logo

Genes within 1Mb (chr12:106292261:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0595 0.078 0.137 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.137 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0188 0.09 0.137 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 9.11e-01 0.014 0.125 0.137 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 9.27e-02 -0.0982 0.0582 0.137 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 5.30e-01 -0.055 0.0875 0.137 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 1.08e-01 -0.113 0.0699 0.137 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0584 0.0515 0.137 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 6.34e-03 -0.223 0.0808 0.137 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.86e-01 0.0328 0.081 0.137 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 9.75e-01 0.00316 0.0996 0.137 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.54e-05 -0.285 0.0675 0.137 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.62e-02 -0.144 0.0781 0.137 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 6.03e-06 0.316 0.0681 0.137 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 1.61e-01 -0.159 0.113 0.137 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 2.28e-01 0.0796 0.0659 0.137 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00424 0.098 0.137 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.21e-01 0.0223 0.0986 0.137 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 6.60e-01 -0.045 0.102 0.137 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0731 0.0646 0.137 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00241 0.0844 0.137 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.19e-01 0.0464 0.0574 0.137 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 3.96e-01 -0.105 0.123 0.137 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00126 0.105 0.14 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.14 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.48e-01 -0.133 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00636 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0859 0.0765 0.14 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0474 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0394 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 7.37e-01 0.027 0.0804 0.137 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0597 0.0965 0.137 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.15e-02 0.212 0.0916 0.137 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.68e-02 -0.165 0.0683 0.137 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.67e-01 0.0892 0.0802 0.137 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.93e-01 0.000564 0.0611 0.137 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0026 0.109 0.137 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 7.95e-01 -0.028 0.108 0.137 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.18e-03 -0.309 0.0997 0.137 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.73e-01 0.0303 0.105 0.137 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 6.82e-02 -0.178 0.0972 0.137 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0413 0.106 0.137 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.75e-04 0.308 0.0867 0.137 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 6.25e-01 0.0624 0.127 0.137 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.85e-01 0.0446 0.0638 0.137 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0944 0.12 0.137 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 5.88e-02 -0.158 0.0832 0.137 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 1.45e-01 0.146 0.0998 0.137 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 8.41e-01 -0.015 0.075 0.137 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0304 0.105 0.137 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 8.80e-03 0.239 0.0905 0.137 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 9.03e-02 0.192 0.113 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0218 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 2.69e-01 0.146 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 4.38e-01 -0.104 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0653 0.104 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0992 0.125 0.122 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0104 0.14 0.122 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 8.19e-01 0.0321 0.14 0.122 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 3.64e-01 -0.107 0.117 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0859 0.13 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.21e-01 0.0412 0.115 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 3.76e-01 -0.11 0.124 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0773 0.096 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 3.57e-01 -0.113 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0757 0.112 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 3.55e-01 0.112 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 1.92e-01 -0.167 0.128 0.136 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.32e-02 -0.209 0.12 0.136 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 6.58e-02 0.2 0.108 0.136 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0615 0.108 0.136 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 5.95e-01 0.0655 0.123 0.136 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 3.04e-01 -0.111 0.108 0.136 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.65e-01 0.00461 0.106 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.88e-01 0.0644 0.118 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 5.21e-01 0.0743 0.116 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0362 0.127 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0356 0.0893 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.96e-01 0.0492 0.126 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0951 0.0874 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.39e-01 0.00949 0.124 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0708 0.125 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 9.32e-02 -0.187 0.111 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 3.25e-01 0.125 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0818 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0987 0.0925 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0151 0.0963 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 6.20e-01 0.0582 0.117 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.01e-01 0.0473 0.123 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 2.43e-01 0.137 0.117 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0926 0.0964 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 8.13e-02 -0.218 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.29e-01 0.147 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.67e-01 0.117 0.105 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0364 0.0604 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 4.83e-02 -0.181 0.091 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 9.78e-01 0.00236 0.0869 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.19e-01 0.0415 0.115 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.17e-04 -0.299 0.0762 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 2.19e-01 -0.104 0.0843 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 1.25e-05 0.338 0.0755 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 1.74e-01 -0.162 0.119 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0636 0.0763 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 2.96e-01 -0.11 0.105 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.52e-01 0.126 0.109 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.126 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.05e-01 -0.125 0.0767 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 9.93e-02 -0.173 0.104 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.00e-03 0.242 0.0833 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 8.05e-02 -0.222 0.126 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00658 0.104 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 2.01e-01 -0.167 0.13 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.14e-01 0.0281 0.12 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0883 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.98e-04 -0.348 0.0997 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 8.59e-01 0.021 0.118 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 5.04e-02 0.2 0.102 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 6.23e-02 0.23 0.122 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.98e-01 0.1 0.0776 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 6.45e-01 0.054 0.117 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.14e-01 0.137 0.11 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0999 0.122 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.45e-01 0.0986 0.104 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 2.14e-01 0.125 0.1 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 1.28e-02 0.277 0.11 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.30e-01 -0.149 0.124 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.31e-01 0.136 0.0893 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0964 0.109 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.83e-01 -0.032 0.116 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0193 0.119 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.34e-01 -0.116 0.0969 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0737 0.103 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0329 0.0868 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0839 0.122 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.24e-02 0.265 0.105 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 4.64e-01 0.0929 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.32e-02 -0.218 0.121 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.12e-01 0.0452 0.122 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 8.57e-01 -0.02 0.111 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 4.18e-01 -0.102 0.126 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 8.63e-01 0.0185 0.107 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 5.81e-01 0.0638 0.115 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00206 0.114 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0713 0.129 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0368 0.124 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 8.23e-01 0.029 0.13 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.90e-01 -0.102 0.119 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0106 0.13 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 7.69e-01 0.0365 0.124 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 3.15e-02 -0.245 0.113 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0216 0.0943 0.136 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0954 0.119 0.136 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.37e-02 -0.188 0.105 0.136 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 2.38e-01 0.136 0.115 0.136 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0691 0.107 0.136 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0825 0.125 0.136 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 9.40e-02 0.182 0.108 0.136 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.46e-01 0.136 0.117 0.136 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.18e-01 0.0218 0.0948 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 8.51e-01 0.0225 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 1.24e-01 -0.161 0.104 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 9.41e-02 -0.217 0.129 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 5.40e-02 -0.234 0.121 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0632 0.0981 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 1.86e-01 0.161 0.121 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 6.87e-02 0.227 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 1.12e-01 -0.19 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0618 0.0737 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 7.44e-01 0.0362 0.111 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 8.41e-01 0.0217 0.108 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.38e-02 -0.205 0.11 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 6.91e-01 0.0438 0.11 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.58e-01 -0.157 0.111 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0472 0.115 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 6.68e-03 0.262 0.0957 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.35e-01 0.152 0.128 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.66e-02 0.177 0.103 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.31e-01 -0.122 0.125 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 2.53e-01 -0.14 0.122 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0295 0.128 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 6.68e-01 0.0558 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.55e-01 -0.104 0.113 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 2.00e-01 -0.165 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.93e-02 0.249 0.126 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.24e-01 -0.145 0.119 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.66e-01 0.0628 0.086 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.65e-01 -0.112 0.123 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 5.94e-01 0.0608 0.114 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.12e-02 -0.218 0.116 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.77e-01 0.034 0.12 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.15e-02 -0.219 0.112 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 4.49e-01 -0.093 0.123 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.84e-02 0.22 0.0999 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 6.17e-01 0.0627 0.125 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 6.50e-01 0.0639 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 2.61e-01 -0.17 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.84e-01 0.144 0.134 0.144 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 8.53e-01 0.0235 0.127 0.144 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0428 0.0847 0.144 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0173 0.108 0.144 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.89e-01 0.15 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.93e-02 -0.144 0.0845 0.139 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.74e-01 -0.109 0.123 0.139 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 9.46e-01 0.0078 0.116 0.139 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0336 0.116 0.139 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 7.14e-01 0.0236 0.0642 0.139 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 2.55e-01 -0.122 0.107 0.139 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.83e-01 0.106 0.0988 0.139 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 1.77e-01 0.138 0.102 0.139 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0699 0.104 0.137 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0436 0.123 0.137 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.33e-02 0.217 0.116 0.137 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 8.41e-01 0.0256 0.127 0.137 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.29e-01 -0.138 0.0905 0.137 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 1.11e-02 -0.297 0.116 0.137 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0975 0.137 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 9.88e-02 -0.191 0.115 0.137 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 7.97e-01 -0.03 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 1.44e-01 0.163 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0973 0.118 0.141 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 4.50e-01 0.077 0.102 0.141 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.50e-01 -0.12 0.0828 0.141 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0316 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.46e-01 0.0947 0.124 0.141 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.90e-01 0.133 0.101 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0387 0.114 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.02e-01 0.132 0.103 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 7.07e-02 -0.141 0.0777 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 7.15e-02 0.168 0.0928 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.55e-01 0.0215 0.118 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.117 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.62e-03 0.323 0.106 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.58e-03 -0.247 0.084 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 9.75e-01 0.00313 0.1 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.37e-02 0.219 0.126 0.152 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0163 0.133 0.152 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.62e-01 0.0235 0.135 0.152 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0315 0.145 0.152 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.38e-01 -0.188 0.126 0.152 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 1.89e-01 -0.174 0.132 0.152 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 5.43e-01 0.084 0.138 0.152 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 2.96e-01 0.138 0.131 0.152 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 2.19e-01 0.144 0.117 0.142 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 4.19e-01 -0.092 0.114 0.142 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 8.54e-01 0.0205 0.111 0.142 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.46e-02 -0.282 0.114 0.142 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 5.19e-01 0.0839 0.13 0.142 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.081 0.143 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 8.08e-01 0.0255 0.105 0.143 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.62e-01 0.0447 0.102 0.143 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.79e-01 -0.118 0.108 0.143 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 4.72e-01 0.0768 0.107 0.143 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 1.76e-01 0.157 0.116 0.147 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0783 0.127 0.147 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 4.01e-01 -0.103 0.123 0.147 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 2.17e-01 -0.142 0.114 0.147 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0453 0.0815 0.147 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0385 0.13 0.147 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0501 0.122 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0921 0.111 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 1.94e-01 -0.167 0.128 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0884 0.11 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 6.99e-01 0.0483 0.125 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 2.08e-01 -0.109 0.0865 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 9.29e-01 0.0108 0.122 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 1.53e-01 -0.15 0.105 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 8.25e-01 0.0212 0.0958 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 7.97e-01 -0.031 0.12 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0616 0.117 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 9.42e-01 0.00935 0.129 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 4.27e-01 -0.071 0.0893 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0517 0.121 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 9.42e-02 -0.13 0.0775 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 2.32e-01 0.117 0.0977 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0449 0.108 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 9.77e-03 0.258 0.0989 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.37e-02 -0.185 0.0744 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 2.64e-01 0.0897 0.0801 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.22e-01 0.00823 0.084 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0239 0.102 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 2.45e-01 0.113 0.097 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 1.62e-02 -0.241 0.0994 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 6.50e-01 0.0475 0.104 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -801288 sc-eQTL 9.64e-01 0.00283 0.0622 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -65487 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0413 0.113 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 152228 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00125 0.109 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -482360 sc-eQTL 7.16e-03 -0.278 0.102 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -694899 sc-eQTL 4.97e-01 0.0734 0.108 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 sc-eQTL 3.14e-02 -0.221 0.102 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -663458 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0623 0.109 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 sc-eQTL 5.17e-04 0.302 0.0857 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -663236 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.127 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -65487 eQTL 1.00e-02 -0.107 0.0414 0.0 0.0 0.122
ENSG00000136026 CKAP4 -12018 eQTL 0.0104 -0.0408 0.0159 0.0 0.0 0.122
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 eQTL 3.3100000000000003e-21 0.208 0.0215 0.0 0.0 0.122

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 -9668 2.73e-05 2.95e-05 5.89e-06 1.53e-05 5.1e-06 1.31e-05 4.15e-05 4.01e-06 2.7e-05 1.33e-05 3.38e-05 1.5e-05 4.49e-05 1.27e-05 6.45e-06 1.63e-05 1.5e-05 2.25e-05 7.51e-06 6.75e-06 1.36e-05 2.81e-05 2.83e-05 9.15e-06 3.96e-05 6.74e-06 1.21e-05 1.12e-05 2.98e-05 2.85e-05 1.73e-05 1.64e-06 2.59e-06 7.07e-06 1.11e-05 5.78e-06 3.13e-06 3.16e-06 4.54e-06 3.57e-06 1.77e-06 3.49e-05 3.04e-06 3.66e-07 2.25e-06 3.67e-06 3.97e-06 1.5e-06 1.52e-06