logo

Genes within 1Mb (chr12:106396835:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0563 0.0719 0.186 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0283 0.104 0.186 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 2.67e-01 -0.092 0.0827 0.186 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 4.88e-01 0.0796 0.115 0.186 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0186 0.0539 0.186 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 9.96e-01 0.000433 0.0807 0.186 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 7.92e-01 0.0171 0.0648 0.186 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0155 0.048 0.186 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 3.88e-01 0.0659 0.0763 0.186 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 2.97e-01 0.0785 0.0751 0.186 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0466 0.0924 0.186 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.82e-02 0.115 0.0648 0.186 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0774 0.0729 0.186 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 9.16e-01 0.00664 0.0627 0.186 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 7.47e-01 0.0214 0.0664 0.186 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 4.00e-01 0.089 0.106 0.186 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 5.36e-01 0.0375 0.0606 0.186 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0125 0.09 0.186 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.36e-01 0.00725 0.0905 0.186 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.72e-01 0.0398 0.0938 0.186 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 9.29e-02 0.0997 0.059 0.186 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0375 0.0774 0.186 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0126 0.0501 0.186 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 1.15e-01 0.083 0.0524 0.186 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0356 0.113 0.186 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 5.91e-01 0.0547 0.102 0.178 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.27e-01 -0.165 0.108 0.178 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 1.89e-01 0.147 0.112 0.178 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00635 0.104 0.178 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 9.09e-01 0.00853 0.0746 0.178 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0998 0.104 0.178 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.83e-01 0.0542 0.0985 0.178 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0154 0.112 0.178 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.01e-02 0.136 0.0749 0.186 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 5.56e-01 0.0534 0.0906 0.186 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0133 0.087 0.186 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0542 0.0649 0.186 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.32e-01 -0.04 0.0835 0.186 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 7.91e-01 -0.02 0.0754 0.186 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0587 0.0564 0.185 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.17e-01 0.159 0.101 0.185 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 3.44e-01 0.0944 0.0996 0.185 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 3.73e-01 0.0841 0.0942 0.185 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.41e-01 0.00724 0.0972 0.185 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 8.89e-01 0.0127 0.0907 0.185 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.27e-01 0.0476 0.0979 0.185 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0408 0.0775 0.185 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 5.70e-01 0.0469 0.0825 0.185 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 2.24e-01 0.143 0.118 0.185 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.07e-01 0.0308 0.0598 0.186 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 4.40e-02 0.225 0.111 0.186 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0162 0.0786 0.186 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0181 0.094 0.186 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 9.28e-01 0.0064 0.0703 0.186 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.93e-01 0.0526 0.0981 0.186 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 8.17e-01 0.0164 0.0706 0.186 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 1.35e-01 -0.129 0.0857 0.186 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 6.50e-01 0.0482 0.106 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 9.29e-01 0.0104 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 4.66e-01 -0.083 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0316 0.115 0.196 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 2.14e-01 0.111 0.0893 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.36e-01 0.0843 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0789 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 2.35e-01 -0.143 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.83e-01 0.044 0.108 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.08e-01 0.19 0.118 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0614 0.105 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.14e-02 0.211 0.112 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.85e-01 -0.024 0.0879 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 1.49e-01 -0.162 0.112 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 5.13e-01 0.0668 0.102 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 3.34e-02 -0.237 0.111 0.188 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 3.91e-01 0.101 0.118 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.94e-01 0.000769 0.111 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 4.58e-01 0.0745 0.1 0.188 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 6.89e-01 0.04 0.0998 0.188 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0165 0.113 0.188 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 3.38e-01 0.0953 0.0992 0.188 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0549 0.0975 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0492 0.11 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.33e-01 0.00902 0.107 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.91e-01 0.00131 0.117 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.00e-01 0.0695 0.0824 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 3.91e-01 0.0997 0.116 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 9.20e-01 0.00812 0.081 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 8.32e-02 -0.206 0.118 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 7.77e-01 -0.034 0.12 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0473 0.107 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00403 0.121 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 1.77e-01 0.14 0.104 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 3.26e-01 -0.119 0.12 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 3.69e-01 0.0798 0.0886 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.61e-02 0.163 0.0916 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00469 0.112 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 1.87e-01 -0.149 0.112 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.04e-01 0.0353 0.0926 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.35e-02 -0.231 0.119 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 2.20e-01 0.115 0.0938 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.91e-01 0.0161 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 3.07e-01 0.103 0.1 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0296 0.0568 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 3.80e-01 0.076 0.0863 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 4.43e-01 0.0628 0.0817 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.46e-01 0.05 0.109 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 2.71e-01 0.0816 0.074 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0425 0.0795 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00423 0.0713 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0148 0.0743 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 7.95e-01 0.0291 0.112 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0438 0.0703 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 4.76e-01 -0.069 0.0967 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 5.74e-01 0.0569 0.101 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00811 0.117 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 1.57e-01 0.101 0.0708 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0502 0.0968 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.01e-01 0.0529 0.0786 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 3.41e-01 0.0746 0.0782 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 5.64e-01 0.0678 0.117 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 1.18e-01 -0.149 0.0951 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 2.10e-01 0.15 0.119 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.94e-01 0.000819 0.11 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 3.84e-01 0.0819 0.0939 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 9.98e-01 0.000224 0.108 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.70e-01 0.035 0.0819 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 2.93e-01 0.0989 0.0939 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.113 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.55e-01 0.0324 0.0722 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.86e-01 -0.144 0.108 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.83e-01 0.00212 0.102 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 7.33e-01 0.0386 0.113 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 2.06e-01 -0.122 0.0965 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 1.04e-01 -0.152 0.0927 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 2.91e-01 0.106 0.1 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 4.06e-01 0.0864 0.104 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 7.56e-01 0.0359 0.115 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 1.76e-01 -0.112 0.0829 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 4.09e-01 0.0835 0.101 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.72e-01 0.0313 0.108 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 2.09e-01 -0.139 0.11 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 1.26e-02 0.223 0.0888 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 4.96e-01 0.0653 0.0959 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.76e-02 -0.136 0.0742 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 1.19e-01 0.125 0.08 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0743 0.113 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.60e-01 0.0305 0.0998 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0414 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0933 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0554 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0496 0.104 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 9.81e-01 0.00284 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 1.39e-01 0.147 0.099 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 3.71e-02 0.207 0.0987 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 3.80e-01 -0.095 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 2.58e-01 0.117 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 2.74e-01 -0.128 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.92e-01 0.0151 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 3.51e-01 0.109 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.55e-02 0.214 0.106 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.48e-01 0.0707 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 7.18e-01 -0.039 0.108 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 6.41e-01 0.0482 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0277 0.0888 0.186 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 2.98e-01 0.117 0.112 0.186 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00865 0.0994 0.186 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0596 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.92e-01 0.0691 0.1 0.186 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 4.98e-01 0.0797 0.117 0.186 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0233 0.0895 0.186 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0723 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 6.08e-01 0.0565 0.11 0.186 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0903 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 2.99e-01 0.119 0.114 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0395 0.1 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.57e-01 0.0386 0.124 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0147 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0154 0.0939 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 9.68e-01 0.0046 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.94e-02 0.193 0.102 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 4.38e-01 0.093 0.12 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 5.96e-01 0.0609 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00652 0.0682 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.35e-01 0.153 0.102 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 6.67e-02 0.183 0.0992 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 3.09e-01 0.104 0.102 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.95e-01 0.0541 0.102 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0763 0.103 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 7.86e-01 0.0289 0.106 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0752 0.085 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0336 0.09 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 7.51e-01 0.0376 0.118 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0662 0.0975 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.80e-02 0.277 0.116 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0576 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0954 0.121 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0671 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.07e-01 0.04 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 7.66e-01 0.0363 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 7.52e-01 0.033 0.104 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 6.64e-01 0.0521 0.12 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 9.67e-01 0.00459 0.112 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0535 0.0801 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 7.87e-01 0.0312 0.115 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0643 0.106 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.40e-01 0.0361 0.109 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.35e-01 0.0691 0.111 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 1.25e-01 0.161 0.105 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 5.45e-01 0.0692 0.114 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.29e-01 0.0404 0.0836 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 9.88e-01 0.0014 0.094 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 2.33e-01 0.139 0.116 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.11e-01 0.0495 0.133 0.185 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0144 0.143 0.185 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.83e-01 0.019 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.62e-01 0.0527 0.12 0.185 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00376 0.0805 0.185 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 8.63e-01 0.0178 0.103 0.185 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0223 0.134 0.185 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 1.14e-01 0.125 0.0788 0.187 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0285 0.115 0.187 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.86e-01 0.0293 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0204 0.0598 0.187 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0683 0.0998 0.187 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.69e-02 0.19 0.0994 0.187 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.63e-03 -0.241 0.0908 0.187 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 7.61e-01 -0.029 0.0955 0.187 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0356 0.0964 0.186 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0427 0.114 0.186 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0376 0.109 0.186 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 9.52e-01 0.00705 0.118 0.186 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.05e-01 -0.032 0.0845 0.186 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.91e-01 0.0436 0.109 0.186 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0524 0.0793 0.186 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0451 0.091 0.186 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 2.40e-01 0.126 0.107 0.186 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.06e-01 -0.176 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.185 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 8.83e-02 0.168 0.0983 0.185 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.41e-01 0.0625 0.0809 0.185 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0176 0.106 0.185 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 5.84e-01 0.0548 0.0998 0.185 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0241 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.28e-01 0.0467 0.0963 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 6.86e-01 0.0441 0.109 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 6.66e-01 0.0427 0.0987 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0296 0.0746 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00092 0.0892 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 9.01e-01 0.0111 0.089 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 2.36e-01 0.133 0.112 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 8.32e-02 0.193 0.111 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0311 0.103 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 6.10e-02 -0.152 0.0809 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0495 0.103 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0893 0.0954 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 8.21e-01 0.0273 0.121 0.194 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.91e-01 0.165 0.126 0.194 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 1.78e-01 -0.173 0.127 0.194 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.19e-01 -0.089 0.137 0.194 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 3.98e-01 0.102 0.12 0.194 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.07e-01 0.0648 0.126 0.194 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0456 0.111 0.194 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 5.53e-01 0.0777 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 1.66e-01 -0.173 0.124 0.194 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 8.97e-02 0.189 0.111 0.182 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 8.07e-01 0.0265 0.109 0.182 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.04e-01 0.0263 0.106 0.182 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 1.89e-01 -0.145 0.11 0.182 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0469 0.102 0.182 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 5.85e-01 0.0678 0.124 0.182 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 4.08e-01 0.0669 0.0806 0.181 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 2.78e-01 -0.113 0.104 0.181 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0192 0.101 0.181 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0595 0.108 0.181 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 4.96e-01 0.0707 0.104 0.181 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 2.60e-01 -0.119 0.105 0.181 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 9.56e-01 0.00638 0.115 0.181 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 9.12e-01 0.0138 0.125 0.181 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 6.68e-01 0.0519 0.121 0.181 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 1.71e-01 -0.155 0.112 0.181 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 5.68e-01 0.0459 0.0802 0.181 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 3.93e-01 -0.109 0.128 0.181 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 7.95e-02 0.174 0.0985 0.181 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0494 0.12 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0351 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 8.21e-02 0.202 0.115 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0744 0.0997 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 6.35e-02 0.209 0.112 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 7.61e-01 0.0239 0.0785 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 1.85e-01 -0.146 0.11 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 9.18e-02 0.16 0.0944 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0432 0.0893 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 3.11e-01 -0.113 0.112 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0757 0.109 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 5.10e-01 -0.079 0.12 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 2.75e-01 0.0909 0.0832 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0146 0.113 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 7.66e-01 0.0217 0.0728 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 3.32e-01 0.0899 0.0925 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.75e-01 0.0271 0.0949 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0536 0.0712 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0367 0.0858 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0157 0.0759 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 4.53e-01 0.0605 0.0805 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 3.05e-01 -0.101 0.0978 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00506 0.0934 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 2.42e-01 -0.113 0.0964 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0935 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0203 0.1 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -696714 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0279 0.0573 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 39087 sc-eQTL 1.94e-01 0.135 0.104 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 256802 sc-eQTL 5.04e-01 0.067 0.1 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -377786 sc-eQTL 7.31e-01 0.0331 0.096 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 sc-eQTL 8.28e-01 0.0217 0.0996 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 92556 sc-eQTL 6.02e-01 0.0497 0.0952 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -558884 sc-eQTL 6.88e-01 0.0405 0.101 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -921586 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0212 0.0746 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00598 0.0814 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -558662 sc-eQTL 4.19e-01 0.0951 0.118 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120832 MTERF2 -590325 eQTL 0.307 0.0291 0.0285 0.00276 0.0 0.201
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 eQTL 5.98e-05 -0.0707 0.0175 0.0 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 94906 1.09e-05 1.46e-05 3.08e-06 9.47e-06 2.4e-06 6.19e-06 1.75e-05 2.48e-06 1.44e-05 7.19e-06 1.59e-05 6.79e-06 1.96e-05 4.65e-06 4.27e-06 8.94e-06 6.9e-06 1.11e-05 4.15e-06 4.08e-06 8.07e-06 1.28e-05 1.13e-05 4.81e-06 1.9e-05 4.94e-06 7.68e-06 5.97e-06 1.41e-05 1.14e-05 8.17e-06 1.03e-06 1.52e-06 3.69e-06 6.01e-06 3.74e-06 1.91e-06 2.73e-06 2.17e-06 1.92e-06 1.14e-06 1.54e-05 2.6e-06 2.73e-07 1.97e-06 2.08e-06 3.11e-06 8.27e-07 9.67e-07