logo

Genes within 1Mb (chr12:106522581:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.35e-02 0.199 0.114 0.062 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.77e-02 -0.284 0.166 0.062 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0325 0.133 0.062 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 1.16e-01 0.288 0.182 0.062 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00341 0.0863 0.062 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 1.62e-01 -0.18 0.128 0.062 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 5.48e-02 -0.198 0.103 0.062 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.45e-01 0.0354 0.0767 0.062 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.73e-01 -0.166 0.122 0.062 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.84e-01 0.033 0.12 0.062 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.79e-02 0.324 0.146 0.062 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.85e-02 -0.228 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.40e-01 0.00882 0.117 0.062 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 3.64e-02 -0.209 0.0992 0.062 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.86e-01 0.043 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 5.11e-01 -0.111 0.169 0.062 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 4.00e-01 0.0814 0.0966 0.062 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 2.87e-01 -0.153 0.143 0.062 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 3.80e-01 0.127 0.144 0.062 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 3.53e-01 0.139 0.149 0.062 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.99e-01 -0.122 0.0945 0.062 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0231 0.124 0.062 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0406 0.0798 0.062 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.41e-02 -0.141 0.0836 0.062 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 2.36e-01 -0.214 0.18 0.062 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.35e-01 -0.033 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.95e-01 0.0223 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0871 0.174 0.063 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 8.17e-01 0.0375 0.162 0.063 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 7.14e-01 0.0425 0.116 0.063 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 2.21e-01 -0.198 0.161 0.063 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0684 0.153 0.063 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00446 0.174 0.063 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0117 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.32e-01 0.218 0.144 0.062 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.38e-01 0.0656 0.139 0.062 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.95e-02 -0.242 0.103 0.062 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 2.39e-01 -0.157 0.133 0.062 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 3.48e-01 0.113 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.78e-01 0.0135 0.0879 0.062 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 9.95e-01 0.000906 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 3.33e-01 0.15 0.155 0.062 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0285 0.147 0.062 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 4.08e-01 -0.125 0.151 0.062 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.49e-01 -0.163 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 4.59e-01 0.113 0.152 0.062 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.45e-01 0.0393 0.121 0.062 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.03e-01 0.032 0.128 0.062 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 2.69e-01 -0.203 0.183 0.062 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 4.06e-01 0.0787 0.0944 0.062 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 2.95e-01 -0.186 0.177 0.062 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 3.79e-01 -0.109 0.124 0.062 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.60e-01 0.167 0.148 0.062 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0281 0.111 0.062 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 1.40e-01 0.229 0.154 0.062 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 1.20e-02 0.279 0.11 0.062 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.00e-01 0.0346 0.136 0.062 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 3.10e-01 0.17 0.167 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0478 0.202 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.23e-01 0.306 0.197 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 5.85e-01 0.11 0.202 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 4.42e-02 0.314 0.155 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.03e-01 0.241 0.188 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 5.17e-01 0.137 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 1.77e-01 0.284 0.209 0.051 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 2.75e-01 0.184 0.168 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 3.66e-01 -0.169 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.27e-01 0.0577 0.165 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 1.36e-01 -0.264 0.177 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 9.21e-01 0.0137 0.138 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 3.91e-01 -0.152 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.25e-01 0.0355 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.56e-02 0.301 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.25e-01 0.0411 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0778 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 9.10e-02 0.265 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 7.26e-01 0.055 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.35e-01 0.0144 0.178 0.062 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 1.60e-02 -0.373 0.154 0.062 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.55e-02 0.285 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0554 0.174 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.83e-01 0.0252 0.17 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.22e-01 0.228 0.186 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0251 0.131 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0908 0.185 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 2.93e-02 -0.28 0.128 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0673 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.55e-01 -0.262 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.05e-01 0.0404 0.164 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 4.78e-01 0.132 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0683 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.10e-03 -0.481 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0307 0.136 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0644 0.14 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0934 0.17 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 2.70e-01 0.197 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0277 0.171 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.54e-02 -0.311 0.138 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 3.39e-01 0.173 0.181 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 1.54e-01 -0.202 0.142 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 7.42e-01 0.0583 0.177 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 8.04e-01 0.0377 0.152 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 3.51e-01 0.084 0.09 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0594 0.137 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0908 0.129 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.18e-01 0.212 0.172 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0794 0.118 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 8.39e-01 0.0257 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 2.55e-01 0.134 0.117 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 8.53e-01 -0.033 0.178 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.29e-01 0.00992 0.111 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 9.50e-01 0.00951 0.153 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.24e-01 0.0566 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.75e-02 0.404 0.182 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 8.34e-02 -0.194 0.112 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 6.91e-01 0.061 0.153 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 4.60e-02 -0.247 0.123 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.28e-01 0.0601 0.124 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 9.97e-02 -0.305 0.184 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0665 0.15 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.43e-02 -0.458 0.185 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.73e-01 0.0497 0.172 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 5.42e-01 -0.112 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.54e-01 -0.21 0.147 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0164 0.169 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.85e-01 0.0352 0.129 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0653 0.148 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 3.63e-01 0.162 0.177 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0449 0.113 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0274 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0571 0.16 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 8.71e-01 0.0286 0.177 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0756 0.151 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 2.98e-01 0.152 0.145 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 1.27e-01 0.239 0.156 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.12e-01 0.0824 0.162 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 1.43e-01 -0.263 0.179 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 5.27e-01 0.0831 0.131 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.04e-01 -0.133 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.83e-02 0.298 0.168 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 9.63e-01 0.008 0.174 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.17e-01 -0.175 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0184 0.151 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0373 0.118 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.57e-02 -0.233 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00107 0.179 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 7.12e-01 0.0562 0.152 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.59e-01 0.134 0.18 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.25e-02 -0.311 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 8.91e-01 -0.024 0.174 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 4.58e-01 0.117 0.157 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0539 0.18 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 8.74e-01 -0.024 0.152 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.62e-02 -0.252 0.151 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 8.13e-02 -0.286 0.163 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0158 0.163 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.07e-01 -0.153 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0828 0.176 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.47e-01 0.214 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.97e-01 -0.177 0.169 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 2.50e-01 0.213 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 5.75e-01 -0.099 0.176 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 4.32e-02 -0.328 0.161 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.90e-01 0.00176 0.138 0.063 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 9.04e-01 0.0211 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0949 0.155 0.063 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 1.09e-01 0.27 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.20e-01 -0.192 0.156 0.063 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 4.88e-02 0.359 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 5.59e-02 0.266 0.138 0.063 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.03e-01 0.0398 0.159 0.063 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 4.31e-01 0.135 0.171 0.063 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0272 0.135 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0418 0.171 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0674 0.149 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 2.02e-01 -0.236 0.184 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 4.65e-01 -0.127 0.173 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.15e-01 -0.22 0.139 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 2.09e-01 0.217 0.172 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 6.95e-01 0.06 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 5.88e-01 0.0965 0.178 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 2.36e-01 -0.202 0.17 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 2.45e-01 -0.123 0.106 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.25e-01 0.127 0.159 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 4.19e-01 0.126 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 3.34e-01 0.154 0.159 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 1.15e-01 -0.249 0.157 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 5.28e-01 -0.101 0.16 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 5.88e-01 0.0895 0.165 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.49e-01 0.0424 0.132 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.14 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 8.60e-01 0.0325 0.184 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 4.06e-01 0.128 0.154 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 5.65e-01 -0.108 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 1.00e+00 8.37e-05 0.182 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 4.46e-01 0.146 0.191 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.89e-01 0.205 0.193 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 9.05e-01 0.0201 0.168 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 3.39e-01 0.184 0.192 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 5.75e-01 0.0925 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.89e-01 0.00259 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0633 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.13e-01 0.0623 0.123 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 6.20e-01 0.0877 0.176 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 6.54e-01 0.0732 0.163 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00902 0.167 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 4.34e-01 0.134 0.171 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.37e-01 -0.24 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 6.33e-01 0.0839 0.175 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 1.76e-01 0.174 0.128 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.91e-01 0.0574 0.144 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 1.80e-01 -0.24 0.178 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.90e-01 0.0859 0.215 0.052 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 6.17e-01 0.116 0.231 0.052 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.86e-01 0.0563 0.207 0.052 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 9.34e-01 0.0161 0.195 0.052 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 4.26e-01 -0.104 0.13 0.052 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 3.60e-01 -0.152 0.166 0.052 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.29e-01 0.047 0.217 0.052 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 1.77e-01 -0.171 0.126 0.063 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 5.80e-01 -0.101 0.183 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 4.88e-01 -0.119 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 3.38e-01 -0.165 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.32e-01 0.144 0.095 0.063 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 4.36e-01 -0.124 0.159 0.063 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 2.71e-01 0.176 0.16 0.063 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 4.71e-01 -0.106 0.147 0.063 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 3.37e-01 0.146 0.152 0.063 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0598 0.153 0.062 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 3.27e-01 -0.178 0.182 0.062 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.28e-01 0.0377 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.58e-01 0.213 0.188 0.062 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 9.28e-02 -0.226 0.134 0.062 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0988 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 3.63e-02 -0.264 0.125 0.062 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.54e-01 0.0267 0.145 0.062 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 4.41e-02 -0.343 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 3.47e-01 0.166 0.177 0.066 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0513 0.17 0.066 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 7.50e-01 0.0575 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 5.86e-01 0.0845 0.155 0.066 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0907 0.126 0.066 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 5.16e-01 -0.108 0.166 0.066 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 3.01e-01 -0.161 0.156 0.066 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.46e-01 0.0128 0.189 0.066 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0742 0.152 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.03e-01 0.0431 0.172 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 3.90e-01 -0.134 0.156 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.40e-01 -0.139 0.118 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0506 0.141 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 1.89e-01 0.185 0.14 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 6.68e-02 0.323 0.175 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 3.19e-01 0.163 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 4.96e-04 -0.444 0.126 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 4.96e-01 -0.111 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0946 0.151 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 7.25e-02 0.322 0.178 0.076 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 8.99e-01 0.024 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00829 0.192 0.076 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 2.65e-01 0.229 0.205 0.076 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 4.26e-01 -0.143 0.18 0.076 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0368 0.188 0.076 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 2.83e-01 0.179 0.166 0.076 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.35e-01 0.0932 0.196 0.076 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 3.29e-01 0.183 0.186 0.076 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.22e-01 0.0397 0.176 0.064 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.44e-01 0.131 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0684 0.167 0.064 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 1.14e-01 -0.275 0.173 0.064 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 7.95e-01 0.0418 0.16 0.064 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.86e-02 0.322 0.194 0.064 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00811 0.125 0.066 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 5.37e-01 0.0992 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 1.63e-01 0.217 0.155 0.066 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 5.56e-02 -0.317 0.165 0.066 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 6.60e-01 0.0705 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0081 0.163 0.066 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 7.88e-01 0.0466 0.173 0.073 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.20e-01 -0.152 0.189 0.073 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 4.07e-01 -0.152 0.182 0.073 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0827 0.171 0.073 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0488 0.121 0.073 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 9.88e-02 -0.318 0.192 0.073 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000456 0.15 0.073 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 8.61e-01 0.032 0.182 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 2.64e-02 0.355 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 2.85e-01 -0.198 0.185 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0109 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 9.84e-01 0.00366 0.18 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 9.09e-01 0.0144 0.125 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 5.93e-01 0.0939 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 4.56e-01 -0.113 0.151 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 4.19e-01 0.114 0.14 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 1.95e-01 -0.228 0.175 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 8.65e-01 0.0294 0.172 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 8.75e-02 0.321 0.187 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0568 0.131 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 6.25e-02 -0.33 0.176 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 3.37e-02 -0.242 0.113 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0206 0.148 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 3.03e-01 0.168 0.163 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00861 0.152 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.13e-02 -0.261 0.112 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 3.24e-01 -0.135 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.121 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 8.01e-01 -0.032 0.127 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 4.26e-01 0.123 0.154 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 1.97e-01 0.19 0.147 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.31e-02 -0.345 0.151 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0176 0.147 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 7.18e-01 0.0572 0.158 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -570968 sc-eQTL 9.29e-01 0.00801 0.0893 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 164833 sc-eQTL 7.52e-01 0.0513 0.162 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 382548 sc-eQTL 1.97e-01 0.201 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -252040 sc-eQTL 6.83e-01 0.061 0.149 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -464579 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0968 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 218302 sc-eQTL 2.86e-01 -0.158 0.148 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -433138 sc-eQTL 6.50e-01 0.0714 0.157 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -795840 sc-eQTL 8.46e-01 0.0225 0.116 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 sc-eQTL 6.54e-01 0.0568 0.127 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -432916 sc-eQTL 3.69e-01 -0.165 0.183 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -570968 eQTL 0.05 0.0582 0.0296 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000136026 CKAP4 218302 pQTL 0.0207 0.0596 0.0258 0.0 0.0 0.0636
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 eQTL 1.96e-06 0.137 0.0286 0.0 0.0 0.0628

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 220652 2.08e-06 2.42e-06 3.38e-07 1.57e-06 4.76e-07 7.96e-07 1.3e-06 6.45e-07 1.75e-06 8.44e-07 1.93e-06 1.34e-06 3.3e-06 9.24e-07 6.94e-07 1.54e-06 9.67e-07 1.79e-06 7.68e-07 1.14e-06 9.48e-07 2.61e-06 2.04e-06 1.03e-06 2.57e-06 1.34e-06 1.22e-06 1.37e-06 1.8e-06 1.65e-06 9.97e-07 3.45e-07 4.8e-07 1.25e-06 9.16e-07 9.27e-07 8.34e-07 4.21e-07 1.03e-06 3.33e-07 1.67e-07 2.83e-06 4.36e-07 1.66e-07 3.61e-07 3.08e-07 7.88e-07 2.41e-07 2e-07