Genes within 1Mb (chr12:106356025:CA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0206 0.123 0.058 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.88e-01 0.048 0.178 0.058 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 3.84e-01 0.124 0.141 0.058 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 7.56e-01 -0.061 0.196 0.058 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.18e-01 0.144 0.0916 0.058 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.82e-01 0.121 0.138 0.058 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.02e-03 0.359 0.108 0.058 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 4.78e-01 0.058 0.0815 0.058 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 9.99e-01 0.000241 0.13 0.058 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00937 0.128 0.058 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 9.60e-02 0.261 0.156 0.058 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.058 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 9.20e-02 0.209 0.124 0.058 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0963 0.106 0.058 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 5.39e-01 0.0694 0.113 0.058 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 7.66e-01 0.0537 0.18 0.058 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 2.38e-01 -0.121 0.102 0.058 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0219 0.152 0.058 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 4.21e-01 -0.123 0.153 0.058 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0508 0.159 0.058 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.54e-01 -0.115 0.1 0.058 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 8.61e-01 0.023 0.131 0.058 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0513 0.0846 0.058 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.44e-01 0.13 0.0888 0.058 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 8.86e-02 0.325 0.19 0.058 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.37e-01 0.0774 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0569 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.12e-01 -0.225 0.18 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 3.48e-01 -0.158 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 8.38e-02 -0.207 0.119 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 8.77e-01 0.0261 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 8.31e-01 0.0339 0.159 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 3.46e-01 0.17 0.18 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0744 0.13 0.058 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 3.63e-01 0.142 0.156 0.058 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 3.37e-01 0.144 0.15 0.058 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.85e-01 0.0307 0.112 0.058 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.53e-02 0.347 0.142 0.058 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.89e-01 0.138 0.13 0.058 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.37e-01 0.0193 0.0936 0.058 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 4.16e-01 0.136 0.167 0.058 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 6.12e-02 -0.308 0.164 0.058 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.97e-01 0.000655 0.156 0.058 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 7.14e-01 -0.059 0.161 0.058 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 9.46e-01 0.0102 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 2.82e-01 0.174 0.162 0.058 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.70e-01 0.176 0.128 0.058 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.16e-01 0.215 0.136 0.058 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 8.71e-01 0.0318 0.195 0.058 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0473 0.102 0.058 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 1.89e-01 -0.25 0.19 0.058 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.78e-01 0.145 0.133 0.058 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 5.58e-01 0.0937 0.16 0.058 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 4.51e-02 -0.238 0.118 0.058 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.10e-01 0.169 0.166 0.058 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0975 0.12 0.058 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0574 0.146 0.058 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 4.59e-01 -0.134 0.18 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 7.18e-02 0.342 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.44e-01 0.037 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 4.51e-01 0.143 0.19 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0604 0.148 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0353 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.73e-01 -0.177 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0112 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 1.58e-01 -0.254 0.179 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 5.46e-01 0.12 0.199 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 3.09e-01 0.18 0.176 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 2.00e-01 0.243 0.189 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 3.25e-01 0.145 0.147 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.52e-02 0.396 0.187 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.32e-01 0.205 0.171 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 3.15e-01 0.189 0.188 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 1.86e-01 -0.263 0.198 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00427 0.187 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 4.22e-01 -0.136 0.169 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.36e-01 -0.25 0.167 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 2.04e-01 -0.242 0.19 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.27e-02 0.415 0.165 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0227 0.162 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.43e-01 -0.213 0.182 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.31e-01 0.269 0.177 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0957 0.195 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 3.84e-01 0.12 0.137 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 7.92e-01 0.0511 0.193 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 6.06e-03 0.367 0.133 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0839 0.195 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 4.00e-01 0.165 0.196 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.50e-01 0.0109 0.175 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 5.75e-01 -0.111 0.198 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.67e-01 0.235 0.17 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 9.27e-01 0.0182 0.198 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.75e-02 0.319 0.144 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.60e-01 0.0678 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.32e-01 0.223 0.186 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 5.13e-01 0.129 0.197 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 2.15e-01 0.233 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0912 0.154 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.47e-01 0.188 0.2 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0408 0.157 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 4.26e-01 0.156 0.195 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 2.17e-02 -0.383 0.166 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 1.97e-01 0.123 0.095 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0446 0.145 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0173 0.137 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 4.22e-01 0.146 0.182 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.60e-01 -0.14 0.124 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 4.01e-01 0.112 0.133 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0992 0.119 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 5.11e-01 0.082 0.125 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 7.26e-01 0.0661 0.188 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0246 0.119 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 9.85e-01 0.00315 0.164 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 6.84e-02 -0.311 0.17 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 5.55e-01 0.117 0.197 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 5.26e-01 0.104 0.164 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0715 0.133 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00088 0.133 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 1.63e-01 0.277 0.198 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.90e-01 0.0222 0.16 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0185 0.201 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 7.49e-01 0.0587 0.184 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 1.35e-02 0.482 0.193 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0438 0.157 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0486 0.181 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0904 0.137 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 6.12e-01 0.0799 0.157 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 7.16e-01 -0.069 0.19 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0613 0.121 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0598 0.182 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.25e-01 -0.208 0.171 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 3.39e-01 -0.181 0.189 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 3.78e-01 -0.143 0.162 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 6.69e-01 0.067 0.157 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 3.96e-01 -0.143 0.168 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.42e-01 0.256 0.174 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0904 0.193 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 4.15e-01 -0.116 0.142 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0109 0.173 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0233 0.185 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 4.75e-01 0.135 0.189 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0158 0.154 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0932 0.164 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.18e-01 0.083 0.128 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 3.24e-01 0.136 0.138 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 1.06e-01 0.313 0.193 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 4.08e-01 -0.138 0.167 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.94e-01 0.209 0.198 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 6.62e-01 0.0837 0.191 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 6.56e-01 0.0856 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.04e-01 -0.22 0.173 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 3.23e-01 0.196 0.198 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 8.42e-02 0.288 0.166 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 7.95e-01 0.0435 0.167 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 2.55e-01 0.206 0.181 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 5.67e-01 0.102 0.178 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.95e-01 0.211 0.201 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.47e-01 0.0127 0.193 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 8.39e-01 -0.041 0.202 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.96e-01 -0.194 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 6.95e-01 0.0797 0.203 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0857 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 5.53e-01 -0.115 0.193 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 1.94e-01 0.232 0.178 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 3.02e-01 0.153 0.148 0.058 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 1.33e-01 -0.28 0.186 0.058 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.60e-01 0.00839 0.166 0.058 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 7.83e-01 0.0499 0.181 0.058 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.22e-01 -0.259 0.166 0.058 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0718 0.196 0.058 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 4.37e-01 -0.116 0.149 0.058 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 7.69e-01 0.0501 0.17 0.058 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 4.72e-01 -0.132 0.183 0.058 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 3.08e-01 0.147 0.144 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.63e-01 0.0317 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 1.95e-01 -0.207 0.159 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 8.39e-01 0.0402 0.198 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 4.16e-01 -0.151 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.18e-01 0.0541 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 9.35e-01 0.0151 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.61e-01 -0.229 0.163 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 7.41e-01 0.0631 0.191 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 8.93e-01 0.0246 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 3.81e-01 0.0987 0.112 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 4.42e-01 0.13 0.169 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0664 0.165 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 5.69e-01 0.0965 0.169 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 8.13e-01 0.0398 0.168 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0207 0.17 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 5.67e-01 0.1 0.175 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 2.99e-01 0.146 0.14 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 9.32e-02 0.249 0.148 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0406 0.196 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00241 0.161 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.60e-01 0.0595 0.195 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 6.07e-01 0.0978 0.19 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.22e-01 0.308 0.198 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 6.92e-01 0.0801 0.202 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0232 0.175 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 6.15e-01 0.101 0.201 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 9.26e-01 -0.016 0.172 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.49e-02 0.478 0.195 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 7.40e-01 0.0615 0.185 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0274 0.131 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.51e-01 0.215 0.187 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 4.04e-03 -0.494 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.34e-01 -0.212 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 5.54e-01 0.108 0.182 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 4.20e-01 0.139 0.171 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 2.20e-01 0.229 0.186 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 7.85e-02 0.24 0.136 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 3.24e-01 0.151 0.153 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 9.47e-01 0.0128 0.191 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 5.24e-01 -0.143 0.224 0.056 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 3.69e-01 0.217 0.241 0.056 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.71e-01 -0.237 0.214 0.056 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 3.10e-01 -0.206 0.202 0.056 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 8.08e-01 -0.033 0.136 0.056 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 8.91e-01 0.0237 0.173 0.056 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 9.48e-01 0.0148 0.226 0.056 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.53e-01 0.0247 0.133 0.059 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 6.92e-01 0.0762 0.192 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 5.51e-01 -0.108 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 4.58e-01 -0.135 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.31e-01 -0.152 0.1 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 5.83e-01 0.0923 0.168 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.05e-01 -0.273 0.167 0.059 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 7.04e-01 -0.059 0.155 0.059 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 5.00e-01 -0.108 0.16 0.059 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.43e-02 0.28 0.162 0.058 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 1.96e-01 0.25 0.192 0.058 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 3.60e-01 0.169 0.184 0.058 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 1.71e-01 0.273 0.199 0.058 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.94e-01 0.185 0.142 0.058 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 2.60e-01 0.208 0.184 0.058 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.33e-01 0.0836 0.134 0.058 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 8.52e-01 0.0287 0.154 0.058 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 9.30e-01 0.016 0.181 0.058 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 4.14e-01 -0.151 0.184 0.063 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 6.52e-01 -0.08 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.39e-01 -0.277 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 3.37e-01 -0.155 0.161 0.063 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0404 0.132 0.063 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0943 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 6.06e-01 0.084 0.163 0.063 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 4.86e-01 0.137 0.196 0.063 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.70e-01 0.0701 0.164 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0564 0.186 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 4.86e-02 0.331 0.167 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 5.99e-01 0.067 0.127 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 9.00e-02 0.257 0.151 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 1.08e-01 0.243 0.151 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 2.87e-01 -0.203 0.19 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0188 0.19 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.86e-01 -0.233 0.175 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 1.44e-01 0.203 0.138 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.63e-01 0.102 0.175 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0122 0.163 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 9.84e-01 0.00421 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0493 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.78e-02 0.513 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 7.19e-01 0.0843 0.234 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0531 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 8.57e-01 0.0386 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 5.98e-01 -0.1 0.189 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 8.25e-01 0.0493 0.223 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00278 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 6.49e-03 -0.508 0.185 0.058 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 1.32e-01 0.274 0.182 0.058 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 9.33e-01 0.0151 0.179 0.058 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 5.49e-01 -0.112 0.186 0.058 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 4.94e-01 0.118 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.77e-01 0.227 0.208 0.058 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0449 0.133 0.061 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.43e-01 0.034 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.98e-02 0.385 0.164 0.061 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 2.94e-01 -0.186 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.58e-01 0.241 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.34e-01 0.207 0.173 0.061 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0384 0.187 0.062 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 2.63e-01 0.228 0.203 0.062 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 1.43e-01 -0.288 0.196 0.062 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0325 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 5.37e-02 -0.251 0.129 0.062 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0886 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 4.43e-01 -0.125 0.162 0.062 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 8.11e-01 0.047 0.197 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0608 0.172 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0356 0.199 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 4.59e-01 0.126 0.17 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 6.97e-01 0.0754 0.193 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 9.76e-01 0.00404 0.134 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 6.88e-01 0.0757 0.189 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 5.12e-02 0.316 0.161 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0109 0.148 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0409 0.186 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 2.93e-01 0.191 0.182 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 3.36e-01 -0.192 0.199 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.138 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 7.48e-01 0.0604 0.188 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 8.53e-03 0.316 0.119 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00158 0.16 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 7.68e-01 0.0524 0.177 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 4.99e-01 0.111 0.164 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 7.81e-02 0.261 0.147 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 4.37e-01 0.102 0.131 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 1.86e-01 -0.178 0.134 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 3.51e-01 0.153 0.164 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 3.65e-01 0.142 0.156 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0954 0.162 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 7.29e-02 0.28 0.155 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 2.05e-01 0.213 0.167 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -737524 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00749 0.0951 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -1723 sc-eQTL 4.62e-01 0.127 0.172 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 215992 sc-eQTL 1.14e-01 -0.262 0.165 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -418596 sc-eQTL 8.36e-01 0.033 0.159 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -631135 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0401 0.165 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 51746 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0468 0.158 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -599694 sc-eQTL 1.96e-01 0.216 0.167 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 sc-eQTL 1.43e-01 0.181 0.123 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 54096 sc-eQTL 5.65e-02 0.257 0.134 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -599472 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0126 0.195 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -737524 eQTL 0.0198 -0.0791 0.0339 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000136026 CKAP4 51746 pQTL 0.0332 -0.0628 0.0295 0.0 0.0 0.0506
ENSG00000151136 BTBD11 -962396 eQTL 0.0241 0.122 0.0539 0.0 0.0 0.0491


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N 215992 7.08e-06 4.88e-06 8.36e-07 3.42e-06 4.71e-07 1.66e-06 3.33e-06 3.9e-07 5.14e-06 1.15e-06 7.9e-06 3.18e-06 7.38e-06 2.18e-06 1.16e-06 1.98e-06 1.26e-06 2.03e-06 1.33e-06 6.52e-07 1.39e-06 4.97e-06 4.55e-06 9.61e-07 5.39e-06 1.02e-06 1.23e-06 1.78e-06 4.15e-06 3e-06 2.89e-06 4.58e-08 2.77e-07 6.15e-07 1.45e-06 5.62e-07 6.93e-07 3.43e-07 4.96e-07 1.17e-07 1.21e-07 1.17e-05 4.01e-07 8.04e-08 1.84e-07 3.14e-07 2.3e-07 1.26e-08 6.26e-08