logo

Genes within 1Mb (chr12:106541304:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.87e-02 -0.241 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0549 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.127 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 2.61e-01 -0.198 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0994 0.0826 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 2.21e-01 0.152 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.30e-01 -0.048 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000621 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.22e-03 -0.324 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00423 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 1.29e-02 -0.247 0.0984 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.57e-01 0.0297 0.0959 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.72e-05 0.398 0.0979 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.43e-01 0.0115 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 7.23e-01 0.0332 0.0938 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 9.55e-01 0.00788 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00545 0.092 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 5.24e-01 0.0494 0.0774 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0813 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 4.22e-01 -0.141 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.13e-01 -0.036 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 6.24e-01 0.0795 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0592 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0443 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.15e-01 -0.144 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 4.49e-02 -0.28 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 2.85e-01 0.143 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.77e-02 -0.274 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0256 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.82e-01 0.15 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.13e-01 0.0984 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.63e-03 0.395 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 5.33e-02 0.349 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0867 0.171 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 6.42e-02 -0.222 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.46e-02 0.248 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 4.65e-01 -0.11 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.03e-01 0.215 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 6.03e-01 0.0845 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 6.82e-01 0.0785 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.11e-01 0.0458 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 1.56e-01 -0.254 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 7.75e-01 0.057 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.83e-01 -0.214 0.199 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 3.67e-01 -0.153 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0892 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 7.66e-01 0.0497 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.02e-01 -0.15 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 3.82e-01 0.156 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.20e-01 -0.198 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0374 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 4.96e-01 -0.124 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 1.74e-01 -0.232 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 6.78e-01 0.0725 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.85e-02 -0.353 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 9.34e-03 -0.469 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 3.42e-01 0.171 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.42e-01 -0.111 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.35e-01 0.144 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 9.56e-02 -0.262 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.90e-01 0.0986 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 8.06e-01 0.033 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0696 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 7.95e-01 0.0451 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 6.23e-02 0.324 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 6.53e-01 0.0644 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.63e-02 -0.352 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 9.89e-01 0.00208 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0245 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 5.40e-02 0.298 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 7.99e-01 0.0221 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.89e-02 -0.27 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0173 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 8.64e-03 -0.294 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0832 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.21e-05 0.483 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 1.43e-01 -0.218 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.62e-01 -0.132 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 1.57e-01 -0.155 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0605 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 6.86e-02 -0.22 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.98e-02 0.279 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.43e-01 0.0129 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.76e-01 0.162 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.67e-01 -0.107 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 7.98e-01 0.0438 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 7.04e-01 0.0695 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 4.60e-02 0.254 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0656 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 9.84e-01 0.00332 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0284 0.175 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.62e-01 0.168 0.149 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.42e-01 0.0882 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.28e-01 0.0162 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.42e-01 0.15 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0328 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 8.40e-01 -0.028 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 5.11e-01 0.0814 0.124 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 5.76e-02 0.289 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.14e-01 0.183 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.75e-02 -0.33 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0396 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0196 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.98e-01 0.0592 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 4.31e-01 0.13 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 6.45e-01 -0.075 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.183 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 6.77e-01 0.0734 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.93e-01 -0.145 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 9.75e-01 0.00583 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.87e-01 -0.147 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.177 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.14e-01 -0.216 0.136 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 2.39e-01 -0.203 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.12e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 7.52e-01 -0.049 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 3.24e-01 -0.179 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 3.38e-01 0.151 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 6.62e-01 0.0592 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.75e-01 -0.152 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.95e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 1.96e-01 -0.224 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 1.39e-01 0.256 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 5.02e-01 -0.103 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 3.94e-01 0.152 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.04e-01 0.0207 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 7.11e-01 0.057 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 1.78e-01 -0.211 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 7.20e-01 0.0566 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 3.08e-01 0.166 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 2.53e-01 0.149 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 3.75e-03 0.397 0.135 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 2.53e-02 0.405 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 5.46e-01 0.0894 0.148 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0319 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0253 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0598 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 5.51e-01 0.0961 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 1.75e-01 -0.25 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 1.26e-01 0.242 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.55e-01 0.257 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 2.80e-01 -0.183 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.49e-02 -0.303 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 6.92e-01 0.0646 0.163 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.73e-02 -0.285 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.38e-01 -0.105 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 5.64e-01 0.0929 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0716 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.30e-01 0.217 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 2.41e-01 0.209 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 5.40e-01 0.0744 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0661 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 7.44e-01 -0.03 0.0917 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 4.98e-02 -0.299 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0571 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 7.63e-02 0.259 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0183 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.97e-02 -0.321 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.29e-01 0.171 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 1.55e-01 0.233 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0359 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0526 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 7.86e-01 0.0494 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.09e-01 0.0353 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 1.12e-01 -0.261 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 2.00e-01 0.191 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0798 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 9.07e-02 -0.287 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.48e-01 0.0944 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 7.06e-01 -0.047 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0662 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.08e-01 0.287 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.24e-01 0.0419 0.188 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0434 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.04e-01 -0.184 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 2.99e-01 -0.194 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.21e-01 0.165 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 6.74e-01 0.0821 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 3.83e-01 0.162 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 3.78e-01 -0.142 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.96e-01 0.000862 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 9.72e-01 0.00536 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0218 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.78e-02 -0.28 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.97e-01 0.0809 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 6.04e-01 0.077 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0816 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0921 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.99e-01 -0.203 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.03e-01 -0.122 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 1.00e+00 -5.4e-05 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0851 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 2.36e-01 0.205 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 3.41e-02 -0.315 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 1.44e-01 -0.202 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 8.49e-01 -0.033 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00656 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.46e-02 -0.319 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.11e-01 0.115 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 5.51e-02 -0.3 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 8.64e-02 -0.208 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0686 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 5.88e-01 0.0763 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0803 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -552245 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000138 0.0884 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 183556 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 401271 sc-eQTL 9.07e-01 0.018 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -233317 sc-eQTL 6.18e-02 -0.275 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -445856 sc-eQTL 8.27e-01 0.0336 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 237025 sc-eQTL 5.88e-01 0.0796 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -414415 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -777117 sc-eQTL 3.72e-01 0.103 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 sc-eQTL 1.72e-03 0.389 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -414193 sc-eQTL 6.16e-02 0.338 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 183556 eQTL 3.52e-04 -0.214 0.0596 0.0 0.0 0.0486
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 eQTL 2.49e-06 0.152 0.0321 0.0 0.0 0.0486

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 239375 1.27e-06 1.27e-06 2.53e-07 1.27e-06 3.73e-07 6.27e-07 1.49e-06 4.18e-07 1.7e-06 6.69e-07 2.08e-06 9.81e-07 2.55e-06 3.24e-07 4.96e-07 9.92e-07 9.15e-07 9.05e-07 8.04e-07 4.5e-07 8.18e-07 1.91e-06 1.1e-06 5.72e-07 2.39e-06 6.17e-07 1.06e-06 9.36e-07 1.63e-06 1.3e-06 8.1e-07 2.62e-07 2.89e-07 6.61e-07 5.91e-07 4.57e-07 7.49e-07 3.58e-07 4.78e-07 3.1e-07 2.56e-07 1.71e-06 2.91e-07 6.48e-08 3.22e-07 1.73e-07 2.59e-07 1.41e-07 2.04e-07
ENSG00000260329 \N -414193 7.87e-07 4.93e-07 1.11e-07 3.96e-07 1.07e-07 2.08e-07 5.54e-07 1.31e-07 3.94e-07 2.34e-07 5.73e-07 3.62e-07 6.77e-07 1.17e-07 2.18e-07 2.05e-07 2.11e-07 3.56e-07 1.7e-07 1.51e-07 1.91e-07 3.49e-07 3.19e-07 1.61e-07 7.01e-07 2.32e-07 2.71e-07 2.13e-07 3e-07 5.82e-07 2.6e-07 6.13e-08 5.77e-08 1.19e-07 3.3e-07 7.57e-08 1.03e-07 1.11e-07 4.55e-08 5.64e-08 8.61e-08 4.55e-07 3.55e-08 2.1e-08 1.1e-07 1.88e-08 9.95e-08 1.28e-08 5.65e-08