logo

Genes within 1Mb (chr12:106302798:T:TG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0944 0.0618 0.267 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.87e-01 0.00143 0.0901 0.267 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0303 0.0717 0.267 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 2.63e-01 -0.111 0.0989 0.267 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0612 0.0464 0.267 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 9.04e-02 -0.118 0.0692 0.267 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.10e-02 -0.141 0.0551 0.267 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0124 0.0407 0.267 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 2.34e-03 -0.196 0.0635 0.267 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0323 0.0639 0.267 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0867 0.0783 0.267 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 3.35e-07 -0.275 0.0521 0.267 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.56e-02 -0.118 0.0616 0.267 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 3.86e-08 0.3 0.0525 0.267 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0315 0.0898 0.267 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.99e-01 8.4e-05 0.0527 0.267 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 7.30e-01 0.027 0.0781 0.267 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 2.74e-01 -0.086 0.0784 0.267 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 8.40e-01 0.0164 0.0815 0.267 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0616 0.0515 0.267 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.36e-01 0.0416 0.0672 0.267 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 5.96e-01 0.0243 0.0458 0.267 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0557 0.0983 0.267 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 7.40e-01 0.0282 0.0848 0.266 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00333 0.0905 0.266 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 2.49e-01 -0.108 0.0933 0.266 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 9.95e-01 0.000539 0.087 0.266 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0742 0.062 0.266 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0767 0.0866 0.266 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0488 0.0934 0.266 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0151 0.0646 0.267 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0771 0.267 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 5.46e-01 0.045 0.0744 0.267 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.67e-03 -0.153 0.0546 0.267 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 3.61e-01 0.059 0.0644 0.267 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00418 0.0474 0.268 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00441 0.0849 0.268 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0301 0.0836 0.268 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.65e-02 -0.165 0.0783 0.268 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 6.82e-01 0.0334 0.0814 0.268 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.55e-02 -0.14 0.0754 0.268 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0344 0.082 0.268 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.11e-03 0.223 0.0675 0.268 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0531 0.0988 0.268 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 8.22e-01 0.0116 0.0513 0.267 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 5.96e-01 -0.051 0.0961 0.267 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0327 0.0674 0.267 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 6.37e-01 0.0381 0.0805 0.267 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 7.01e-01 0.0232 0.0602 0.267 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0918 0.0839 0.267 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 6.91e-04 0.248 0.0719 0.267 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 2.91e-01 0.096 0.0908 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00584 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.93e-01 0.04 0.101 0.247 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 8.16e-01 0.024 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0795 0.247 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0162 0.0963 0.247 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 6.39e-01 0.0505 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0411 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0956 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0443 0.106 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 5.08e-01 0.0624 0.0942 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 6.49e-03 -0.273 0.0994 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.38e-01 -0.061 0.0785 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 2.25e-01 -0.122 0.1 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.13e-01 -0.145 0.0908 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 3.05e-01 0.1 0.0974 0.265 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.23e-02 -0.192 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 5.67e-02 -0.184 0.0961 0.265 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.30e-01 -0.055 0.0874 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.59e-01 -0.122 0.0866 0.265 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0531 0.0988 0.265 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0862 0.265 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0351 0.083 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.30e-01 0.0909 0.093 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 9.42e-01 0.00667 0.0911 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 4.96e-01 -0.068 0.0998 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 7.37e-02 -0.125 0.0697 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 2.42e-01 -0.116 0.0986 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.27e-02 -0.123 0.0684 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.47e-01 0.00674 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0746 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.84e-01 -0.12 0.0897 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0874 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0387 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.33e-01 -0.112 0.0746 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0629 0.0784 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.98e-01 0.0371 0.0954 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 7.83e-01 0.0277 0.1 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 1.03e-01 0.156 0.0953 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.85e-01 -0.043 0.0787 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0954 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.45e-02 0.177 0.0987 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 3.38e-01 0.082 0.0853 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 3.97e-01 0.0403 0.0474 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 1.11e-01 -0.115 0.0718 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0227 0.0683 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0562 0.0907 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.49e-06 -0.278 0.059 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0778 0.0663 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 6.62e-08 0.324 0.0579 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0173 0.0938 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.42e-01 0.00437 0.0602 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 2.13e-01 -0.103 0.0826 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00323 0.0866 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 2.28e-02 -0.226 0.0985 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.07e-03 -0.166 0.0598 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 4.88e-03 -0.231 0.0813 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.06e-04 0.245 0.0649 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 7.28e-01 -0.035 0.1 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 4.85e-01 0.0587 0.0839 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.34e-02 -0.223 0.104 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 8.33e-01 0.0203 0.0962 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 1.72e-01 -0.14 0.102 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.53e-03 -0.247 0.0808 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.41e-01 0.058 0.0947 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.89e-03 0.244 0.0809 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 4.13e-01 0.0815 0.0993 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 4.52e-01 0.0465 0.0617 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.96e-02 0.168 0.0923 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0596 0.0873 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0777 0.0965 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.36e-01 0.0392 0.0828 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 1.76e-02 0.188 0.0787 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 6.61e-03 0.24 0.0873 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0615 0.0985 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 3.65e-01 0.0649 0.0715 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 8.81e-02 -0.148 0.0864 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 7.61e-01 0.0282 0.0926 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 6.62e-01 0.0416 0.095 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.74e-01 -0.105 0.0772 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 4.85e-02 -0.162 0.0818 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0566 0.0691 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0105 0.0977 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 5.02e-02 0.17 0.0864 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.42e-01 0.00759 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 2.40e-01 -0.117 0.0993 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 8.77e-01 0.0155 0.1 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.65e-01 0.0521 0.0905 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 1.86e-01 -0.137 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0311 0.0873 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 6.44e-01 0.0438 0.0945 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.19e-01 0.00935 0.0919 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.104 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0468 0.0995 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.42e-01 0.0637 0.104 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0427 0.0958 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 4.46e-01 0.08 0.105 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.77e-01 0.0284 0.0998 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 2.43e-02 -0.207 0.091 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0299 0.0753 0.266 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0638 0.0948 0.266 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 4.46e-02 -0.169 0.0835 0.266 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 4.55e-01 0.0689 0.092 0.266 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0701 0.085 0.266 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 9.53e-02 -0.166 0.099 0.266 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.52e-03 0.26 0.0849 0.266 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0201 0.0933 0.266 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 5.20e-01 0.0486 0.0754 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.32e-01 0.0458 0.0954 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.083 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.103 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.70e-02 -0.184 0.0962 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0374 0.0781 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0964 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 4.28e-02 0.201 0.0987 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 1.82e-01 -0.127 0.0951 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0904 0.0571 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0125 0.0863 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0148 0.0843 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.22e-01 -0.133 0.0859 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 4.02e-01 0.0719 0.0856 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.08e-01 -0.109 0.0863 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.76e-01 -0.05 0.0894 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 5.01e-02 0.148 0.0752 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0252 0.0999 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 4.28e-01 0.0641 0.0808 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0828 0.0977 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0858 0.0952 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.88e-01 0.0403 0.1 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.28e-01 0.0641 0.101 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0519 0.088 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0508 0.101 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 3.67e-02 0.206 0.0981 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 8.86e-01 0.0134 0.0929 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 6.23e-01 0.0328 0.0668 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 5.04e-01 -0.064 0.0957 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 3.09e-01 0.09 0.0883 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.72e-01 -0.124 0.0904 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0266 0.0927 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 8.60e-02 -0.15 0.087 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0884 0.0951 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 3.95e-02 0.161 0.0776 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0417 0.0972 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0143 0.113 0.278 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 2.80e-01 0.131 0.121 0.278 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.59e-01 0.153 0.108 0.278 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0293 0.102 0.278 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0778 0.0679 0.278 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 9.37e-01 0.00689 0.0873 0.278 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.59e-02 0.201 0.112 0.278 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0374 0.0675 0.27 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.07e-01 0.0114 0.0976 0.27 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 2.17e-01 0.113 0.0916 0.27 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.58e-01 -0.054 0.0921 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.57e-01 0.038 0.051 0.27 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0497 0.0851 0.27 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.98e-02 0.138 0.0781 0.27 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 5.17e-01 0.0528 0.0813 0.27 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 1.37e-01 -0.124 0.0831 0.267 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0869 0.099 0.267 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 7.36e-02 0.169 0.0938 0.267 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0176 0.102 0.267 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.76e-02 -0.173 0.0723 0.267 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 9.20e-03 -0.245 0.0934 0.267 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 3.58e-03 0.228 0.0774 0.267 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0967 0.0929 0.267 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 9.29e-01 0.00852 0.0958 0.266 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 5.18e-01 0.0597 0.0921 0.266 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0984 0.0971 0.266 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 9.46e-01 0.00572 0.0838 0.266 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0341 0.0685 0.266 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0446 0.0897 0.266 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.43e-01 0.0335 0.102 0.266 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 5.80e-01 0.0448 0.0808 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 1.10e-01 0.146 0.0908 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.73e-01 0.0738 0.0827 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 7.61e-04 -0.208 0.0609 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.30e-01 0.113 0.0743 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 6.93e-01 0.037 0.0935 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 2.06e-01 -0.118 0.0929 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 4.02e-02 0.176 0.0854 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.38e-03 -0.193 0.0669 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0245 0.0799 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 2.25e-01 0.129 0.106 0.279 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 1.09e-01 -0.178 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 6.07e-01 0.0584 0.113 0.279 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 2.84e-01 -0.13 0.121 0.279 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0691 0.106 0.279 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 1.96e-01 -0.143 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 5.04e-01 0.0773 0.116 0.279 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 2.42e-01 0.129 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 7.61e-01 0.0287 0.0943 0.273 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0804 0.0914 0.273 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.44e-01 -0.131 0.089 0.273 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.093 0.273 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 6.84e-01 0.0426 0.105 0.273 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0882 0.0662 0.271 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 4.61e-02 0.17 0.0848 0.271 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0572 0.083 0.271 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0865 0.0884 0.271 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.30e-01 0.132 0.0866 0.271 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 8.08e-01 0.0256 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 2.14e-01 -0.142 0.114 0.263 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 9.02e-01 0.0136 0.111 0.263 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 5.97e-01 -0.055 0.104 0.263 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0558 0.0735 0.263 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00339 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0775 0.11 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 2.24e-01 -0.107 0.0877 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0662 0.101 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 9.98e-01 0.00023 0.0872 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 2.17e-02 -0.225 0.0975 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 1.13e-01 -0.108 0.0682 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0298 0.0963 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 1.01e-02 -0.212 0.0818 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0237 0.0756 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 9.01e-01 0.0118 0.0948 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0926 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.101 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 5.62e-02 -0.134 0.07 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 2.03e-01 -0.122 0.0953 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.39e-02 -0.138 0.0609 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 4.25e-01 0.0621 0.0777 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 4.16e-01 0.07 0.0859 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 1.71e-01 0.109 0.0794 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 6.99e-04 -0.201 0.0583 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.86e-01 0.068 0.0635 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0342 0.0679 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 1.37e-01 0.123 0.0823 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0697 0.0786 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 2.02e-01 -0.104 0.0813 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 4.49e-01 0.0641 0.0844 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -790751 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00985 0.0481 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -54950 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0355 0.0873 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 162765 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0312 0.084 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -471823 sc-eQTL 4.81e-02 -0.159 0.0798 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -684362 sc-eQTL 4.40e-01 0.0645 0.0834 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -1481 sc-eQTL 8.29e-02 -0.138 0.0793 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -652921 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0584 0.0845 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 869 sc-eQTL 2.52e-03 0.204 0.0668 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -652699 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0681 0.0986 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -54950 0.000241 0.000145 7.58e-06 2.54e-05 7.46e-06 3.58e-05 8.25e-05 7.11e-06 7.46e-05 1.79e-05 8.76e-05 3.22e-05 0.00014 3.52e-05 6.27e-06 5.44e-05 1.44e-05 3.92e-05 1.06e-05 9.83e-06 3.05e-05 0.000116 7.84e-05 1.34e-05 0.000109 1.76e-05 3.58e-05 4.02e-05 7.13e-05 2.35e-05 4.44e-05 1.58e-06 4.67e-06 1.6e-05 1.76e-05 6.44e-06 2.85e-06 3.17e-06 6.44e-06 3.56e-06 2.38e-06 0.000153 1.41e-05 5.83e-07 2.07e-06 6.92e-06 5.47e-06 6.17e-07 1.52e-06
ENSG00000074590 \N 162765 8.53e-05 2.15e-05 1.21e-06 9.77e-06 2.44e-06 5.5e-06 1.98e-05 1.76e-06 1.07e-05 4.04e-06 1.59e-05 5.35e-06 2.38e-05 3.85e-06 1.01e-06 9.16e-06 3.7e-06 9.51e-06 2.61e-06 2.95e-06 8.43e-06 1.47e-05 1.17e-05 3.35e-06 1.75e-05 4.33e-06 5.56e-06 8.02e-06 1.27e-05 7.79e-06 5.58e-06 2.86e-07 1.25e-06 5.09e-06 4.96e-06 2.31e-06 1.06e-06 9.08e-07 1.63e-06 8.68e-07 8.4e-07 5.78e-05 4.47e-06 3.05e-07 3.52e-07 1.71e-06 1.3e-06 4.82e-08 2.87e-07
ENSG00000136026 \N -1481 0.000348 0.000383 4.52e-05 8.66e-05 4.9e-05 0.000108 0.000322 4.3e-05 0.000277 0.000122 0.000352 0.000152 0.000436 0.000135 6.12e-05 0.000215 0.000136 0.000206 6.62e-05 4.93e-05 0.000143 0.000346 0.000274 7.19e-05 0.000358 9.42e-05 0.000156 0.000108 0.000277 0.000102 0.000188 1.44e-05 1.95e-05 5.65e-05 5.69e-05 3.58e-05 1.44e-05 1.54e-05 3.15e-05 1.46e-05 8.07e-06 0.000426 3.89e-05 1.38e-06 2.65e-05 3.92e-05 3.55e-05 1.52e-05 1e-05
ENSG00000166046 \N 869 0.000346 0.000383 4.61e-05 8.66e-05 5.22e-05 0.000109 0.000325 4.43e-05 0.000281 0.000124 0.000359 0.000156 0.00044 0.000135 6.24e-05 0.000218 0.000138 0.000206 6.78e-05 5.18e-05 0.000146 0.000348 0.000276 7.32e-05 0.000358 9.71e-05 0.000159 0.000109 0.000281 0.000107 0.00019 1.47e-05 1.99e-05 5.78e-05 5.73e-05 3.79e-05 1.45e-05 1.56e-05 3.19e-05 1.46e-05 8.37e-06 0.000429 4e-05 1.38e-06 2.79e-05 4.04e-05 3.63e-05 1.51e-05 1.01e-05
ENSG00000260329 \N -652699 2.28e-06 1.08e-06 1.14e-07 1.27e-06 1.81e-07 6.22e-07 1.52e-06 9.91e-08 1.13e-06 3.22e-07 1.5e-06 5.62e-07 2.46e-06 2.57e-07 2.18e-07 9.33e-07 4.87e-07 5.76e-07 5.88e-07 3.42e-07 8.18e-07 1.35e-06 9.97e-07 1.91e-07 1.42e-06 2.48e-07 4.9e-07 5e-07 1.02e-06 9.21e-07 4.48e-07 3.87e-08 1.08e-07 5.53e-07 4.15e-07 1.28e-07 4.68e-07 1.21e-07 3.18e-07 1.98e-08 5.05e-08 4.11e-06 1.26e-06 1.99e-07 3.2e-08 7.64e-08 7.89e-08 3.95e-09 4.69e-08