logo

Genes within 1Mb (chr12:106543120:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.87e-02 -0.241 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0549 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.127 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 2.61e-01 -0.198 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0994 0.0826 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 2.21e-01 0.152 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.30e-01 -0.048 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000621 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.22e-03 -0.324 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00423 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 1.29e-02 -0.247 0.0984 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.57e-01 0.0297 0.0959 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.72e-05 0.398 0.0979 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.43e-01 0.0115 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 7.23e-01 0.0332 0.0938 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 9.55e-01 0.00788 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00545 0.092 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 5.24e-01 0.0494 0.0774 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0813 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.13e-01 -0.036 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 6.24e-01 0.0795 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0592 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0443 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.15e-01 -0.144 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 4.49e-02 -0.28 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 2.85e-01 0.143 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.77e-02 -0.274 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0256 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.82e-01 0.15 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.13e-01 0.0984 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.63e-03 0.395 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 5.33e-02 0.349 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0867 0.171 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 6.42e-02 -0.222 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.46e-02 0.248 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.03e-01 0.215 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 6.03e-01 0.0845 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 6.82e-01 0.0785 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.11e-01 0.0458 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 1.56e-01 -0.254 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 7.75e-01 0.057 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.83e-01 -0.214 0.199 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 3.67e-01 -0.153 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0892 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 7.66e-01 0.0497 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.02e-01 -0.15 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 3.82e-01 0.156 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.20e-01 -0.198 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0374 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 4.96e-01 -0.124 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 1.74e-01 -0.232 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 6.78e-01 0.0725 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.85e-02 -0.353 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 9.34e-03 -0.469 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 3.42e-01 0.171 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.42e-01 -0.111 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.35e-01 0.144 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 9.56e-02 -0.262 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.90e-01 0.0986 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 8.06e-01 0.033 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0696 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 7.95e-01 0.0451 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 6.23e-02 0.324 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 6.53e-01 0.0644 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.63e-02 -0.352 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 9.89e-01 0.00208 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0245 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 5.40e-02 0.298 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 7.99e-01 0.0221 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.89e-02 -0.27 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0173 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 8.64e-03 -0.294 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0832 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.21e-05 0.483 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 1.43e-01 -0.218 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.62e-01 -0.132 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 1.57e-01 -0.155 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0605 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 6.86e-02 -0.22 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.98e-02 0.279 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.43e-01 0.0129 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.76e-01 0.162 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.67e-01 -0.107 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 7.98e-01 0.0438 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 7.04e-01 0.0695 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 4.60e-02 0.254 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0656 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 9.84e-01 0.00332 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0284 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.62e-01 0.168 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.42e-01 0.0882 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.28e-01 0.0162 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.42e-01 0.15 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0328 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 8.40e-01 -0.028 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 5.11e-01 0.0814 0.124 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 5.76e-02 0.289 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.14e-01 0.183 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.75e-02 -0.33 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0396 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0196 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.98e-01 0.0592 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 4.31e-01 0.13 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 6.45e-01 -0.075 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.183 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 6.77e-01 0.0734 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.93e-01 -0.145 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 9.75e-01 0.00583 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.87e-01 -0.147 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.177 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.14e-01 -0.216 0.136 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 2.39e-01 -0.203 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.12e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 7.52e-01 -0.049 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 3.24e-01 -0.179 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 3.38e-01 0.151 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 6.62e-01 0.0592 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.75e-01 -0.152 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.95e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 1.96e-01 -0.224 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 1.39e-01 0.256 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 3.94e-01 0.152 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.04e-01 0.0207 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 7.11e-01 0.057 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 1.78e-01 -0.211 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 7.20e-01 0.0566 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 3.08e-01 0.166 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 2.53e-01 0.149 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 3.75e-03 0.397 0.135 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 2.53e-02 0.405 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 5.46e-01 0.0894 0.148 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0253 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0598 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 5.51e-01 0.0961 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 1.75e-01 -0.25 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 1.26e-01 0.242 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.55e-01 0.257 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.49e-02 -0.303 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 6.92e-01 0.0646 0.163 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.73e-02 -0.285 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.38e-01 -0.105 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 5.64e-01 0.0929 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0716 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.30e-01 0.217 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 2.41e-01 0.209 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 5.40e-01 0.0744 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0661 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 7.44e-01 -0.03 0.0917 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 4.98e-02 -0.299 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0571 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 7.63e-02 0.259 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0183 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.97e-02 -0.321 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.29e-01 0.171 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 1.55e-01 0.233 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0359 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0526 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 7.86e-01 0.0494 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.09e-01 0.0353 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 1.12e-01 -0.261 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 2.00e-01 0.191 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0798 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 9.07e-02 -0.287 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.48e-01 0.0944 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 7.06e-01 -0.047 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0662 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.08e-01 0.287 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.24e-01 0.0419 0.188 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0434 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.04e-01 -0.184 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 2.99e-01 -0.194 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.21e-01 0.165 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 6.74e-01 0.0821 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 3.83e-01 0.162 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 3.78e-01 -0.142 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.96e-01 0.000862 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 9.72e-01 0.00536 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0218 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.78e-02 -0.28 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.97e-01 0.0809 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 6.04e-01 0.077 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0816 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0921 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.99e-01 -0.203 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.03e-01 -0.122 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 1.00e+00 -5.4e-05 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0851 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 2.36e-01 0.205 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 3.41e-02 -0.315 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 1.44e-01 -0.202 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 8.49e-01 -0.033 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00656 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.46e-02 -0.319 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.11e-01 0.115 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 5.51e-02 -0.3 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 8.64e-02 -0.208 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0686 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 5.88e-01 0.0763 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0803 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -550429 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000138 0.0884 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 185372 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 403087 sc-eQTL 9.07e-01 0.018 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -231501 sc-eQTL 6.18e-02 -0.275 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -444040 sc-eQTL 8.27e-01 0.0336 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 238841 sc-eQTL 5.88e-01 0.0796 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -412599 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -775301 sc-eQTL 3.72e-01 0.103 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 sc-eQTL 1.72e-03 0.389 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -412377 sc-eQTL 6.16e-02 0.338 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 185372 eQTL 3.52e-04 -0.214 0.0596 0.0 0.0 0.0486
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 eQTL 2.49e-06 0.152 0.0321 0.0 0.0 0.0486

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 241191 1.28e-06 1.31e-06 2.54e-07 1.28e-06 3.82e-07 6.24e-07 1.41e-06 4.44e-07 1.68e-06 6.36e-07 2.04e-06 8.59e-07 2.6e-06 3.31e-07 4.96e-07 9.51e-07 9.64e-07 9.53e-07 6.6e-07 4.38e-07 7.69e-07 1.89e-06 1.1e-06 5.67e-07 2.45e-06 7.64e-07 9.72e-07 8.31e-07 1.6e-06 1.31e-06 8.18e-07 3.07e-07 3.32e-07 5.61e-07 6.64e-07 4.82e-07 7.71e-07 3.38e-07 5.05e-07 2.04e-07 3.57e-07 1.8e-06 1.39e-07 1.99e-07 3.14e-07 2.31e-07 2.47e-07 1.16e-07 2.03e-07
ENSG00000260329 \N -412377 8.63e-07 6.07e-07 1.05e-07 4.32e-07 1.12e-07 2.77e-07 6.06e-07 1.73e-07 4.61e-07 2.62e-07 8.15e-07 3.68e-07 9.23e-07 1.52e-07 2.35e-07 2.23e-07 3.35e-07 3.95e-07 2.56e-07 1.8e-07 2.52e-07 3.8e-07 3.87e-07 2.17e-07 9.71e-07 2.54e-07 2.71e-07 2.74e-07 4.22e-07 6.03e-07 3.49e-07 6.84e-08 5.3e-08 1.71e-07 3.82e-07 1.18e-07 1.23e-07 1.14e-07 7.72e-08 1.63e-08 1.15e-07 6.11e-07 2.84e-08 1.95e-08 1.6e-07 1.42e-08 1.21e-07 2.31e-08 5.96e-08