Genes within 1Mb (chr12:106354287:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0355 0.126 0.056 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.25e-01 0.0405 0.183 0.056 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.145 0.056 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0529 0.201 0.056 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0939 0.056 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 4.05e-01 0.118 0.141 0.056 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.06e-03 0.367 0.111 0.056 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.35e-01 0.052 0.0837 0.056 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00506 0.133 0.056 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.35e-01 0.0445 0.131 0.056 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.24e-02 0.289 0.16 0.056 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 1.47e-01 -0.165 0.113 0.056 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 1.08e-01 0.205 0.127 0.056 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0961 0.109 0.056 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.54e-01 0.0869 0.116 0.056 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 7.06e-01 0.0697 0.185 0.056 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.24e-01 -0.103 0.105 0.056 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0865 0.155 0.056 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 2.93e-01 -0.164 0.156 0.056 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0328 0.162 0.056 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.102 0.056 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.90e-01 0.0186 0.134 0.056 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0937 0.0863 0.056 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.25e-01 0.14 0.0906 0.056 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 1.57e-01 0.277 0.195 0.056 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.80e-01 0.0928 0.167 0.059 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0363 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 2.75e-01 -0.202 0.184 0.059 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 3.14e-01 -0.173 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 3.13e-02 -0.263 0.121 0.059 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 9.96e-01 0.000789 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0477 0.162 0.059 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 2.60e-01 0.208 0.184 0.059 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0506 0.133 0.056 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 5.32e-01 0.0996 0.159 0.056 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 4.84e-01 0.107 0.153 0.056 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0121 0.114 0.056 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 3.68e-02 0.305 0.145 0.056 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.04e-01 0.136 0.132 0.056 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.23e-01 0.0214 0.0953 0.056 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 4.11e-01 0.141 0.171 0.056 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 9.76e-02 -0.278 0.167 0.056 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 9.71e-01 0.00575 0.159 0.056 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0759 0.164 0.056 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0344 0.153 0.056 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 3.68e-01 0.149 0.165 0.056 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 9.86e-02 0.215 0.13 0.056 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.23e-01 0.214 0.138 0.056 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 9.04e-01 0.0241 0.199 0.056 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0533 0.104 0.056 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.40e-01 -0.229 0.194 0.056 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 3.17e-01 0.137 0.136 0.056 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.03e-01 0.085 0.163 0.056 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.06e-02 -0.249 0.121 0.056 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 3.11e-01 0.173 0.17 0.056 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0828 0.123 0.056 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0658 0.15 0.056 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 3.73e-01 -0.164 0.184 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.96e-02 0.32 0.193 0.064 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.71e-01 0.0311 0.191 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 4.96e-01 0.132 0.194 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0469 0.151 0.064 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0844 0.182 0.064 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 5.03e-01 -0.136 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0381 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 1.20e-01 -0.286 0.183 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 4.74e-01 0.146 0.203 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 3.39e-01 0.173 0.18 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 2.90e-01 0.205 0.193 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 3.31e-01 0.146 0.15 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 5.09e-02 0.375 0.191 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 2.33e-01 0.209 0.174 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.73e-01 0.171 0.192 0.056 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 1.47e-01 -0.294 0.202 0.056 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0544 0.191 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 4.19e-01 -0.139 0.172 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.03e-01 -0.218 0.171 0.056 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 1.70e-01 -0.267 0.194 0.056 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.10e-02 0.432 0.168 0.056 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0488 0.166 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 3.03e-01 -0.192 0.186 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.48e-01 0.263 0.181 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.78e-01 -0.083 0.2 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.33e-01 0.11 0.14 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.45e-01 0.0387 0.198 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.98e-03 0.358 0.136 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.18e-01 -0.129 0.199 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 3.25e-01 0.197 0.2 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 9.64e-01 0.0081 0.178 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 5.43e-01 -0.123 0.202 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 1.89e-01 0.228 0.173 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.83e-01 0.0298 0.202 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 2.81e-02 0.324 0.147 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.87e-01 0.0855 0.157 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.10e-01 0.24 0.19 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.15e-01 0.0735 0.201 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 3.20e-01 0.191 0.192 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0462 0.158 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 2.52e-01 0.234 0.204 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 9.79e-01 0.00429 0.16 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.48e-01 0.151 0.199 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 4.22e-02 -0.347 0.169 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 2.55e-01 0.112 0.0977 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0462 0.149 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 8.76e-01 0.022 0.141 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 3.46e-01 0.177 0.187 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.09e-01 -0.161 0.127 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 4.40e-01 0.106 0.137 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 3.78e-01 -0.108 0.123 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.89e-01 0.11 0.128 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 6.74e-01 0.0814 0.193 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0222 0.122 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0196 0.168 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.19e-01 -0.273 0.174 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 5.12e-01 0.132 0.202 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.123 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 5.66e-01 0.0963 0.168 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0445 0.136 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 9.85e-01 0.00253 0.136 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 1.84e-01 0.27 0.203 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.31e-01 0.0141 0.163 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 7.28e-01 0.0712 0.205 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 5.40e-01 0.115 0.187 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 1.05e-02 0.509 0.197 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.93e-01 -0.11 0.16 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0177 0.184 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0886 0.14 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.99e-01 0.109 0.161 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0433 0.193 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0563 0.124 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0708 0.186 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.66e-01 -0.242 0.174 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 4.26e-01 -0.154 0.193 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.06e-01 -0.138 0.166 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.23e-01 0.0358 0.16 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 3.05e-01 -0.177 0.172 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.15e-02 0.309 0.177 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0875 0.197 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0792 0.146 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 4.77e-01 -0.126 0.177 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0643 0.189 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 5.61e-01 0.113 0.193 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0382 0.158 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 4.71e-01 -0.121 0.168 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 6.59e-01 0.058 0.131 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 2.93e-01 0.148 0.141 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 2.81e-01 0.214 0.198 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0977 0.17 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 3.37e-01 0.195 0.202 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 6.49e-01 0.0886 0.195 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 9.55e-01 0.0112 0.196 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.70e-01 -0.195 0.176 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 3.25e-01 0.199 0.201 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 2.11e-01 0.213 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.55e-01 0.0312 0.171 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 2.33e-01 0.22 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 6.35e-01 0.0864 0.182 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.07e-01 0.26 0.205 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00468 0.197 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0373 0.207 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.29e-01 -0.15 0.189 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 4.71e-01 0.15 0.207 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 4.12e-01 -0.156 0.19 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.62e-01 -0.145 0.197 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 1.19e-01 0.284 0.181 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.90e-01 0.13 0.151 0.056 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.46e-01 -0.222 0.191 0.056 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 9.25e-01 0.0159 0.17 0.056 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 8.27e-01 0.0405 0.185 0.056 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 8.74e-02 -0.292 0.17 0.056 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0535 0.201 0.056 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0549 0.153 0.056 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 7.83e-01 0.0481 0.175 0.056 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 3.68e-01 -0.169 0.188 0.056 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.20e-01 0.147 0.148 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0122 0.187 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 2.69e-01 -0.181 0.163 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.03e-01 0.0775 0.203 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.51e-01 -0.086 0.19 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 6.50e-01 0.0695 0.153 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00341 0.19 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 2.17e-01 -0.207 0.167 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.12e-01 0.0465 0.195 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 7.21e-01 0.067 0.187 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 4.22e-01 0.0921 0.115 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 5.35e-01 0.107 0.172 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0485 0.168 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 6.68e-01 0.0739 0.172 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 9.38e-01 0.0133 0.171 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0554 0.173 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.04e-01 0.0444 0.179 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 1.78e-01 0.193 0.143 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 6.25e-02 0.282 0.15 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0628 0.199 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.39e-01 0.0335 0.164 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 7.14e-01 0.0728 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 5.23e-01 0.124 0.194 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.56e-01 0.288 0.202 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.06e-01 0.0778 0.206 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 9.26e-01 0.0167 0.179 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.62e-01 0.0356 0.205 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 8.96e-01 0.0229 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.51e-02 0.486 0.198 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 5.87e-01 0.102 0.188 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0132 0.133 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 1.56e-01 0.271 0.191 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 1.22e-02 -0.441 0.174 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 4.68e-01 -0.132 0.181 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.48e-01 0.0848 0.185 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 5.25e-01 0.111 0.175 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 2.06e-01 0.241 0.19 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 8.11e-02 0.243 0.138 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.18e-01 0.156 0.156 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 9.17e-01 0.0203 0.194 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 4.78e-01 -0.165 0.232 0.052 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 4.34e-01 0.196 0.25 0.052 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 3.58e-01 -0.206 0.223 0.052 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 2.91e-01 -0.222 0.209 0.052 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0999 0.14 0.052 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 7.34e-01 0.0612 0.18 0.052 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 9.98e-01 0.00048 0.235 0.052 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.82e-01 0.0203 0.136 0.057 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 6.83e-01 0.0803 0.196 0.057 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 5.19e-01 -0.12 0.185 0.057 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 3.83e-01 -0.162 0.185 0.057 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 1.09e-01 -0.164 0.102 0.057 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 5.62e-01 0.0997 0.171 0.057 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 9.89e-02 -0.283 0.171 0.057 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0613 0.158 0.057 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 4.12e-01 -0.134 0.164 0.057 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.43e-02 0.277 0.165 0.056 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 1.95e-01 0.255 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 4.94e-01 0.129 0.188 0.056 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 2.41e-01 0.238 0.203 0.056 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.056 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 2.04e-01 0.239 0.188 0.056 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 6.93e-01 0.0541 0.137 0.056 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.66e-01 0.0264 0.157 0.056 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 8.91e-01 0.0253 0.185 0.056 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 4.24e-01 -0.15 0.188 0.061 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0603 0.181 0.061 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.85e-01 -0.254 0.19 0.061 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 2.22e-01 -0.201 0.164 0.061 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 5.47e-01 -0.081 0.134 0.061 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0645 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 9.22e-01 0.0162 0.166 0.061 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.86e-01 0.174 0.2 0.061 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 6.13e-01 0.085 0.168 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 5.56e-01 -0.112 0.189 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.31e-01 0.259 0.171 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 8.49e-01 0.0248 0.13 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 1.46e-01 0.226 0.155 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.59e-01 0.218 0.154 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.22e-01 -0.193 0.195 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0297 0.195 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.57e-01 -0.254 0.179 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.17e-01 0.176 0.142 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 7.09e-01 0.067 0.179 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00143 0.167 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.84e-01 0.00421 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0493 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.78e-02 0.513 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.19e-01 0.0843 0.234 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0531 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 8.57e-01 0.0386 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 5.98e-01 -0.1 0.189 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.25e-01 0.0493 0.223 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00278 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.00e-03 -0.506 0.189 0.056 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 1.06e-01 0.301 0.185 0.056 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 8.04e-01 0.0453 0.182 0.056 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 3.04e-01 -0.195 0.19 0.056 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 5.96e-01 0.0931 0.175 0.056 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.57e-01 0.197 0.213 0.056 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0261 0.133 0.059 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.09e-01 0.0414 0.171 0.059 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.52e-02 0.401 0.164 0.059 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 3.28e-01 -0.174 0.177 0.059 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 1.97e-01 0.22 0.17 0.059 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 3.58e-01 0.16 0.174 0.059 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0384 0.187 0.062 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.63e-01 0.228 0.203 0.062 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 1.43e-01 -0.288 0.196 0.062 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0325 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 5.37e-02 -0.251 0.129 0.062 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0886 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 4.43e-01 -0.125 0.162 0.062 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 8.11e-01 0.047 0.197 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 5.61e-01 -0.102 0.176 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0333 0.203 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 6.06e-01 0.0898 0.174 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 7.78e-01 0.0555 0.197 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 9.18e-01 0.0141 0.137 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 7.41e-01 0.0637 0.192 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 5.18e-02 0.322 0.164 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0483 0.152 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 9.94e-01 -0.0015 0.19 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 3.03e-01 0.192 0.186 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 3.55e-01 -0.189 0.203 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 4.61e-01 0.104 0.142 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 7.61e-01 0.0585 0.192 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 1.19e-02 0.309 0.122 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 8.91e-01 0.0224 0.163 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 9.80e-01 0.00455 0.181 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.19e-01 0.0603 0.167 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 6.11e-01 0.064 0.126 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 1.59e-01 0.213 0.151 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.20e-01 0.108 0.133 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 3.24e-01 -0.136 0.138 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 2.83e-01 0.18 0.167 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 2.87e-01 0.17 0.159 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 2.45e-01 -0.192 0.165 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 9.61e-02 0.266 0.159 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 2.57e-01 0.194 0.171 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -739262 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0106 0.0968 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -3461 sc-eQTL 4.58e-01 0.131 0.176 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 214254 sc-eQTL 1.88e-01 -0.223 0.168 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -420334 sc-eQTL 7.19e-01 0.0583 0.162 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -632873 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0677 0.168 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 50008 sc-eQTL 5.24e-01 -0.103 0.161 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -601432 sc-eQTL 2.59e-01 0.192 0.17 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 sc-eQTL 1.01e-01 0.206 0.125 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 52358 sc-eQTL 4.31e-02 0.277 0.136 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -601210 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0178 0.199 0.056 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -739262 eQTL 0.00648 -0.0907 0.0332 0.0 0.0 0.051
ENSG00000136026 CKAP4 50008 pQTL 0.0237 -0.066 0.0292 0.0 0.0 0.0517
ENSG00000151136 BTBD11 -964134 eQTL 0.0469 0.105 0.0529 0.0 0.0 0.051


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N 214254 2.28e-06 2.44e-06 6.05e-07 1.8e-06 6.85e-07 8.27e-07 1.82e-06 9.75e-07 2.38e-06 1.28e-06 2.53e-06 1.69e-06 3.43e-06 1.38e-06 9.32e-07 2.08e-06 1.49e-06 2.31e-06 1.53e-06 1.2e-06 1.64e-06 3.2e-06 2.64e-06 1.56e-06 3.5e-06 1.24e-06 1.51e-06 1.8e-06 2.56e-06 1.81e-06 1.75e-06 5.6e-07 5.81e-07 1.59e-06 1.27e-06 9.23e-07 9.14e-07 3.77e-07 1.25e-06 3.46e-07 2.92e-07 3e-06 6.37e-07 2.06e-07 3.13e-07 3.6e-07 8.16e-07 2.11e-07 3.35e-07