -0.113 0.102 0.137 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 5.25e-01 0.0842 0.132 0.137 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 6.09e-01 -0.049 0.0959 0.137 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.40e-01 0.085 0.11 0.137 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 4.00e-01 -0.109 0.13 0.137 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.62e-01 0.00622 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0809 0.127 0.144 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0598 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 4.67e-01 0.0838 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0388 0.0941 0.144 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 3.99e-01 -0.104 0.123 0.144 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0445 0.116 0.144 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 6.36e-01 0.0665 0.14 0.144 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 6.89e-01 0.0476 0.119 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 7.19e-01 0.0482 0.134 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 7.64e-01 0.0365 0.121 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 8.19e-01 -0.021 0.0918 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 4.72e-01 0.079 0.11 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.71e-02 0.208 0.109 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0769 0.138 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 1.63e-02 0.328 0.136 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 9.30e-01 0.0112 0.127 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 9.81e-02 -0.166 0.0999 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0578 0.127 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0806 0.118 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.37e-01 0.166 0.14 0.161 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0106 0.148 0.161 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.27e-01 0.181 0.149 0.161 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.05e-01 0.26 0.159 0.161 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0716 0.141 0.161 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0296 0.147 0.161 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 4.66e-01 0.095 0.13 0.161 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0103 0.153 0.161 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 4.72e-01 0.105 0.146 0.161 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 2.53e-01 -0.156 0.136 0.14 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 1.65e-01 0.184 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0271 0.129 0.14 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 3.94e-02 -0.277 0.133 0.14 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 3.97e-01 0.105 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 9.46e-02 0.252 0.15 0.14 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.47e-01 0.0571 0.0947 0.14 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 2.56e-01 0.139 0.122 0.14 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.49e-05 0.489 0.113 0.14 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 7.98e-02 -0.221 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 9.85e-02 0.201 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 5.90e-01 0.067 0.124 0.14 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.64e-01 0.00604 0.132 0.15 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.23e-01 -0.116 0.144 0.15 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 1.31e-01 -0.209 0.138 0.15 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0678 0.13 0.15 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 6.68e-02 -0.169 0.0914 0.15 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 1.79e-01 -0.198 0.147 0.15 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 5.30e-01 0.0719 0.114 0.15 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0487 0.139 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 3.52e-01 0.113 0.121 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00307 0.14 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 3.17e-01 -0.12 0.12 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0285 0.136 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 9.61e-01 0.00463 0.0945 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 7.32e-01 0.0455 0.133 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 7.16e-01 0.0417 0.114 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 8.15e-01 0.0247 0.105 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 7.83e-02 -0.232 0.131 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 2.54e-01 0.147 0.129 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0402 0.141 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 8.67e-01 0.0165 0.0983 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 3.81e-02 -0.275 0.132 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 8.36e-01 0.0178 0.0858 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 5.57e-01 0.0674 0.114 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.99e-02 0.248 0.126 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 8.11e-01 0.0282 0.117 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 3.18e-01 -0.088 0.088 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 9.68e-01 0.00428 0.106 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 2.43e-01 0.109 0.0935 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00234 0.0982 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.119 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 4.38e-03 0.321 0.112 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.60e-02 -0.282 0.116 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 2.15e-01 0.141 0.113 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 4.22e-01 0.098 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -544211 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0674 0.0677 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 191590 sc-eQTL 4.97e-01 0.0837 0.123 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 409305 sc-eQTL 7.38e-01 0.0397 0.118 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -225283 sc-eQTL 4.55e-01 0.085 0.113 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -437822 sc-eQTL 1.22e-01 -0.182 0.117 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 245059 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.112 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -406381 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 sc-eQTL 3.49e-01 0.0827 0.0881 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 sc-eQTL 1.16e-01 0.151 0.0958 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -406159 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0112 0.139 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000151136 BTBD11 -769083 eQTL 0.00756 0.0917 0.0342 0.0 0.0 0.133
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 eQTL 0.000126 0.0806 0.0209 0.0 0.0 0.133


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 247409 1.34e-06 1.22e-06 2.43e-07 1.2e-06 3.92e-07 6.09e-07 1.47e-06 4.27e-07 1.74e-06 6.65e-07 2.04e-06 9.21e-07 2.55e-06 2.98e-07 4.48e-07 1.01e-06 9.77e-07 1.09e-06 6.79e-07 4.58e-07 7.67e-07 1.91e-06 1.1e-06 6.31e-07 2.28e-06 7.73e-07 1.06e-06 8.92e-07 1.6e-06 1.31e-06 8.11e-07 2.8e-07 2.98e-07 5.59e-07 5.69e-07 5.41e-07 7.3e-07 3.27e-07 5.15e-07 2.1e-07 3.35e-07 1.58e-06 2.46e-07 9.66e-08 3.14e-07 2.32e-07 2.6e-07 1.41e-07 2.76e-07