logo

Genes within 1Mb (chr12:106296934:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0342 0.108 0.077 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.11e-01 0.129 0.157 0.077 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.85e-01 0.165 0.124 0.077 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 7.06e-01 0.0652 0.173 0.077 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 1.78e-02 0.191 0.0801 0.077 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.40e-01 0.116 0.121 0.077 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.65e-03 0.29 0.0955 0.077 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 7.21e-01 0.0258 0.0721 0.077 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.99e-01 0.0445 0.115 0.077 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.40e-01 0.167 0.113 0.077 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 4.01e-01 0.117 0.139 0.077 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 5.82e-01 -0.054 0.0981 0.077 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 5.26e-01 0.0697 0.11 0.077 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 9.45e-01 0.00693 0.0999 0.077 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0578 0.159 0.077 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 2.52e-01 -0.105 0.0911 0.077 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 8.86e-01 0.0195 0.136 0.077 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.15e-01 -0.137 0.136 0.077 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000864 0.141 0.077 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0687 0.0894 0.077 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0837 0.117 0.077 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 3.12e-01 0.0803 0.0793 0.077 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 4.37e-01 0.133 0.17 0.077 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.69e-01 0.00561 0.146 0.081 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 3.55e-01 0.144 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0954 0.161 0.081 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0106 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 6.09e-02 -0.2 0.106 0.081 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0791 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 5.40e-02 0.309 0.159 0.081 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00848 0.114 0.077 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 5.18e-01 0.0883 0.136 0.077 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.27e-01 0.158 0.131 0.077 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0193 0.0979 0.077 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0538 0.114 0.077 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0325 0.0833 0.077 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.19e-01 0.0743 0.149 0.077 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 4.20e-01 -0.119 0.147 0.077 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 5.41e-01 0.0851 0.139 0.077 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 3.61e-01 -0.131 0.143 0.077 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 4.21e-01 0.107 0.133 0.077 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0638 0.144 0.077 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 4.31e-01 0.096 0.122 0.077 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0117 0.174 0.077 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0508 0.0895 0.077 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 3.26e-01 -0.165 0.167 0.077 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 4.31e-01 0.0927 0.118 0.077 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.33e-01 0.0672 0.141 0.077 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 1.70e-01 -0.144 0.105 0.077 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 1.60e-01 0.206 0.146 0.077 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0606 0.129 0.077 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 6.37e-02 -0.294 0.158 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 2.58e-02 0.385 0.171 0.087 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 5.70e-01 0.0974 0.171 0.087 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.02e-01 0.221 0.173 0.087 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 8.87e-01 0.0191 0.135 0.087 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.12e-01 -0.164 0.162 0.087 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0282 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0556 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.81e-01 0.0243 0.162 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.23e-01 0.0879 0.179 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.75e-01 0.173 0.158 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.31e-01 0.0148 0.17 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.72e-01 0.118 0.132 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 4.52e-02 0.338 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.18e-01 0.189 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.76e-01 0.00516 0.169 0.078 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 3.98e-01 -0.151 0.178 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0356 0.168 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 7.87e-01 0.0408 0.151 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0903 0.15 0.078 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 2.15e-01 -0.212 0.17 0.078 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.86e-02 0.327 0.148 0.078 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.22e-01 -0.115 0.143 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 9.94e-01 0.00129 0.161 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 6.02e-02 0.295 0.156 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0699 0.173 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 4.49e-01 0.092 0.121 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 8.63e-01 0.0295 0.171 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.96e-02 0.258 0.118 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0169 0.172 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 5.11e-01 0.114 0.173 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 8.81e-01 -0.023 0.154 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0139 0.175 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 2.48e-01 0.173 0.15 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 7.85e-01 0.0476 0.174 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 8.36e-02 0.221 0.127 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0292 0.14 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.28e-01 0.135 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0624 0.179 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 4.07e-01 0.142 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 5.95e-01 0.0746 0.14 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000971 0.181 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 4.01e-01 0.149 0.177 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 1.53e-01 -0.217 0.151 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.86e-01 0.0587 0.0842 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0595 0.128 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.84e-01 0.161 0.121 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.39e-01 0.0755 0.161 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0503 0.11 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 8.41e-01 0.0237 0.118 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 8.04e-01 0.0273 0.11 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 4.31e-01 -0.131 0.166 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.39e-01 0.00806 0.106 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 7.32e-01 0.0499 0.145 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.13e-01 -0.153 0.152 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 8.40e-01 0.0353 0.175 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0552 0.107 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00537 0.145 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0241 0.118 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 2.50e-01 0.203 0.176 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 5.01e-01 0.0954 0.142 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.52e-01 0.134 0.177 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.40e-01 0.191 0.162 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 1.83e-01 0.231 0.173 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00131 0.139 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.50e-01 -0.149 0.16 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 9.14e-01 0.0151 0.139 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0359 0.168 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0899 0.108 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.84e-01 0.0661 0.162 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.49e-01 -0.176 0.152 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0649 0.169 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.38e-01 -0.139 0.144 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 7.73e-01 0.0403 0.139 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 1.90e-01 0.203 0.155 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0608 0.172 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0821 0.126 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0759 0.153 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0444 0.163 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 5.33e-01 0.104 0.167 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0467 0.136 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 2.23e-01 -0.177 0.145 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 7.80e-01 0.0341 0.122 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 8.37e-01 0.0355 0.172 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.27e-01 0.0323 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 7.55e-02 0.312 0.174 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 7.41e-01 0.0559 0.169 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.45e-01 0.0783 0.17 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0962 0.153 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 7.19e-01 0.063 0.175 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 5.87e-01 0.0804 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 2.84e-01 0.172 0.16 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 6.89e-01 0.064 0.16 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 9.35e-01 0.0149 0.181 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 8.15e-01 0.0407 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0852 0.182 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00487 0.167 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.69e-01 0.164 0.182 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 5.53e-01 -0.103 0.174 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 1.04e-01 0.261 0.159 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.51e-01 0.0248 0.132 0.078 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 1.16e-01 -0.262 0.166 0.078 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 9.90e-01 0.00191 0.148 0.078 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 8.20e-01 0.0368 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.89e-01 -0.129 0.149 0.078 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00223 0.175 0.078 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000729 0.152 0.078 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 1.66e-01 -0.227 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 5.05e-01 0.0874 0.131 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.47e-01 0.126 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0401 0.144 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 6.51e-01 0.0814 0.179 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 4.25e-01 0.134 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 5.92e-02 0.255 0.134 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 4.39e-01 -0.13 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.52e-01 -0.198 0.172 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 8.61e-01 0.0289 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 7.52e-01 0.0316 0.1 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0213 0.15 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 5.61e-01 0.0854 0.147 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.50e-01 0.217 0.15 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 4.57e-01 -0.111 0.149 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0322 0.151 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.95e-01 -0.133 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 1.46e-01 0.192 0.132 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 9.70e-01 0.00663 0.174 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.43e-01 -0.109 0.142 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 9.86e-01 0.00298 0.172 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 8.66e-02 0.287 0.167 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 4.59e-01 0.131 0.176 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 5.92e-01 0.0959 0.179 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.76e-01 0.0242 0.155 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0388 0.178 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.02e-01 0.223 0.174 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 5.60e-01 0.0956 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00419 0.116 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 2.85e-01 0.179 0.167 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 7.78e-02 -0.271 0.153 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0232 0.158 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.99e-01 0.000149 0.162 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 2.03e-01 0.194 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 8.28e-01 0.0361 0.166 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 4.05e-01 0.114 0.136 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 8.09e-01 0.0411 0.17 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 3.57e-01 0.182 0.197 0.078 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.43e-01 0.164 0.213 0.078 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 4.59e-01 0.141 0.19 0.078 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0485 0.179 0.078 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0191 0.12 0.078 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 9.23e-01 0.0148 0.153 0.078 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 3.98e-01 0.169 0.199 0.078 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.078 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 5.32e-01 0.105 0.168 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 4.82e-01 -0.111 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0947 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0894 0.0876 0.078 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.46e-01 0.138 0.146 0.078 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0343 0.135 0.078 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 4.63e-01 -0.103 0.14 0.078 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 1.24e-01 0.221 0.143 0.077 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 2.61e-01 0.192 0.17 0.077 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 5.21e-02 0.315 0.161 0.077 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 3.04e-01 0.181 0.176 0.077 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 1.17e-01 0.197 0.125 0.077 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 7.72e-01 0.0475 0.163 0.077 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.54e-01 -0.155 0.136 0.077 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0127 0.16 0.077 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 2.17e-01 -0.203 0.164 0.085 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 3.07e-01 0.162 0.158 0.085 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.54e-01 -0.191 0.167 0.085 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0779 0.144 0.085 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.085 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0638 0.154 0.085 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 9.62e-02 0.291 0.174 0.085 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 3.07e-01 0.148 0.144 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0304 0.163 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.27e-01 0.225 0.147 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00655 0.112 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 7.95e-01 0.0348 0.133 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 1.68e-01 -0.231 0.167 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 7.02e-01 0.064 0.167 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0472 0.155 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 7.40e-02 0.218 0.121 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 3.40e-01 -0.137 0.143 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 1.35e-01 -0.274 0.182 0.088 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 5.75e-01 0.108 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.92e-01 0.167 0.195 0.088 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 1.33e-01 0.314 0.208 0.088 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0281 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 3.83e-01 0.167 0.191 0.088 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0453 0.199 0.088 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 2.71e-01 -0.209 0.189 0.088 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.74e-02 -0.325 0.163 0.078 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 1.66e-01 0.221 0.159 0.078 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0478 0.156 0.078 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.78e-01 -0.144 0.163 0.078 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 6.54e-01 0.0819 0.183 0.078 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.44e-01 0.0232 0.117 0.079 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 4.58e-01 -0.112 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.46e-02 0.356 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.74e-01 -0.139 0.156 0.079 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 9.63e-01 0.00712 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0553 0.164 0.085 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 1.94e-01 0.232 0.178 0.085 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 1.41e-01 -0.253 0.171 0.085 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.83e-01 0.0661 0.161 0.085 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 2.66e-01 -0.127 0.114 0.085 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 4.30e-01 -0.144 0.182 0.085 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 2.52e-01 0.197 0.171 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.96e-01 0.104 0.153 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 9.71e-01 0.00652 0.176 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.94e-01 0.129 0.151 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00105 0.171 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.56e-01 0.0217 0.119 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 4.30e-01 0.132 0.167 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 1.66e-01 0.2 0.144 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.131 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.18e-01 0.0819 0.164 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 2.31e-01 0.192 0.16 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0851 0.175 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 3.43e-01 0.116 0.122 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 7.40e-01 0.0549 0.165 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 3.60e-02 0.222 0.105 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 8.70e-01 0.0231 0.14 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 6.68e-01 0.0665 0.155 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.63e-01 0.131 0.143 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 6.28e-01 0.0523 0.108 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0597 0.115 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0504 0.118 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 7.00e-01 0.0556 0.144 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 4.18e-01 0.111 0.137 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 2.55e-01 -0.162 0.142 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 4.84e-01 0.103 0.147 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796615 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0594 0.0847 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60814 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0144 0.154 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 156901 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0882 0.148 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477687 sc-eQTL 3.06e-01 0.145 0.141 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690226 sc-eQTL 2.45e-01 -0.171 0.147 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0263 0.141 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658785 sc-eQTL 9.53e-01 0.00884 0.149 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 sc-eQTL 1.09e-01 0.192 0.12 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -658563 sc-eQTL 9.18e-01 -0.018 0.174 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -7345 pQTL 0.00109 -0.0801 0.0245 0.0 0.0 0.0827
ENSG00000166046 TCP11L2 -4995 eQTL 0.289 0.0293 0.0276 0.136 0.0 0.0819

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina