logo

Genes within 1Mb (chr12:106460293:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.84e-02 0.22 0.116 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.94e-02 -0.332 0.168 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00463 0.135 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 1.05e-01 0.301 0.185 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 9.86e-01 0.00157 0.0876 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 1.41e-01 -0.193 0.13 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 1.06e-01 -0.169 0.104 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 6.62e-01 0.0339 0.0774 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 2.24e-01 -0.15 0.123 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.79e-01 0.0504 0.121 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 3.96e-02 0.306 0.148 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.28e-02 -0.203 0.104 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.118 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 4.80e-02 -0.199 0.1 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 8.96e-01 0.014 0.107 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0766 0.171 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.05e-01 0.0655 0.0981 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 2.67e-01 -0.161 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 3.98e-01 0.124 0.146 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 4.96e-01 0.103 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.79e-01 -0.129 0.0958 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 8.11e-01 -0.03 0.125 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0431 0.081 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 1.42e-01 -0.125 0.0849 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 3.50e-01 -0.171 0.183 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0359 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.70e-01 0.0728 0.171 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0463 0.177 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 8.97e-01 0.0214 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 6.49e-01 0.0535 0.117 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 2.94e-01 -0.172 0.163 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0157 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0134 0.176 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 9.54e-01 0.00707 0.122 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 1.35e-01 0.219 0.146 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 4.63e-01 0.103 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 9.67e-02 -0.174 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 3.53e-01 -0.125 0.135 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 3.37e-01 0.117 0.122 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.13e-01 0.0328 0.0891 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 9.11e-01 0.0179 0.16 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 3.86e-01 0.136 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0244 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 3.68e-01 -0.138 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 2.47e-01 -0.165 0.142 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 4.92e-01 0.106 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 6.10e-01 0.0623 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.85e-01 0.0355 0.13 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 2.64e-01 -0.208 0.185 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 3.17e-01 0.0962 0.0958 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 5.21e-01 -0.116 0.18 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 3.77e-01 -0.112 0.126 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.31e-01 0.18 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0183 0.113 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 1.37e-01 0.234 0.157 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 4.27e-03 0.321 0.111 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 8.22e-01 0.0312 0.138 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 2.80e-01 0.184 0.17 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 1.45e-01 0.25 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 3.68e-01 -0.171 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.81e-01 0.0693 0.168 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 1.60e-01 -0.253 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 7.44e-01 0.0459 0.14 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 3.58e-01 -0.165 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.84e-01 0.0447 0.163 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 1.10e-01 0.284 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0255 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0789 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 6.88e-02 0.29 0.158 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 6.93e-01 0.0627 0.159 0.06 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 9.63e-01 0.00835 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 2.35e-02 -0.357 0.156 0.06 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 4.54e-02 0.313 0.155 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0887 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 7.74e-01 0.0495 0.172 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.96e-01 0.197 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0332 0.133 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 5.46e-01 -0.113 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 6.33e-02 -0.241 0.129 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.63e-01 -0.056 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 1.72e-01 -0.254 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.28e-01 -0.015 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 4.02e-01 0.158 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0397 0.162 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 1.47e-02 -0.456 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.138 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0789 0.141 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0795 0.172 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 2.88e-01 0.192 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 9.96e-01 0.000919 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 3.32e-02 -0.301 0.14 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 3.02e-01 0.19 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 1.79e-01 -0.193 0.143 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 8.09e-01 0.0433 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 6.98e-01 0.0598 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.54e-01 0.0538 0.0909 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0429 0.138 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0588 0.131 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.45e-01 0.202 0.173 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0728 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 9.13e-01 0.014 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 1.95e-01 -0.148 0.113 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 4.13e-01 0.0973 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0131 0.179 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.65e-01 0.0337 0.113 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 9.21e-01 0.0153 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.59e-01 0.0715 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 4.98e-02 0.364 0.185 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.30e-01 0.0748 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.44e-02 -0.241 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.15e-01 0.0457 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 1.28e-01 -0.285 0.187 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0698 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 1.54e-02 -0.461 0.189 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 7.38e-01 0.0585 0.175 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 4.80e-01 -0.132 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.37e-01 -0.223 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0711 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 9.18e-01 0.0134 0.131 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0593 0.15 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 3.60e-01 0.166 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0641 0.115 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0462 0.173 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0488 0.162 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 9.46e-01 0.0123 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0957 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 2.74e-01 0.162 0.148 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 9.56e-02 0.265 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 5.91e-01 0.0888 0.165 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 1.92e-01 -0.238 0.182 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.74e-01 0.0383 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.28e-01 -0.128 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.21e-02 0.299 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00312 0.177 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.60e-01 -0.202 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00716 0.154 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0578 0.12 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 1.03e-01 -0.209 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 9.19e-01 0.0185 0.182 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 4.10e-01 0.127 0.154 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.20e-01 0.148 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.12e-02 -0.307 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0398 0.177 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 4.59e-01 0.119 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0573 0.183 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0746 0.154 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.52e-02 -0.274 0.153 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 1.58e-01 -0.236 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0204 0.165 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 3.73e-01 -0.166 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 5.03e-01 -0.12 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.36e-01 0.222 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 2.61e-01 -0.193 0.171 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 3.73e-01 0.168 0.188 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 3.33e-01 0.167 0.172 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0733 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 4.56e-02 -0.33 0.164 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.30e-01 0.0302 0.141 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.82e-01 0.0727 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0978 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 1.16e-01 0.27 0.171 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 3.06e-01 -0.163 0.159 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.80e-02 0.338 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 3.29e-02 0.301 0.14 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.15e-01 0.0174 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 3.28e-01 0.17 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00333 0.137 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0211 0.174 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 5.08e-01 -0.1 0.151 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 2.44e-01 -0.219 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 3.47e-01 -0.166 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.40e-01 -0.209 0.141 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 1.25e-01 0.269 0.175 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.06e-01 0.103 0.155 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 5.29e-01 0.114 0.181 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 2.60e-01 -0.195 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 2.98e-01 -0.112 0.107 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 3.64e-01 0.147 0.161 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 4.48e-01 0.12 0.158 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 3.30e-01 0.158 0.161 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 1.17e-01 -0.251 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.13e-01 -0.106 0.162 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.11e-01 0.0852 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 6.41e-01 0.0627 0.134 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 8.53e-01 0.0263 0.142 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 9.37e-01 0.0147 0.187 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 3.75e-01 0.14 0.158 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.72e-01 -0.137 0.191 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 9.89e-01 0.00257 0.186 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 4.67e-01 0.142 0.195 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 3.60e-01 0.181 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.75e-01 -0.027 0.172 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 3.13e-01 0.199 0.196 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.83e-01 0.0927 0.169 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.59e-01 0.01 0.193 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0872 0.181 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 5.77e-01 0.0698 0.125 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.83e-01 0.126 0.179 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 7.14e-01 0.0608 0.166 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.88e-01 0.00265 0.17 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 5.36e-01 0.108 0.174 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.06e-01 -0.265 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 7.00e-01 0.0689 0.179 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 1.69e-01 0.18 0.13 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.05e-01 0.0556 0.147 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 2.43e-01 -0.212 0.182 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 1.98e-01 -0.165 0.128 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0599 0.185 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 4.93e-01 -0.12 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.85e-01 -0.187 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 9.47e-02 0.161 0.0962 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 3.62e-01 -0.148 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 3.92e-01 0.139 0.162 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 4.03e-01 -0.125 0.149 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 2.55e-01 0.176 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0637 0.155 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 3.19e-01 -0.183 0.184 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.34e-01 0.0146 0.176 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 1.88e-01 0.25 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.73e-01 -0.185 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 5.35e-01 -0.11 0.176 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.36e-02 -0.246 0.127 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.46e-01 0.00987 0.147 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 8.17e-02 -0.3 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 3.66e-01 0.162 0.179 0.063 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0128 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 5.69e-01 0.104 0.182 0.063 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 7.72e-01 0.0456 0.157 0.063 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0847 0.128 0.063 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0714 0.168 0.063 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 4.57e-01 -0.118 0.158 0.063 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.18e-01 0.0197 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.50e-01 -0.049 0.154 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 7.06e-01 0.0657 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 4.94e-01 -0.108 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0736 0.119 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0223 0.142 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 1.81e-01 0.19 0.142 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.17e-01 0.0414 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.46e-02 0.329 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 2.67e-01 0.183 0.165 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 3.42e-03 -0.379 0.128 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0963 0.164 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 4.78e-01 -0.109 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 3.42e-02 0.388 0.181 0.073 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.86e-01 0.0781 0.193 0.073 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0266 0.196 0.073 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 2.32e-01 0.251 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 3.75e-01 -0.163 0.184 0.073 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0135 0.192 0.073 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 1.20e-01 0.264 0.169 0.073 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 4.84e-01 0.14 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 5.21e-01 0.123 0.191 0.073 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.75e-01 0.028 0.178 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 4.72e-01 0.124 0.172 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0345 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 3.22e-01 -0.174 0.175 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.60e-01 0.0946 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 7.44e-02 0.351 0.196 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.75e-01 0.0198 0.126 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 7.01e-01 0.0626 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 1.55e-01 0.225 0.157 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 1.22e-01 -0.26 0.167 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 5.83e-01 0.0892 0.162 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0105 0.166 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.22e-01 0.0397 0.176 0.071 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 5.14e-01 -0.125 0.192 0.071 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 5.62e-01 -0.108 0.185 0.071 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0419 0.174 0.071 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 6.91e-01 -0.049 0.123 0.071 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 1.49e-01 -0.283 0.195 0.071 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 9.92e-01 0.00156 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00609 0.185 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 1.57e-02 0.392 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 1.65e-01 -0.261 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.83e-01 0.00342 0.162 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 8.71e-01 0.0298 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.29e-01 0.0276 0.127 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.08e-01 0.0917 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 3.25e-01 0.14 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 1.96e-01 -0.23 0.178 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 9.71e-01 0.0064 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 9.15e-02 0.321 0.19 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0402 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 6.62e-02 -0.33 0.179 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 9.14e-02 -0.195 0.115 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00986 0.149 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 2.63e-01 0.185 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 8.85e-01 0.0222 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 8.41e-02 -0.198 0.114 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 4.28e-01 -0.11 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 3.14e-01 0.123 0.122 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0165 0.129 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 5.33e-01 0.0977 0.156 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 1.49e-01 0.215 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 7.73e-02 -0.272 0.153 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 8.83e-01 0.0219 0.149 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 6.77e-01 0.0669 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -633256 sc-eQTL 7.93e-01 0.0238 0.0905 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 102545 sc-eQTL 6.70e-01 0.0701 0.164 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 320260 sc-eQTL 2.27e-01 0.191 0.158 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -314328 sc-eQTL 6.78e-01 0.063 0.151 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -526867 sc-eQTL 4.97e-01 -0.107 0.157 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 156014 sc-eQTL 2.50e-01 -0.173 0.15 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -495426 sc-eQTL 7.06e-01 0.0601 0.159 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -858128 sc-eQTL 7.07e-01 0.0444 0.118 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 sc-eQTL 6.22e-01 0.0634 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -495204 sc-eQTL 3.55e-01 -0.172 0.185 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -633256 eQTL 0.046 0.0592 0.0296 0.0 0.0 0.0623
ENSG00000136026 CKAP4 156014 pQTL 0.0171 0.0615 0.0258 0.0 0.0 0.0632
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 eQTL 2.39e-06 0.136 0.0287 0.0 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 158364 4.74e-06 5.07e-06 7.65e-07 2.63e-06 1.32e-06 1.35e-06 4.31e-06 1.03e-06 4.96e-06 2.33e-06 5.21e-06 3.37e-06 7.2e-06 2.31e-06 1.39e-06 3.26e-06 2.07e-06 2.87e-06 1.41e-06 9.46e-07 2.77e-06 4.67e-06 3.78e-06 1.57e-06 5.99e-06 1.48e-06 2.57e-06 1.84e-06 4.34e-06 3.77e-06 2.75e-06 5.76e-07 6.52e-07 1.82e-06 2.1e-06 9.44e-07 9.6e-07 4.93e-07 1.06e-06 3.41e-07 3.61e-07 5.69e-06 3.82e-07 1.82e-07 3.58e-07 7.78e-07 8.07e-07 2.11e-07 3.18e-07