logo

Genes within 1Mb (chr12:106416231:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0536 0.0708 0.19 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 9.39e-01 0.00791 0.103 0.19 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 1.77e-01 -0.11 0.0814 0.19 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 3.47e-01 0.106 0.113 0.19 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0131 0.0531 0.19 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 9.43e-01 0.00574 0.0795 0.19 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.43e-01 0.021 0.0638 0.19 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00385 0.0472 0.19 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 3.81e-01 0.0659 0.0751 0.19 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 2.75e-01 0.0808 0.0739 0.19 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0436 0.0909 0.19 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.12e-02 0.112 0.0638 0.19 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0704 0.0718 0.19 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 6.79e-01 0.0256 0.0617 0.19 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.62e-01 0.038 0.0653 0.19 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 3.75e-01 0.0923 0.104 0.19 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 4.64e-01 0.0437 0.0596 0.19 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0106 0.0885 0.19 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00543 0.0891 0.19 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 5.51e-01 0.0551 0.0922 0.19 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.18e-02 0.102 0.0581 0.19 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0319 0.0762 0.19 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00548 0.0493 0.19 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.70e-02 0.0859 0.0516 0.19 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0435 0.111 0.19 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 5.01e-01 0.0675 0.1 0.182 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.10e-01 -0.171 0.106 0.182 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 1.28e-01 0.168 0.11 0.182 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.96e-01 0.0267 0.103 0.182 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 9.20e-01 0.00739 0.0736 0.182 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 2.79e-01 -0.111 0.102 0.182 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 4.33e-01 0.0762 0.0971 0.182 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0275 0.111 0.182 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.08e-01 0.119 0.0738 0.19 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 6.78e-01 0.037 0.0892 0.19 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0312 0.0857 0.19 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0607 0.0638 0.19 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.74e-01 -0.013 0.0822 0.19 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0233 0.0742 0.19 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0443 0.0557 0.189 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.00e-01 0.128 0.0996 0.189 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 2.38e-01 0.116 0.0982 0.189 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 5.29e-01 0.0586 0.0931 0.189 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 9.28e-01 0.00866 0.0959 0.189 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 9.07e-01 0.0105 0.0895 0.189 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 7.37e-01 0.0325 0.0966 0.189 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0432 0.0764 0.189 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.99e-01 0.0429 0.0815 0.189 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.189 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.66e-01 0.0254 0.0588 0.19 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 4.00e-02 0.225 0.109 0.19 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0268 0.0772 0.19 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0228 0.0924 0.19 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.18e-01 0.0159 0.0691 0.19 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.15e-01 0.0787 0.0963 0.19 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.45e-01 0.0136 0.0694 0.19 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 1.65e-01 -0.117 0.0843 0.19 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0377 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0906 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0479 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 2.46e-01 0.102 0.0881 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.202 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0981 0.119 0.202 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 2.29e-01 -0.143 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 5.77e-01 0.0591 0.106 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 8.58e-02 0.2 0.116 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0695 0.104 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 6.25e-02 0.207 0.11 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0203 0.0865 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.98e-02 -0.187 0.11 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.29e-01 0.0633 0.1 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 2.29e-02 -0.249 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 4.48e-01 0.0881 0.116 0.192 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0211 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 4.30e-01 0.0778 0.0984 0.192 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 5.10e-01 0.0646 0.098 0.192 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0485 0.111 0.192 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0974 0.192 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0361 0.0959 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0232 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.37e-01 0.0355 0.105 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 8.69e-01 0.0191 0.115 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.62e-01 0.0741 0.081 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 2.37e-01 0.135 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 8.27e-01 0.0174 0.0797 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 4.07e-02 -0.239 0.116 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 8.60e-01 0.0208 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0386 0.105 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.59e-01 0.0367 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.32e-01 0.122 0.102 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.00e-01 -0.1 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 4.13e-01 0.0716 0.0872 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.26e-01 0.138 0.0899 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0387 0.11 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 6.79e-01 -0.048 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 1.43e-01 -0.162 0.11 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 7.07e-01 0.0342 0.0907 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.53e-02 -0.234 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 1.03e-01 0.15 0.0916 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 6.42e-01 0.0533 0.115 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 4.01e-01 0.0828 0.0983 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0185 0.056 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 4.03e-01 0.0712 0.085 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 4.99e-01 0.0546 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 6.44e-01 0.0496 0.107 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.79e-01 0.0791 0.0729 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0334 0.0784 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.32e-01 0.0149 0.0702 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.98e-01 0.000219 0.0732 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 7.36e-01 0.0373 0.111 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0339 0.0692 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0581 0.0952 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 6.07e-01 0.0513 0.0996 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00542 0.115 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 1.22e-01 0.108 0.0697 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0532 0.0953 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 3.20e-01 0.0769 0.0772 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 2.30e-01 0.0924 0.0768 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 5.78e-01 0.0643 0.115 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.83e-01 -0.126 0.094 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.95e-01 0.153 0.118 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.10e-01 0.0261 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 3.13e-01 -0.117 0.115 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.50e-01 0.0867 0.0926 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 9.36e-01 0.00854 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 5.41e-01 0.0495 0.0808 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 2.50e-01 0.107 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0979 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.62e-01 0.0312 0.0712 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.30e-01 -0.162 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00592 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.70e-01 0.0326 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.11e-01 -0.119 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.89e-02 -0.167 0.0912 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 3.75e-01 0.0878 0.0988 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 8.38e-01 0.0233 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0992 0.0817 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 3.23e-01 0.0983 0.0992 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.72e-01 0.0172 0.106 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 2.84e-01 -0.116 0.108 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 1.07e-02 0.225 0.0873 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.07e-01 0.0783 0.0943 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 1.15e-01 -0.116 0.0732 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 1.03e-01 0.129 0.0787 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0792 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.05e-01 0.0371 0.0979 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0458 0.117 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0954 0.112 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0306 0.112 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0676 0.102 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.94e-01 0.0155 0.116 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 1.91e-01 0.128 0.0974 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 6.20e-02 0.182 0.0972 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0931 0.106 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 2.07e-01 0.128 0.101 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.41e-01 -0.135 0.114 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.92e-01 0.00115 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 4.73e-01 0.0827 0.115 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.23e-02 0.225 0.104 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.85e-01 0.0468 0.115 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.106 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.77e-01 0.00321 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 8.04e-01 0.0252 0.102 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0199 0.0875 0.19 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.87e-01 0.117 0.11 0.19 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0255 0.0978 0.19 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 6.27e-01 -0.052 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 4.62e-01 0.0728 0.0988 0.19 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 3.94e-01 0.0988 0.116 0.19 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.65e-01 -0.015 0.0881 0.19 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.72e-01 -0.057 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 6.16e-01 0.0544 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.84e-01 -0.119 0.0892 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.83e-01 0.122 0.113 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00604 0.099 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.76e-01 0.0351 0.123 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0125 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 7.79e-01 -0.026 0.0928 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.83e-01 0.017 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 1.13e-01 0.161 0.101 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 4.44e-01 0.0906 0.118 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 5.21e-01 0.0727 0.113 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 9.65e-01 0.00297 0.0672 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.00e-01 0.129 0.101 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 4.09e-02 0.201 0.0976 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 4.54e-01 0.0757 0.101 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 5.41e-01 0.0614 0.1 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0871 0.101 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 7.78e-01 0.0296 0.105 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0723 0.0839 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0337 0.0888 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0698 0.096 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.99e-02 0.269 0.115 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.113 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0844 0.119 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0556 0.12 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 4.99e-01 0.0708 0.105 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.77e-01 0.0185 0.12 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.56e-01 0.032 0.103 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.14e-01 0.0433 0.118 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00796 0.11 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0365 0.079 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 9.59e-01 0.0059 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0391 0.105 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.18e-01 0.0247 0.107 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 5.52e-01 0.0654 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 9.72e-02 0.172 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.75e-01 0.0472 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.21e-01 0.0295 0.0825 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00422 0.0927 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.115 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.78e-01 0.0539 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0351 0.139 0.189 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.70e-01 0.00469 0.125 0.189 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 5.11e-01 0.0772 0.117 0.189 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 9.06e-01 0.00922 0.0783 0.189 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 7.98e-01 0.0257 0.1 0.189 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0286 0.131 0.189 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.30e-01 0.117 0.0772 0.191 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0336 0.112 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.31e-01 0.0226 0.106 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 3.30e-01 0.103 0.106 0.191 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 9.05e-01 -0.007 0.0586 0.191 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0412 0.0979 0.191 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.20e-02 0.176 0.0975 0.191 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 1.33e-02 -0.223 0.0891 0.191 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0421 0.0935 0.191 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0259 0.0948 0.19 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0476 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.19e-01 -0.011 0.107 0.19 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.34e-01 0.0396 0.116 0.19 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0153 0.0831 0.19 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 7.56e-01 0.0335 0.108 0.19 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0575 0.078 0.19 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0272 0.0896 0.19 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 1.99e-01 0.136 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.82e-01 0.149 0.111 0.19 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 3.24e-01 0.112 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 1.17e-01 0.153 0.0973 0.19 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 5.63e-01 0.0463 0.08 0.19 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0354 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 4.27e-01 0.0785 0.0986 0.19 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0663 0.119 0.19 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.35e-01 0.0322 0.0949 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 7.18e-01 0.0388 0.107 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.15e-01 0.0228 0.0972 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0364 0.0734 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.61e-01 0.0154 0.0878 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00282 0.0876 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.90e-01 0.144 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.19e-01 0.171 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0351 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 4.00e-02 -0.164 0.0795 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0301 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0795 0.094 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 8.32e-01 0.0256 0.12 0.197 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 2.10e-01 0.158 0.125 0.197 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 1.54e-01 -0.182 0.127 0.197 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0925 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.69e-01 0.108 0.12 0.197 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 4.83e-01 0.0881 0.125 0.197 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0639 0.111 0.197 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 5.27e-01 0.0828 0.13 0.197 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 2.08e-01 -0.157 0.124 0.197 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 1.14e-01 0.173 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00267 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.98e-01 0.0133 0.104 0.187 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.31e-01 -0.13 0.108 0.187 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0262 0.1 0.187 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 6.35e-01 0.058 0.122 0.187 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 3.98e-01 0.068 0.0802 0.186 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0969 0.103 0.186 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.66e-01 -0.017 0.101 0.186 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0557 0.107 0.186 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 3.43e-01 0.098 0.103 0.186 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0864 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 8.65e-01 0.0193 0.114 0.186 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.124 0.186 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 6.35e-01 0.0568 0.119 0.186 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 3.05e-01 -0.115 0.112 0.186 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 5.25e-01 0.0506 0.0793 0.186 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 2.64e-01 -0.141 0.126 0.186 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 3.20e-02 0.21 0.097 0.186 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0446 0.119 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0364 0.0991 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 7.06e-02 0.206 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0931 0.098 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.22e-02 0.199 0.11 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 6.21e-01 0.0382 0.0772 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.89e-02 -0.184 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 8.02e-02 0.163 0.0929 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0395 0.088 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0574 0.11 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0445 0.108 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0368 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.77e-01 0.0893 0.0819 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.71e-01 0.018 0.111 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.35e-01 0.0243 0.0717 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 3.83e-01 0.0796 0.0911 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 1.97e-01 0.13 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.31e-01 0.00809 0.0935 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0635 0.0701 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 8.50e-01 -0.016 0.0845 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0193 0.0747 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 6.38e-01 0.0374 0.0793 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0939 0.0963 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 8.53e-01 -0.017 0.0919 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0988 0.095 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 9.53e-01 0.00548 0.092 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0139 0.0986 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -677318 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0167 0.0566 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 58483 sc-eQTL 3.16e-01 0.103 0.102 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 276198 sc-eQTL 3.50e-01 0.0924 0.0986 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -358390 sc-eQTL 9.24e-01 0.00907 0.0947 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 sc-eQTL 8.03e-01 0.0246 0.0982 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 111952 sc-eQTL 6.10e-01 0.048 0.0939 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -539488 sc-eQTL 8.07e-01 0.0244 0.0995 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -902190 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0236 0.0736 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0091 0.0803 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -539266 sc-eQTL 5.04e-01 0.0776 0.116 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120832 MTERF2 -570929 eQTL 0.225 0.0343 0.0282 0.00289 0.0 0.21
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 eQTL 5.83e-05 -0.07 0.0173 0.0 0.0 0.21

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151135 \N -539488 5.14e-07 3.12e-07 8.55e-08 2.92e-07 1.09e-07 1.5e-07 3.94e-07 8.86e-08 2.66e-07 1.65e-07 3.32e-07 2.11e-07 4.88e-07 9.18e-08 1.12e-07 1.39e-07 1.35e-07 2.9e-07 9.97e-08 8.39e-08 1.65e-07 2.45e-07 2.56e-07 9.63e-08 4.46e-07 2.2e-07 1.74e-07 1.67e-07 2.11e-07 2.89e-07 1.88e-07 8.02e-08 4.98e-08 1.21e-07 1.95e-07 5.32e-08 9.11e-08 6.89e-08 4.9e-08 7.28e-08 2.87e-08 2.91e-07 2.62e-08 2.1e-08 8.45e-08 9.31e-09 9.73e-08 2.75e-09 4.68e-08
ENSG00000166046 TCP11L2 114302 4.74e-06 4.86e-06 8.56e-07 2.84e-06 1.64e-06 1.57e-06 4.56e-06 9.79e-07 4.98e-06 2.39e-06 5.25e-06 3.6e-06 7.53e-06 2.31e-06 1.43e-06 3.58e-06 1.78e-06 3.57e-06 1.43e-06 1.16e-06 2.9e-06 4.79e-06 4.66e-06 1.39e-06 6.86e-06 1.95e-06 2.55e-06 1.79e-06 4.36e-06 4.39e-06 2.73e-06 5.42e-07 5.9e-07 1.66e-06 2.13e-06 9.71e-07 9.81e-07 4.58e-07 8.38e-07 4.57e-07 6.17e-07 5.67e-06 3.65e-07 1.81e-07 5.64e-07 7.78e-07 9.76e-07 4.11e-07 3.4e-07