logo

Genes within 1Mb (chr12:106284796:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 1.10e-01 -0.13 0.081 0.147 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 2.69e-01 0.131 0.118 0.147 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0651 0.0938 0.147 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 6.08e-02 -0.243 0.129 0.147 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 7.45e-01 0.0199 0.061 0.147 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0581 0.0912 0.147 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0368 0.0733 0.147 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 4.36e-01 0.0424 0.0543 0.147 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 1.47e-01 -0.125 0.0862 0.147 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 1.30e-01 -0.129 0.0849 0.147 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 6.08e-02 -0.196 0.104 0.147 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 2.06e-02 -0.17 0.0731 0.147 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 1.97e-01 -0.107 0.0825 0.147 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.37e-01 0.112 0.0749 0.147 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.147 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0943 0.0694 0.147 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 8.48e-01 0.0198 0.103 0.147 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.10e-02 -0.175 0.103 0.147 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 3.60e-01 0.0988 0.108 0.147 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0298 0.0683 0.147 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00756 0.089 0.147 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.38e-01 0.0203 0.0606 0.147 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 7.91e-01 0.0346 0.13 0.147 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00959 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 1.98e-01 -0.155 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.45e-02 -0.208 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0102 0.116 0.142 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00169 0.0827 0.142 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.46e-01 -0.053 0.115 0.142 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00699 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0844 0.0849 0.147 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 4.46e-03 0.288 0.1 0.147 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 2.57e-01 -0.111 0.0978 0.147 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0568 0.0732 0.147 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0482 0.085 0.147 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 9.94e-02 -0.103 0.0623 0.148 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 7.29e-01 -0.039 0.112 0.148 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0279 0.111 0.148 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 5.41e-01 0.0641 0.105 0.148 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 5.16e-01 -0.07 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0161 0.101 0.148 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0537 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.56e-01 0.13 0.0911 0.148 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0828 0.131 0.148 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0537 0.067 0.147 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0946 0.126 0.147 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0878 0.147 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0838 0.105 0.147 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 3.30e-01 0.0768 0.0786 0.147 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.51e-02 -0.202 0.109 0.147 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 3.17e-01 0.0967 0.0964 0.147 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0611 0.119 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.87e-01 -0.113 0.13 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.65e-01 0.097 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 2.69e-01 -0.114 0.103 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000936 0.124 0.143 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.91e-01 0.0551 0.139 0.143 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.27e-01 -0.11 0.138 0.143 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 2.69e-01 -0.137 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 6.24e-01 0.067 0.136 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.65e-01 0.00534 0.121 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 1.00e-01 -0.213 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.89e-01 0.0141 0.101 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0708 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0804 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 6.83e-01 0.0525 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 7.69e-01 0.0398 0.135 0.147 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 1.73e-01 -0.173 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 3.91e-02 -0.236 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 2.90e-01 -0.121 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0927 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0366 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0705 0.109 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00296 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00858 0.119 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 2.73e-01 -0.143 0.131 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 2.16e-02 -0.21 0.0909 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0446 0.0903 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0466 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0714 0.13 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 6.51e-01 0.0597 0.132 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.74e-01 0.018 0.113 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0188 0.131 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0075 0.0965 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0987 0.103 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0234 0.126 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00235 0.133 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 6.38e-01 0.0597 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 5.73e-01 0.0586 0.104 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.04e-01 0.11 0.131 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 7.24e-01 0.0399 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 1.64e-01 0.0881 0.0631 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0406 0.0962 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0837 0.0909 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 8.57e-02 -0.208 0.12 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 2.34e-02 -0.186 0.0817 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0877 0.0885 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.56e-01 0.117 0.0824 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 1.75e-01 0.107 0.079 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 2.81e-01 -0.118 0.109 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 3.17e-01 -0.114 0.114 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 1.23e-01 -0.202 0.131 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 1.69e-01 -0.11 0.0798 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 4.82e-03 -0.305 0.107 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.82e-01 0.118 0.0879 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 5.59e-02 0.252 0.131 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.31e-01 0.0382 0.111 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.78e-01 -0.123 0.139 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0869 0.127 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 1.17e-01 -0.213 0.135 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 7.77e-01 -0.031 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0247 0.125 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.07e-01 0.176 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0788 0.131 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0451 0.0815 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 1.93e-01 0.159 0.122 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 3.35e-02 -0.244 0.114 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000945 0.128 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 7.91e-01 -0.029 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 7.58e-02 0.186 0.104 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000231 0.13 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0382 0.0944 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 2.20e-01 -0.141 0.114 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 2.67e-01 0.136 0.122 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.40e-01 0.0969 0.125 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0407 0.102 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.96e-03 -0.297 0.107 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0311 0.0913 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 4.37e-01 0.1 0.129 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0685 0.12 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.14e-01 -0.143 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 7.97e-01 0.0353 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 8.49e-01 0.0263 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.79e-01 0.0515 0.124 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 2.83e-01 -0.152 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0347 0.12 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 5.27e-01 0.0822 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0814 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.34e-01 -0.102 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 8.63e-01 0.0236 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.12e-01 0.0635 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 3.78e-01 0.12 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0932 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0513 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 8.44e-01 0.0196 0.0996 0.147 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.94e-01 -0.107 0.125 0.147 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0899 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0155 0.122 0.147 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0524 0.113 0.147 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.78e-02 -0.249 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 1.35e-01 0.171 0.114 0.147 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 3.87e-01 -0.107 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0261 0.101 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 5.90e-01 0.0751 0.139 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.13 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00399 0.105 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.54e-01 0.0771 0.13 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.134 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0631 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 8.44e-02 -0.131 0.0756 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.82e-01 -0.063 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0773 0.112 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.43e-01 0.00813 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00304 0.115 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0759 0.118 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.53e-01 0.0317 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.132 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 3.69e-02 -0.225 0.107 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 8.77e-01 0.0203 0.131 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 4.94e-01 0.0872 0.127 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 7.53e-01 0.0422 0.134 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 6.45e-01 0.0625 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0156 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0341 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 3.46e-01 0.125 0.132 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 2.91e-01 0.131 0.124 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0888 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 4.39e-01 -0.099 0.128 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 6.12e-01 0.0601 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00476 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0698 0.124 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 5.58e-01 0.0686 0.117 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0242 0.127 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.85e-01 0.0731 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0709 0.13 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 2.35e-01 -0.176 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 2.76e-03 0.469 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0149 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0964 0.134 0.156 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00283 0.0896 0.156 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.08e-01 0.076 0.114 0.156 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.71e-01 0.108 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 4.12e-01 0.0736 0.0896 0.148 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.09e-01 0.0857 0.13 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.121 0.148 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 9.47e-01 0.00807 0.122 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.63e-01 0.0117 0.0677 0.148 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.50e-01 0.0513 0.113 0.148 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.05e-01 0.0871 0.104 0.148 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 2.63e-01 -0.121 0.108 0.148 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0339 0.112 0.147 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0743 0.132 0.147 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.17e-01 0.0131 0.126 0.147 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 2.92e-01 -0.144 0.136 0.147 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 4.26e-02 -0.197 0.0968 0.147 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0337 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 8.80e-02 0.179 0.105 0.147 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00505 0.124 0.147 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 9.57e-01 0.00693 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.37e-01 -0.118 0.123 0.139 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 1.43e-01 -0.19 0.129 0.139 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0935 0.111 0.139 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 2.76e-01 0.0994 0.091 0.139 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0944 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0267 0.136 0.139 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0293 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.32e-02 0.259 0.121 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 5.31e-01 0.0693 0.111 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 3.87e-02 -0.172 0.0828 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00963 0.0998 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.60e-01 -0.073 0.125 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.125 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 3.77e-01 -0.102 0.115 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0407 0.0911 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0734 0.107 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 8.16e-01 -0.033 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 3.30e-02 -0.314 0.146 0.142 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 6.19e-01 0.075 0.15 0.142 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 2.42e-01 -0.189 0.161 0.142 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 7.62e-02 0.25 0.14 0.142 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.18e-01 -0.034 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0864 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0233 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0746 0.125 0.149 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0585 0.122 0.149 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 1.08e-01 -0.191 0.118 0.149 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 3.70e-01 0.111 0.124 0.149 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0446 0.139 0.149 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0825 0.0923 0.143 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 1.33e-02 0.293 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 2.08e-01 -0.146 0.115 0.143 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0457 0.123 0.143 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 2.13e-01 0.151 0.121 0.143 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 6.45e-02 -0.257 0.138 0.133 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 4.90e-01 -0.105 0.152 0.133 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0572 0.147 0.133 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 4.19e-01 0.111 0.137 0.133 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0189 0.0976 0.133 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 6.94e-01 0.0614 0.156 0.133 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0292 0.147 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0927 0.115 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 2.18e-01 0.163 0.132 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 9.47e-01 0.00756 0.114 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 1.13e-02 -0.324 0.127 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0404 0.0896 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 8.18e-01 -0.029 0.126 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 3.09e-01 -0.11 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0558 0.0988 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0588 0.124 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 4.68e-01 -0.088 0.121 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 3.44e-01 -0.126 0.132 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 1.15e-01 -0.145 0.0917 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0684 0.125 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0303 0.0805 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0369 0.104 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 5.88e-02 0.216 0.114 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0617 0.106 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 1.35e-01 -0.119 0.0794 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0155 0.0849 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0653 0.0898 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 4.67e-02 0.217 0.108 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 8.86e-02 -0.177 0.103 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 5.52e-01 0.0643 0.108 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 9.16e-01 0.0118 0.112 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -808753 sc-eQTL 8.86e-02 -0.108 0.0632 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -72952 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0521 0.115 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 144763 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0688 0.111 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -489825 sc-eQTL 7.27e-01 0.0372 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0642 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 sc-eQTL 6.40e-01 0.0495 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -670923 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0723 0.112 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 sc-eQTL 3.16e-01 0.0905 0.0901 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -670701 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 144763 eQTL 0.0119 -0.109 0.0434 0.00124 0.0 0.137
ENSG00000120832 MTERF2 -702364 eQTL 0.0118 -0.0869 0.0344 0.0 0.0 0.137
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 eQTL 0.0394 -0.0311 0.0151 0.0 0.0 0.137
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 eQTL 2.73e-13 0.154 0.0208 0.0 0.0 0.137

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 144763 2.96e-06 3.17e-06 9.15e-07 3.06e-06 4.72e-07 8.1e-07 2.54e-06 3.85e-07 2.27e-06 6.73e-07 2.27e-06 1.57e-06 3.53e-06 1.41e-06 9.63e-07 1.77e-06 1.54e-06 2.2e-06 1.17e-06 6.52e-07 1.21e-06 2.76e-06 1.77e-06 1.07e-06 4.19e-06 8.11e-07 1.31e-06 8.37e-07 2.2e-06 3.08e-06 1.45e-06 5.4e-08 2.17e-07 1.42e-06 1.91e-06 9.57e-07 7.29e-07 3.27e-07 1.33e-07 2.8e-08 4.49e-08 2.76e-06 4.11e-07 1.75e-07 1.45e-07 3.12e-07 2.6e-07 8.96e-08 5.05e-08
ENSG00000136026 CKAP4 -19483 1.86e-05 3.04e-05 6.97e-06 1.29e-05 4.91e-06 8.4e-06 3.12e-05 3.37e-06 2.46e-05 1.19e-05 2.86e-05 1.72e-05 3.8e-05 1.52e-05 1.02e-05 1.34e-05 1.89e-05 1.92e-05 7.02e-06 4.47e-06 1.09e-05 2.47e-05 2e-05 7.57e-06 4.24e-05 5.96e-06 1.14e-05 8.35e-06 2.39e-05 2.17e-05 1.31e-05 1.51e-06 1.23e-06 6.48e-06 9.06e-06 5.84e-06 3.1e-06 2.45e-06 3.16e-06 1.96e-06 9.3e-07 2.31e-05 4.96e-06 4.39e-07 2.26e-06 2.83e-06 3.43e-06 1.5e-06 6.27e-07
ENSG00000166046 TCP11L2 -17133 2.43e-05 3.08e-05 7.49e-06 1.32e-05 5.1e-06 9.07e-06 3.36e-05 3.4e-06 2.55e-05 1.25e-05 2.96e-05 1.67e-05 3.91e-05 1.45e-05 9.07e-06 1.48e-05 1.98e-05 2.03e-05 7.36e-06 4.88e-06 1.21e-05 2.62e-05 2.34e-05 7.73e-06 4.44e-05 6.35e-06 1.21e-05 9.09e-06 2.59e-05 2.35e-05 1.44e-05 1.65e-06 1.31e-06 6.68e-06 9.85e-06 5.77e-06 3.09e-06 2.77e-06 3.44e-06 2.11e-06 1.2e-06 2.73e-05 4.99e-06 4.28e-07 2.49e-06 2.75e-06 3.35e-06 1.47e-06 9.39e-07