logo

Genes within 1Mb (chr12:106271122:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 1.10e-01 -0.13 0.081 0.147 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 2.69e-01 0.131 0.118 0.147 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0651 0.0938 0.147 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 6.08e-02 -0.243 0.129 0.147 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 7.45e-01 0.0199 0.061 0.147 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0581 0.0912 0.147 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0368 0.0733 0.147 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 4.36e-01 0.0424 0.0543 0.147 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 1.47e-01 -0.125 0.0862 0.147 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 1.30e-01 -0.129 0.0849 0.147 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 6.08e-02 -0.196 0.104 0.147 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 2.06e-02 -0.17 0.0731 0.147 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 1.97e-01 -0.107 0.0825 0.147 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.37e-01 0.112 0.0749 0.147 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.147 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0943 0.0694 0.147 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 8.48e-01 0.0198 0.103 0.147 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.10e-02 -0.175 0.103 0.147 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 3.60e-01 0.0988 0.108 0.147 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0298 0.0683 0.147 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00756 0.089 0.147 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.38e-01 0.0203 0.0606 0.147 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 7.91e-01 0.0346 0.13 0.147 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00959 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 1.98e-01 -0.155 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.45e-02 -0.208 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0102 0.116 0.142 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00169 0.0827 0.142 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.46e-01 -0.053 0.115 0.142 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00699 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0844 0.0849 0.147 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 4.46e-03 0.288 0.1 0.147 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 2.57e-01 -0.111 0.0978 0.147 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0568 0.0732 0.147 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0482 0.085 0.147 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 9.94e-02 -0.103 0.0623 0.148 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 7.29e-01 -0.039 0.112 0.148 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0279 0.111 0.148 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 5.41e-01 0.0641 0.105 0.148 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 5.16e-01 -0.07 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0161 0.101 0.148 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0537 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.56e-01 0.13 0.0911 0.148 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0828 0.131 0.148 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0537 0.067 0.147 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0946 0.126 0.147 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0878 0.147 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0838 0.105 0.147 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 3.30e-01 0.0768 0.0786 0.147 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.51e-02 -0.202 0.109 0.147 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 3.17e-01 0.0967 0.0964 0.147 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0611 0.119 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.87e-01 -0.113 0.13 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.65e-01 0.097 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 2.69e-01 -0.114 0.103 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000936 0.124 0.143 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.91e-01 0.0551 0.139 0.143 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.27e-01 -0.11 0.138 0.143 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 2.69e-01 -0.137 0.123 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 6.24e-01 0.067 0.136 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.65e-01 0.00534 0.121 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 1.00e-01 -0.213 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.89e-01 0.0141 0.101 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0708 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0804 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 6.83e-01 0.0525 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 7.69e-01 0.0398 0.135 0.147 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 1.73e-01 -0.173 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 3.91e-02 -0.236 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 2.90e-01 -0.121 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0927 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0366 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0705 0.109 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00296 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00858 0.119 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 2.73e-01 -0.143 0.131 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 2.16e-02 -0.21 0.0909 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0446 0.0903 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0466 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0714 0.13 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 6.51e-01 0.0597 0.132 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.74e-01 0.018 0.113 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0188 0.131 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0075 0.0965 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0987 0.103 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0234 0.126 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00235 0.133 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 6.38e-01 0.0597 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 5.73e-01 0.0586 0.104 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.04e-01 0.11 0.131 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 7.24e-01 0.0399 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 1.64e-01 0.0881 0.0631 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0406 0.0962 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0837 0.0909 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 8.57e-02 -0.208 0.12 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 2.34e-02 -0.186 0.0817 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0877 0.0885 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.56e-01 0.117 0.0824 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 1.75e-01 0.107 0.079 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 2.81e-01 -0.118 0.109 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 3.17e-01 -0.114 0.114 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 1.23e-01 -0.202 0.131 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 1.69e-01 -0.11 0.0798 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 4.82e-03 -0.305 0.107 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.82e-01 0.118 0.0879 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 5.59e-02 0.252 0.131 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.31e-01 0.0382 0.111 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.78e-01 -0.123 0.139 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0869 0.127 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 1.17e-01 -0.213 0.135 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 7.77e-01 -0.031 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0247 0.125 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.07e-01 0.176 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0788 0.131 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0451 0.0815 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 1.93e-01 0.159 0.122 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 3.35e-02 -0.244 0.114 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000945 0.128 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 7.91e-01 -0.029 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 7.58e-02 0.186 0.104 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000231 0.13 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0382 0.0944 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 2.20e-01 -0.141 0.114 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 2.67e-01 0.136 0.122 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.40e-01 0.0969 0.125 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0407 0.102 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.96e-03 -0.297 0.107 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0311 0.0913 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 4.37e-01 0.1 0.129 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0685 0.12 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.14e-01 -0.143 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 7.97e-01 0.0353 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 8.49e-01 0.0263 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.79e-01 0.0515 0.124 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 2.83e-01 -0.152 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0347 0.12 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 5.27e-01 0.0822 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0814 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.34e-01 -0.102 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 8.63e-01 0.0236 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.12e-01 0.0635 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 3.78e-01 0.12 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0932 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0513 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 8.44e-01 0.0196 0.0996 0.147 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.94e-01 -0.107 0.125 0.147 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0899 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0155 0.122 0.147 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0524 0.113 0.147 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.78e-02 -0.249 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 1.35e-01 0.171 0.114 0.147 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 3.87e-01 -0.107 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0261 0.101 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 5.90e-01 0.0751 0.139 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.13 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00399 0.105 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.54e-01 0.0771 0.13 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.134 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0631 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 8.44e-02 -0.131 0.0756 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.82e-01 -0.063 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0773 0.112 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.43e-01 0.00813 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00304 0.115 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0759 0.118 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.53e-01 0.0317 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.132 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 3.69e-02 -0.225 0.107 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 8.77e-01 0.0203 0.131 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 4.94e-01 0.0872 0.127 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 7.53e-01 0.0422 0.134 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 6.45e-01 0.0625 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0156 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0341 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 3.46e-01 0.125 0.132 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 2.91e-01 0.131 0.124 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0888 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 4.39e-01 -0.099 0.128 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 6.12e-01 0.0601 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00476 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0698 0.124 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 5.58e-01 0.0686 0.117 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0242 0.127 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.85e-01 0.0731 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0709 0.13 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 2.35e-01 -0.176 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 2.76e-03 0.469 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0149 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0964 0.134 0.156 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00283 0.0896 0.156 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.08e-01 0.076 0.114 0.156 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.71e-01 0.108 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 4.12e-01 0.0736 0.0896 0.148 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.09e-01 0.0857 0.13 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.121 0.148 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 9.47e-01 0.00807 0.122 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.63e-01 0.0117 0.0677 0.148 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.50e-01 0.0513 0.113 0.148 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.05e-01 0.0871 0.104 0.148 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 2.63e-01 -0.121 0.108 0.148 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0339 0.112 0.147 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0743 0.132 0.147 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.17e-01 0.0131 0.126 0.147 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 2.92e-01 -0.144 0.136 0.147 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 4.26e-02 -0.197 0.0968 0.147 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0337 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 8.80e-02 0.179 0.105 0.147 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00505 0.124 0.147 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 9.57e-01 0.00693 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.37e-01 -0.118 0.123 0.139 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 1.43e-01 -0.19 0.129 0.139 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0935 0.111 0.139 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 2.76e-01 0.0994 0.091 0.139 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0944 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0267 0.136 0.139 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0293 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.32e-02 0.259 0.121 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 5.31e-01 0.0693 0.111 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 3.87e-02 -0.172 0.0828 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00963 0.0998 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.60e-01 -0.073 0.125 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.125 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 3.77e-01 -0.102 0.115 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0407 0.0911 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0734 0.107 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 8.16e-01 -0.033 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 3.30e-02 -0.314 0.146 0.142 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 6.19e-01 0.075 0.15 0.142 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 2.42e-01 -0.189 0.161 0.142 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 7.62e-02 0.25 0.14 0.142 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.18e-01 -0.034 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0864 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0233 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0746 0.125 0.149 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0585 0.122 0.149 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 1.08e-01 -0.191 0.118 0.149 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 3.70e-01 0.111 0.124 0.149 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0446 0.139 0.149 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0825 0.0923 0.143 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 1.33e-02 0.293 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 2.08e-01 -0.146 0.115 0.143 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0457 0.123 0.143 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 2.13e-01 0.151 0.121 0.143 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 6.45e-02 -0.257 0.138 0.133 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 4.90e-01 -0.105 0.152 0.133 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0572 0.147 0.133 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 4.19e-01 0.111 0.137 0.133 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0189 0.0976 0.133 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 6.94e-01 0.0614 0.156 0.133 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0292 0.147 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0927 0.115 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 2.18e-01 0.163 0.132 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 9.47e-01 0.00756 0.114 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 1.13e-02 -0.324 0.127 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0404 0.0896 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 8.18e-01 -0.029 0.126 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 3.09e-01 -0.11 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0558 0.0988 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0588 0.124 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 4.68e-01 -0.088 0.121 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 3.44e-01 -0.126 0.132 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 1.15e-01 -0.145 0.0917 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0684 0.125 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0303 0.0805 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0369 0.104 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 5.88e-02 0.216 0.114 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0617 0.106 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 1.35e-01 -0.119 0.0794 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0155 0.0849 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0653 0.0898 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 4.67e-02 0.217 0.108 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 8.86e-02 -0.177 0.103 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 5.52e-01 0.0643 0.108 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 9.16e-01 0.0118 0.112 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -822427 sc-eQTL 8.86e-02 -0.108 0.0632 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -86626 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0521 0.115 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 131089 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0688 0.111 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -503499 sc-eQTL 7.27e-01 0.0372 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0642 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -33157 sc-eQTL 6.40e-01 0.0495 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -684597 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0723 0.112 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 sc-eQTL 3.16e-01 0.0905 0.0901 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -684375 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -86626 eQTL 3.85e-02 -0.0821 0.0396 0.0 0.0 0.137
ENSG00000074590 NUAK1 131089 eQTL 0.0163 -0.105 0.0437 0.0 0.0 0.137
ENSG00000120832 MTERF2 -716038 eQTL 0.0143 -0.0852 0.0347 0.0 0.0 0.137
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 eQTL 6.89e-13 0.153 0.021 0.0 0.0 0.137

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 131089 4.68e-06 5.93e-06 6.55e-07 3.21e-06 1.5e-06 1.56e-06 6.63e-06 1.15e-06 5e-06 2.84e-06 7.19e-06 3.01e-06 9.33e-06 1.95e-06 1.02e-06 3.98e-06 3.02e-06 3.95e-06 2.11e-06 1.61e-06 2.6e-06 5.66e-06 4.62e-06 1.81e-06 9.05e-06 2.1e-06 2.55e-06 1.76e-06 5.8e-06 6.94e-06 2.57e-06 4.16e-07 8.01e-07 2.1e-06 2.03e-06 1.35e-06 1.11e-06 6.18e-07 1.05e-06 7.17e-07 6.17e-07 6.66e-06 5.62e-07 2.01e-07 6.98e-07 1.1e-06 9.9e-07 6.09e-07 5.78e-07
ENSG00000166046 TCP11L2 -30807 1.24e-05 1.76e-05 3.05e-06 1.06e-05 3.2e-06 7.78e-06 2.29e-05 3.34e-06 1.67e-05 8.98e-06 2.18e-05 8.63e-06 3.42e-05 8.31e-06 5.23e-06 1.01e-05 1.05e-05 1.39e-05 6.14e-06 4.89e-06 8.37e-06 1.71e-05 1.74e-05 5.67e-06 2.91e-05 5.37e-06 8.02e-06 8.17e-06 2.14e-05 1.99e-05 1.19e-05 1.31e-06 2.37e-06 5.43e-06 7.35e-06 4.55e-06 2.4e-06 2.76e-06 4e-06 2.84e-06 1.62e-06 2.02e-05 2.34e-06 3.6e-07 1.85e-06 2.69e-06 3.39e-06 1.5e-06 1.23e-06