logo

Genes within 1Mb (chr12:106266154:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.12e-01 0.0111 0.0999 0.079 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 4.18e-02 -0.294 0.143 0.079 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 3.14e-01 0.116 0.115 0.079 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 2.41e-01 -0.187 0.159 0.079 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 8.49e-01 0.0143 0.0749 0.079 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0598 0.112 0.079 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 8.89e-01 0.0125 0.0899 0.079 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.55e-01 0.0758 0.0664 0.079 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0909 0.106 0.079 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0594 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 8.17e-02 0.223 0.127 0.079 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0594 0.0905 0.079 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0811 0.101 0.079 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 2.26e-01 0.112 0.0919 0.079 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.27e-01 0.117 0.147 0.079 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0445 0.0852 0.079 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 4.29e-01 -0.1 0.126 0.079 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 3.16e-01 0.128 0.127 0.079 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0387 0.132 0.079 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0867 0.0833 0.079 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0558 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 3.83e-01 0.0647 0.074 0.079 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 3.23e-01 -0.157 0.159 0.079 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 8.23e-01 0.0305 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0742 0.145 0.081 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 8.17e-01 0.035 0.151 0.081 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.86e-02 -0.327 0.138 0.081 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 2.50e-01 0.115 0.0998 0.081 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 7.36e-02 -0.249 0.139 0.081 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0695 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.81e-01 0.114 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 5.48e-01 0.0765 0.127 0.079 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 8.89e-01 0.0171 0.122 0.079 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0934 0.0911 0.079 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 3.99e-01 0.0894 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.81e-01 0.084 0.0777 0.077 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 6.70e-01 0.0595 0.14 0.077 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 3.62e-01 -0.125 0.137 0.077 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 1.48e-01 -0.188 0.129 0.077 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.02e-01 -0.219 0.133 0.077 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.89e-01 0.05 0.125 0.077 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.90e-01 0.0931 0.135 0.077 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 4.08e-01 0.0941 0.114 0.077 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.58e-01 0.121 0.162 0.077 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.48e-01 0.0498 0.0827 0.079 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 2.00e-02 0.359 0.153 0.079 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0307 0.109 0.079 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 9.89e-01 0.00181 0.13 0.079 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.84e-02 0.177 0.0964 0.079 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 2.38e-01 -0.16 0.135 0.079 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 7.81e-01 0.0332 0.119 0.079 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 7.41e-01 0.0485 0.147 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.74e-01 0.0697 0.165 0.071 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 3.30e-01 -0.159 0.162 0.071 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 2.38e-01 0.195 0.165 0.071 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.48e-01 0.121 0.128 0.071 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0417 0.155 0.071 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0122 0.173 0.071 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.64e-01 -0.24 0.171 0.071 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.04e-02 -0.254 0.149 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0238 0.166 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.63e-01 0.00684 0.147 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 9.81e-01 0.0037 0.158 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 7.17e-01 -0.057 0.157 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 3.73e-01 -0.127 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.69e-01 0.0664 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 1.37e-01 -0.243 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 1.14e-01 0.243 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.60e-01 0.195 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 2.44e-01 0.161 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 2.33e-01 -0.187 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 4.78e-01 0.0978 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0255 0.135 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0629 0.152 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 1.88e-01 -0.195 0.148 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 5.68e-02 -0.309 0.161 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 7.45e-01 0.0373 0.114 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 5.32e-01 -0.101 0.161 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 3.41e-01 -0.107 0.112 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.68e-01 0.145 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 2.27e-01 -0.196 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.06e-01 0.0958 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 2.98e-01 -0.171 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0712 0.141 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 9.11e-01 0.0182 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.119 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 1.22e-01 0.193 0.124 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.96e-02 0.257 0.151 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.57e-01 0.094 0.16 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.12e-01 0.155 0.152 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 9.82e-01 0.00278 0.125 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0228 0.162 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 8.85e-01 -0.023 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 2.10e-01 0.171 0.136 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.53e-01 0.0896 0.0782 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 2.72e-01 -0.131 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0227 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.08e-02 0.322 0.148 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000438 0.102 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0776 0.11 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.46e-01 0.149 0.102 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.21e-01 0.125 0.155 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.44e-01 0.0926 0.0976 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00155 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000235 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 7.82e-01 0.0448 0.162 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0912 0.0987 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0985 0.134 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 5.98e-01 0.0575 0.109 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 3.91e-01 -0.14 0.163 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0751 0.132 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 5.34e-01 -0.103 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 4.95e-01 0.103 0.151 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 9.53e-01 0.00953 0.162 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 1.25e-01 -0.199 0.129 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 2.24e-01 -0.181 0.148 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 5.51e-01 0.0775 0.13 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 6.10e-01 0.0798 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.79e-01 0.0885 0.1 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0529 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.76e-01 0.0795 0.142 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 7.75e-01 0.0449 0.157 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0861 0.135 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 6.08e-01 0.0667 0.13 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 3.10e-01 0.147 0.144 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.83e-01 -0.112 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.81e-01 0.00279 0.116 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0535 0.14 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.22e-01 0.0957 0.149 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.75e-01 -0.208 0.153 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 2.70e-01 -0.138 0.125 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 3.85e-01 -0.116 0.133 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 7.50e-01 0.0356 0.112 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0374 0.158 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.36e-01 -0.131 0.136 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 4.42e-01 0.125 0.162 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.19e-01 -0.1 0.155 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.85e-01 -0.136 0.156 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.30e-01 0.0888 0.141 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 2.18e-01 0.199 0.161 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 7.75e-01 0.0389 0.136 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 1.89e-01 -0.194 0.147 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.72e-01 0.0613 0.144 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.18e-01 0.0377 0.164 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 6.01e-01 0.0819 0.156 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 6.57e-01 -0.073 0.164 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 9.62e-01 0.00714 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 8.56e-01 0.03 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 6.49e-01 0.0714 0.157 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 1.16e-01 -0.227 0.144 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 8.59e-01 0.0214 0.12 0.08 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 2.02e-02 0.35 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000235 0.135 0.08 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 6.02e-01 0.0768 0.147 0.08 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.77e-01 0.0567 0.136 0.08 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 3.46e-01 -0.15 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0137 0.139 0.08 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 8.41e-01 0.0299 0.149 0.08 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.80e-01 0.0669 0.121 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 2.86e-01 0.163 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 9.81e-01 0.00321 0.133 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 2.24e-01 -0.201 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.58e-01 -0.143 0.155 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 1.51e-01 -0.179 0.124 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 2.81e-01 0.167 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0616 0.159 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.15e-01 0.124 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.93e-01 0.000847 0.0937 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0257 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 3.50e-01 -0.128 0.137 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 3.86e-01 -0.122 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 3.13e-01 -0.141 0.139 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.83e-01 0.0776 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 7.61e-01 0.0444 0.146 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 8.31e-01 0.0265 0.124 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 4.96e-01 0.111 0.163 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.96e-01 0.0506 0.129 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 3.59e-01 0.144 0.156 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 2.03e-01 -0.194 0.152 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00664 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0938 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 1.05e-01 0.228 0.14 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 5.39e-01 0.0993 0.161 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00349 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0537 0.148 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 7.41e-01 0.0363 0.11 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 9.31e-01 0.0136 0.157 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00695 0.145 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 3.04e-01 -0.153 0.149 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.51e-01 -0.219 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0487 0.144 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 6.84e-01 0.0637 0.157 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 4.10e-01 0.106 0.129 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 9.05e-01 0.0192 0.16 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.78e-01 0.235 0.216 0.07 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 7.97e-01 0.0601 0.233 0.07 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 3.59e-01 0.191 0.207 0.07 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.60e-01 0.275 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 2.66e-02 0.288 0.128 0.07 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 9.35e-01 0.0137 0.167 0.07 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 5.56e-01 -0.129 0.218 0.07 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0937 0.111 0.08 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0513 0.16 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 1.80e-02 -0.355 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0853 0.151 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0521 0.0836 0.08 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.17e-01 -0.113 0.14 0.08 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 2.85e-01 0.138 0.129 0.08 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 5.68e-01 0.0763 0.133 0.08 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0095 0.134 0.079 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 9.76e-01 0.00482 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.48e-01 -0.091 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 8.11e-01 0.0393 0.164 0.079 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0359 0.117 0.079 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 8.62e-01 0.0265 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.10e-01 0.202 0.126 0.079 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0511 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.00e-01 0.103 0.153 0.083 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 6.85e-02 -0.267 0.146 0.083 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.29e-01 0.0138 0.155 0.083 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 4.38e-01 -0.104 0.133 0.083 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 9.37e-01 0.00859 0.109 0.083 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0662 0.143 0.083 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 9.98e-01 0.000508 0.163 0.083 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.49e-01 0.0806 0.134 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 7.71e-01 0.0442 0.152 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 8.47e-01 0.0267 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0641 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.00e+00 1.86e-05 0.124 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 8.66e-02 0.269 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 1.50e-01 0.226 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0403 0.145 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0485 0.115 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 4.38e-01 0.104 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.16e-01 0.159 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0238 0.166 0.094 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 5.84e-01 0.0924 0.168 0.094 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 4.17e-01 -0.147 0.18 0.094 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 1.05e-01 0.256 0.157 0.094 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 8.75e-01 0.0261 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.47e-01 0.249 0.171 0.094 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 9.09e-01 0.0189 0.164 0.094 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 8.94e-01 0.0208 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 1.28e-01 0.23 0.15 0.08 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 8.34e-01 0.0309 0.148 0.08 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 1.43e-01 -0.225 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 1.59e-01 -0.243 0.172 0.08 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 6.81e-01 0.0449 0.109 0.079 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 4.47e-01 -0.107 0.14 0.079 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 6.12e-01 0.0692 0.136 0.079 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.14e-01 0.0734 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 2.29e-01 0.172 0.142 0.079 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.02e-01 -0.193 0.151 0.088 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 3.70e-01 0.148 0.165 0.088 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 7.93e-01 0.0419 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 2.81e-01 -0.161 0.149 0.088 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 9.01e-02 0.179 0.105 0.088 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 5.16e-01 -0.11 0.169 0.088 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0439 0.159 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0811 0.143 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 1.11e-01 -0.262 0.164 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 2.03e-01 0.18 0.141 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.33e-01 0.24 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 4.60e-01 -0.116 0.156 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0421 0.135 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 9.36e-01 0.00989 0.123 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 5.05e-01 -0.102 0.153 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0783 0.15 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.89e-02 -0.384 0.162 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 7.45e-01 0.0373 0.114 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0334 0.155 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 8.84e-01 0.0146 0.0998 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 2.37e-01 0.154 0.13 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 1.88e-01 0.189 0.143 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00478 0.133 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0828 0.0999 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 5.60e-01 0.0621 0.106 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0812 0.113 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00561 0.138 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 6.35e-01 0.0624 0.131 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0639 0.136 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 8.81e-01 0.0211 0.141 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -827395 sc-eQTL 3.17e-01 0.0789 0.0787 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -91594 sc-eQTL 8.58e-01 0.0257 0.143 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 126121 sc-eQTL 4.22e-01 -0.111 0.138 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -508467 sc-eQTL 1.47e-01 -0.191 0.131 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -721006 sc-eQTL 1.47e-01 -0.199 0.136 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -38125 sc-eQTL 3.81e-01 0.115 0.131 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -689565 sc-eQTL 5.77e-01 0.0773 0.139 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35775 sc-eQTL 5.88e-01 0.0607 0.112 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -689343 sc-eQTL 7.22e-01 0.0576 0.162 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258355 AC079174.1 19198 eQTL 0.0227 0.0839 0.0368 0.0 0.0 0.0746

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina