logo

Genes within 1Mb (chr12:106517654:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.35e-02 0.199 0.114 0.062 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.77e-02 -0.284 0.166 0.062 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0325 0.133 0.062 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 1.16e-01 0.288 0.182 0.062 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00341 0.0863 0.062 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 1.62e-01 -0.18 0.128 0.062 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 5.48e-02 -0.198 0.103 0.062 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.45e-01 0.0354 0.0767 0.062 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.73e-01 -0.166 0.122 0.062 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.84e-01 0.033 0.12 0.062 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.79e-02 0.324 0.146 0.062 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.85e-02 -0.228 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.40e-01 0.00882 0.117 0.062 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 3.64e-02 -0.209 0.0992 0.062 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.86e-01 0.043 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 5.11e-01 -0.111 0.169 0.062 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 4.00e-01 0.0814 0.0966 0.062 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 2.87e-01 -0.153 0.143 0.062 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 3.80e-01 0.127 0.144 0.062 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 3.53e-01 0.139 0.149 0.062 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.99e-01 -0.122 0.0945 0.062 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0231 0.124 0.062 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0406 0.0798 0.062 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.41e-02 -0.141 0.0836 0.062 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 2.36e-01 -0.214 0.18 0.062 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.35e-01 -0.033 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.95e-01 0.0223 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0871 0.174 0.063 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 8.17e-01 0.0375 0.162 0.063 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 7.14e-01 0.0425 0.116 0.063 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 2.21e-01 -0.198 0.161 0.063 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0684 0.153 0.063 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00446 0.174 0.063 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0117 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.32e-01 0.218 0.144 0.062 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.38e-01 0.0656 0.139 0.062 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.95e-02 -0.242 0.103 0.062 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 2.39e-01 -0.157 0.133 0.062 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 3.48e-01 0.113 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.78e-01 0.0135 0.0879 0.062 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 9.95e-01 0.000906 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 3.33e-01 0.15 0.155 0.062 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0285 0.147 0.062 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 4.08e-01 -0.125 0.151 0.062 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.49e-01 -0.163 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 4.59e-01 0.113 0.152 0.062 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.45e-01 0.0393 0.121 0.062 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.03e-01 0.032 0.128 0.062 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 2.69e-01 -0.203 0.183 0.062 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 4.06e-01 0.0787 0.0944 0.062 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 2.95e-01 -0.186 0.177 0.062 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 3.79e-01 -0.109 0.124 0.062 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.60e-01 0.167 0.148 0.062 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0281 0.111 0.062 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 1.40e-01 0.229 0.154 0.062 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 1.20e-02 0.279 0.11 0.062 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.00e-01 0.0346 0.136 0.062 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 3.10e-01 0.17 0.167 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0478 0.202 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.23e-01 0.306 0.197 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 5.85e-01 0.11 0.202 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 4.42e-02 0.314 0.155 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.03e-01 0.241 0.188 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 5.17e-01 0.137 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 1.77e-01 0.284 0.209 0.051 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 2.75e-01 0.184 0.168 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 3.66e-01 -0.169 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.27e-01 0.0577 0.165 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 1.36e-01 -0.264 0.177 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 9.21e-01 0.0137 0.138 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 3.91e-01 -0.152 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.25e-01 0.0355 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.56e-02 0.301 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.25e-01 0.0411 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0778 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 9.10e-02 0.265 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 7.26e-01 0.055 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.35e-01 0.0144 0.178 0.062 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 1.60e-02 -0.373 0.154 0.062 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.55e-02 0.285 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0554 0.174 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.83e-01 0.0252 0.17 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.22e-01 0.228 0.186 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0251 0.131 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0908 0.185 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 2.93e-02 -0.28 0.128 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0673 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.55e-01 -0.262 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.05e-01 0.0404 0.164 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 4.78e-01 0.132 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0683 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.10e-03 -0.481 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0307 0.136 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0644 0.14 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0934 0.17 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 2.70e-01 0.197 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0277 0.171 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.54e-02 -0.311 0.138 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 3.39e-01 0.173 0.181 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 1.54e-01 -0.202 0.142 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 7.42e-01 0.0583 0.177 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 8.04e-01 0.0377 0.152 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 3.51e-01 0.084 0.09 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0594 0.137 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0908 0.129 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.18e-01 0.212 0.172 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0794 0.118 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 8.39e-01 0.0257 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 2.55e-01 0.134 0.117 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 8.53e-01 -0.033 0.178 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.29e-01 0.00992 0.111 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 9.50e-01 0.00951 0.153 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.24e-01 0.0566 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.75e-02 0.404 0.182 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 8.34e-02 -0.194 0.112 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 6.91e-01 0.061 0.153 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 4.60e-02 -0.247 0.123 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.28e-01 0.0601 0.124 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 9.97e-02 -0.305 0.184 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0665 0.15 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.43e-02 -0.458 0.185 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.73e-01 0.0497 0.172 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 5.42e-01 -0.112 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.54e-01 -0.21 0.147 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0164 0.169 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.85e-01 0.0352 0.129 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0653 0.148 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 3.63e-01 0.162 0.177 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0449 0.113 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0274 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0571 0.16 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 8.71e-01 0.0286 0.177 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0756 0.151 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 2.98e-01 0.152 0.145 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 1.27e-01 0.239 0.156 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.12e-01 0.0824 0.162 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 1.43e-01 -0.263 0.179 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 5.27e-01 0.0831 0.131 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.04e-01 -0.133 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.83e-02 0.298 0.168 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 9.63e-01 0.008 0.174 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.17e-01 -0.175 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0184 0.151 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0373 0.118 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.57e-02 -0.233 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00107 0.179 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 7.12e-01 0.0562 0.152 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.59e-01 0.134 0.18 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.25e-02 -0.311 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 8.91e-01 -0.024 0.174 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 4.58e-01 0.117 0.157 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0539 0.18 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 8.74e-01 -0.024 0.152 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.62e-02 -0.252 0.151 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 8.13e-02 -0.286 0.163 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0158 0.163 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.07e-01 -0.153 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0828 0.176 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.47e-01 0.214 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.97e-01 -0.177 0.169 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 2.50e-01 0.213 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 5.75e-01 -0.099 0.176 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 4.32e-02 -0.328 0.161 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.90e-01 0.00176 0.138 0.063 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 9.04e-01 0.0211 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0949 0.155 0.063 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 1.09e-01 0.27 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.20e-01 -0.192 0.156 0.063 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 4.88e-02 0.359 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 5.59e-02 0.266 0.138 0.063 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.03e-01 0.0398 0.159 0.063 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 4.31e-01 0.135 0.171 0.063 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0272 0.135 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0418 0.171 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0674 0.149 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 2.02e-01 -0.236 0.184 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 4.65e-01 -0.127 0.173 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.15e-01 -0.22 0.139 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 2.09e-01 0.217 0.172 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 6.95e-01 0.06 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 5.88e-01 0.0965 0.178 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 2.36e-01 -0.202 0.17 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 2.45e-01 -0.123 0.106 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.25e-01 0.127 0.159 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 4.19e-01 0.126 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 3.34e-01 0.154 0.159 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 1.15e-01 -0.249 0.157 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 5.28e-01 -0.101 0.16 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 5.88e-01 0.0895 0.165 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.49e-01 0.0424 0.132 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.14 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 8.60e-01 0.0325 0.184 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 4.06e-01 0.128 0.154 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 5.65e-01 -0.108 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 1.00e+00 8.37e-05 0.182 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 4.46e-01 0.146 0.191 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.89e-01 0.205 0.193 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 9.05e-01 0.0201 0.168 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 3.39e-01 0.184 0.192 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 5.75e-01 0.0925 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.89e-01 0.00259 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0633 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.13e-01 0.0623 0.123 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 6.20e-01 0.0877 0.176 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 6.54e-01 0.0732 0.163 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00902 0.167 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 4.34e-01 0.134 0.171 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.37e-01 -0.24 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 6.33e-01 0.0839 0.175 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 1.76e-01 0.174 0.128 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.91e-01 0.0574 0.144 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 1.80e-01 -0.24 0.178 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.90e-01 0.0859 0.215 0.052 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 6.17e-01 0.116 0.231 0.052 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.86e-01 0.0563 0.207 0.052 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 9.34e-01 0.0161 0.195 0.052 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 4.26e-01 -0.104 0.13 0.052 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 3.60e-01 -0.152 0.166 0.052 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.29e-01 0.047 0.217 0.052 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 1.77e-01 -0.171 0.126 0.063 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 5.80e-01 -0.101 0.183 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 4.88e-01 -0.119 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 3.38e-01 -0.165 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.32e-01 0.144 0.095 0.063 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 4.36e-01 -0.124 0.159 0.063 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 2.71e-01 0.176 0.16 0.063 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 4.71e-01 -0.106 0.147 0.063 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 3.37e-01 0.146 0.152 0.063 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0598 0.153 0.062 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 3.27e-01 -0.178 0.182 0.062 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.28e-01 0.0377 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.58e-01 0.213 0.188 0.062 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 9.28e-02 -0.226 0.134 0.062 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0988 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 3.63e-02 -0.264 0.125 0.062 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.54e-01 0.0267 0.145 0.062 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 4.41e-02 -0.343 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 3.47e-01 0.166 0.177 0.066 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0513 0.17 0.066 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 7.50e-01 0.0575 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 5.86e-01 0.0845 0.155 0.066 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0907 0.126 0.066 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 5.16e-01 -0.108 0.166 0.066 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 3.01e-01 -0.161 0.156 0.066 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.46e-01 0.0128 0.189 0.066 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0742 0.152 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.03e-01 0.0431 0.172 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 3.90e-01 -0.134 0.156 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.40e-01 -0.139 0.118 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0506 0.141 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 1.89e-01 0.185 0.14 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 6.68e-02 0.323 0.175 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 3.19e-01 0.163 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 4.96e-04 -0.444 0.126 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 4.96e-01 -0.111 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0946 0.151 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 7.25e-02 0.322 0.178 0.076 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 8.99e-01 0.024 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00829 0.192 0.076 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 2.65e-01 0.229 0.205 0.076 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 4.26e-01 -0.143 0.18 0.076 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0368 0.188 0.076 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 2.83e-01 0.179 0.166 0.076 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.35e-01 0.0932 0.196 0.076 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 3.29e-01 0.183 0.186 0.076 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.22e-01 0.0397 0.176 0.064 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.44e-01 0.131 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0684 0.167 0.064 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 1.14e-01 -0.275 0.173 0.064 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 7.95e-01 0.0418 0.16 0.064 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.86e-02 0.322 0.194 0.064 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00811 0.125 0.066 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 5.37e-01 0.0992 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 1.63e-01 0.217 0.155 0.066 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 5.56e-02 -0.317 0.165 0.066 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 6.60e-01 0.0705 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0081 0.163 0.066 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 7.88e-01 0.0466 0.173 0.073 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.20e-01 -0.152 0.189 0.073 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 4.07e-01 -0.152 0.182 0.073 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0827 0.171 0.073 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0488 0.121 0.073 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 9.88e-02 -0.318 0.192 0.073 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000456 0.15 0.073 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 8.61e-01 0.032 0.182 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 2.64e-02 0.355 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 2.85e-01 -0.198 0.185 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0109 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 9.84e-01 0.00366 0.18 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 9.09e-01 0.0144 0.125 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 5.93e-01 0.0939 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 4.56e-01 -0.113 0.151 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 4.19e-01 0.114 0.14 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 1.95e-01 -0.228 0.175 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 8.65e-01 0.0294 0.172 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 8.75e-02 0.321 0.187 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0568 0.131 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 6.25e-02 -0.33 0.176 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 3.37e-02 -0.242 0.113 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0206 0.148 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 3.03e-01 0.168 0.163 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00861 0.152 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.13e-02 -0.261 0.112 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 3.24e-01 -0.135 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.121 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 8.01e-01 -0.032 0.127 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 4.26e-01 0.123 0.154 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 1.97e-01 0.19 0.147 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.31e-02 -0.345 0.151 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0176 0.147 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 7.18e-01 0.0572 0.158 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -575895 sc-eQTL 9.29e-01 0.00801 0.0893 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 159906 sc-eQTL 7.52e-01 0.0513 0.162 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 377621 sc-eQTL 1.97e-01 0.201 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -256967 sc-eQTL 6.83e-01 0.061 0.149 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -469506 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0968 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 213375 sc-eQTL 2.86e-01 -0.158 0.148 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -438065 sc-eQTL 6.50e-01 0.0714 0.157 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -800767 sc-eQTL 8.46e-01 0.0225 0.116 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 sc-eQTL 6.54e-01 0.0568 0.127 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -437843 sc-eQTL 3.69e-01 -0.165 0.183 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -575895 eQTL 0.0495 0.0582 0.0296 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000136026 CKAP4 213375 pQTL 0.0195 0.0602 0.0257 0.0 0.0 0.0636
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 eQTL 1.92e-06 0.137 0.0286 0.0 0.0 0.0628

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 215725 2.21e-06 3.13e-06 5.97e-07 1.86e-06 1.1e-06 7.74e-07 2.28e-06 9.75e-07 2.68e-06 1.48e-06 2.77e-06 1.9e-06 4.26e-06 1.28e-06 1.03e-06 2.23e-06 1.61e-06 2.2e-06 1.46e-06 8.79e-07 1.81e-06 3.23e-06 2.67e-06 1.68e-06 4.41e-06 1.24e-06 1.84e-06 1.55e-06 3.17e-06 2.13e-06 2.02e-06 5.76e-07 7.34e-07 1.51e-06 1.84e-06 8.67e-07 9.11e-07 4.71e-07 1.23e-06 4.29e-07 6.45e-07 3.43e-06 5.95e-07 1.69e-07 3.63e-07 3.41e-07 7.99e-07 2.4e-07 3.35e-07