logo

Genes within 1Mb (chr12:106523740:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.20e-01 0.174 0.111 0.058 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.77e-01 0.144 0.162 0.058 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.058 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 1.83e-01 -0.237 0.178 0.058 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.34e-01 0.0176 0.0839 0.058 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 1.59e-01 -0.177 0.125 0.058 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0164 0.101 0.058 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.18e-01 0.0743 0.0743 0.058 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 6.95e-01 0.0465 0.119 0.058 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 8.08e-01 0.0284 0.117 0.058 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.43e-01 0.0874 0.143 0.058 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.04e-01 0.0122 0.101 0.058 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.44e-02 -0.202 0.113 0.058 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0973 0.058 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 1.01e-02 -0.263 0.101 0.058 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00465 0.164 0.058 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.30e-01 0.0929 0.0951 0.058 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 1.76e-01 0.191 0.141 0.058 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 8.61e-03 0.371 0.14 0.058 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 3.73e-01 -0.131 0.147 0.058 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0236 0.0934 0.058 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.20e-01 -0.149 0.121 0.058 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 2.47e-01 -0.091 0.0784 0.058 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.0825 0.058 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 1.28e-01 0.27 0.177 0.058 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0843 0.164 0.054 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 2.44e-01 0.204 0.174 0.054 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.37e-02 -0.408 0.179 0.054 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 9.00e-01 0.0211 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 2.94e-01 0.126 0.12 0.054 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00379 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0519 0.159 0.054 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.37e-01 -0.112 0.181 0.054 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.04e-01 0.149 0.117 0.058 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 2.53e-01 -0.161 0.14 0.058 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.00e-01 -0.173 0.134 0.058 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.65e-02 0.167 0.1 0.058 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 1.28e-02 0.32 0.128 0.058 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0271 0.117 0.058 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.67e-01 0.0971 0.0872 0.058 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.25e-01 -0.154 0.156 0.058 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 4.70e-01 -0.112 0.154 0.058 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.86e-01 -0.127 0.146 0.058 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 9.31e-01 -0.013 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.52e-01 0.0084 0.14 0.058 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.52e-02 0.269 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0516 0.12 0.058 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0856 0.128 0.058 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 6.41e-01 0.085 0.182 0.058 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.07e-02 0.173 0.0919 0.058 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.48e-01 -0.132 0.173 0.058 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.55e-01 0.173 0.121 0.058 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 3.15e-01 0.146 0.145 0.058 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 7.10e-01 0.0405 0.109 0.058 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 6.60e-02 -0.279 0.151 0.058 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 9.44e-01 0.00772 0.109 0.058 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0941 0.133 0.058 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 2.94e-01 0.173 0.164 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0155 0.181 0.056 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.89e-01 0.0477 0.178 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 9.08e-01 -0.021 0.181 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0598 0.141 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 4.23e-01 0.136 0.169 0.056 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.18e-01 0.0685 0.189 0.056 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.00e-01 0.0991 0.189 0.056 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.67e-01 -0.203 0.182 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.35e-01 0.0683 0.202 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.74e-01 0.196 0.179 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0886 0.192 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 1.35e-01 0.223 0.149 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 5.94e-01 -0.102 0.191 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 1.94e-01 0.225 0.173 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0351 0.19 0.054 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 8.94e-02 0.34 0.199 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.70e-01 0.169 0.188 0.054 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0914 0.17 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0388 0.169 0.054 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 4.05e-01 -0.16 0.192 0.054 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.98e-01 -0.114 0.169 0.054 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.37e-01 0.224 0.15 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0956 0.169 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 5.61e-01 0.0963 0.165 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 2.11e-01 -0.227 0.181 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0352 0.128 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0691 0.179 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.00e-01 0.0158 0.125 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.73e-01 0.199 0.181 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.05e-01 0.153 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.69e-01 0.223 0.162 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.89e-01 0.074 0.185 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 2.23e-01 0.193 0.158 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0639 0.184 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.20e-01 -0.109 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.43e-01 0.205 0.139 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.38e-01 -0.057 0.17 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 5.74e-01 0.101 0.179 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 9.90e-01 0.00217 0.171 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 3.11e-01 -0.142 0.14 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.88e-01 -0.194 0.182 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0982 0.143 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.177 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 5.22e-01 -0.098 0.153 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 9.93e-01 0.000812 0.0871 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.50e-01 0.0422 0.132 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 6.87e-01 0.0504 0.125 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 8.50e-01 0.0316 0.166 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 5.89e-01 0.0614 0.114 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.55e-01 -0.139 0.121 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.69e-01 0.0181 0.109 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.16e-02 -0.212 0.113 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 8.25e-01 0.0381 0.172 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 5.44e-01 0.0662 0.109 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.04e-01 -0.057 0.15 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0965 0.157 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 9.29e-01 0.0162 0.18 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0229 0.11 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 9.35e-02 -0.251 0.149 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 1.73e-01 0.166 0.121 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.17e-02 -0.226 0.12 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0181 0.182 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.64e-01 0.167 0.149 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0609 0.187 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 9.91e-02 0.282 0.17 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 8.32e-01 0.0389 0.183 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.13e-01 0.016 0.147 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0431 0.169 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.72e-01 -0.114 0.128 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.25e-02 -0.273 0.146 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 5.05e-01 -0.118 0.177 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 8.14e-01 0.0264 0.112 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 2.47e-02 0.376 0.166 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 4.14e-01 0.129 0.158 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0718 0.175 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00537 0.15 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 6.41e-03 -0.391 0.142 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 2.75e-01 -0.17 0.155 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.13e-01 -0.132 0.161 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 8.40e-01 0.0361 0.178 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.09e-02 0.298 0.128 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 8.29e-01 -0.034 0.157 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.34e-01 0.251 0.167 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 3.15e-01 -0.173 0.172 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0932 0.14 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0348 0.15 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0563 0.117 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0491 0.125 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 1.39e-01 0.261 0.176 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0174 0.152 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.66e-01 -0.132 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.10e-01 0.176 0.173 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 8.46e-01 0.034 0.174 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 1.84e-01 -0.209 0.157 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.84e-02 -0.316 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.04e-02 -0.327 0.15 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.60e-01 0.112 0.152 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 3.17e-01 0.165 0.164 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.97e-01 0.0628 0.161 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.92e-01 0.126 0.183 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.95e-01 0.226 0.174 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.74e-01 0.103 0.183 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0742 0.168 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 8.23e-01 0.0412 0.184 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.93e-01 -0.144 0.168 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.47e-02 -0.292 0.174 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 2.58e-01 0.183 0.161 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.16e-03 0.404 0.135 0.056 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 8.11e-01 0.0416 0.174 0.056 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 4.70e-02 0.306 0.153 0.056 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.10e-01 0.112 0.169 0.056 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00873 0.156 0.056 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 1.68e-01 -0.252 0.182 0.056 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.70e-01 0.0228 0.139 0.056 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 3.93e-01 -0.136 0.159 0.056 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 1.50e-01 0.246 0.17 0.056 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.02e-01 0.145 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 2.74e-01 -0.195 0.177 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0243 0.155 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 5.10e-01 0.127 0.193 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 4.24e-01 0.145 0.18 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 1.51e-01 0.209 0.145 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 9.87e-02 -0.297 0.179 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 1.70e-01 0.218 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.12e-02 -0.313 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 1.97e-01 -0.229 0.177 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.63e-01 0.147 0.105 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00392 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 4.17e-01 -0.126 0.155 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.17e-01 -0.248 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0573 0.158 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.09e-01 0.0385 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 4.16e-02 0.333 0.163 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 9.14e-01 0.0143 0.132 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.30e-01 0.0122 0.139 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0481 0.183 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.15e-01 -0.081 0.161 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 6.03e-01 0.101 0.194 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 3.62e-01 -0.173 0.189 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.84e-01 0.214 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00682 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000679 0.175 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 9.74e-01 0.00666 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.43e-02 -0.296 0.171 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0884 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 3.68e-01 -0.166 0.184 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.47e-01 0.183 0.126 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.67e-01 -0.132 0.181 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 2.92e-01 -0.177 0.167 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.67e-01 -0.155 0.172 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 8.07e-01 0.043 0.176 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0867 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.33e-01 0.215 0.18 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0304 0.132 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 2.54e-01 0.169 0.148 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 4.61e-01 0.136 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.98e-01 0.159 0.188 0.067 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.93e-01 -0.173 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00999 0.181 0.067 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0288 0.17 0.067 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.24e-01 0.0253 0.114 0.067 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.73e-01 -0.159 0.145 0.067 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.75e-01 -0.107 0.19 0.067 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0459 0.122 0.059 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0927 0.176 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 8.67e-01 0.0278 0.166 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 3.46e-01 0.157 0.166 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0175 0.0921 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.60e-01 0.0471 0.154 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 1.97e-01 -0.199 0.154 0.059 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 2.37e-01 0.168 0.142 0.059 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 9.98e-01 0.000325 0.147 0.059 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0793 0.154 0.058 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.76e-01 0.161 0.182 0.058 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 4.15e-03 -0.494 0.17 0.058 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.60e-01 0.0829 0.188 0.058 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 2.99e-01 -0.14 0.134 0.058 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 4.21e-01 -0.14 0.174 0.058 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 7.37e-01 0.0425 0.126 0.058 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0952 0.145 0.058 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 1.12e-01 -0.271 0.17 0.058 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0479 0.19 0.051 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.36e-01 0.176 0.183 0.051 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 9.82e-01 0.00426 0.193 0.051 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.08e-01 -0.11 0.166 0.051 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 2.28e-01 0.164 0.135 0.051 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 8.34e-02 0.308 0.177 0.051 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.07e-01 -0.171 0.167 0.051 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 4.26e-01 0.161 0.202 0.051 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 8.63e-02 0.259 0.15 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 9.36e-01 0.0137 0.171 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 1.32e-01 -0.233 0.154 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 9.52e-02 0.195 0.116 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.05e-02 0.301 0.138 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0166 0.14 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0596 0.175 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.51e-02 -0.366 0.172 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0212 0.161 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 2.86e-01 0.136 0.127 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 7.54e-02 0.284 0.159 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 5.95e-01 0.0795 0.149 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 4.79e-01 -0.147 0.207 0.061 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 1.59e-01 -0.306 0.216 0.061 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 5.38e-01 0.136 0.221 0.061 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.12e-01 0.156 0.237 0.061 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 4.04e-01 -0.173 0.207 0.061 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 8.21e-01 -0.049 0.216 0.061 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 1.83e-01 -0.255 0.191 0.061 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0562 0.225 0.061 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 2.64e-01 0.24 0.215 0.061 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.87e-02 -0.399 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 4.50e-01 -0.132 0.174 0.058 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 8.31e-02 0.313 0.18 0.058 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.20e-02 0.29 0.166 0.058 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 7.87e-01 -0.055 0.203 0.058 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 7.56e-01 0.0392 0.126 0.059 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.24e-01 -0.13 0.162 0.059 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 7.01e-01 0.0606 0.157 0.059 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 3.27e-01 0.165 0.168 0.059 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 5.22e-01 -0.104 0.162 0.059 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00252 0.165 0.059 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0885 0.179 0.062 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 2.46e-01 0.227 0.195 0.062 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.84e-02 -0.389 0.186 0.062 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 5.85e-01 0.0967 0.177 0.062 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 4.25e-01 0.1 0.125 0.062 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 4.95e-01 -0.137 0.2 0.062 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 5.50e-01 0.0932 0.156 0.062 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.34e-01 -0.09 0.189 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.41e-01 -0.188 0.16 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.42e-01 0.176 0.185 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 4.59e-01 0.118 0.159 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0914 0.18 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 7.44e-01 0.0409 0.125 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 2.65e-01 -0.196 0.175 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00688 0.151 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 1.61e-01 0.193 0.137 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 8.56e-01 0.0315 0.173 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.06e-01 0.214 0.168 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 4.24e-01 -0.148 0.184 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 7.02e-01 0.0493 0.128 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0805 0.174 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 8.66e-01 0.0189 0.112 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 2.42e-01 0.17 0.145 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 3.05e-01 -0.165 0.161 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 3.31e-01 -0.145 0.149 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.111 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 3.59e-02 0.282 0.133 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00485 0.119 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00297 0.13 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 4.88e-01 -0.109 0.157 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0618 0.15 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 5.78e-01 0.0865 0.155 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 8.38e-01 0.0309 0.15 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0719 0.161 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -569809 sc-eQTL 3.18e-01 0.0882 0.0881 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 165992 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0864 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 383707 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0938 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -250881 sc-eQTL 2.43e-01 -0.172 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -463420 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0496 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 219461 sc-eQTL 4.39e-01 -0.114 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 sc-eQTL 7.18e-02 0.279 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -794681 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0827 0.115 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 sc-eQTL 8.30e-01 0.027 0.125 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 sc-eQTL 2.25e-01 0.22 0.18 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -569809 eQTL 0.15 -0.0453 0.0315 0.00106 0.0 0.0569
ENSG00000151135 TMEM263 -431979 eQTL 0.0231 -0.057 0.025 0.0 0.0 0.0569
ENSG00000166046 TCP11L2 221811 eQTL 0.00764 -0.0819 0.0306 0.0 0.0 0.0569
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 eQTL 0.00298 -0.199 0.0668 0.0 0.0 0.0569

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000260329 AC007541.1 -431757 1.31e-06 9.25e-07 2.86e-07 1.27e-06 1.19e-07 3.58e-07 1.16e-06 2.68e-07 1.25e-06 5.9e-07 1.36e-06 5.62e-07 2.38e-06 3.07e-07 5.32e-07 5.7e-07 9.2e-07 5.69e-07 7.4e-07 6.72e-07 4.43e-07 9.14e-07 7.95e-07 6.51e-07 2.11e-06 3.47e-07 6.38e-07 7.2e-07 1.05e-06 1.22e-06 6.78e-07 1.92e-07 1.36e-07 5.71e-07 5.3e-07 4.5e-07 6.25e-07 1.68e-07 5.07e-07 2.03e-07 2.72e-07 9.59e-07 1.28e-07 1.66e-07 1.74e-07 1.71e-07 2.24e-07 2.3e-07 1.83e-07