logo

Genes within 1Mb (chr12:106296844:AG:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0618 0.0786 0.135 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 4.15e-01 -0.093 0.114 0.135 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0144 0.0907 0.135 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 9.23e-01 0.0122 0.125 0.135 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 8.37e-02 -0.102 0.0586 0.135 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0711 0.0881 0.135 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 1.42e-01 -0.104 0.0704 0.135 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0567 0.0518 0.135 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.63e-03 -0.247 0.081 0.135 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.57e-01 0.0253 0.0815 0.135 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 9.08e-01 0.0116 0.1 0.135 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.24e-05 -0.294 0.0678 0.135 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 8.33e-02 -0.137 0.0787 0.135 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.05e-06 0.328 0.0683 0.135 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 1.54e-01 -0.163 0.114 0.135 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 2.08e-01 0.0837 0.0663 0.135 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0157 0.0986 0.135 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.89e-01 0.0139 0.0992 0.135 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0442 0.103 0.135 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0775 0.065 0.135 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00371 0.0849 0.135 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.85e-01 0.0503 0.0577 0.135 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0909 0.124 0.135 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.50e-01 0.00665 0.105 0.137 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.137 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.52e-01 -0.133 0.116 0.137 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000149 0.108 0.137 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0839 0.0769 0.137 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0487 0.108 0.137 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0678 0.116 0.137 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 7.36e-01 0.0273 0.0809 0.135 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0639 0.0971 0.135 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.28e-02 0.212 0.0922 0.135 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.43e-02 -0.17 0.0687 0.135 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.38e-01 0.0954 0.0806 0.135 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.99e-01 0.00781 0.0615 0.135 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0138 0.11 0.135 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00353 0.109 0.135 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 3.15e-03 -0.3 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 8.22e-01 0.0238 0.106 0.135 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 6.21e-02 -0.184 0.0979 0.135 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0487 0.106 0.135 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.82e-04 0.322 0.0871 0.135 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 6.01e-01 0.0672 0.128 0.135 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 5.37e-01 0.0397 0.0642 0.135 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0915 0.12 0.135 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 4.98e-02 -0.165 0.0836 0.135 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 1.26e-01 0.154 0.1 0.135 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0223 0.0754 0.135 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0291 0.105 0.135 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 6.74e-03 0.249 0.0909 0.135 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 1.84e-01 0.151 0.114 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0218 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.69e-01 0.146 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 4.38e-01 -0.104 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0653 0.104 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0992 0.125 0.122 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0104 0.14 0.122 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 8.19e-01 0.0321 0.14 0.122 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 3.26e-01 -0.116 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 5.46e-01 -0.079 0.131 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.08e-01 0.0434 0.116 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0871 0.124 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0743 0.0966 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0979 0.124 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0818 0.112 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.59e-01 0.0907 0.122 0.134 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 1.68e-01 -0.178 0.129 0.134 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.28e-02 -0.21 0.121 0.134 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 1.08e-01 0.176 0.109 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0652 0.109 0.134 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 5.13e-01 0.0811 0.124 0.134 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0771 0.109 0.134 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.22e-01 0.0105 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 5.93e-01 0.064 0.119 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 4.45e-01 0.0892 0.116 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0342 0.128 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0409 0.0899 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 8.25e-01 0.0281 0.127 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0915 0.0881 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.26e-01 0.0274 0.125 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0386 0.126 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 1.08e-01 -0.18 0.111 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.127 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.97e-01 -0.141 0.109 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 3.23e-01 -0.125 0.126 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0797 0.0929 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0241 0.0968 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.48e-01 0.0538 0.118 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.91e-01 0.0328 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 2.15e-01 0.147 0.118 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0943 0.0969 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 7.65e-02 -0.222 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 1.98e-01 0.158 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 3.43e-01 0.1 0.105 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 5.88e-01 -0.033 0.0608 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.78e-02 -0.202 0.0913 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00515 0.0874 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.21e-01 0.0416 0.116 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.04e-04 -0.303 0.0766 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0996 0.0848 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.15e-06 0.357 0.0756 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0541 0.0769 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.18e-01 -0.13 0.106 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.22e-01 0.135 0.11 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 3.95e-01 -0.108 0.127 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 7.93e-02 -0.136 0.0772 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 1.27e-01 -0.161 0.105 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 6.59e-03 0.231 0.0841 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 1.23e-01 -0.198 0.128 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.19e-01 0.0107 0.105 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 1.15e-01 -0.207 0.131 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.74e-01 0.0346 0.12 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0722 0.128 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.49e-04 -0.364 0.1 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 6.48e-01 0.054 0.118 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.47e-02 0.206 0.102 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 9.00e-02 0.21 0.123 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.77e-01 0.106 0.0779 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.56e-01 0.0525 0.118 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.31e-01 0.133 0.11 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 4.10e-01 -0.101 0.122 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.48e-01 0.0985 0.105 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 2.08e-01 0.127 0.101 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 9.61e-03 0.289 0.111 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 2.42e-01 -0.146 0.124 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.33e-01 0.136 0.0899 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.98e-01 -0.114 0.109 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.20e-01 -0.042 0.117 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0257 0.12 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.22e-01 -0.12 0.0975 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0821 0.104 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0307 0.0873 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0741 0.123 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.08e-02 0.271 0.105 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.13e-01 0.0646 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 6.28e-02 -0.227 0.121 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 5.53e-01 0.073 0.123 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0453 0.111 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.11e-01 -0.105 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 8.66e-01 0.0181 0.107 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 6.35e-01 0.0553 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.43e-01 0.00818 0.115 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0593 0.13 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.36e-01 -0.042 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.91e-01 0.0345 0.13 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0909 0.119 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00288 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 6.76e-01 0.0521 0.125 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 4.41e-02 -0.231 0.114 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0295 0.0949 0.134 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0916 0.119 0.134 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.11e-02 -0.185 0.105 0.134 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 2.20e-01 0.142 0.116 0.134 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 4.79e-01 -0.076 0.107 0.134 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0803 0.125 0.134 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 8.82e-02 0.186 0.109 0.134 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 3.25e-01 0.116 0.117 0.134 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 7.71e-01 0.0278 0.0954 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 8.08e-01 0.0293 0.121 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 8.39e-02 -0.182 0.105 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 1.23e-01 -0.201 0.13 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 6.28e-02 -0.227 0.122 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0775 0.0986 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 2.07e-01 0.154 0.122 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 5.50e-02 0.241 0.125 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 1.51e-01 -0.173 0.12 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0574 0.0741 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 8.65e-01 0.0189 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 7.21e-01 0.0389 0.109 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.54e-02 -0.191 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.64e-01 0.0332 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0526 0.115 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 5.63e-03 0.269 0.0963 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 2.60e-01 0.145 0.129 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.67e-02 0.207 0.103 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 3.60e-01 -0.115 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 3.54e-01 -0.114 0.123 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0375 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.50e-01 0.0418 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.113 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 2.07e-01 -0.164 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.04e-02 0.276 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 2.79e-01 -0.13 0.12 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 4.39e-01 0.0672 0.0866 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 3.50e-01 -0.116 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 4.12e-01 0.0943 0.115 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 5.18e-02 -0.229 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.76e-01 0.0344 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.97e-02 -0.233 0.113 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.14e-02 0.233 0.101 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 6.05e-01 0.0655 0.126 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 6.50e-01 0.0639 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.61e-01 -0.17 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.84e-01 0.144 0.134 0.144 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 8.53e-01 0.0235 0.127 0.144 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0428 0.0847 0.144 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0173 0.108 0.144 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.89e-01 0.15 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.20e-01 -0.133 0.085 0.137 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.93e-01 -0.13 0.123 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0211 0.116 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0392 0.117 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 6.04e-01 0.0335 0.0645 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.108 0.137 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.66e-01 0.111 0.0993 0.137 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 3.94e-01 0.0878 0.103 0.137 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0633 0.104 0.135 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0338 0.124 0.135 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 6.60e-02 0.217 0.117 0.135 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 6.74e-01 0.054 0.128 0.135 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.26e-01 -0.14 0.091 0.135 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 8.70e-03 -0.309 0.117 0.135 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 9.43e-02 0.165 0.098 0.135 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 7.78e-02 -0.205 0.116 0.135 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0317 0.117 0.139 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 9.40e-02 0.188 0.112 0.139 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0775 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 4.88e-01 0.0711 0.102 0.139 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.69e-01 -0.115 0.0832 0.139 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0439 0.11 0.139 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 5.49e-01 0.0748 0.125 0.139 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.47e-01 0.147 0.101 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0431 0.115 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 1.88e-01 0.137 0.104 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 5.06e-02 -0.153 0.078 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 6.09e-02 0.176 0.0932 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.78e-01 0.0181 0.118 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 3.44e-01 -0.111 0.118 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 4.55e-03 0.307 0.107 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 5.72e-03 -0.236 0.0846 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 9.25e-01 0.00957 0.101 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 6.53e-02 0.235 0.126 0.148 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00405 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0151 0.136 0.148 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0149 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 7.28e-02 -0.229 0.126 0.148 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 1.29e-01 -0.202 0.132 0.148 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.41e-01 0.107 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 4.66e-01 0.097 0.133 0.148 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 2.49e-01 0.136 0.117 0.14 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 3.50e-01 -0.107 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00252 0.112 0.14 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.21e-02 -0.291 0.115 0.14 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 5.98e-01 0.0689 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.58e-02 -0.136 0.0814 0.14 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 8.87e-01 0.0151 0.106 0.14 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 5.96e-01 0.0544 0.102 0.14 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.14 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.22e-01 0.0862 0.107 0.14 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.46e-01 0.17 0.116 0.144 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 4.09e-01 -0.106 0.128 0.144 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 3.60e-01 -0.113 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 2.88e-01 -0.123 0.115 0.144 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0548 0.0819 0.144 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0339 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0882 0.123 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 2.03e-01 -0.164 0.129 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 4.28e-01 -0.088 0.111 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 6.95e-01 0.0494 0.126 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 2.19e-01 -0.107 0.087 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 7.85e-01 0.0336 0.123 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 7.34e-01 0.0328 0.0965 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0179 0.121 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0443 0.118 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 9.77e-01 0.00378 0.129 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0828 0.0899 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0852 0.122 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 1.17e-01 -0.123 0.0782 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.0983 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0509 0.109 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 1.15e-02 0.254 0.0996 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.09e-02 -0.192 0.0748 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 2.39e-01 0.0951 0.0805 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 9.39e-01 0.00647 0.0844 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0335 0.103 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 2.36e-01 0.116 0.0974 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 1.45e-02 -0.246 0.0998 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 6.07e-01 0.054 0.105 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -796705 sc-eQTL 8.71e-01 0.0102 0.0626 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -60904 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0557 0.114 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 156811 sc-eQTL 7.81e-01 0.0304 0.109 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -477777 sc-eQTL 8.32e-03 -0.274 0.103 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -690316 sc-eQTL 5.52e-01 0.0647 0.109 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 sc-eQTL 3.05e-02 -0.224 0.103 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0703 0.11 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 sc-eQTL 3.56e-04 0.313 0.0862 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -658653 sc-eQTL 4.10e-01 0.106 0.128 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -60904 eQTL 5.23e-03 -0.114 0.0407 0.0 0.0 0.119
ENSG00000136026 CKAP4 -7435 eQTL 0.0114 -0.0396 0.0156 0.0 0.0 0.119
ENSG00000151135 TMEM263 -658875 eQTL 0.017 -0.0431 0.018 0.0 0.0 0.119
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 eQTL 4.7899999999999993e-23 0.214 0.0211 0.0 0.0 0.119

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 -5085 0.000103 5.98e-05 8.72e-06 1.84e-05 7.76e-06 2.36e-05 6.82e-05 5.44e-06 4.45e-05 1.78e-05 5.7e-05 2.48e-05 7.51e-05 2.04e-05 9.95e-06 2.94e-05 2.88e-05 3.59e-05 1.1e-05 7.61e-06 2.29e-05 5.35e-05 5.12e-05 1.15e-05 6.8e-05 1.23e-05 1.98e-05 1.58e-05 5.37e-05 3.39e-05 3.25e-05 1.65e-06 2.68e-06 8.1e-06 1.47e-05 6.68e-06 3.43e-06 3.17e-06 5.26e-06 3.6e-06 1.77e-06 6.82e-05 5.66e-06 2.86e-07 3e-06 4.96e-06 5.39e-06 1.6e-06 1.54e-06
ENSG00000258355 \N 49888 6.76e-05 4.67e-05 1.04e-05 1.34e-05 3.92e-06 1.37e-05 4.44e-05 3.4e-06 2.67e-05 1.11e-05 3.08e-05 1.29e-05 4.4e-05 1.49e-05 7.23e-06 1.75e-05 2.36e-05 2.14e-05 6.78e-06 5.45e-06 1.45e-05 2.99e-05 3.45e-05 7.65e-06 4.78e-05 7.14e-06 1.27e-05 1.09e-05 3.53e-05 2.57e-05 1.66e-05 1.47e-06 1.92e-06 6.8e-06 1.12e-05 4.68e-06 2.72e-06 2.76e-06 3.46e-06 2e-06 1.67e-06 4.79e-05 5.77e-06 3.6e-07 2.49e-06 2.74e-06 3.71e-06 1.18e-06 1.03e-06