logo

Genes within 1Mb (chr12:106419124:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.84e-02 0.22 0.116 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.94e-02 -0.332 0.168 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00463 0.135 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 1.05e-01 0.301 0.185 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 9.86e-01 0.00157 0.0876 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 1.41e-01 -0.193 0.13 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 1.06e-01 -0.169 0.104 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 6.62e-01 0.0339 0.0774 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 2.24e-01 -0.15 0.123 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.79e-01 0.0504 0.121 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 3.96e-02 0.306 0.148 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.28e-02 -0.203 0.104 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.118 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 4.80e-02 -0.199 0.1 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 8.96e-01 0.014 0.107 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0766 0.171 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.05e-01 0.0655 0.0981 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 2.67e-01 -0.161 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 3.98e-01 0.124 0.146 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 4.96e-01 0.103 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.79e-01 -0.129 0.0958 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 8.11e-01 -0.03 0.125 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0431 0.081 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 1.42e-01 -0.125 0.0849 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 3.50e-01 -0.171 0.183 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0359 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.70e-01 0.0728 0.171 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0463 0.177 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 8.97e-01 0.0214 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 6.49e-01 0.0535 0.117 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 2.94e-01 -0.172 0.163 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0157 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0134 0.176 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 9.54e-01 0.00707 0.122 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 1.35e-01 0.219 0.146 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 4.63e-01 0.103 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 9.67e-02 -0.174 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 3.53e-01 -0.125 0.135 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 3.37e-01 0.117 0.122 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.13e-01 0.0328 0.0891 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 9.11e-01 0.0179 0.16 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 3.86e-01 0.136 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0244 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 3.68e-01 -0.138 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 2.47e-01 -0.165 0.142 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 4.92e-01 0.106 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 6.10e-01 0.0623 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.85e-01 0.0355 0.13 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 2.64e-01 -0.208 0.185 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 3.17e-01 0.0962 0.0958 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 5.21e-01 -0.116 0.18 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 3.77e-01 -0.112 0.126 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.31e-01 0.18 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0183 0.113 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 1.37e-01 0.234 0.157 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 4.27e-03 0.321 0.111 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 8.22e-01 0.0312 0.138 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 2.80e-01 0.184 0.17 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 1.45e-01 0.25 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 3.68e-01 -0.171 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.81e-01 0.0693 0.168 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 1.60e-01 -0.253 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 7.44e-01 0.0459 0.14 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 3.58e-01 -0.165 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.84e-01 0.0447 0.163 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 1.10e-01 0.284 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0255 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0789 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 6.88e-02 0.29 0.158 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 6.93e-01 0.0627 0.159 0.06 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 9.63e-01 0.00835 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 2.35e-02 -0.357 0.156 0.06 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 4.54e-02 0.313 0.155 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0887 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 7.74e-01 0.0495 0.172 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.96e-01 0.197 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0332 0.133 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 5.46e-01 -0.113 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 6.33e-02 -0.241 0.129 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.63e-01 -0.056 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 1.72e-01 -0.254 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.28e-01 -0.015 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 4.02e-01 0.158 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0397 0.162 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 1.47e-02 -0.456 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.138 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0789 0.141 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0795 0.172 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 2.88e-01 0.192 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 9.96e-01 0.000919 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 3.32e-02 -0.301 0.14 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 3.02e-01 0.19 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 1.79e-01 -0.193 0.143 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 8.09e-01 0.0433 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 6.98e-01 0.0598 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.54e-01 0.0538 0.0909 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0429 0.138 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0588 0.131 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.45e-01 0.202 0.173 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0728 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 9.13e-01 0.014 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 1.95e-01 -0.148 0.113 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 4.13e-01 0.0973 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0131 0.179 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.65e-01 0.0337 0.113 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 9.21e-01 0.0153 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.59e-01 0.0715 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 4.98e-02 0.364 0.185 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.30e-01 0.0748 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.44e-02 -0.241 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.15e-01 0.0457 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 1.28e-01 -0.285 0.187 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0698 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 1.54e-02 -0.461 0.189 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 7.38e-01 0.0585 0.175 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 4.80e-01 -0.132 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.37e-01 -0.223 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0711 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 9.18e-01 0.0134 0.131 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0593 0.15 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 3.60e-01 0.166 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0641 0.115 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0462 0.173 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0488 0.162 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 9.46e-01 0.0123 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0957 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 2.74e-01 0.162 0.148 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 9.56e-02 0.265 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 5.91e-01 0.0888 0.165 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 1.92e-01 -0.238 0.182 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.74e-01 0.0383 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.28e-01 -0.128 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.21e-02 0.299 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00312 0.177 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.60e-01 -0.202 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00716 0.154 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0578 0.12 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 1.03e-01 -0.209 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 9.19e-01 0.0185 0.182 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 4.10e-01 0.127 0.154 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.20e-01 0.148 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.12e-02 -0.307 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0398 0.177 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 4.59e-01 0.119 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0573 0.183 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0746 0.154 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.52e-02 -0.274 0.153 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 1.58e-01 -0.236 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0204 0.165 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 3.73e-01 -0.166 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 5.03e-01 -0.12 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.36e-01 0.222 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 2.61e-01 -0.193 0.171 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 3.73e-01 0.168 0.188 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 3.33e-01 0.167 0.172 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0733 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 4.56e-02 -0.33 0.164 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.30e-01 0.0302 0.141 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.82e-01 0.0727 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0978 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 1.16e-01 0.27 0.171 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 3.06e-01 -0.163 0.159 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.80e-02 0.338 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 3.29e-02 0.301 0.14 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.15e-01 0.0174 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 3.28e-01 0.17 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00333 0.137 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0211 0.174 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 5.08e-01 -0.1 0.151 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 2.44e-01 -0.219 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 3.47e-01 -0.166 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.40e-01 -0.209 0.141 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 1.25e-01 0.269 0.175 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.06e-01 0.103 0.155 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 5.29e-01 0.114 0.181 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 2.60e-01 -0.195 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 2.98e-01 -0.112 0.107 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 3.64e-01 0.147 0.161 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 4.48e-01 0.12 0.158 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 3.30e-01 0.158 0.161 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 1.17e-01 -0.251 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.13e-01 -0.106 0.162 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.11e-01 0.0852 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 6.41e-01 0.0627 0.134 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 8.53e-01 0.0263 0.142 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 9.37e-01 0.0147 0.187 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 3.75e-01 0.14 0.158 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.72e-01 -0.137 0.191 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 9.89e-01 0.00257 0.186 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 4.67e-01 0.142 0.195 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 3.60e-01 0.181 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.75e-01 -0.027 0.172 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 3.13e-01 0.199 0.196 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.83e-01 0.0927 0.169 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.59e-01 0.01 0.193 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0872 0.181 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 5.77e-01 0.0698 0.125 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.83e-01 0.126 0.179 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 7.14e-01 0.0608 0.166 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.88e-01 0.00265 0.17 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 5.36e-01 0.108 0.174 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.06e-01 -0.265 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 7.00e-01 0.0689 0.179 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 1.69e-01 0.18 0.13 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.05e-01 0.0556 0.147 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 2.43e-01 -0.212 0.182 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 1.98e-01 -0.165 0.128 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0599 0.185 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 4.93e-01 -0.12 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.85e-01 -0.187 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 9.47e-02 0.161 0.0962 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 3.62e-01 -0.148 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 3.92e-01 0.139 0.162 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 4.03e-01 -0.125 0.149 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 2.55e-01 0.176 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0637 0.155 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 3.19e-01 -0.183 0.184 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.34e-01 0.0146 0.176 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 1.88e-01 0.25 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.73e-01 -0.185 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 5.35e-01 -0.11 0.176 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.36e-02 -0.246 0.127 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.46e-01 0.00987 0.147 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 8.17e-02 -0.3 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 3.66e-01 0.162 0.179 0.063 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0128 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 5.69e-01 0.104 0.182 0.063 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 7.72e-01 0.0456 0.157 0.063 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0847 0.128 0.063 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0714 0.168 0.063 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 4.57e-01 -0.118 0.158 0.063 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.18e-01 0.0197 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.50e-01 -0.049 0.154 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 7.06e-01 0.0657 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 4.94e-01 -0.108 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0736 0.119 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0223 0.142 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 1.81e-01 0.19 0.142 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.17e-01 0.0414 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.46e-02 0.329 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 2.67e-01 0.183 0.165 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 3.42e-03 -0.379 0.128 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0963 0.164 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 4.78e-01 -0.109 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 3.42e-02 0.388 0.181 0.073 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.86e-01 0.0781 0.193 0.073 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0266 0.196 0.073 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 2.32e-01 0.251 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 3.75e-01 -0.163 0.184 0.073 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0135 0.192 0.073 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 1.20e-01 0.264 0.169 0.073 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 4.84e-01 0.14 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 5.21e-01 0.123 0.191 0.073 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.75e-01 0.028 0.178 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 4.72e-01 0.124 0.172 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0345 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 3.22e-01 -0.174 0.175 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.60e-01 0.0946 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 7.44e-02 0.351 0.196 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.75e-01 0.0198 0.126 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 7.01e-01 0.0626 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 1.55e-01 0.225 0.157 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 1.22e-01 -0.26 0.167 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 5.83e-01 0.0892 0.162 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0105 0.166 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.22e-01 0.0397 0.176 0.071 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 5.14e-01 -0.125 0.192 0.071 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 5.62e-01 -0.108 0.185 0.071 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0419 0.174 0.071 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 6.91e-01 -0.049 0.123 0.071 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 1.49e-01 -0.283 0.195 0.071 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 9.92e-01 0.00156 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00609 0.185 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 1.57e-02 0.392 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 1.65e-01 -0.261 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.83e-01 0.00342 0.162 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 8.71e-01 0.0298 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.29e-01 0.0276 0.127 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.08e-01 0.0917 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 3.25e-01 0.14 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 1.96e-01 -0.23 0.178 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 9.71e-01 0.0064 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 9.15e-02 0.321 0.19 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0402 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 6.62e-02 -0.33 0.179 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 9.14e-02 -0.195 0.115 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00986 0.149 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 2.63e-01 0.185 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 8.85e-01 0.0222 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 8.41e-02 -0.198 0.114 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 4.28e-01 -0.11 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 3.14e-01 0.123 0.122 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0165 0.129 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 5.33e-01 0.0977 0.156 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 1.49e-01 0.215 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 7.73e-02 -0.272 0.153 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 8.83e-01 0.0219 0.149 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 6.77e-01 0.0669 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -674425 sc-eQTL 7.93e-01 0.0238 0.0905 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 61376 sc-eQTL 6.70e-01 0.0701 0.164 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 279091 sc-eQTL 2.27e-01 0.191 0.158 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -355497 sc-eQTL 6.78e-01 0.063 0.151 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -568036 sc-eQTL 4.97e-01 -0.107 0.157 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 114845 sc-eQTL 2.50e-01 -0.173 0.15 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -536595 sc-eQTL 7.06e-01 0.0601 0.159 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -899297 sc-eQTL 7.07e-01 0.0444 0.118 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 sc-eQTL 6.22e-01 0.0634 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -536373 sc-eQTL 3.55e-01 -0.172 0.185 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -674425 eQTL 0.0445 0.0597 0.0297 0.0 0.0 0.0623
ENSG00000136026 CKAP4 114845 pQTL 0.0165 0.0618 0.0257 0.0 0.0 0.0632
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 eQTL 2.88e-06 0.135 0.0287 0.0 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 117195 1.05e-05 1.81e-05 2.41e-06 1.3e-05 2.45e-06 6.16e-06 1.76e-05 2.16e-06 1.53e-05 6.12e-06 1.68e-05 7.34e-06 3.56e-05 8.62e-06 4.15e-06 9.02e-06 8.68e-06 1e-05 3.34e-06 4.14e-06 6.39e-06 1.21e-05 1.32e-05 4.68e-06 2.84e-05 4.73e-06 6.97e-06 5.34e-06 1.35e-05 1.31e-05 1.12e-05 1.26e-06 1.1e-06 4.85e-06 8.98e-06 2.77e-06 2.04e-06 2.2e-06 3.74e-06 3.2e-06 1.67e-06 2.07e-05 2.34e-06 1.9e-07 9.34e-07 2.01e-06 1.75e-06 6.68e-07 5.08e-07